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结直肠癌无进展生存时间预测模型及影响因素研究
1
作者 陈佳莹 褚以忞 彭海霞 《上海交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期324-334,共11页
目的·探究影响结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者无进展生存时间(progression-free survival,PFS)的风险因素,建立相应的预后预测模型。方法·采用回顾性队列研究,纳入上海交通大学医学院附属同仁医院的533例经手术切除并... 目的·探究影响结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者无进展生存时间(progression-free survival,PFS)的风险因素,建立相应的预后预测模型。方法·采用回顾性队列研究,纳入上海交通大学医学院附属同仁医院的533例经手术切除并病理确诊为结直肠腺癌的患者,按照7∶3的比例随机拆分为训练集(373例)和验证集(160例)。采用单因素和多因素Cox比例风险回归模型分析纳入的临床资料,分析CRC患者术后PFS的独立影响因素,并建立关于结直肠癌的临床预后预测模型。使用一致性指数(concordance index,C-index)、受试者操作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC曲线)下面积(area under the curve,AUC)、校准曲线、生存曲线评估预测模型的区分度和校准度。进一步通过多因素Cox回归分析确定不同年龄、性别以及美国癌症联合委员会(American Joint Committee on Cancer,AJCC)癌症分期人群预后的独立影响因素。结果·多因素Cox回归分析发现,年龄、吸烟史、肝脏疾病、糖类抗原724(carbohydrate antigen 724,CA724)、AJCC分期是PFS的独立影响因素。在训练集中,该PFS模型的C-index为0.69,3年和5年的AUC分别为0.744和0.713。在验证集中,该PFS模型的C-index为0.64,3年和5年的AUC分别为0.706和0.683。校准曲线图可见训练集和验证集的PFS预测校准曲线均趋近标准曲线。生存曲线提示低风险组患者的进展率显著低于高风险组。分层分析结果表明:对年龄≥65岁患者,年龄、肝脏疾病、AJCC临床分期是术后PFS的独立影响因素;对年龄<65岁的患者,吸烟史、CA724、AJCC临床分期是术后PFS的独立影响因素。对男性患者,年龄、吸烟史、CA724、AJCC临床分期是术后PFS的独立影响因素;对女性患者,肝脏疾病、CA724、AJCC临床分期是术后PFS的独立影响因素。对AJCC分期Ⅰ~Ⅱ期的患者,年龄和吸烟史是术后PFS的独立影响因素;对AJCC分期Ⅲ~Ⅳ期的患者,年龄、肝脏疾病和CA724是术后PFS的独立影响因素。结论·针对CRC患者建立的PFS预后模型具有较好区分能力,为临床医师提供了有效的风险评估工具。 展开更多
关键词 结直肠癌 无进展生存时间 影响因素 预测模型
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结直肠癌和结直肠腺瘤筛查方式的研究进展 被引量：12
2
作者 赵敏 褚以忞 彭海霞 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期673-679,共7页
近年来我国结直肠癌(colorectal cancer,CRC)发病率和死亡率呈上升趋势,严重威胁我国居民的生命健康,并造成了巨大的社会负担。筛查发现早期结直肠癌或腺瘤(癌前病变)可有效降低CRC发病率和死亡率。因此,在CRC的防治中,筛查的作用和意... 近年来我国结直肠癌(colorectal cancer,CRC)发病率和死亡率呈上升趋势,严重威胁我国居民的生命健康,并造成了巨大的社会负担。筛查发现早期结直肠癌或腺瘤(癌前病变)可有效降低CRC发病率和死亡率。因此,在CRC的防治中,筛查的作用和意义重大。CRC和结直肠腺瘤的筛查技术包括以下4种类型。①基于粪便的检查:粪便隐血试验(fecal occult based test,FOBT)、粪便DNA检测、粪便菌群标志物检测和粪便M2型丙酮酸激酶(M2 pruvate kinase,M2-PK)检测。②影像学检查:计算机断层结肠成像(computed tomo-graphic colonography,CTC)、双对比钡灌肠(double-contrast barium enema,DCBE)和结肠胶囊内镜检查(colon capsule endoscopy,CCE)。③内窥镜检查:柔性乙状结肠镜(flexible sigmoidoscopy,FS)和结肠镜(colonoscopy,CS)。④液体活检:循环肿瘤细胞、循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)、循环肿瘤RNA(circulating tumor RNAs,ctRNAs)、蛋白质标志物、细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)等。其中生物标志物DNA和RNA分子等可传达出丰富的人体健康状态信息,在筛查CRC中具有高敏感度和特异度,但在筛查腺瘤方面尚未广泛开展,需要对相关生物标志物开展更深入大规模的随机研究。该文对CRC和结直肠腺瘤筛查技术进行综述,介绍其原理、特点以及最新的研究进展,为CRC和结直肠腺瘤筛查技术在临床上的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 结直肠癌 结直肠腺瘤 筛查
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基于差异表达基因组合构建高度微卫星不稳定结直肠癌转移预测模型 被引量：3
3
作者 徐莹 褚以忞 +3 位作者 杨大明 李吉 张海芹 彭海霞 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1197-1206,共10页
目的·从转录组层面探究影响高度微卫星不稳定(microsatellite instability-high,MSI-H)结直肠癌转移的潜在关键基因及基因表达特征,并构建基因转移预测模型。方法·从癌症基因组图谱数据库中收集MSI-H结直肠癌患者转录组数据,... 目的·从转录组层面探究影响高度微卫星不稳定(microsatellite instability-high,MSI-H)结直肠癌转移的潜在关键基因及基因表达特征,并构建基因转移预测模型。方法·从癌症基因组图谱数据库中收集MSI-H结直肠癌患者转录组数据,根据转移信息分为转移组(21例)和无转移组(42例),分析2组间差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),以基因本体数据库(Gene Ontology,GO)、基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)对DEG进行注释、聚类及信号通路富集;使用STRING、Cytoscape软件筛选枢纽基因(hub基因);选取DEG绘制列线图,使用Bootstrap方法进行交叉验证;分析列线图中每个基因对MSI-H结直肠癌无进展生存期(progression-free survival,PFS)的影响。结果·转移组和无转移组间共得到245个DEGs,其中转移组较无转移组表达上调基因204个,下调基因41个。GO分析发现:DEG在生物过程、分子功能上主要富集于离子穿膜转运、氯离子穿膜转运及氯离子通道活性;在细胞组分中,富集于细胞外部分、细胞外空间等。GSEA结果显示:上调基因富集于神经活性物质配体-受体相互作用和代谢信号通路。通过Cytoscape筛选出上调基因蛋白质互作网络中的前10位的hub基因。根据DEG中调整后P值最小且与肿瘤发生发展关联性高的前10个基因构建的转移预测模型有一定的预测效能,其中训练集曲线下面积(area under curve,AUC)=0.975,验证集AUC=0.920;模型中AC078993.1、IGLJ2(immunoglobulin lambda joining 2)的表达水平与MSI-H结直肠癌PFS呈明显负相关(P=0.011,P=0.005)。结论·在MSI-H结直肠癌中,离子通道变化及细胞外环境变化可能对肿瘤转移有重要影响,神经活性物质配体-受体相互作用、代谢信号通路可能是对转移较重要的信号通路;初步构建了MSI-H结直肠癌基因转移预测模型,可为后续相关临床研究提供参考。 展开更多
关键词 结直肠癌 高度微卫星不稳定 转移 差异表达基因 生物信息学 列线图
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VTCN1调控结肠癌细胞长链非编码RNA和mRNA的全基因表达谱分析 被引量：2
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作者 褚以忞 周锋利 +5 位作者 徐莹 蒯榕 李吉 侯照远 杨大明 彭海霞 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期270-277,共8页
目的·探讨含V-set域T细胞激活抑制因子(V-set domain containing T cell activation inhibitor 1,VTCN1)在结肠癌中对下游长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA的调控作用。方法·利用慢病毒质粒在结肠癌细胞株SW1... 目的·探讨含V-set域T细胞激活抑制因子(V-set domain containing T cell activation inhibitor 1,VTCN1)在结肠癌中对下游长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA的调控作用。方法·利用慢病毒质粒在结肠癌细胞株SW1116中过表达VTCN1,抽提RNA并测序,与阴性对照组比较分析差异表达的lncRNA和m RNA,并任意选取差异表达的lncRNA(3条)和mRNA(2条)进行实时定量PCR(qRT-PCR)验证RNA测序结果的准确性。通过BLAST2GO和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析预测这些差异表达lncRNA和m RNA的相关功能。利用线上平台GEPIA18(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)分析差异表达lncRNA与结直肠癌患者生存期的相关性。结果·通过RNA测序在过表达VTCN1的SW1116细胞中发现了167条差异基因,包括39条lncRNA和128条m RNA。qRT-PCR检验结果与RNA测序结果变化趋势一致。生物信息学分析结果显示这些受VTCN1调控的差异基因可能参与了内质网中的蛋白处理、mRNA监控信号通路。另外,在过表达VTCN1的结肠癌细胞中明显上调的3条lncRNA(DNAJC9-AS1、HCG27和RP11-339B21.13),同时也是预测结直肠癌患者总生存期的独立因子。结论·在结肠癌细胞中VTCN1对下游多条lncRNA和mRNA具有调控作用,这些lncRNA和mRNA可能参与了内质网中的蛋白处理和mRNA监控信号通路。 展开更多
关键词 含V-set域T细胞激活抑制因子 结肠癌 长链非编码RNA RNA测序 生物信息学分析
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DLC1不同亚型对结肠癌细胞增殖及迁移的抑制作用
5
作者 彭海霞 侯明月 +7 位作者 褚以忞 杨大明 周锋利 蒯榕 徐莹 侯照远 李吉 金震东 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期17-22,共6页
目的探讨肝癌缺失基因1(DLC1)不同亚型对结肠癌细胞系增殖及迁移的抑制作用。方法通过qRT-PCR检测DLC1不同亚型在17对结肠癌组织与正常组织中的表达水平;同时过表达不同亚型的慢病毒感染结肠癌细胞SW1116,通过CCK8及Transwell实验观察... 目的探讨肝癌缺失基因1(DLC1)不同亚型对结肠癌细胞系增殖及迁移的抑制作用。方法通过qRT-PCR检测DLC1不同亚型在17对结肠癌组织与正常组织中的表达水平;同时过表达不同亚型的慢病毒感染结肠癌细胞SW1116,通过CCK8及Transwell实验观察不同亚型对结肠癌细胞株增殖及迁移的作用。结果 DLC1不同亚型在结肠癌组织中的表达均显著低于癌旁组织;过表达DLC1能够抑制结肠癌细胞系SW1116的增殖及迁移,其中DLC1亚型2(DLC1-isoform2)的作用效果最强。结论 DLC1的不同亚型在结肠癌组织中的表达均低于癌旁组织,DLC1-isoform2对抑制结肠癌细胞的增殖及迁移作用最强。 展开更多
关键词 结肠癌 肝癌缺失基因1 亚型 增殖 迁移
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散发性结直肠癌DNA错配修复系统蛋白表达及其临床意义 被引量：11
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作者 孙伟杰 徐莹 +4 位作者 杨静 褚以忞 杨大明 李吉 彭海霞 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期759-763,共5页
目的·探讨DNA错配修复(mismatch repair,MMR)系统蛋白MLH1(mutL homolog1)、MSH2(mutS homolog2)、MSH6(mutS homolog6)和PMS2(postmeiotic segregation increased2)在散发性结直肠癌(sporadic colorectal carcinoma,SCRC)中的表... 目的·探讨DNA错配修复(mismatch repair,MMR)系统蛋白MLH1(mutL homolog1)、MSH2(mutS homolog2)、MSH6(mutS homolog6)和PMS2(postmeiotic segregation increased2)在散发性结直肠癌(sporadic colorectal carcinoma,SCRC)中的表达及与临床病理特征之间的关系。方法·收集2014年4月-2018年8月在上海交通大学医学院附属同仁医院行结直肠癌根治术的SCRC患者的癌组织样本。采用免疫组织化学法检测符合标准的209例患者的结直肠癌组织样本中的MLH1、MSH2、MSH6、PMS2和p53蛋白,并对其中67例癌组织行荧光定量PCR检测KRAS癌基因突变情况。结果·209例患者的癌组织中,MLH1、MSH2、MSH6及PMS2蛋白缺失率分别为17.2%(36/209)、2.4%(5/209)、12.9%(27/209)、16.7%(35/209)。MMR系统蛋白总的缺失率为30.1%(63/209),在55岁以下、肿瘤位于右半结肠、肿瘤直径>6cm及黏液腺癌的SCRC患者中较高(均P<0.05)。p53基因突变患者的MLH1缺失率显著高于未突变患者(P=0.012),KRAS基因突变患者的MLH1缺失率显著低于未突变患者(P=0.044)。这些SCRC患者中,MLH1和PMS2蛋白阳性表达率差异无统计学意义(P=1.000)。结论·MMR系统蛋白缺失可能与SCRC患者年龄、肿瘤位置、肿瘤大小和病理组织分型相关,MLH1蛋白缺失可能与p53基因及KRAS基因的突变相关。 展开更多
关键词 散发性结直肠癌 错配修复 MLH1 免疫组织化学
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