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基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试
1
作者
张留所
孔晓瑜
+2 位作者
喻子牛
孔杰
相建海
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期1-4,共4页
微卫星的发展主要受限于微卫星及其旁侧特异引物区的分离,在中国明对虾(Fenner-openaeus chinensis)中建立了选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL,selective amplified mic-rosatellite polymorphic loci)技术体系,并初步尝试了基于SAMPL的...
微卫星的发展主要受限于微卫星及其旁侧特异引物区的分离,在中国明对虾(Fenner-openaeus chinensis)中建立了选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL,selective amplified mic-rosatellite polymorphic loci)技术体系,并初步尝试了基于SAMPL的一种微卫星筛选方法。通过5′端锚定引物引入微卫星序列,对传统SAMPL技术加以改进并以期富集简单重复序列。从测序胶上随机选择5条SAMPL条带(分别命名为S11,S13,S14,S22,S24)克隆测序,大小分别为161,157,147,152,298。其中S11,S13,S14,S22四个片段两端引物分别为AFLP选择性引物和SAMPL引物,S13和S22含微卫星序列重复,S24两端引物均为传统的AFLP引物,在此片断中有一(AG)39重复。
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关键词
选择性扩增多态微卫星位点(
sampl
)
中国明对虾(Fenneropenaeus
chinensis)
微卫星
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职称材料
RAPD分析中最适样本量和位点数的研究
被引量：
12
2
作者
刘丽
刘楚吾
曾健民
《湛江海洋大学学报》
CAS
2005年第4期1-4,共4页
用25个引物,对40个样本扩增,研究了勒氏笛鲷随机扩增多态性DNA(RAPD)分析中的最适样本量和位点数。结果显示:在样本量达到20且位点数达到70个以上时,遗传距离趋于一个稳定的数值,即在RAPD分析中,样本数应达到20且位点数应达到70才能保...
用25个引物,对40个样本扩增,研究了勒氏笛鲷随机扩增多态性DNA(RAPD)分析中的最适样本量和位点数。结果显示:在样本量达到20且位点数达到70个以上时,遗传距离趋于一个稳定的数值,即在RAPD分析中,样本数应达到20且位点数应达到70才能保证结果的可靠性。
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关键词
勒氏笛鲷
随机扩增多态性DNA(RAPD)
遗传距离
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位点数
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职称材料
题名
基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试
1
作者
张留所
孔晓瑜
喻子牛
孔杰
相建海
机构
中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室
中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室
中国水产科学研究院黄海水产研究所
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期1-4,共4页
基金
国家863计划(2001AA620105)
国家自然科学基金重点课题(30230280)
海水养殖教育部重点实验室基金
文摘
微卫星的发展主要受限于微卫星及其旁侧特异引物区的分离,在中国明对虾(Fenner-openaeus chinensis)中建立了选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL,selective amplified mic-rosatellite polymorphic loci)技术体系,并初步尝试了基于SAMPL的一种微卫星筛选方法。通过5′端锚定引物引入微卫星序列,对传统SAMPL技术加以改进并以期富集简单重复序列。从测序胶上随机选择5条SAMPL条带(分别命名为S11,S13,S14,S22,S24)克隆测序,大小分别为161,157,147,152,298。其中S11,S13,S14,S22四个片段两端引物分别为AFLP选择性引物和SAMPL引物,S13和S22含微卫星序列重复,S24两端引物均为传统的AFLP引物,在此片断中有一(AG)39重复。
关键词
选择性扩增多态微卫星位点(
sampl
)
中国明对虾(Fenneropenaeus
chinensis)
微卫星
Keywords
selective amplified microsatellite polymorphic loci（sampl）
Fenneropenaeus chinensis
microsatellite
分类号
Q31 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
RAPD分析中最适样本量和位点数的研究
被引量：
12
2
作者
刘丽
刘楚吾
曾健民
机构
湛江海洋大学海洋生物研究所
出处
《湛江海洋大学学报》
CAS
2005年第4期1-4,共4页
基金
广东省重大科技兴海项目(A200099A01)
湛江市科技攻关项目(2000-17)
文摘
用25个引物,对40个样本扩增,研究了勒氏笛鲷随机扩增多态性DNA(RAPD)分析中的最适样本量和位点数。结果显示:在样本量达到20且位点数达到70个以上时,遗传距离趋于一个稳定的数值,即在RAPD分析中,样本数应达到20且位点数应达到70才能保证结果的可靠性。
关键词
勒氏笛鲷
随机扩增多态性DNA(RAPD)
遗传距离
样本量
位点数
Keywords
Lutjanus russwlli Bleeker
Random
amplified
polymorphic
DNA（RAPD）
Genetic distance
sampl
e quantity
loci
quantity
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
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1
基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试
张留所
孔晓瑜
喻子牛
孔杰
相建海
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006
0
在线阅读
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职称材料
2
RAPD分析中最适样本量和位点数的研究
刘丽
刘楚吾
曾健民
《湛江海洋大学学报》
CAS
2005
12
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职称材料
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