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基因表达连续分析标签数据库的实时定量多聚酶链反应验证
被引量：
1
1
作者
尹磊淼
张庆华
+2 位作者
王宇
徐玉东
杨永清
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期51-54,共4页
目的采用实时定量多聚酶链反应(PCR)技术验证不同丰度和匹配度的基因表达序列标签,尝试用该技术补充和完善高通量基因表达谱的结果。方法根据各基因序列全长设计引物,选择9个单匹配标签,6个多匹配标签,1个美国国家生物技术信息中心(NCBI...
目的采用实时定量多聚酶链反应(PCR)技术验证不同丰度和匹配度的基因表达序列标签,尝试用该技术补充和完善高通量基因表达谱的结果。方法根据各基因序列全长设计引物,选择9个单匹配标签,6个多匹配标签,1个美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库更新后无匹配标签和2个无匹配基因进行实时定量PCR验证。结果挑选的所有基因均得到特异性扩增。基因表达量分析结果显示,基因表达连续分析(SAGE)文库中9个单匹配标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;6个多匹配标签中有3个标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;1个NCBI数据库更新后无匹配标签表达趋势和定量结果相反;2个无匹配基因表达量数据提示两组间没有显著性差别。结论实时定量PCR技术是验证SAGE等高通量数据的可靠工具之一。SAGE文库标签匹配度可影响数据的可信度。
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关键词
基因表达连续分析
实时定量多聚酶链反应
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职称材料
题名
基因表达连续分析标签数据库的实时定量多聚酶链反应验证
被引量：
1
1
作者
尹磊淼
张庆华
王宇
徐玉东
杨永清
机构
上海中医药大学上海市针灸经络研究所神经生物研究室
生物
芯片
上海
国家工程
研究
中心
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期51-54,共4页
基金
国家自然科学基金(30873299
90409014
30701 123)~~
文摘
目的采用实时定量多聚酶链反应(PCR)技术验证不同丰度和匹配度的基因表达序列标签,尝试用该技术补充和完善高通量基因表达谱的结果。方法根据各基因序列全长设计引物,选择9个单匹配标签,6个多匹配标签,1个美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库更新后无匹配标签和2个无匹配基因进行实时定量PCR验证。结果挑选的所有基因均得到特异性扩增。基因表达量分析结果显示,基因表达连续分析(SAGE)文库中9个单匹配标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;6个多匹配标签中有3个标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;1个NCBI数据库更新后无匹配标签表达趋势和定量结果相反;2个无匹配基因表达量数据提示两组间没有显著性差别。结论实时定量PCR技术是验证SAGE等高通量数据的可靠工具之一。SAGE文库标签匹配度可影响数据的可信度。
关键词
基因表达连续分析
实时定量多聚酶链反应
Keywords
serial analysis of gene expression
real-time polymerase chain reaction
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基因表达连续分析标签数据库的实时定量多聚酶链反应验证
尹磊淼
张庆华
王宇
徐玉东
杨永清
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
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