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融合IMR-WGAN的时序数据修复方法 被引量:1
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作者 孟祥福 马荣国 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2024年第3期641-650,共10页
工业数据由于技术故障和人为因素通常导致数据异常,现有基于约束的方法因约束阈值设置的过于宽松或严格会导致修复错误,基于统计的方法因平滑修复机制导致对时间步长较远的异常值修复准确度较低.针对上述问题,提出了基于奖励机制的最小... 工业数据由于技术故障和人为因素通常导致数据异常,现有基于约束的方法因约束阈值设置的过于宽松或严格会导致修复错误,基于统计的方法因平滑修复机制导致对时间步长较远的异常值修复准确度较低.针对上述问题,提出了基于奖励机制的最小迭代修复和改进WGAN混合模型的时序数据修复方法.首先,在预处理阶段,保留异常数据,进行信息标注等处理,从而充分挖掘异常值与真实值之间的特征约束.其次,在噪声模块提出了近邻参数裁剪规则,用于修正最小迭代修复公式生成的噪声向量.将其传递至模拟分布模块的生成器中,同时设计了一个动态时间注意力网络层,用于提取时序特征权重并与门控循环单元串联组合捕捉不同步长的特征依赖,并引入递归多步预测原理共同提升模型的表达能力;在判别器中设计了Abnormal and Truth奖励机制和Weighted Mean Square Error损失函数共同反向优化生成器修复数据的细节和质量.最后,在公开数据集和真实数据集上的实验结果表明,该方法的修复准确度与模型稳定性显著优于现有方法. 展开更多
关键词 数据修复 改进Wasserstein生成对抗网络 Abnormal and Truth奖励机制 动态时间注意力机制 weighted Mean Square Error损失函数
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动态加权蛋白质相互作用网络构建及其应用研究 被引量:10
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作者 胡赛 熊慧军 +2 位作者 赵碧海 李学勇 王晶 《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2015年第11期1893-1900,共8页
一个蛋白质可能在不同条件或不同时刻与不同的蛋白质发生相互作用,这称为蛋白质的动态特性.蛋白质在分子处理的不同阶段参与到不同的模块,与其他的蛋白质共同完成某项功能.因此,动态蛋白质相互作用的研究有助于提高蛋白质功能预测的准确... 一个蛋白质可能在不同条件或不同时刻与不同的蛋白质发生相互作用,这称为蛋白质的动态特性.蛋白质在分子处理的不同阶段参与到不同的模块,与其他的蛋白质共同完成某项功能.因此,动态蛋白质相互作用的研究有助于提高蛋白质功能预测的准确率.结合蛋白质相互作用网络和时间序列基因表达数据,构建动态蛋白质相互作用网络.为降低PPI网络中假阴性对功能预测产生的负面影响,结合结构域信息和复合物信息,预测和产生新的相互作用,并对相互作用加权.基于构建的动态加权网络,提出一种功能预测方法 D-PIN(Dynamic protein interaction networks).基于三个不同的酵母相互作用网络实验结果表明,D-PIN方法的综合性能比现有方法提高了14%以上.结果验证了构建的动态加权蛋白质相互网络的有效性. 展开更多
关键词 动态加权网络 功能预测 蛋白质相互作用网络 基因表达
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基于时序加权PPI网络的关键蛋白质识别 被引量:3
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作者 胡健 朱海湾 毛伊敏 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2019年第23期150-162,共13页
关键蛋白质是生物体内一切生命活动中不可缺少的物质基础,关键蛋白质的识别不仅可以从理论上理解生命活动机理,同时在实际应用中为药物研制、疾病治疗提供重要基础。目前,现有的关键蛋白质识别算法大多应用在静态PPI网络上,忽略了蛋白... 关键蛋白质是生物体内一切生命活动中不可缺少的物质基础,关键蛋白质的识别不仅可以从理论上理解生命活动机理,同时在实际应用中为药物研制、疾病治疗提供重要基础。目前,现有的关键蛋白质识别算法大多应用在静态PPI网络上,忽略了蛋白质的动态性和保守性,只考虑网络拓扑结构,忽略了蛋白质的生物特性,并且未能完全解决PPI网络中假阳性和假阴性问题。针对以上问题,构建一种混合动态保守蛋白质的时序加权PPI网络,并提出一种名为JTBC(Joint Topological properties,Biological properties and Complexes information)的关键蛋白质识别算法。利用基因表达数据提取动态蛋白质和保守蛋白质的活性信息,以动态调整静态PPI网络进而构建时序PPI网络,有效降低了PPI网络中的假阴性;设计一种融合双重拓扑特性的点边凝聚度DEcc(node and edge cohesion coefficient),以衡量蛋白质在PPI网络中的拓扑特性,再结合带有生物特性的蛋白质结构域信息和皮尔逊相关系数为时序PPI网络加权,以准确描述蛋白质之间的相互作用,减少了假阳性的影响;根据关键蛋白质的聚集特性和共表达特性,设计一种共表达复合物中心性方法局部评估蛋白质的重要程度。综上考虑,整合权重信息和蛋白质复合物信息来综合衡量蛋白质的关键性。实验结果表明该算法能够从全局和局部特性较准确地识别关键蛋白质。 展开更多
关键词 关键蛋白质 保守蛋白质 混合动态保守蛋白质的时序加权网络 蛋白质结构域 共表达复合物中心性
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基于改进熵权法与时序算子的配网规划适应性动态评价 被引量:2
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作者 李丹 张翔宇 +2 位作者 荣梦蕾 宋毅 谭忠富 《水电能源科学》 北大核心 2017年第10期193-197,共5页
鉴于配网规划受内、外部因素的共同影响,采用解释结构模型法提取关键外部适应性指标,构建配网规划适应性指标体系,应用最小二乘法对熵权法得到的客观权重进行优化,进而采用时序算子动态评价模型对指标体系进行综合评价。对浙江省某地区... 鉴于配网规划受内、外部因素的共同影响,采用解释结构模型法提取关键外部适应性指标,构建配网规划适应性指标体系,应用最小二乘法对熵权法得到的客观权重进行优化,进而采用时序算子动态评价模型对指标体系进行综合评价。对浙江省某地区的三个配网规划方案的评价结果表明,利用该评价体系与评价方法可获得配网规划适应性的优劣排序,该评价方法能更好地适应内外部影响因子随时间发展而带来的变动。 展开更多
关键词 配网规划适应性 熵权法 最小二乘法 时序算子 动态评价
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基于动态加权PPI网络的关键蛋白质识别算法 被引量:5
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作者 杨书新 鲁纪华 汤达荣 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2019年第2期367-370,379,共5页
与静态PPI网络相比,动态PPI网络更能体现蛋白质之间相互作用的真实情况,并有效降低PPI网络中的假阴性。现有的关键蛋白质预测方法主要应用在静态PPI网络,忽视了PPI网络的动态特性。为有效预测关键蛋白质,利用基因表达数据提取蛋白质的... 与静态PPI网络相比,动态PPI网络更能体现蛋白质之间相互作用的真实情况,并有效降低PPI网络中的假阴性。现有的关键蛋白质预测方法主要应用在静态PPI网络,忽视了PPI网络的动态特性。为有效预测关键蛋白质,利用基因表达数据提取蛋白质的动态信息,再结合静态PPI网络构建动态PPI网络,然后引入GO术语对网络加权,并基于动态加权PPI网络提出一种新的预测方法——DWE。该方法以蛋白质在动态网络中的动态加权边之和与蛋白质在动态网络中出现的次数的比值衡量蛋白质在网络中的关键性。实验结果表明动态加权PPI网络有助于提高关键蛋白质的预测精度,且DWE方法优于其他几种关键蛋白质预测方法。 展开更多
关键词 动态网络 关键蛋白质 GO术语 动态加权PPI网络
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基于加权非负矩阵分解的链接预测算法 被引量:2
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作者 王萌萌 左万利 王英 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第10期2391-2397,共7页
本文针对在线微博,首先,基于带权动态链接预测特征集合,以用户社会关系因子约束目标函数,从用户概要和用户发布内容两个维度利用非负矩阵分解方法预测社会网络中链接的存在性和方向性.然后,在真实的数据集上验证了提出框架的有效性,并... 本文针对在线微博,首先,基于带权动态链接预测特征集合,以用户社会关系因子约束目标函数,从用户概要和用户发布内容两个维度利用非负矩阵分解方法预测社会网络中链接的存在性和方向性.然后,在真实的数据集上验证了提出框架的有效性,并通过实验进一步证明了特征权重和时间信息在链接预测问题中的重要性. 展开更多
关键词 有向链接预测 非负矩阵分解 特征权重 时间信息 动态社会网络
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基于时序网络记忆效应的意见领袖动态识别 被引量:3
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作者 朱义鑫 朱恺 《计算机工程与设计》 北大核心 2023年第2期343-348,共6页
使用微博用户互动数据构建的社交时序网络,通过用户互动强度优化权重分配改进PageRank算法,计算网络快照中各节点影响力,引入网络快照的记忆效应参数,得到动态的意见领袖识别算法。F-Measure值的对比实验结果表明,该算法的准确率优于Pag... 使用微博用户互动数据构建的社交时序网络,通过用户互动强度优化权重分配改进PageRank算法,计算网络快照中各节点影响力,引入网络快照的记忆效应参数,得到动态的意见领袖识别算法。F-Measure值的对比实验结果表明,该算法的准确率优于PageRank算法、HITS算法;记忆效应衰减率的不同取值对该意见领袖动态识别算法准确率有显著影响,为网络舆情的动态监管提供了一种方法和手段。 展开更多
关键词 网络舆情 时序网络 互动强度 权重分配 记忆效应 意见领袖 动态识别
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