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胆汁酸的代谢稳态调控作用综述
被引量：
8
1
作者
李森
贾子衡
+4 位作者
魏雪睿
马赛
卢天成
李婷婷
顾燕云
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期1126-1130,共5页
胆汁酸是肝脏中胆固醇降解的主要产物,主要功能是促进肠道脂质吸收和运输。人体各组织器官中广泛分布着不同的胆汁酸受体,主要包括法尼醇X受体和G蛋白偶联受体。这2种受体因特异表达的脏器所感应胆汁酸成分及细胞内激发下游信号的不同,...
胆汁酸是肝脏中胆固醇降解的主要产物,主要功能是促进肠道脂质吸收和运输。人体各组织器官中广泛分布着不同的胆汁酸受体,主要包括法尼醇X受体和G蛋白偶联受体。这2种受体因特异表达的脏器所感应胆汁酸成分及细胞内激发下游信号的不同,各自介导了胆汁酸的多种生物学功能,包括胆汁酸自身的合成和运输、免疫调控以及糖脂代谢。研究发现,胆汁酸池的组分及容量受宿主和肠道菌群的双重影响。因此,胆汁酸信号可能是宿主和肠道共生菌群相互"对话"的重要途径,协调机体代谢稳态和肠道菌群生态平衡。文章对胆汁酸调节领域的研究进展和胆汁酸信号通路维持代谢稳态的相关机制进行综述。
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关键词
胆汁酸
胆汁酸受体
糖代谢
炎症
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职称材料
生物信息学方法筛选胰腺癌进展相关的核心基因
被引量：
3
2
作者
杨鹿笛
王高明
+2 位作者
胡仁豪
蒋小华
崔然
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期571-578,共8页
目的·筛选胰腺癌进展相关的核心基因和关键通路。方法·通过GEO(Gene Expression Omnibus)数据库检索筛选得到包含45例胰腺癌组织和45例癌旁正常组织的基因芯片数据集GSE28735。采用GEO2R在线分析工具提取癌组织及癌旁正常组...
目的·筛选胰腺癌进展相关的核心基因和关键通路。方法·通过GEO(Gene Expression Omnibus)数据库检索筛选得到包含45例胰腺癌组织和45例癌旁正常组织的基因芯片数据集GSE28735。采用GEO2R在线分析工具提取癌组织及癌旁正常组织的基因,联合RStudio软件筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并对其进行可视化处理。通过基因功能注释在线工具DAVID对差异表达显著的基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。利用交互基因检索工具STRING及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络,结合节点度值进一步筛选核心基因。通过基因表达谱分析数据库GEPIA对179例胰腺癌中核心基因的表达水平与患者总生存期(overall survival,OS)、无病生存期(disease free survival,DFS)及肿瘤分期的关系进行分析。结果·从GSE28735芯片中筛选得到131个DEGs,其中表达上调的基因115个,表达下调的基因16个。GO功能富集分析显示DEGs主要在细胞黏附、质膜、蛋白质结合方面富集。KEGG通路富集提示磷脂酰肌醇-3激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)是DEGs富集的主要信号通路。通过PPI网络筛选得到5个核心基因,分别为纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)、间质表皮转化因子(mesenchymal to epithelial transition factor,MET)、层粘连蛋白β3(polyclonal antibody to lamininβ3,LAMB3)、层粘连蛋白α3(laminin subunitα3,LAMA3)、整合素亚单位α3(integrin subunitα3,ITGA3)。MET、LAMA3、LAMB3和ITGA3的表达水平均与胰腺癌患者OS有关,仅MET、LAMB3和ITGA3的表达水平与胰腺癌患者DFS有关,且基因低表达组的预后明显优于基因高表达组。FN1、MET、LAMA3和LAMB3的表达水平在不同分期胰腺癌组织中的差异存在统计学意义。结论·胰腺癌中异常表达的FN1、MET、LAMB3、LAMA3、ITGA3与细胞黏附、质膜组分、蛋白质结合功能的改变和PI3K/AKT通路相关,MET和LAMB3的表达升高可能预示胰腺癌患者的不良预后。
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关键词
胰腺癌
生物信息学
差异表达基因
肿瘤发生
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职称材料
题名
胆汁酸的代谢稳态调控作用综述
被引量：
8
1
作者
李森
贾子衡
魏雪睿
马赛
卢天成
李婷婷
顾燕云
机构
上海交通大学医学院附属瑞金临床医学院
上海交通大学医学院
附属
瑞金
医院内分泌代谢病科
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期1126-1130,共5页
基金
上海交通大学医学院第13期大学生创新训练计划(1319193)
上海交通大学医学院高水平地方高校创新团队
国家自然科学基金(81870555)。
文摘
胆汁酸是肝脏中胆固醇降解的主要产物,主要功能是促进肠道脂质吸收和运输。人体各组织器官中广泛分布着不同的胆汁酸受体,主要包括法尼醇X受体和G蛋白偶联受体。这2种受体因特异表达的脏器所感应胆汁酸成分及细胞内激发下游信号的不同,各自介导了胆汁酸的多种生物学功能,包括胆汁酸自身的合成和运输、免疫调控以及糖脂代谢。研究发现,胆汁酸池的组分及容量受宿主和肠道菌群的双重影响。因此,胆汁酸信号可能是宿主和肠道共生菌群相互"对话"的重要途径,协调机体代谢稳态和肠道菌群生态平衡。文章对胆汁酸调节领域的研究进展和胆汁酸信号通路维持代谢稳态的相关机制进行综述。
关键词
胆汁酸
胆汁酸受体
糖代谢
炎症
Keywords
bile acid
bile acid receptor
glucose metabolism
inflammation
分类号
R589 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
生物信息学方法筛选胰腺癌进展相关的核心基因
被引量：
3
2
作者
杨鹿笛
王高明
胡仁豪
蒋小华
崔然
机构
上海交通大学医学院附属瑞金临床医学院
同济
大学
附属
东方医院普外科
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期571-578,共8页
基金
上海市卫生健康委员会科研课题(20204Y0302)。
文摘
目的·筛选胰腺癌进展相关的核心基因和关键通路。方法·通过GEO(Gene Expression Omnibus)数据库检索筛选得到包含45例胰腺癌组织和45例癌旁正常组织的基因芯片数据集GSE28735。采用GEO2R在线分析工具提取癌组织及癌旁正常组织的基因,联合RStudio软件筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并对其进行可视化处理。通过基因功能注释在线工具DAVID对差异表达显著的基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。利用交互基因检索工具STRING及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络,结合节点度值进一步筛选核心基因。通过基因表达谱分析数据库GEPIA对179例胰腺癌中核心基因的表达水平与患者总生存期(overall survival,OS)、无病生存期(disease free survival,DFS)及肿瘤分期的关系进行分析。结果·从GSE28735芯片中筛选得到131个DEGs,其中表达上调的基因115个,表达下调的基因16个。GO功能富集分析显示DEGs主要在细胞黏附、质膜、蛋白质结合方面富集。KEGG通路富集提示磷脂酰肌醇-3激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)是DEGs富集的主要信号通路。通过PPI网络筛选得到5个核心基因,分别为纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)、间质表皮转化因子(mesenchymal to epithelial transition factor,MET)、层粘连蛋白β3(polyclonal antibody to lamininβ3,LAMB3)、层粘连蛋白α3(laminin subunitα3,LAMA3)、整合素亚单位α3(integrin subunitα3,ITGA3)。MET、LAMA3、LAMB3和ITGA3的表达水平均与胰腺癌患者OS有关,仅MET、LAMB3和ITGA3的表达水平与胰腺癌患者DFS有关,且基因低表达组的预后明显优于基因高表达组。FN1、MET、LAMA3和LAMB3的表达水平在不同分期胰腺癌组织中的差异存在统计学意义。结论·胰腺癌中异常表达的FN1、MET、LAMB3、LAMA3、ITGA3与细胞黏附、质膜组分、蛋白质结合功能的改变和PI3K/AKT通路相关,MET和LAMB3的表达升高可能预示胰腺癌患者的不良预后。
关键词
胰腺癌
生物信息学
差异表达基因
肿瘤发生
Keywords
pancreatic cancer
bioinformatics
differentially expressed gene
tumorigenesis
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胆汁酸的代谢稳态调控作用综述
李森
贾子衡
魏雪睿
马赛
卢天成
李婷婷
顾燕云
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
生物信息学方法筛选胰腺癌进展相关的核心基因
杨鹿笛
王高明
胡仁豪
蒋小华
崔然
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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