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2020—2023年上海地区犬钩端螺旋体血清流行病学调查与分析
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作者 张玉杰 何随彬 +6 位作者 徐锋 庄源 王晓旭 沈莉萍 向蒙 杨显超 王建 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2025年第1期48-54,共7页
为了解上海地区犬钩端螺旋体的免疫和临床感染情况,同时明确犬携带钩端螺旋体的优势血清群,为上海地区犬钩端螺旋体病的防控提供重要的数据支撑。本试验采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对2020—2023年收集的3920份犬血清样本(3557份流浪犬... 为了解上海地区犬钩端螺旋体的免疫和临床感染情况,同时明确犬携带钩端螺旋体的优势血清群,为上海地区犬钩端螺旋体病的防控提供重要的数据支撑。本试验采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对2020—2023年收集的3920份犬血清样本(3557份流浪犬血清样本、176份免疫家养犬血清样本和187份未免疫家养犬血清样本)进行血清学检测,采用显微凝集试验(MAT)对ELISA检测阳性的80份血清样本进行钩端螺旋体血清群检测,同时对血清阳性率和血清群数据进行统计分析。结果显示,流浪犬的钩端螺旋体血清阳性率为52.38%(95%CI:51.22%~53.54%),家养犬的钩端螺旋体血清阳性率为19.28%(95%CI:15.22%~23.34%)。血清分群结果显示,流浪犬血清样本所含血清群的占比为犬群>澳洲群>黄疸出血群>拜伦群>40%,未发现流感伤寒群;家养犬血清样本中15种血清群均有发现,其中未免疫家养犬血清样本所含血清群的占比为黄疸出血群>秋季群=回归热群>犬群>50%,免疫家养犬血清样本所含血清群的占比为拜伦群>波摩那群>致热群>50%(与疫苗有关的黄疸出血群和犬群不用于优势血清群的比较);统计分析结果显示,未免疫家养犬的感染血清群数量存在地区差异(P<0.05),流浪犬和家养犬的血清阳性率和感染血清群类型(澳洲群、波摩那群、流感伤寒群和塔拉索夫群)存在显著差异(P<0.05),免疫家养犬和未免疫家养犬感染的血清群类型(拜伦群、致热群和秋季群)存在显著差异(P<0.05)。结果表明,上海地区不同犬种群的钩端螺旋体优势血清群不同,且流浪犬血清阳性率较高,应当注意防范流浪犬带来的潜在公共卫生安全问题。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 血清群 流浪犬 家养犬
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我国部分地区禽病原性大肠杆菌的分离与鉴定 被引量:118
2
作者 高崧 刘秀梵 +9 位作者 张如宽 焦新安 文其乙 吴长新 唐一鸣 朱晓波 李琮 陈娟 崔力兵 崔洪平 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期164-171,共8页
从江苏、广东、河南、新疆、四川、北京、黑龙江等18个省、市、自治区临诊上有典型大肠杆菌病病变的病禽1051羽采集病料,分离培养和鉴定出595株大肠杆菌。经O血清型测定,除144株未能定型、11株自凝外,共鉴定出440... 从江苏、广东、河南、新疆、四川、北京、黑龙江等18个省、市、自治区临诊上有典型大肠杆菌病病变的病禽1051羽采集病料,分离培养和鉴定出595株大肠杆菌。经O血清型测定,除144株未能定型、11株自凝外,共鉴定出440个分离株的O血清型。这些分离株覆盖了60个血清型,但以O18、O78、O2、O88、O11、O26、O4、O1、O127和O131等10个血清型为主,共264株,占定型菌株的60%;前6种血清型在种类上只占定型菌株血清型总数的10%,却拥有204个分离株,占定型菌株的4636%。因此,可以认定O18、O78、O2、O88、O11、O26等6个血清型为优势血清型。不同地区优势血清型分离株60个,以每分离株107菌落形成单位(CFU)细菌气管内接种1日龄无特定病原体(SPF)鸡6羽,根据接种后7天内发生死亡和病变鸡的比例,确定出高致病株、中度致病株和低致病株分别为8333%、10%和667%;其它常见血清型O4、O1、O127和O131分离株30个和10个非常见血清型分离株,按同样方法接种1日龄易感鸡6羽,高致病株、中度致病株和低致病株分别为90%、10%和0%。结果表明:我们所收集的分离株均? 展开更多
关键词 大肠杆菌 分离株 O血清型 致病性
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四川规模化猪场仔猪黄、白痢E.coli的分离鉴定 被引量:24
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作者 刘书亮 王红宁 +3 位作者 陶勇 黄勇 吴琦 柳萍 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期367-371,共5页
从四川省 17个规模化猪场发生典型仔猪黄、白痢猪的肛拭粪样及死亡猪的心血和肝脏中分离鉴定出 2 45株致病性大肠肝菌 ,用 35种大肠杆菌O抗原单价血清进行了血清学鉴定。结果表明 :2 45株分离菌有 172株能定型 ,分属 30种血清型 ,其中以... 从四川省 17个规模化猪场发生典型仔猪黄、白痢猪的肛拭粪样及死亡猪的心血和肝脏中分离鉴定出 2 45株致病性大肠肝菌 ,用 35种大肠杆菌O抗原单价血清进行了血清学鉴定。结果表明 :2 45株分离菌有 172株能定型 ,分属 30种血清型 ,其中以 0 60 (13.3% )、0 89(10 .47% )、0 119(9.30 % )、0 14 1(8.14% )、0 9(8.14% ) 0 2 0 (6 .40 % )、0 137(5 .81% )和 0 10 1(5 .2 3% )等 8种为优势血清型。同一猪场存在多种血清型 ,大多数猪场有本场的优势血清型。同一地区的不同猪场流行的主要血清型一般不同。不同地区猪场的优势血清型有的相同 ,有的不同。四川规模化养殖场分离的E .coli血清型与 80年代初报道的血清型比较已发生了较大变化。 展开更多
关键词 致病性大肠杆菌 O抗原血清型 仔猪 黄白痢
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猪源肠外致病性大肠杆菌的分离与鉴定 被引量:36
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作者 马增军 芮萍 +5 位作者 逯春香 杨彩然 刘谢荣 王秋悦 刘曜综 张建文 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期130-134,共5页
目的检测猪源肠外致病性大肠杆菌(ExPEC)的血清型与毒力基因。方法对2013-2014年间秦皇岛地区30份组织病料采用细菌形态观察、培养特性试验、生化试验鉴定出8株肠外致病性大肠杆菌。采用玻片凝集法测定这些大肠杆菌病的血清型,并用PCR... 目的检测猪源肠外致病性大肠杆菌(ExPEC)的血清型与毒力基因。方法对2013-2014年间秦皇岛地区30份组织病料采用细菌形态观察、培养特性试验、生化试验鉴定出8株肠外致病性大肠杆菌。采用玻片凝集法测定这些大肠杆菌病的血清型,并用PCR扩增法检测9种毒力基因。结果定型菌株5株,分别属于O53、O93和O157 3个血清型,9种毒力基因PCR检测结果表明ler、iutA、irp2、fyuA、astA 5种基因检出率分别为100%、75.0%、50.0%、50.0%、25.0%。结论所检测的猪源肠外致病性大肠杆菌以O53、O93和O157为主要流行血清型,同时携带fyuA、ler和iutA基因的菌株致病性较强。 展开更多
关键词 肠外致病性大肠杆菌 血清型 毒力基因
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2016-2018年江西省钩端螺旋体病鼠类动物流行病学调查与分离菌株鉴定 被引量:26
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作者 张翠彩 张汀兰 +2 位作者 徐建民 蒋秀高 邱海燕 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1080-1084,共5页
目的初步了解江西省钩端螺旋体病主要宿主动物鼠类种类构成、带菌率及血清学和分子流行病学特征,为钩体病的防控提供科学依据。方法2016-2018年选取江西省钩体病4个国家级监测点上饶、上高、上犹及浮梁县作为现场监测地点,开展鼠类种类... 目的初步了解江西省钩端螺旋体病主要宿主动物鼠类种类构成、带菌率及血清学和分子流行病学特征,为钩体病的防控提供科学依据。方法2016-2018年选取江西省钩体病4个国家级监测点上饶、上高、上犹及浮梁县作为现场监测地点,开展鼠类种类调查、钩体分离培养工作。利用暗视野显微镜凝集试验和MLST技术对分离菌株进行血清学鉴定和MLST基因分型。结果共计捕鼠14387只,平均鼠密度为9.76%,分离菌株64株,鼠类钩体分离率为4.56%。鼠种构成包括黑线姬鼠、褐家鼠、黄毛鼠、黄胸鼠及社鼠5个种类。4个监测点优势鼠种均以黑线姬鼠和黄毛鼠为主。血清群鉴定结果显示:64株菌株隶属于3个血清群,其中黄疸出血群为主要优势血清群,占81.25%,其次是爪哇群和致热群。MLST研究显示:64株菌株隶属于6个ST型别,分别为ST1、ST17、ST92、ST143、ST216和ST224,其中ST1为主要基因型,占76.56%。BioNumerics软件分析显示:64株菌株隶属于6个Clusters,分别对应6个ST型,血清学、MLST基因型分布具有明显地域差异。结论江西省以黑线姬鼠和黄毛鼠为优势鼠种,黄疸出血群和ST1为江西省钩体病主要流行型别,充分了解江西省钩体病可能的宿主动物以及血清学和分子流行病学特征,对钩体病的预防控制有一定的指导意义。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 宿主动物 血清群 MLST
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河南省猪链球菌的分离鉴定及耐药性分析 被引量:30
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作者 徐引弟 孙帅杰 +6 位作者 王治方 张青娴 朱文豪 焦文强 李海利 郎利敏 王克领 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第2期501-509,共9页
为探讨河南省猪链球菌的血清型分布和耐药性情况,本试验对2016年5月~2017年5月从河南省猪场采集的各种组织病料进行猪链球菌的分离培养、生化鉴定及PCR鉴定,并进行了血清群的分群鉴定和血清型的分型鉴定,对其中的2型猪链球菌进行了药敏... 为探讨河南省猪链球菌的血清型分布和耐药性情况,本试验对2016年5月~2017年5月从河南省猪场采集的各种组织病料进行猪链球菌的分离培养、生化鉴定及PCR鉴定,并进行了血清群的分群鉴定和血清型的分型鉴定,对其中的2型猪链球菌进行了药敏试验。结果显示,试验共鉴定出189株猪链球菌,流行的猪链球菌的血清群主要以D群为主,其次是G群和C群;优势的血清型是2型、7型、9型和1型。其中87株为2型猪链球菌,超过90%的2型菌株对β-内酰胺类(青霉素G、阿莫西林和头孢菌素类)、氯霉素、万古霉素、环丙沙星敏感,超过40%的2型菌株对多西环素、四环素、红霉素、复方新诺明、丁胺卡那霉素、克林霉素、链霉素、米诺环素产生耐药性。以上结果为指导猪场使用敏感药物及时控制疫情、选择血清型相符的疫苗进行预防及减少损失提供参考依据。 展开更多
关键词 猪链球菌 血清型 血清群 耐药性
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宠物源大肠杆菌的血清型和毒力基因及耐药性调查 被引量:18
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作者 张美君 廖晓萍 +6 位作者 王秀梅 朱恒乾 孙坚 孙迎 王杨 庄娜 刘雅红 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期601-605,共5页
为研究宠物源致病性大肠杆菌(Escherichia coli)的血清型、毒力基因和耐药性之间的相关性,本研究由健康和患病犬、猫直肠拭子样品中分离177株E.coli,并采用玻片凝集法鉴定其血清型,结果显示分离株中定型菌株135株,分别属于20个不同的血... 为研究宠物源致病性大肠杆菌(Escherichia coli)的血清型、毒力基因和耐药性之间的相关性,本研究由健康和患病犬、猫直肠拭子样品中分离177株E.coli,并采用玻片凝集法鉴定其血清型,结果显示分离株中定型菌株135株,分别属于20个不同的血清型,其中O1、O2和O8为主要的流行血清型。PCR方法检测11种毒力相关基因,并采用琼脂稀释法测定分离菌株对14种抗菌药的敏感性,结果表明3个血清型的菌株拥有相似的耐药表型,但毒力基因谱不同。62%的分离菌株携带fimH基因,并且毒力基因组合iroN+hlyF、iroN+fimH和traT+sitA比较流行。55%的O1血清型携带fimH基因,并且多数耐受四环素、多西环素、头孢噻吩和庆大霉素;20.8%的O2血清型菌株携带traT和sitA基因;50%的O8血清型携带traT和fimH基因。3个血清型分离菌株多数对安普霉素和阿米卡星敏感。 展开更多
关键词 大肠杆菌 宠物源 血清型 毒力基因 耐药性
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贵州省钩端螺旋体血清群特异性PCR鉴定结果与分析 被引量:8
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作者 刘英 陈红 +7 位作者 李沛丽 马青 王定明 唐光鹏 姚光海 周敬祝 陈峥宏 李世军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1146-1150,1156,共6页
目的采用血清群特异性PCR技术了解贵州省近年钩端螺旋体(钩体)流行菌群,为贵州省钩体病的防控提供技术手段和科学依据。方法采用致病性钩体特异性PCR方法(G1/G2-PCR)对来自贵州省近年的钩体分离菌株进行鉴定,进一步应用基于致病性钩体O... 目的采用血清群特异性PCR技术了解贵州省近年钩端螺旋体(钩体)流行菌群,为贵州省钩体病的防控提供技术手段和科学依据。方法采用致病性钩体特异性PCR方法(G1/G2-PCR)对来自贵州省近年的钩体分离菌株进行鉴定,进一步应用基于致病性钩体O抗原基因的血清群特异性PCR(O-PCR)对贵州省近年的58株钩体分离株进行血清群鉴定,并采用显微凝集试验(MAT)对O-PCR方法的检测结果进行验证。结果 G1/G2-PCR检测结果显示58株菌株均为致病性钩体,O-PCR将58株致病性钩体菌株鉴定为黄疸出血群,与传统的MAT法鉴定结果一致。结论 O-PCR技术可作为我省钩体快速分群鉴定可靠的实验室诊断技术手段,贵州省近年的钩体流行菌群为黄疸出血群。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 血清群 PCR 贵州
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我国部分地区猪源大肠杆菌LEE和HPI毒力岛相关基因的检测 被引量:25
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作者 陈祥 赵娟 +5 位作者 高崧 苗晓青 刘静 黄莉莉 焦新安 刘秀梵 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期33-35,47,共4页
目的采用PCR方法检测我国江苏等9个省市部分地区分离的1 007株猪源大肠杆菌中肠细胞脱落位点毒力岛(LEE)和强毒力岛(HPI)。方法对LEE毒力岛检测其核心区的ler和eaeA基因,对HPI毒力岛检测其irp2和fyuA基因。同时对LEE和/或HPI阳性大肠杆... 目的采用PCR方法检测我国江苏等9个省市部分地区分离的1 007株猪源大肠杆菌中肠细胞脱落位点毒力岛(LEE)和强毒力岛(HPI)。方法对LEE毒力岛检测其核心区的ler和eaeA基因,对HPI毒力岛检测其irp2和fyuA基因。同时对LEE和/或HPI阳性大肠杆菌进行了O血清型的鉴定。结果在分离的猪源大肠杆菌中,LEE毒力岛基因检测结果为:2.2%(22/1 007)的菌株ler和eaeA基因的扩增阳性,0.5%(5/100 7)的菌株eaeA阳性。HPI毒力岛基因检测结果为:10.6%(107/1 007)的菌株irp2和fruA基因扩增阳性,2.1%(21/1007)的菌株irp2阳性;其中有2株irp2和ler基因扩增阳性,有3株irp2、ler和eaeA基因扩增阳性,1株irp2f、yuA、ler和eaeA基因扩增都为阳性;在128个HPI阳性分离株中,O93和O107血清型菌株分别占定型菌株的15.7%(13/83)和12.0%(10/83)。结论2.7%的猪源大肠杆菌携带LEE,12.7%的菌株携带耶尔森菌HPI,O93和O107为猪源HPI大肠杆菌常见血清型。 展开更多
关键词 猪源大肠杆菌 O血清型 强毒力岛 肠细胞脱落位点毒力岛
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规模化猪场致病性大肠杆菌血清型鉴定 被引量:19
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作者 刘书亮 陶勇 +3 位作者 王红宁 吴琦 黄勇 柳萍 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2000年第C00期74-77,共4页
从四川省 1 6个规模化猪场临诊发生典型仔猪黄、白痢猪只的肛试粪样及死亡猪只的心血和肝中分离出致病性大肠杆菌 2 45株 ,用 35种大肠杆菌单价O抗原进行血清型鉴定。 2 45株分离菌有 1 72株能定型 ,分属 30种血清型 ,其中以O6 0、O89、... 从四川省 1 6个规模化猪场临诊发生典型仔猪黄、白痢猪只的肛试粪样及死亡猪只的心血和肝中分离出致病性大肠杆菌 2 45株 ,用 35种大肠杆菌单价O抗原进行血清型鉴定。 2 45株分离菌有 1 72株能定型 ,分属 30种血清型 ,其中以O6 0、O89、O1 1 9、O1 41、O9、O2 0、O1 37和O1 0 1等 8种血清型为优势血清型 ,占定型菌株的 6 6 86 %。尚有 73株未能定型 ,占分离菌株的 2 9 80 % (73/2 45 )。 展开更多
关键词 致病性大肠杆菌 优势血清型 O血清型 猪场
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广东省深圳社区获得性肺炎患儿肺炎链球菌的血清群/型的分布及其耐药性 被引量:20
11
作者 赵瑞珍 郑跃杰 +3 位作者 邓秋莲 王红梅 陈乾 邓继岿 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2010年第3期205-208,共4页
目的通过了解广东省深圳地区社区获得性肺炎患儿肺炎链球菌的血清群/型的分布,几种疫苗的覆盖情况及其对8种抗菌药物的耐药性,评估几种疫苗在本地区预防肺炎链球菌的价值,以及为临床合理应用抗生素提供参考。方法选择2006年2月—2007年... 目的通过了解广东省深圳地区社区获得性肺炎患儿肺炎链球菌的血清群/型的分布,几种疫苗的覆盖情况及其对8种抗菌药物的耐药性,评估几种疫苗在本地区预防肺炎链球菌的价值,以及为临床合理应用抗生素提供参考。方法选择2006年2月—2007年2月广东省深圳地区社区获得性肺炎患儿分离的肺炎链球菌,进行血清分型,E试验法检测该菌对8种抗菌药物的耐药情况。结果 1011例患儿中分离出肺炎链球菌90株,分离率为8.9%。血清型分布以19F最常见(62.2%,56/90),其次为23F(15.6%,14/90)、6B(10.0%,9/90)、4(6.7%,6/90),7价疫苗覆盖率为94.4%。而9、10和11价疫苗所包含的血清型均未分离到。13价疫苗的覆盖率(97.8%)较7价疫苗无明显升高(χ2=1.34,P>0.05)。7价疫苗所含血清型的肺炎链球菌株中,青霉素耐药率为14.1%,所有分离的肺炎链球菌青霉素的耐药率为13.3%,对万古霉素100%敏感,氧氟沙星耐药率为0,阿莫西林的耐药率为2.2%。未出现耐亚胺培南菌株,但11.1%的菌株处于中介。对红霉素的耐药率高达98.9%,头孢呋辛的耐药率也达到64.4%,头孢曲松的耐药率为4.4%。结论广东省深圳地区社区获得性肺炎患儿肺炎链球菌的血清群/型的分布,以19F、23F、6B、4常见,7价疫苗覆盖率为94.4%。对万古霉素、左氧氟沙星、阿莫西林、亚胺培南敏感性高,青霉素、红霉素和头孢呋辛敏感率低。 展开更多
关键词 社区获得性肺炎 肺炎链球菌 血清群/型 耐药性
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鸡大肠杆菌病病原的分离、鉴定及特性 被引量:26
12
作者 恽时锋 郑明球 潘震寰 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 1998年第1期90-97,共8页
从江苏地区5个大型种鸡场孵化后期死亡的163枚鸡胚及84羽出壳弱雏中分离鉴定出99株大肠埃希氏菌,死胚分离率为36.81%,出壳弱雏分离率46.43%;从其它9个蛋鸡场47羽疑似大肠杆菌病的病、死鸡的肝、脾、心包、腹... 从江苏地区5个大型种鸡场孵化后期死亡的163枚鸡胚及84羽出壳弱雏中分离鉴定出99株大肠埃希氏菌,死胚分离率为36.81%,出壳弱雏分离率46.43%;从其它9个蛋鸡场47羽疑似大肠杆菌病的病、死鸡的肝、脾、心包、腹水、输卵管、脑、眼中分离鉴定出23株大肠埃希氏菌,分离率为48.94%。分离菌中有67株对清洁级昆明种小鼠(KM)具有强毒力。对其进行大肠埃希氏菌O群抗原鉴定,共有22种O型血清型,O11、O88、O115为优势血清型,O78及O81各为3株,O18、O20、O26、O36、O89各为2株,其余为O3、O4、O9、O30、O60、O75、O93、O103、O114、O131、O133及O149;未定型菌11株,占待检菌株的16.42%,其中O3、O9、O18、O30、O81、O114、O131及O149为首次发现。对29株不同血清型不同来源的分离菌进行抗生素敏感性试验,结果,所有菌株对头孢唑啉(CFZ)极度敏感;对其它抗生素的敏感性则各不相同。此外,本试验还对分离菌的生长培养特性,形态特征,生化特性及对ld鸡的致病性进行了研究。 展开更多
关键词 大肠埃希氏菌 血清型 抗生素 鸡病 大肠杆菌病
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江西省致病性钩端螺旋体血清学和分子流行病学研究 被引量:11
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作者 张翠彩 徐建民 +2 位作者 邱海燕 张汀兰 蒋秀高 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期1074-1078,共5页
目的对2013年以来江西省致病性钩端螺旋体进行血清学、基因分型分析,以了解江西省钩端螺旋体血清学和分子流行病学特征。方法对27株钩端螺旋体进行暗视野显微镜凝集试验确定血清群。PCR扩增16SrRNA基因、测序,确定基因种。利用MLST(mult... 目的对2013年以来江西省致病性钩端螺旋体进行血清学、基因分型分析,以了解江西省钩端螺旋体血清学和分子流行病学特征。方法对27株钩端螺旋体进行暗视野显微镜凝集试验确定血清群。PCR扩增16SrRNA基因、测序,确定基因种。利用MLST(multilocus sequence typing)研究进行基因分型分析,并应用BioNumerics(Version5.10)软件进行聚类分析。结果血清群鉴定:27株菌株隶属于4个血清群,其中黄疸出血群为主要优势血清群,占59.26%,其次依次是爪哇群25.92%、澳洲群7.41%和巴达维亚群7.41%。基因种鉴定:27株菌株隶属于L.interrogans和L.borgpetersenii 2个致病性基因种,L.interrogans为江西省主要优势型别,占77.78%。MLST研究显示27株菌株隶属于5个ST型别,其中ST1为主要基因型,占59.26%。BioNumerics软件分析:27株菌株分为5个Clusters对应于5个ST型,MLST基因型别具有明显的地域性特征,而年代间变化不明显。结论黄疸出血群为江西省主要流行血清群,L.interrogan为主要致病基因种,ST1为主要基因型,充分了解江西省钩体病血清学和分子流行病学特征将对钩体病防控和疫苗制备有一定的指导意义。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 血清群 基因种 MLST
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云南烟草上出现番茄斑萎病毒(Tospovirus)属病毒 被引量:7
14
作者 刘雅婷 卢秀萍 +2 位作者 郑元仙 李永忠 李正跃 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 2008年第6期53-56,共4页
2004-2007年间对云南省烤烟种植区进行调查,在云南省楚雄和文山2个地区,获得3份疑似Tospovirus属病毒的样本。通过Tospovirus组引物(Tospovirus Group Primer)进行RT-PCR扩增、克隆和测序,获得500nts核酸片段,通过NCBI BLAST网络... 2004-2007年间对云南省烤烟种植区进行调查,在云南省楚雄和文山2个地区,获得3份疑似Tospovirus属病毒的样本。通过Tospovirus组引物(Tospovirus Group Primer)进行RT-PCR扩增、克隆和测序,获得500nts核酸片段,通过NCBI BLAST网络数据库比对,确定这3份样品为Tospovirus属的病毒;通过DNAman软件比对分析所得到的核酸序列和已经公布的Tospovirus属病毒RNA L同位点序列,从得到的系统进化图可以看出,云南3个样品明显分为2簇,即YN-1和YN-2,分别与血清组I和Ⅵ的Tospovirus属病毒聚为一簇。 展开更多
关键词 番茄斑萎病毒属 鉴定 血清组
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多位点序列分型应用于致病性黄疸出血群钩端螺旋体分析 被引量:6
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作者 张翠彩 徐建民 +2 位作者 李秀文 曹志强 蒋秀高 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期395-398,共4页
目的初步探讨MLST(multilocus sequence typing)分型技术在致病性钩端螺旋体中的应用。方法对我国3个省份的39株致病性钩端螺旋体黄疸出血群菌株提取DNA,采用7个位点进行PCR扩增、序列测定,应用eBURST和BioNumerics(Version5.10)软件进... 目的初步探讨MLST(multilocus sequence typing)分型技术在致病性钩端螺旋体中的应用。方法对我国3个省份的39株致病性钩端螺旋体黄疸出血群菌株提取DNA,采用7个位点进行PCR扩增、序列测定,应用eBURST和BioNumerics(Version5.10)软件进行分析。结果 39株菌株呈现5个ST型别,ST1为中国三省份中主要的基因型,占53.85%(21/39)。eBURST分析显示:39株菌株分为2个Clonal complexes和1个singleton,其中Group1占66.67%(26/39),Group2占20.51%(8/39),一个singleton占12.82%(5/39);BioNumerics软件聚类分析显示:39株菌株分为3个Group,与eBURST分析中的分群结构一致。MLST基因型别具有明显的地域性特征。结论 MLST方法可初步应用于致病性钩端螺旋体分子流行病学、种群结构、亲缘进化关系等研究。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 黄疸出血群 基因分型 MLST
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102株侵袭性肺炎链球菌血清型分布特征及耐药谱分析 被引量:9
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作者 任红宇 王艳晴 +2 位作者 李一楠 赵娜 秦天 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期801-807,共7页
目的了解侵袭性肺炎链球菌菌株血清群/型分布特征和菌株耐药性情况。方法选用本科室保存的102株侵袭性肺炎链球菌菌株(来自内蒙古、宁夏、四川及辽宁)。合成23种肺炎链球菌血清群/型特异性引物,采用多重PCR方法扩增进行初筛,扩增阳性的... 目的了解侵袭性肺炎链球菌菌株血清群/型分布特征和菌株耐药性情况。方法选用本科室保存的102株侵袭性肺炎链球菌菌株(来自内蒙古、宁夏、四川及辽宁)。合成23种肺炎链球菌血清群/型特异性引物,采用多重PCR方法扩增进行初筛,扩增阳性的用荚膜肿胀方法进行复核验证。并选用24种抗生素进行药物敏感性实验。结果102株侵袭性肺炎链球菌共分为21个血清群,主要流行血清群/型(株数由高到低)依次为19、6、14、23、35/42、34、3、22A、15、1、18、4、5、7B、8、10A、11A、13、17A、20、33F。含10株以上的是19群、6群、14群。24种抗生素中,莫西沙星、吉米沙星、头孢曲松、多西环素未发现耐药菌株。其余20种抗生素均有耐药菌株出现。耐药率大于90%的抗生素从高到低依次为:阿奇霉素、地红霉素、克拉霉素、红霉素;耐药率小于10%的依次为:万古霉素、青霉素(注射)、利奈唑胺、美罗培南、利福平、左氧氟沙星、阿莫西林/克拉维酸、头孢吡肟。结论我国侵袭性肺炎链球菌分离株以19群、6群、14群最多见;23价肺炎疫苗覆盖血清群但不包含的血清型(6A、6C、6D、15C、23B、22A、18A、7B、17A)和非疫苗相关的13群、34群、35/42群也占有一定比例。治疗由肺炎链球菌引起的感染首选吉米沙星、莫西沙星、头孢曲松、多西环素等抗生素。 展开更多
关键词 侵袭性肺炎链球菌 血清群/型 抗生素耐药性 非疫苗相关血清群/型
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洪灾区钩端螺旋体宿主动物及健康人群感染情况的流行病学研究 被引量:6
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作者 周价 黄昕 +6 位作者 何华先 张潇 刘爱忠 杨土保 李硕颀 汤学民 谭红专 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期99-103,共5页
目的:了解洪灾区钩端螺旋体宿主动物的带菌情况及人群的免疫水平。方法:应用柯素夫培养法作牛尿和鼠肾钩体培养。显微凝集试验(microscopic agglutination test,MAT)作钩体及人群钩体感染的血清学分群(型)。结果:灾区、临灾区及新建移... 目的:了解洪灾区钩端螺旋体宿主动物的带菌情况及人群的免疫水平。方法:应用柯素夫培养法作牛尿和鼠肾钩体培养。显微凝集试验(microscopic agglutination test,MAT)作钩体及人群钩体感染的血清学分群(型)。结果:灾区、临灾区及新建移民点的鼠密度分别为6.95%,6.28%及8.67%;鼠肾钩体培养阳性率分别为4.63%,1.35%和3.13%;牛尿培养阳性率分别为5.88%,5.98%和1.75%;分离的菌株主要为黄疸出血型及犬型;人群钩体抗体阳性率分别为45.91%,62.30%和58.67%,明显高于全省及全国的平均感染率;其主要血清学分型依次为黄疸出血、秋季热、犬型、泼摩那型、巴达维亚型;人群抗体阳性率无年龄差异。结论:3个不同区域的宿主动物鼠和牛中均有钩体带菌,人群钩体隐性感染率水平较高,宿主动物和人群感染的主要血清群相吻合,主要为黄疸出血型。 展开更多
关键词 洪灾 钩端螺旋体 血清型 人群感染 宿主动物
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洪湖市土壤中快生型大豆根瘤菌的多样性 被引量:8
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作者 陈雯莉 李阜棣 +1 位作者 周俊初 王福生 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第6期581-587,共7页
从湖北省洪湖市土壤中分离纯化了92株快生型大豆根瘤菌。用来自8个取样地点的12个快生型典型菌株和1个慢生型菌株的抗血清检测了该快生型大豆根瘤菌群体的抗原构成。其中65株菌归入15个血清型,20.7%属于USDA205... 从湖北省洪湖市土壤中分离纯化了92株快生型大豆根瘤菌。用来自8个取样地点的12个快生型典型菌株和1个慢生型菌株的抗血清检测了该快生型大豆根瘤菌群体的抗原构成。其中65株菌归入15个血清型,20.7%属于USDA205型,15.2%为Ad301(1)型。有27株不与已知抗血清反应,为未知的血清型。对供试菌株质粒进行的快速检测结果表明,各菌株均含有2~6个质粒,其中最大的质粒在500Md左右。含4个质粒的菌株最多,含5~6个质粒的菌株较少。根据质粒图谱分析,洪湖快生型大豆根瘤菌可分为11个质粒型.菌株的质粒型与血清型之间无明显相关性。 展开更多
关键词 多样性 质粒 快生型 大豆 根瘤菌
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食品来源副溶血性弧菌毒力基因分布及分子分型研究 被引量:5
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作者 陈晶 黄建飞 +4 位作者 刘丛丛 刘灵燕 赖小红 杨国武 兰全学 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期239-241,249,共4页
分析食品中分离获得的副溶血性弧菌主要毒力基因的分布特征、血清型及分子分型特点,为食源性副溶血性弧菌感染暴发的早期预警和疫情溯源提供实验室数据。提取40株副溶血性弧菌基因组,分别用PCR检测VcrD1、Vp1680、VopP和VcrD2基因,荧光... 分析食品中分离获得的副溶血性弧菌主要毒力基因的分布特征、血清型及分子分型特点,为食源性副溶血性弧菌感染暴发的早期预警和疫情溯源提供实验室数据。提取40株副溶血性弧菌基因组,分别用PCR检测VcrD1、Vp1680、VopP和VcrD2基因,荧光PCR检测tdh、trh和tlh基因。对40株菌株进行血清型分型并采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对其进行分子分型。利用BioNumerics软件对图谱进行聚类分析,建立PFGE分子分型数据库。40株菌株均未检测到tdh、trh、Vop P和VcrD2基因,tlh、VcrD1和Vp1680基因阳性检测率为100%。40株菌株中含有16种血清型,其中9株未分型,主要血清型为O_2∶K_(28)和O_5∶K_(17),血清型分布呈多样性。40株菌株共获得39个不同的PFGE带型,PFGE呈现遗传多样性,无优势带型。本实验食品环境中分离的副溶血性弧菌未发现毒力因子,副溶血性弧菌血清型呈分散趋势且菌株之间亲缘关系较远。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 脉冲场凝胶电泳 血清分型 毒力基因
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兔源F型多杀性巴氏杆菌荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:7
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作者 王锦祥 林松华 +5 位作者 陈冬金 孙世坤 陈岩锋 高承芳 桑雷 谢喜平 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期156-160,共5页
为建立特异性强且敏感性高的兔源F型多杀性巴氏杆菌(Pm)快速检测方法,本实验根据F型Pm fcbD基因的保守序列设计特异性引物和探针,经反应条件优化,建立了检测兔源F型Pm的荧光定量PCR方法。利用该方法检测兔源F型Pm、兔源A和D型Pm、支气... 为建立特异性强且敏感性高的兔源F型多杀性巴氏杆菌(Pm)快速检测方法,本实验根据F型Pm fcbD基因的保守序列设计特异性引物和探针,经反应条件优化,建立了检测兔源F型Pm的荧光定量PCR方法。利用该方法检测兔源F型Pm、兔源A和D型Pm、支气管败血波氏杆菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、魏氏梭菌和金黄色葡萄球菌等临床常见兔源病原菌,结果显示,该方法仅对兔源F型Pm检测为阳性,其余病原菌均为阴性,特异性强。利用该方法分别检测10倍倍比稀释(1×10^(8)拷贝/μL~1×10^(0)拷贝/μL)的兔源F型Pm基因组DNA,进行敏感性试验,结果显示该方法的检测限为10拷贝/μL,敏感性分别是已报导的双重PCR方法和环介导等温扩增方法的100倍和10倍,敏感性高。利用该方法对不同稀释度的质粒标准品进行批内和批间重复性试验,结果显示,批内和批间变异系数均小于3%,重复性好。利用该方法检测64份已知结果的临床样品,结果显示该方法的检测结果与已报导的双重PCR方法和环介导等温扩增方法检测结果的符合率均为100%,准确性高。本研究首次以fcbD为靶基因建立兔源F型Pm的荧光定量PCR检测方法,为兔源F型Pm的检测提供了有力的技术手段。 展开更多
关键词 F型多杀性巴氏杆菌 fcbD基因 荧光定量PCR方法
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