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重复序列PCR与多位点分型技术在白假丝酵母菌基因分型中的比较
被引量：
2
1
作者
魏冰
刘锦燕
+1 位作者
史册
项明洁
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期1445-1448,共4页
目的应用多位点序列分型技术(MLST)和重复序列聚合酶链反应(REP-PCR)对临床分离出的白假丝酵母菌进行分型,并对两种方法作出应用评价。方法收集上海地区医院中真菌性阴道炎分离出的40株白假丝酵母菌,选择合适引物进行扩增,通过电泳比较...
目的应用多位点序列分型技术(MLST)和重复序列聚合酶链反应(REP-PCR)对临床分离出的白假丝酵母菌进行分型,并对两种方法作出应用评价。方法收集上海地区医院中真菌性阴道炎分离出的40株白假丝酵母菌,选择合适引物进行扩增,通过电泳比较分析获得REP-PCR分型。选择7对管家基因进行PCR反应并测序,将测序结果与标准序列进行比对,获得由7对管家基因组成的等位基因谱,最终得到相应的序列分型。结果 REP-PCR中Ca22-Ca22引物对得到电泳条带最优,40株白假丝酵母菌共分成7种REP-PCR型;MLST分型得出29种,且均为新型。结论 MLST分辨率较REP-PCR高,但由于REP-PCR分型方法更为快捷、经济,更适用于实验室大量菌株分型和临床分型。MLST则更客观,更适合用于进化学的研究及全球性流行病学的调查研究。
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关键词
白假丝酵母菌
多位点序列分型技术
重复序列聚合酶链反应
基因分型
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职称材料
题名
重复序列PCR与多位点分型技术在白假丝酵母菌基因分型中的比较
被引量：
2
1
作者
魏冰
刘锦燕
史册
项明洁
机构
上海交通大学医学院
附属
瑞金医院
检验
科
上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院放射免疫检验科
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期1445-1448,共4页
基金
上海市卫生局资助项目(2009239)
上海市科委生物医药资助项目(11411960500)
上海市医学重点专科建设项目(2012年A类21号)~~
文摘
目的应用多位点序列分型技术(MLST)和重复序列聚合酶链反应(REP-PCR)对临床分离出的白假丝酵母菌进行分型,并对两种方法作出应用评价。方法收集上海地区医院中真菌性阴道炎分离出的40株白假丝酵母菌,选择合适引物进行扩增,通过电泳比较分析获得REP-PCR分型。选择7对管家基因进行PCR反应并测序,将测序结果与标准序列进行比对,获得由7对管家基因组成的等位基因谱,最终得到相应的序列分型。结果 REP-PCR中Ca22-Ca22引物对得到电泳条带最优,40株白假丝酵母菌共分成7种REP-PCR型;MLST分型得出29种,且均为新型。结论 MLST分辨率较REP-PCR高,但由于REP-PCR分型方法更为快捷、经济,更适用于实验室大量菌株分型和临床分型。MLST则更客观,更适合用于进化学的研究及全球性流行病学的调查研究。
关键词
白假丝酵母菌
多位点序列分型技术
重复序列聚合酶链反应
基因分型
Keywords
Candida albicans
multilocus sequence typing
repetitive sequence-based polymerase chain reaction
genotyping
分类号
R379 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
重复序列PCR与多位点分型技术在白假丝酵母菌基因分型中的比较
魏冰
刘锦燕
史册
项明洁
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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