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文心兰软腐病菌Dickeya fangzhongdai Onc5 vfmE基因的克隆及表达分析
1
作者
王文婷
任驰
+2 位作者
丁建华
荆恩荣
卢秋巍
《热带作物学报》
北大核心
2025年第3期544-552,共9页
狄克氏菌(Dickeya fangzhongdai)是引起兰科植物毁灭性病害软腐病(soft rot disease)的主要病原菌之一。病原菌致病基因在病原菌与植物互作中发挥至关重要的作用。软腐病菌D.fangzhongdai Onc5从福建南茜文心兰(Oncidium,Gower Ramsey)...
狄克氏菌(Dickeya fangzhongdai)是引起兰科植物毁灭性病害软腐病(soft rot disease)的主要病原菌之一。病原菌致病基因在病原菌与植物互作中发挥至关重要的作用。软腐病菌D.fangzhongdai Onc5从福建南茜文心兰(Oncidium,Gower Ramsey)软腐病患病植株中分离而来。本研究旨在明确D.fangzhongdai Onc5 vfmE基因的分子生物学特征,并分析其在侵染寄主过程中的作用,为揭示vfmE基因在D.fangzhongdai Onc5侵染寄主过程中的致病机制提供理论依据。本研究以D.fangzhongdai Onc5基因组DNA为模版,通过RT-PCR扩增,成功获得vfmE基因,并进行生物信息学分析;利用RT-qPCR分析vfmE基因在D.fangzhongdai Onc5侵染文心兰过程中的表达情况。结果表明:D.fangzhongdai Onc5 vfmE基因的ORF为564 bp,编码187个氨基酸;vfmE蛋白质的分子质量为21.93 kDa,理论等电点(pI)为9.01,含1个AraC超家族结构域;vfmE蛋白质为结构不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,不存在跨膜结构域;其蛋白质二级结构主要为α-螺旋(58.29%)和无规则卷曲(40.64%);同源性分析表明,其氨基酸序列与Dickeya属其他菌种的vfmE序列具有很高的相似性(>86%);RT-qPCR分析表明:vfmE基因在D.fangzhongdai Onc5侵染文心兰叶片和假鳞茎后均持续高表达,在12 h的表达量最高(P<0.01),表明vfmE蛋白在D.fangzhongdai Onc5侵染文心兰的过程中发挥着重要的作用。本研究结果为进一步研究vfmE基因功能和Dickeya属病原菌致病机制提供提论基础,同时也有利于发展植物软腐病新的防治靶标。
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关键词
狄克氏菌
vfme
基因
克隆
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
题名
文心兰软腐病菌Dickeya fangzhongdai Onc5 vfmE基因的克隆及表达分析
1
作者
王文婷
任驰
丁建华
荆恩荣
卢秋巍
机构
忻州师范学院生物系
出处
《热带作物学报》
北大核心
2025年第3期544-552,共9页
基金
山西省科技厅基础研究计划项目(No.20210302124516,No.20210302124502)
山西省高校科技创新计划项目(No.2021L462)。
文摘
狄克氏菌(Dickeya fangzhongdai)是引起兰科植物毁灭性病害软腐病(soft rot disease)的主要病原菌之一。病原菌致病基因在病原菌与植物互作中发挥至关重要的作用。软腐病菌D.fangzhongdai Onc5从福建南茜文心兰(Oncidium,Gower Ramsey)软腐病患病植株中分离而来。本研究旨在明确D.fangzhongdai Onc5 vfmE基因的分子生物学特征,并分析其在侵染寄主过程中的作用,为揭示vfmE基因在D.fangzhongdai Onc5侵染寄主过程中的致病机制提供理论依据。本研究以D.fangzhongdai Onc5基因组DNA为模版,通过RT-PCR扩增,成功获得vfmE基因,并进行生物信息学分析;利用RT-qPCR分析vfmE基因在D.fangzhongdai Onc5侵染文心兰过程中的表达情况。结果表明:D.fangzhongdai Onc5 vfmE基因的ORF为564 bp,编码187个氨基酸;vfmE蛋白质的分子质量为21.93 kDa,理论等电点(pI)为9.01,含1个AraC超家族结构域;vfmE蛋白质为结构不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,不存在跨膜结构域;其蛋白质二级结构主要为α-螺旋(58.29%)和无规则卷曲(40.64%);同源性分析表明,其氨基酸序列与Dickeya属其他菌种的vfmE序列具有很高的相似性(>86%);RT-qPCR分析表明:vfmE基因在D.fangzhongdai Onc5侵染文心兰叶片和假鳞茎后均持续高表达,在12 h的表达量最高(P<0.01),表明vfmE蛋白在D.fangzhongdai Onc5侵染文心兰的过程中发挥着重要的作用。本研究结果为进一步研究vfmE基因功能和Dickeya属病原菌致病机制提供提论基础,同时也有利于发展植物软腐病新的防治靶标。
关键词
狄克氏菌
vfme
基因
克隆
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Dickeya fangzhongdai Onc5
vfme gene
cloning
bioinformatics analysis
expression analysis
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
文心兰软腐病菌Dickeya fangzhongdai Onc5 vfmE基因的克隆及表达分析
王文婷
任驰
丁建华
荆恩荣
卢秋巍
《热带作物学报》
北大核心
2025
0
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