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酿酒酵母反义snoRNA一级结构的分析 被引量:1
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作者 岳强 周惠 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期68-72,共5页
对酿酒酵母Saccharomycescerevisiae基因组中发现和鉴定的41个反义snoRNA进行一级结构的分析表明:酿酒酵母snoRNA基因富含AT;41个反义snoRNA全都具有boxC’和boxD’结构元素... 对酿酒酵母Saccharomycescerevisiae基因组中发现和鉴定的41个反义snoRNA进行一级结构的分析表明:酿酒酵母snoRNA基因富含AT;41个反义snoRNA全都具有boxC’和boxD’结构元素;根据反义snoRNA保守结构元素及反义序列的数目和位置的特点,将反义snoRNA分为5种结构类型,认为snoRNA分子具有两个主要的功能区;在snR57、snR59、snR68、snR71和snR75不具有指导甲基化反义序列的功能区中,发现有一段长10~12个核苷酸的序列与rRNA互补.为进一步研究反义snoRNA的结构与功能提供了重要线索. 展开更多
关键词 醇酒酵母 反义snornaG 一级结构 反义序列 结构元素 重复序列 snorna基因
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拟南芥中1个新snoRNA基因的鉴定 被引量:4
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作者 徐玲 胡娜 +1 位作者 刘仁荣 裘雪梅 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第33期16255-16256,16281,共3页
[目的]鉴定拟南芥中1个新snoRNA基因。[方法]运用生物信息学方法筛选拟南芥基因组序列,并对候选的基因序列结构、基因组织形式和功能进行分析。[结果]在拟南芥基因组中发现snR95box H/ACAsno RNA上游有一段序列具有典型boxC/DsnoRNA的... [目的]鉴定拟南芥中1个新snoRNA基因。[方法]运用生物信息学方法筛选拟南芥基因组序列,并对候选的基因序列结构、基因组织形式和功能进行分析。[结果]在拟南芥基因组中发现snR95box H/ACAsno RNA上游有一段序列具有典型boxC/DsnoRNA的保守组件和结构特征,并具有2段与rRNA互补、长度超过数10个核苷酸的反义序列,该基因下游的反义序列与snoRNA数据库中水稻Z270的下游反义序列一致,命名为boxC/Dsno RNA-AthZ270。[结论]拟南芥Z270 snoRNA具有不同与一般snoRNA的功能。 展开更多
关键词 拟南芥 snorna AthZ270
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C1 SnoRNA,水稻中一种新的核仁小分子RNA 被引量:1
3
作者 屈良鹄 钟翎 +2 位作者 施苏华 陆勇军 周惠 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1996年第3期1-5,共5页
通过计算机分析国际分子生物学数据库和cDNA序列分析等方法,在水稻(Oryzasativa)中发现了一种新的核仁小分子RNA:C1SnoRNA.该RNA具有boxC,boxD和末端碱基配对区等典型的核仁小分子RNA结... 通过计算机分析国际分子生物学数据库和cDNA序列分析等方法,在水稻(Oryzasativa)中发现了一种新的核仁小分子RNA:C1SnoRNA.该RNA具有boxC,boxD和末端碱基配对区等典型的核仁小分子RNA结构特征;并有14个核苷酸与水稻18srRNA中一段保守序列互补.推测C1SnoRNA可能在18srRNA甲基化过程中起重要作用.编码C1SnoRNA的基因位于水稻Hsp70基因的第一个内含子中.这是在水稻中发现的第一个由基因内含子编码的SnoRNA. 展开更多
关键词 snorna 水稻 基因 核仁 RNA
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一种从基因数据库中识别反义snoRNA基因的新方法 被引量:2
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作者 屈良鹄 周惠 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期25-28,共4页
报道一种从国际分子生物学数据库中识别反义snoRNA基因的计算机新方法.介绍新方法的生物学原理及在反义SnoRNA新基因发现中的应用.
关键词 基因识别 snorna 基因库 计算机识别
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酿酒酵母中一种新的反义snoRNA分子的鉴定(英文)
5
作者 陆勇军 赵锦 +2 位作者 周惠 周维欣 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1998年第2期57-60,共4页
核仁小分子RNA(snoRNA)是一类在真核生物核糖体生物合成过程中起重要作用的小分子RNA.通过计算机直接分析国际分子生物学数据库及RNA杂交分析、cDNA序列测定等方法,在酿酒酵母(Sacharomycescer... 核仁小分子RNA(snoRNA)是一类在真核生物核糖体生物合成过程中起重要作用的小分子RNA.通过计算机直接分析国际分子生物学数据库及RNA杂交分析、cDNA序列测定等方法,在酿酒酵母(Sacharomycescerevisiae)中发现和鉴定了1个新的snoRNA-Z6snoRNA.该snoRNA长109个核苷酸,由位于酿酒酵母第13号染色体上的1个独立基因编码.Z6snoRNA含有boxC(UGAUGA)、boxD(CUGA)等保守的结构元素,属于反义snoRNA家族,即分子中有1段11个核苷酸的片段与25SrRNA中1段保守核心序列互补,该snoRNA片段连同其下游的boxD共同指导与其互补的rRNA序列第2195位胞苷酸的2’-氧-核糖的甲基化. 展开更多
关键词 snorna 酿酒酵母 酵母 RRNA 甲基化 反义核酸
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水稻Hsp70基因第一个内含子中snoRNA基因簇的保守性及分布特点
6
作者 钟翎 王诚炳 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期43-48,共6页
对水稻、野生稻和茭白Hsp70基因第一个内含子进行PCR分析及部分序列测定,分析结果表明植物Hsp70基因内含子编码多个snoRNA的基因组织具有一定的保守性和分布范围,揭示了植物内含子编码的snoRNA在进化过程中... 对水稻、野生稻和茭白Hsp70基因第一个内含子进行PCR分析及部分序列测定,分析结果表明植物Hsp70基因内含子编码多个snoRNA的基因组织具有一定的保守性和分布范围,揭示了植物内含子编码的snoRNA在进化过程中具有比脊椎动物和酵母更加丰富的多样性和移动性. 展开更多
关键词 HSP70基因 内含子 snorna基因簇 水稻 保守性
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哺乳动物核仁蛋白基因编码多个内含子snoRNA
7
作者 周惠 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期129-130,共2页
Through computer screening of Genbank and experimental analysis a novel snoRNA, termed Z25, was first identified from mammals. Z25 snoRNA is 69 nucleotide in length, possessing typical boxC/D and terminal repeat seque... Through computer screening of Genbank and experimental analysis a novel snoRNA, termed Z25, was first identified from mammals. Z25 snoRNA is 69 nucleotide in length, possessing typical boxC/D and terminal repeat sequence, a 11 nt long sequence complementarity to 18S rRNA implies that Z25 snoRNA is a 2′ O ribose methylation guide at A1678 (human coordinate) of 18S rRNA. Z25 snoRNA is encoded by the fifth intron of human, mouse and rat nucleolin genes that have been found as the host genes for U20 and U23 snoRNA. 展开更多
关键词 snorna 核仁蛋白 哺乳动物 基因编码 内含子
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酵母snoRNA基因簇启动子的比较分析
8
作者 周惠 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期89-92,共4页
报道对酿酒酵母snoRNA基因簇启动子序列的研究结果.通过计算机分析,发现酿酒酵母中Z2Z8和SnR190U14snoRNA基因簇有相似的启动子结构.这两个snoRNA基因簇都是由一个上游的启动子负责整个基因簇的... 报道对酿酒酵母snoRNA基因簇启动子序列的研究结果.通过计算机分析,发现酿酒酵母中Z2Z8和SnR190U14snoRNA基因簇有相似的启动子结构.这两个snoRNA基因簇都是由一个上游的启动子负责整个基因簇的转录,产生多个顺反子snoRNA的前体,然后再加工成熟为各个独立的snoRNA.在启动子保守序列TATAbox的上游还发现2个RAP1序列,表明snoRNA基因簇的表达可以通过RAP1元素与核糖体蛋白基因的表达协同调控.这是在snoRNA基因的启动子中首次发现RAP1调控元素.对snoRNA基因簇的进化特点也进行了讨论. 展开更多
关键词 snorna基因簇 启动子 RAP1 酿酒酵母
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拟南芥U59snoRNA基因簇的结构与功能研究 被引量:1
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作者 孟清 周惠 +1 位作者 许飞 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期74-79,共6页
在拟南芥 (Arabidopsisthaliana)中发现和鉴定了具有两个反义序列的snoRNA组成的一个基因簇 .该基因簇由两个相同的snoRNA基因组成 .位于boxD′上游的反义序列与人U59snoRNA基因的反义序列相同 ,因此命名为拟南芥U59a和U59b .位于boxD... 在拟南芥 (Arabidopsisthaliana)中发现和鉴定了具有两个反义序列的snoRNA组成的一个基因簇 .该基因簇由两个相同的snoRNA基因组成 .位于boxD′上游的反义序列与人U59snoRNA基因的反义序列相同 ,因此命名为拟南芥U59a和U59b .位于boxD上游的反义序列在所有哺乳动物和酵母snoRNA基因的反义序列中未找到同源拷贝 .经低浓度的dNTP逆转录检验证实此反义序列并不指导拟南芥 2 5SrRNAGl84 5位点 2′ o 核糖甲基化 .这些结果表明 :拟南芥U59a和U59bsnoRNA基因与动物U59snoRNA在基因结构、组织和功能上有较大的差异 .拟南芥U59snoRNA基因簇的发现为进一步研究植物rRNA的加工和修饰、植物snoRNA基因的组织与表达多样性以及两个反义序列snoRNA基因的起源提供了一个良好的研究体系 . 展开更多
关键词 拟南芥 结构 U59 snorna 基因簇 调控机制
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草地贪夜蛾Sf9细胞中snoRNA Bm-15反义寡核苷酸的定位及其对Bm-15的干涉效率 被引量:2
10
作者 李新梅 邱妩洁 +5 位作者 崔斌 杨宗霖 申雅文 路一平 阚云超 李丹丹 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期795-800,共6页
【目的】利用反义寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)干涉昆虫核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)Bm-15的表达,并探索ASO进入细胞后的代谢途径。【方法】利用脂质体携带Cy5标记的、2'-O核糖甲基化修饰和硫代磷酸骨架修饰... 【目的】利用反义寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)干涉昆虫核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)Bm-15的表达,并探索ASO进入细胞后的代谢途径。【方法】利用脂质体携带Cy5标记的、2'-O核糖甲基化修饰和硫代磷酸骨架修饰的Bm-15 ASO转染草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda Sf9细胞,然后通过Cy5标记与溶酶体及线粒体免疫荧光探针共定位研究Bm-15 ASO在细胞内的转运机制。利用实时荧光定量PCR检测转染Bm-15 ASO的Sf9细胞中Bm-15的表达量,分析ASO对snoRNA Bm-15的干涉效果。【结果】Bm-15 ASO转染草地贪夜蛾Sf9细胞48 h后,ASO荧光信号充斥整个细胞和位于细胞边缘的比例分别为34%和66%,说明ASO进入细胞后可能分布在不同的亚细胞器中;进一步对Bm-15 ASO和溶酶体及线粒体进行共定位发现,位于细胞边缘的ASO大多被运输至溶酶体而不会存在于线粒体等细胞器中。实时荧光定量PCR检测结果表明,转染Bm-15 ASO的Sf9细胞中Bm-15表达量下降了47%。【结论】即使经过多种化学修饰,ASO仍然逃避不了细胞内源降解机器的识别,这有效解释了某些情况下利用ASO干涉基因表达时靶标基因干涉效率较低的现象。 展开更多
关键词 昆虫 草地贪夜蛾 反义寡核苷酸 snorna Bm-15 溶酶体
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粟酒裂殖酵母Z15snoRNA的鉴定及结构与功能分析 被引量:4
11
作者 周惠 岳强 +1 位作者 杜延平 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期56-60,共5页
运用计算机及实验的方法,在粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中发现和鉴定了一个新的、结构特殊的snoRNA──Z15.该snoRNA由一个独立转录的基因编码,位于酵母2号染色体上Z15... 运用计算机及实验的方法,在粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中发现和鉴定了一个新的、结构特殊的snoRNA──Z15.该snoRNA由一个独立转录的基因编码,位于酵母2号染色体上Z15长达为92个核苷酸,属于反义snoRNA家族.它除了具有典型的boxC/D结构元素和末端配对区外、还含有分别与酿酒酵母Z15和Z2相同的两个反义序列,反映了粟酒裂殖酵母川Z15sonRNA基因可能通过2种snoRNA基因的重组而来的.推测Z15除了指导25S rRNA A849和A908的2’-氧-核糖的甲基化修饰外,还可能在rRNA构象形成中起作用.粟酒裂殖酵母Z15的发现.从一个新的角度揭示了snoRNA基因结构和功能的复杂性,并为研究这类snoRNA基因的起源和进化提供了重要线索. 展开更多
关键词 粟酒裂殖酵母 RNA制备 甲基化
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酵母snR72~78snoRNA基因簇的研究
12
作者 杜延平 周惠 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期68-72,共5页
通过PCR分析发现Kluyveromycesdelphensis中存在与酿酒酵母相似的snR72~ 78snoR NA基因簇 .对该基因簇进行序列测定并与酿酒酵母比较分析 ,发现基因簇中各个snoRNA编码区具有一定的保守性 ,但是基因间隔区却有完全不同的序列 ,这表明RN... 通过PCR分析发现Kluyveromycesdelphensis中存在与酿酒酵母相似的snR72~ 78snoR NA基因簇 .对该基因簇进行序列测定并与酿酒酵母比较分析 ,发现基因簇中各个snoRNA编码区具有一定的保守性 ,但是基因间隔区却有完全不同的序列 ,这表明RNaseⅢ对snoRNA前体加工的识别信号存在于各snoRNA基因间隔区的高级结构中 .进一步对另外 4种酵母进行PCR分析 ,结果表明snR72~ 78snoRNA基因簇是一种保守的基因组织 ,普遍存在于各种酵母中 . 展开更多
关键词 snorna 基因簇 酵母 基因组织 基因表达
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家蚕snoRNA Bm-15的细胞定位及与类Notch受体基因的互作关系
13
作者 申雅文 马田田 +4 位作者 霍春月 杨宗霖 路一平 阚云超 李丹丹 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期895-900,共6页
【目的】前期研究中发现的一个家蚕Bombyx mori C/D box snoRNA Bm-15能够与类Notch受体基因(Notch-like receptor gene,NLR)发生体外互作。本研究旨在了解家蚕中snoRNA Bm-15与NLR的互作机制。【方法】利用实时荧光定量PCR检测snoRNA B... 【目的】前期研究中发现的一个家蚕Bombyx mori C/D box snoRNA Bm-15能够与类Notch受体基因(Notch-like receptor gene,NLR)发生体外互作。本研究旨在了解家蚕中snoRNA Bm-15与NLR的互作机制。【方法】利用实时荧光定量PCR检测snoRNA Bm-15和NLR在家蚕幼虫、蛹及成虫不同发育阶段的表达谱;利用原位杂交鉴定snoRNA Bm-15与NLR在BmN4细胞中的定位,以探索两者之间的互作机制。【结果】表达谱分析发现,snoRNA Bm-15及NLR在家蚕幼虫期的表达趋势基本一致,均呈现先下降后上升的趋势,2龄幼虫中表达量最低。在家蚕化蛹过程中,snoRNA Bm-15表达量呈现逐渐下降的趋势,到处女蛾时表达量最低。而NLR在雌虫化蛹后第1天表达量最低,处女蛾中表达量最高。利用原位杂交进行细胞定位发现,snoRNA Bm-15不仅存在于BmN4细胞核中,在细胞质中也有分布;而NLR则大部分分布于细胞核中,与Bm-15在核内有位置重叠。【结论】首次在鳞翅目昆虫中发现一个snoRNA Bm-15同时存在于细胞核和细胞质中,与其互作的基因NLR则主要存在于细胞核中,与Bm-15有位置重叠。二者在家蚕幼虫阶段存在一致的表达模式,在化蛹及化蛾过程中存在相反的表达模式,提示snoRNA Bm-15与NLR在家蚕不同发育阶段可能存在不同的互作模式。 展开更多
关键词 家蚕 发育 snorna Bm-15 表达谱 细胞定位
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基因组的进化与内含子中的基因的进化 被引量:6
14
作者 张尚宏 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期49-53,共5页
论述了基因组整体进化过程中内含子所含的基因的进化.分析了内含子的起源方式与内含子中的基因种类的关系,并结合基因组在大小、组成等方面进化过程中内含子的演化趋势,探讨了内含子中的基因,特别是核仁小分子RNA基因的进化规律... 论述了基因组整体进化过程中内含子所含的基因的进化.分析了内含子的起源方式与内含子中的基因种类的关系,并结合基因组在大小、组成等方面进化过程中内含子的演化趋势,探讨了内含子中的基因,特别是核仁小分子RNA基因的进化规律.同时,对于内含子中的基因的进化,提出了一些可能的途径. 展开更多
关键词 基因组 进化 内含子 RNA snorna
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核仁小分子RNA基因的起源初探 被引量:1
15
作者 张尚宏 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期83-88,共6页
通过分析、比较含BoxC/D和含BoxH/ACA这两类snoRNA的一些代表与几种剪接体snRNA的序列和二级结构特征,研究它们的进化关系,并探讨snoRNA是起源于内含子还是后来才插入到内含子中这一与snoRNA的... 通过分析、比较含BoxC/D和含BoxH/ACA这两类snoRNA的一些代表与几种剪接体snRNA的序列和二级结构特征,研究它们的进化关系,并探讨snoRNA是起源于内含子还是后来才插入到内含子中这一与snoRNA的起源密切相关的问题.结合对剪接体snRNA起源的有关研究,提出两类snoRNA最初是起源于原始Ⅱ类内含子中的不同部分的观点. 展开更多
关键词 snorna 剪接体snRNA 内含子 RNA 核仁 基因
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核仁小RNA在肿瘤发生中的作用 被引量:2
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作者 肖丙秀 夏天 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1087-1092,共6页
核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是一类真核细胞核仁中的60~300个核苷酸长度的非编码RNA,主要参与rRNA和其它小RNA转录后的成熟加工过程.它们与肿瘤的关系曾一度被人们所忽视,然而,近年来有关snoRNA新功能的研究证明,它们与肿... 核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是一类真核细胞核仁中的60~300个核苷酸长度的非编码RNA,主要参与rRNA和其它小RNA转录后的成熟加工过程.它们与肿瘤的关系曾一度被人们所忽视,然而,近年来有关snoRNA新功能的研究证明,它们与肿瘤的发生、发展密切相关.snoRNA以多种方式参与肿瘤的发生:一些snoRNA(如:U50、SNORD12、SNORD12b、SNORD12c、SNORD44和h5sn2等)具有抑癌活性,而另一些snoRNA(如:SNORD33、SNORD66、SNORD76、SNORD112、SNORD113、SNORD114、SNORA42、U70C和ACA59B等)具有促癌活性.另外,编码snoRNA基因的异常也被发现与肿瘤的发生有关.因此,开展snoRNA与肿瘤关系的研究将有可能为肿瘤诊治提供新线索. 展开更多
关键词 核仁小RNA 肿瘤 肿瘤发生 促癌活性 抑癌活性
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核仁小RNA与肺癌
17
作者 杨柳 孙军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1209-1213,共5页
核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是一类定位于核仁内的短链非编码RNA,在多种RNA的加工修饰过程中发挥重要作用。随着人们对基因组认识的深入,snoRNA等非编码RNA的结构及功能已成为研究的热点。近年来有研究表明,snoRNA与肺癌的... 核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是一类定位于核仁内的短链非编码RNA,在多种RNA的加工修饰过程中发挥重要作用。随着人们对基因组认识的深入,snoRNA等非编码RNA的结构及功能已成为研究的热点。近年来有研究表明,snoRNA与肺癌的发生发展有密切关系。本文结合国内外snoRNA与肺癌相关的最新研究结果,在总结snoRNA的基本结构和功能的基础上,对snoRNA在肺癌发生发展中的特点以及在肺癌的诊断和治疗中潜在应用价值进行综述,以期为后续相关的研究提供参考。 展开更多
关键词 核仁小RNA 肺癌 肺癌诊断与治疗
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