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最小二乘支持向量机算法在中医临床脉图参数﹣血压预测模型的应用
被引量：
3
1
作者
杨晶东
孙磊明
燕海霞
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期492-496,共5页
目的提出基于最小二乘支持向量机(LSSVM)算法的学习模型,以提高中医临床血压数据预测的准确度和效率。方法将LSSVM学习模型应用于中医临床血压数据预测。用LSSVM等式约束代替支持向量机不等式约束,将二次规划问题转化为线性方程求解问题...
目的提出基于最小二乘支持向量机(LSSVM)算法的学习模型,以提高中医临床血压数据预测的准确度和效率。方法将LSSVM学习模型应用于中医临床血压数据预测。用LSSVM等式约束代替支持向量机不等式约束,将二次规划问题转化为线性方程求解问题,降低计算复杂性,加快算法收敛速度。收集320例患者的临床脉图参数及血压数据,以其中300例样本作为训练样本,训练得到LSSVM学习模型,以其余20例样本作为测试数据,用得到的LSSVM学习模型根据患者的脉图参数预测血压数据。结果实验证明,LSSVM学习模型对血压数据有较好的预测准确度。其中基于多项式核函数的LSSVM学习模型较基于径向基核函数LSSVM学习模型表现出更好的学习和预测能力,基于多项式核函数的LSSVM学习模型中收缩压、舒张压、平均动脉压预测结果的平均预测误差分别为7.88%、8.40%、6.67%,低于基于径向基核函数的LSSVM学习模型的预测误差(分别为7.95%、9.70%、7.48%)。结论本实验提出的基于LSSVM的学习模型仅通过患者的临床脉图参数就可预测患者血压数据,对中医学临床诊断有一定的参考价值。
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关键词
中国传统医学
脉图参数
血压
支持向量机
核函数
最小二乘法分析
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职称材料
中西方心身关系认识的历史追寻
2
作者
王宁
倪红梅
+1 位作者
何裕民
沈红艺
《中华中医药学刊》
CAS
2012年第12期2630-2632,共3页
心身和谐是目前大家对健康的共识。人们对心身关系的认识中西方都经历了漫长的过程,留给我们很多丰富而宝贵的资料。东西方文化由于受到地域的阻隔,在相对独立的状态下走过了漫长的认知发展过程,有共性,又各自有其特点。通过对中西方古...
心身和谐是目前大家对健康的共识。人们对心身关系的认识中西方都经历了漫长的过程,留给我们很多丰富而宝贵的资料。东西方文化由于受到地域的阻隔,在相对独立的状态下走过了漫长的认知发展过程,有共性,又各自有其特点。通过对中西方古代形神观早期形成的回顾,进行比较分析。
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关键词
心身关系
形神
灵魂
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职称材料
基于网络药理学及实验验证探讨甘草苷治疗帕金森病的作用机制
3
作者
曲欣妮
李文标
+5 位作者
王利
沈隽吉
殷宇晴
徐缘博
何建成
许言午
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2023年第5期1689-1701,共13页
目的应用网络药理学方法预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证。方法从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获取甘草苷的作用靶点,从OMIM、GeneCards、...
目的应用网络药理学方法预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证。方法从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获取甘草苷的作用靶点,从OMIM、GeneCards、CTD等数据库获取帕金森病相关基因。将甘草苷的预测靶点和帕金森病相关基因取交集,通过Cytoscape软件利用交集靶点构建“药物-靶点-疾病”网络并进行可视化;运用Cytoscape软件的BisoGenet插件对交集靶点构建PPI网络,通过CytoNCA插件进行拓扑学计算并经度中心性(Degree centrality,DC)和中介中心性(Between centrality,BC)两步筛选获得核心PPI网络;采用R软件运行Bioconductor程序包进行GO和KEGG富集分析;运用Cytoscape软件构建“基因-通路”网络,筛选出网络的关键靶点,并将其与甘草苷进行分子对接;采用Western blot方法验证甘草苷对6-羟基多巴胺(6-hydroxydopamine,6-OHDA)诱导的SH-SY5Y细胞Caspase-3、Bax、Bcl-2、p-PI3K和p-AKT等凋亡通路关键蛋白表达与活化的调控作用。结果共获得甘草苷靶点343个,帕金森病相关基因1328个,二者交集靶点为46个;经拓扑学分析获得核心PPI网络,包含108个节点和2298条边;GO功能分析得到的1543个条目主要与凋亡调控、细胞周期与节律、DNA合成及分解代谢有关;凋亡、PI3K-AKT、NF-κB、TGF-β、HIF-1、FoxO等97条KEGG信号通路被显著富集;“基因-通路”中筛选的关键蛋白及分子对接结果显示TP53、AKT1及RELA可能是甘草苷治疗帕金森病的关键靶点;Western blot结果显示,与6-OHDA组相比,给与甘草苷处理后Bax和Cleaved-Caspase-3的表达水平明显减少(P<0.05),Bcl-2的表达水平显著增加(P<0.01);p-PI3K和p-AKT磷酸化水平明显增多(P<0.01)。结论网络药理学分析提示甘草苷可通过调控多种生物学过程和相关信号途径治疗帕金森病;细胞水平实验证明了甘草苷对6-OHDA损伤神经细胞的保护作用,并初步证实了其对凋亡信号通路的调控作用,为进一步阐明甘草苷治疗帕金森病的分子机制奠定了基础。
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关键词
网络药理学
甘草苷
帕金森病
机制
凋亡
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职称材料
题名
最小二乘支持向量机算法在中医临床脉图参数﹣血压预测模型的应用
被引量：
3
1
作者
杨晶东
孙磊明
燕海霞
机构
上海
理工
大学
光电信息与计算机工程
学院
自主机器人实验室
上海中医药大学
基础
医学院
中医
诊断
教研室
出处
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期492-496,共5页
基金
国家自然科学基金(61374039)
上海市自然科学基金(15ZR1429100)
沪江基金(C14002)~~
文摘
目的提出基于最小二乘支持向量机(LSSVM)算法的学习模型,以提高中医临床血压数据预测的准确度和效率。方法将LSSVM学习模型应用于中医临床血压数据预测。用LSSVM等式约束代替支持向量机不等式约束,将二次规划问题转化为线性方程求解问题,降低计算复杂性,加快算法收敛速度。收集320例患者的临床脉图参数及血压数据,以其中300例样本作为训练样本,训练得到LSSVM学习模型,以其余20例样本作为测试数据,用得到的LSSVM学习模型根据患者的脉图参数预测血压数据。结果实验证明,LSSVM学习模型对血压数据有较好的预测准确度。其中基于多项式核函数的LSSVM学习模型较基于径向基核函数LSSVM学习模型表现出更好的学习和预测能力,基于多项式核函数的LSSVM学习模型中收缩压、舒张压、平均动脉压预测结果的平均预测误差分别为7.88%、8.40%、6.67%,低于基于径向基核函数的LSSVM学习模型的预测误差(分别为7.95%、9.70%、7.48%)。结论本实验提出的基于LSSVM的学习模型仅通过患者的临床脉图参数就可预测患者血压数据,对中医学临床诊断有一定的参考价值。
关键词
中国传统医学
脉图参数
血压
支持向量机
核函数
最小二乘法分析
Keywords
traditional Chinese medicine
pulse diagram parameters
blood pressure
support vector machine
kernel function
least-squares analysis
分类号
R241.1 [医药卫生—中医诊断学]
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职称材料
题名
中西方心身关系认识的历史追寻
2
作者
王宁
倪红梅
何裕民
沈红艺
机构
上海中医药大学
基础
医学院
中医
基础
教研室
上海中医药大学
科研处营养健康
教研室
出处
《中华中医药学刊》
CAS
2012年第12期2630-2632,共3页
基金
国家"十一五"科技支撑计划重点资助项目(2006BAI13B01)
上海市卫生局科研资助项目(F447)
上海市教育委员会资助项目(2010JW29)
文摘
心身和谐是目前大家对健康的共识。人们对心身关系的认识中西方都经历了漫长的过程,留给我们很多丰富而宝贵的资料。东西方文化由于受到地域的阻隔,在相对独立的状态下走过了漫长的认知发展过程,有共性,又各自有其特点。通过对中西方古代形神观早期形成的回顾,进行比较分析。
关键词
心身关系
形神
灵魂
Keywords
relationship between physical and mental
body and spirit
soul
分类号
R749.053 [医药卫生—神经病学与精神病学]
在线阅读
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职称材料
题名
基于网络药理学及实验验证探讨甘草苷治疗帕金森病的作用机制
3
作者
曲欣妮
李文标
王利
沈隽吉
殷宇晴
徐缘博
何建成
许言午
机构
上海中医药大学
基础
医学院
生物化学
教研室
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2023年第5期1689-1701,共13页
基金
国家自然科学基金委员会青年项目(8210152629):基于Nrf2/HMOX-1铁死亡信号通路探讨复方地黄颗粒治疗帕金森病的机制,负责人:王利
上海市生物医药领域科技支撑项目(20S21901700):中药复方芪脊颗粒治疗帕金森病的临床前研究,负责人:何建成
文摘
目的应用网络药理学方法预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证。方法从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获取甘草苷的作用靶点,从OMIM、GeneCards、CTD等数据库获取帕金森病相关基因。将甘草苷的预测靶点和帕金森病相关基因取交集,通过Cytoscape软件利用交集靶点构建“药物-靶点-疾病”网络并进行可视化;运用Cytoscape软件的BisoGenet插件对交集靶点构建PPI网络,通过CytoNCA插件进行拓扑学计算并经度中心性(Degree centrality,DC)和中介中心性(Between centrality,BC)两步筛选获得核心PPI网络;采用R软件运行Bioconductor程序包进行GO和KEGG富集分析;运用Cytoscape软件构建“基因-通路”网络,筛选出网络的关键靶点,并将其与甘草苷进行分子对接;采用Western blot方法验证甘草苷对6-羟基多巴胺(6-hydroxydopamine,6-OHDA)诱导的SH-SY5Y细胞Caspase-3、Bax、Bcl-2、p-PI3K和p-AKT等凋亡通路关键蛋白表达与活化的调控作用。结果共获得甘草苷靶点343个,帕金森病相关基因1328个,二者交集靶点为46个;经拓扑学分析获得核心PPI网络,包含108个节点和2298条边;GO功能分析得到的1543个条目主要与凋亡调控、细胞周期与节律、DNA合成及分解代谢有关;凋亡、PI3K-AKT、NF-κB、TGF-β、HIF-1、FoxO等97条KEGG信号通路被显著富集;“基因-通路”中筛选的关键蛋白及分子对接结果显示TP53、AKT1及RELA可能是甘草苷治疗帕金森病的关键靶点;Western blot结果显示,与6-OHDA组相比,给与甘草苷处理后Bax和Cleaved-Caspase-3的表达水平明显减少(P<0.05),Bcl-2的表达水平显著增加(P<0.01);p-PI3K和p-AKT磷酸化水平明显增多(P<0.01)。结论网络药理学分析提示甘草苷可通过调控多种生物学过程和相关信号途径治疗帕金森病;细胞水平实验证明了甘草苷对6-OHDA损伤神经细胞的保护作用,并初步证实了其对凋亡信号通路的调控作用,为进一步阐明甘草苷治疗帕金森病的分子机制奠定了基础。
关键词
网络药理学
甘草苷
帕金森病
机制
凋亡
Keywords
Network pharmacology
Liquiritin
Parkinson disease
Mechanism
Apoptosis
分类号
R285 [医药卫生]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
最小二乘支持向量机算法在中医临床脉图参数﹣血压预测模型的应用
杨晶东
孙磊明
燕海霞
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
中西方心身关系认识的历史追寻
王宁
倪红梅
何裕民
沈红艺
《中华中医药学刊》
CAS
2012
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于网络药理学及实验验证探讨甘草苷治疗帕金森病的作用机制
曲欣妮
李文标
王利
沈隽吉
殷宇晴
徐缘博
何建成
许言午
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2023
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