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题名基因重复驱动的演化:基因组学时代的回顾与展望
被引量：1
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作者
沈洁宇
苏天晗
余大奇
谭生军
张勇
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机构
中国科学院动物研究所
中国科学院大学
北京星辰集因科技有限责任公司
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出处
《遗传》
北大核心
2025年第2期147-171,共25页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:32325014)
国家重点研发计划项目(编号:2019YFA0802600)
中国科学院基础前沿科学研究计划(编号:ZDBS-LY-SM005)资助。
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文摘
基因重复指基因组中一个基因通过多样化的分子机制从一个基因拷贝形成两个或多个重复拷贝的过程,是新基因起源的重要途径之一,对真核生物基因组贡献了约为一半的基因,也推动了物种的适应性演化。在过去50年中,特别是近20年进入组学时代以来,演化遗传学领域对于重复基因的产生机制、演化历程与演化动力展开了广泛而深入的讨论。一方面,重复基因的序列相似性带来的功能冗余使机体具有更强的稳健性;另一方面,重复基因的功能分歧带来了新功能与可演化性的提升。本文全面介绍了上述基因重复的机制、重复基因的命运及演化模型,最后展望了三代测序技术、基因编辑等各种高通量技术将进一步推动重复基因在遗传-发育-演化网络中角色的解析。
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关键词
基因重复
全基因组重复
逆转录转座
功能冗余
新功能化
亚功能化
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Keywords
gene duplication
whole genome duplication
retroposition
functional redundancy
neofunctionalization
subfunctionalization
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分类号
Q311
[生物学—遗传学]
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题名极点配置和状态观测器辅助设计工具开发
- 2
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作者
周灿丰
邓双成
林顺英
张明昆
张微
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机构
北京石油化工学院机械工程系
湘潭(郑煤集团)机械电器有限公司
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出处
《控制工程》
CSCD
2003年第z1期115-117,共3页
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基金
北京市教育委员会科技发展计划项目资助(2002KJ071)
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文摘
开发了一个运行于MATLAB环境的极点配置和状态观测器设计GUI辅助工具,帮助设计人员快捷、直观地完成相应的系统设计与仿真任务。在论述有关理论的基础上,以MatlabGUIDE为开发手段,进行该GUI辅助工具的设计。该设计的图形用户界面由GUIDE中的控件编辑、组合而成,控制算法通过调用ControlSystemToolbox中的命令函数来实现,为了实现不同控件callbacksubfunction代码之间的数据传输,采用global将要求共享的变量申明为全局变量。该GUI辅助工具可以做为MatlabSISODesignTool的有益补充。
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关键词
极点配置
状态观测器
GUI
CALLBACK
subfunction
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Keywords
pole placement
state estimator
GUI
callback subfunction
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分类号
TP311
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名查尔酮合酶基因重复-歧化的遗传学效应
被引量：2
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作者
朱子超
柴友荣
杨光伟
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机构
西南大学农学与生物科技学院
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出处
《安徽农学通报》
2009年第1期25-30,共6页
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基金
国家863项目(2006AA10Z110)
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文摘
基因的重复-歧化是生物进化的重要机制。查尔酮合酶(CHS)是类黄酮途径的第一个关键酶,影响植物的多种性状。本文综述了CHS基因经重复-歧化后的假基因化、亚功能化、新功能化、基因互作这4种遗传学效应的表现和发生原因,并从系统发生的角度综述了亚功能化和新功能化的成员在分子进化树上的聚类式样。
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关键词
查尔酮合酶
歧化
重复
基因互作
新功能化
假基因化
亚功能化
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Keywords
Chalcone synthase
disproportionation
duplication
gene interaction
neofunctionalization
pseudogenization
subfunctionalization
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分类号
Q554.7
[生物学—生物化学]
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题名虹鳟hif-1a基因家族的拷贝数变异及分歧进化
被引量：1
- 4
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作者
王宪宗
宋晶
杨春娟
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机构
山西农业大学动物科学学院
山西省水产技术推广站
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出处
《河南农业科学》
北大核心
2021年第11期153-161,共9页
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基金
山西省高等学校科技创新项目(2020L0158)
山西农业大学科技创新项目(2017YJ05)。
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文摘
为深入阐明虹鳟不耐低氧的分子机制,采用BLAST搜索、重构最大似然树来确定其hif-1a家族的拷贝数,并对这些拷贝的组织表达谱、共表达基因及其所富集的GO条目、编码蛋白质的保守结构域分布及部分结构域的三维结构进行比较。结果显示,虹鳟的hif-1a有2个拷贝,与它们直系同源的斑马鱼基因均是hif-1aa。2个hif-1a拷贝的组织表达谱存在显著的分化,它们的共表达基因数量及所富集的与血管生成、细胞增殖、物质运输和代谢相关的GO条目数量也存在较大差异;它们所编码的蛋白质均拥有5个保守结构域,C-TAD结构域三维结构均存在结构创新,但bHLH结构域的三维结构存在较大差异。综上,虹鳟在较近的全基因组重复事件之前丢失了hif-1ab,现有的2个hif-1aa拷贝在朝亚功能化方向快速进化,某些地理种群中可能已经存在有利于提高耐低氧性能的基因型。
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关键词
虹鳟
hif-1a基因家族
低氧
全基因组重复
共表达基因
亚功能化
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Keywords
Oncorhynchus mykiss
hif-1a gene family
Hypoxia
Whole genome duplication
Co-expressed gene
subfunctionalization
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分类号
S917.4
[农业科学—水产科学]
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