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牛分枝杆菌Spoligotyping和VNTR-MIRU的基因分型研究 被引量：1
1
作者 杜艳芬 林靖凯 +5 位作者 刘思国 王春来 刘慧芳 司微 王聃 赵海玲 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期114-116,126,共4页
为了探讨间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列-结核分枝杆菌散在分布重复单元(VNTR-MIRU)基因分型法用于国内牛分枝杆菌的基因分型研究,初步了解我国牛分枝杆菌基因型种类、分布以及2种方法在我国应用的可行性。... 为了探讨间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列-结核分枝杆菌散在分布重复单元(VNTR-MIRU)基因分型法用于国内牛分枝杆菌的基因分型研究,初步了解我国牛分枝杆菌基因型种类、分布以及2种方法在我国应用的可行性。本研究收集东北、西北、华北、华南4个地区分离的10株牛分枝杆菌分离株,分别采用Spoligotyping和VNTR-MIRU对这些分离株进行基因分型,比较两种方法的分型效果,评价其在牛分枝杆菌基因分型中的应用。结果表明,使用Spoligotyping方法,10株牛分枝杆菌呈现出4种基因型,使用VNTR-MIRU方法,10株分离株也呈现4种基因型;当两种方法联合使用时,可以分为5种基因型,其中的2个菌株具有独特的基因型,显示来自不同地区的牛分枝杆菌存在主要的流行型为BCG家族。将Spoligotyping和VNTR-MIRU联合使用,可有效提高牛结核病的分子流行病学调查和病原学的监测效果。 展开更多
关键词 牛分枝杆菌 spoligotyping VNTR MIRU 基因分型
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114例HIV/MTB双重感染病例结核分枝杆菌Spoligotyping基因分型研究 被引量：1
2
作者 赵明惠 刘开明 +1 位作者 王宁 冉鑫 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期15-20,共6页
目的了解HIV/MTB双重感染病例中结核分枝杆菌基因型构成情况以及北京家族基因型菌株所占的比例,为HIV/MTB双重感染病例结核病预防控制提供分子流行病学依据。方法收集HIV/MTB双重感染病例结核分枝杆菌临床分离株114株,利用间隔寡核苷酸... 目的了解HIV/MTB双重感染病例中结核分枝杆菌基因型构成情况以及北京家族基因型菌株所占的比例,为HIV/MTB双重感染病例结核病预防控制提供分子流行病学依据。方法收集HIV/MTB双重感染病例结核分枝杆菌临床分离株114株,利用间隔寡核苷酸分型(Spoligotyping)技术对所收集的临床分离株进行分型研究,分析HIV/MTB双重感染病例中结核分枝杆菌基因型构成情况及主要流行型。结果 114例HIV/MTB双重感染病例结核分枝杆菌成2个大的基因家族,即北京家族(Beijing Family)和非北京家族(non-Beijing Family),分别占66.7%(76/114)和33.3%(38/114),共30种基因型。其中,非北京家族包括T家族共18株,H家族共5株,EAI5基因家族1株,CAS1_DEHLI基因家族1株及12种在数据库中没有对应基因家族或没有匹配的结果的新基因型13株。结论 HIV/MTB双重感染病例中,结核分枝杆菌基因型呈明显的多态性,北京家族基因型菌株仍为HIV/MTB双重感染病例中结核分枝杆菌主要流行菌株。 展开更多
关键词 HIV/MTB 结核分枝杆菌 spoligotyping
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新疆维吾尔自治区结核分枝杆菌基因型多样性及其耐药特征研究
3
作者 王泉 古丽比克·木拉提 +6 位作者 陈清波 张亚丽 许苗 杨婷 常炜 李媛媛 马瑞瑛 《中国防痨杂志》 北大核心 2025年第S1期12-16,共5页
目的:分析新疆维吾尔自治区结核分枝杆菌基因型分布特征及其与耐药性的相关性。方法:纳入2022年7月至2023年12月新疆医科大学第八附属医院确诊的肺结核患者结核分枝杆菌临床分离株的培养物,综合运用间隔子寡核苷酸分型(Spoligotyping)... 目的:分析新疆维吾尔自治区结核分枝杆菌基因型分布特征及其与耐药性的相关性。方法:纳入2022年7月至2023年12月新疆医科大学第八附属医院确诊的肺结核患者结核分枝杆菌临床分离株的培养物,综合运用间隔子寡核苷酸分型(Spoligotyping)和分枝杆菌散在分布-数目可变-串联重复序列分型(MIRU-VNTR)技术进行基因分型,结合探针熔解曲线分析技术检测利福平、异烟肼、乙胺丁醇和氟喹诺酮类药物耐药相关基因突变。结果:在459株结核分枝杆菌中,北京基因型家族占据主导地位(69.5%),其构成比在汉族患者中明显高于维吾尔族等少数民族患者(81.5%vs 71.1%,P<0.001)。非北京基因型家族呈现民族特异性分布特征,Ural家族菌株仅见于维吾尔族患者,CAS和EAI家族菌株在少数民族患者中的检出率有高于汉族患者的趋势,但差异无统计学意义(P>0.05)。耐药分析显示,北京基因型家族对四类抗结核药物的耐药率虽高于非北京基因型家族,但差异无统计学意义(P>0.05)。传播网络分析发现7个传播簇,其中3个为跨民族传播,且同一传播簇内菌株耐药谱存在异质性。结论:北京基因型家族结核分枝杆菌仍是新疆维吾尔自治区结核病防控的重点对象,但非北京基因型家族菌株在少数民族患者群体中的特异性分布及跨民族传播特征提示需重视其流行病学意义。耐药发展可能主要受药物选择压力驱动而非菌株固有特性。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 基因分型 分子药敏 spoligotyping分型技术 MIRU-VNTR分型技术
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