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江西稻瘟病菌DNA指纹分析及遗传宗谱结构
被引量:
16
1
作者
马辉刚
朱有勇
+2 位作者
胡水秀
黄瑞荣
何霞红
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
2003年第3期407-411,共5页
应用Rep-PCR (Repetitiveelement-basedPCR)分子指纹技术 ,完成了江西 99个稻瘟病菌株DNA指纹谱型的分析。结果表明 ,以相似度 75 %为界 ,可以将江西省不同稻区采集的 99个菌株划分为 1 4个遗传宗谱。其中 ,4、1和 1 0三个宗谱为优势宗...
应用Rep-PCR (Repetitiveelement-basedPCR)分子指纹技术 ,完成了江西 99个稻瘟病菌株DNA指纹谱型的分析。结果表明 ,以相似度 75 %为界 ,可以将江西省不同稻区采集的 99个菌株划分为 1 4个遗传宗谱。其中 ,4、1和 1 0三个宗谱为优势宗谱 ,宗谱 4有 3 7个菌株 ,宗谱 1有 1 8个菌株 ,宗谱 1 0有 1 2个菌株 ,分别占总数的 3 7.3 7%、1 8.1 8%、1 2 .1 2 % ,宗谱 5、2、7、1 2、3、1 3的菌株数分别为 7、6、5、5、2和 2株 ,其余 5个宗谱所含菌株数均为 1株。宗谱GL4分布最广 ,在赣东丘陵山地区 (GD)、赣南山地丘陵区 (GN)、赣西丘陵山地区 (GX)、赣北鄱阳湖平原区 (GB)和赣中吉泰盆地区 (GZ) 5大稻区均有分布。其次是宗谱 1、5和 1 0 ,在GD、GN、GX和GB 4大稻区有分布。同一稻作区的病菌存在多个不同的遗传宗谱。从中可以看出江西省稻瘟病菌群体结构的多样性和复杂性。
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关键词
稻瘟病菌
DNA
指纹
分析
遗传宗谱
rep-pcr
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职称材料
四川部分稻瘟病菌的DNA指纹分析
被引量:
6
2
作者
卢代华
叶慧丽
+5 位作者
龚学书
周西全
陈国华
蒋国荣
毛建辉
余桂蓉
《四川农业大学学报》
CSCD
2003年第2期126-128,144,共4页
应用rep PCR(repetitiveelement basedpolymerasechainreaction)分子指纹技术,对28个四川稻瘟病菌菌株进行了DNA指纹特征分析和相似百分率比较。结果表明,供试菌株基因组用Pot2-1和Pot2-2引物共扩增出26条DNA谱带,其中11条为多态性DNA带...
应用rep PCR(repetitiveelement basedpolymerasechainreaction)分子指纹技术,对28个四川稻瘟病菌菌株进行了DNA指纹特征分析和相似百分率比较。结果表明,供试菌株基因组用Pot2-1和Pot2-2引物共扩增出26条DNA谱带,其中11条为多态性DNA带,各菌株分别扩增出10条左右不等的带谱;供试菌株传统的小种划分与DNA指纹特征的相似百分率比较没有明显的相关性。
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关键词
稻瘟病菌
rep-pcr
DNA
指纹
分析
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职称材料
四川稻瘟病菌分子指纹聚类分析及与病菌致病型比较研究
被引量:
2
3
作者
卢代华
叶慧丽
+4 位作者
周西全
陈国华
蒋国荣
毛建辉
何霞红
《西南农业学报》
CSCD
2004年第3期328-330,共3页
应用rep PCR(repetitiveelement basedpolymerasechainreaction)分子指纹技术,对75个四川稻瘟病菌菌株进行了DNA分子指纹扩增和聚类分析。结果表明,供试菌株基因组用Pot2 1和Pot2 2引物共扩增出29条DNA谱带,其中14条为多态性DNA带,各菌...
应用rep PCR(repetitiveelement basedpolymerasechainreaction)分子指纹技术,对75个四川稻瘟病菌菌株进行了DNA分子指纹扩增和聚类分析。结果表明,供试菌株基因组用Pot2 1和Pot2 2引物共扩增出29条DNA谱带,其中14条为多态性DNA带,各菌株分别扩增出4到17条不等的带谱;经聚类分析,在0 19连锁距离点,所有供试菌株分为7个遗传宗亲群组,其中第5宗亲群和7宗亲群分别为优势宗亲群。供试菌株传统小种划分的致病型与遗传宗亲群之间没有明显的相关性。
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关键词
稻瘟病菌
rep-pcr
聚类
分析
致病型
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职称材料
幽门螺杆菌临床分离株的REPPCR分析
被引量:
2
4
作者
彭颖
吕建新
+1 位作者
叶嗣颖
黄庆华
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期684-686,共3页
应用REP PCR对来自20例单纯性胃炎和20例消化性溃疡病人的幽门螺杆菌菌株进行基因分型,并运用SAS软件进行聚类分析。结果显示这些菌株按照基因型被分为两大类,但两种来源的菌株在两大类中的比例无明显差异(P>0.1),提示幽门螺杆菌临...
应用REP PCR对来自20例单纯性胃炎和20例消化性溃疡病人的幽门螺杆菌菌株进行基因分型,并运用SAS软件进行聚类分析。结果显示这些菌株按照基因型被分为两大类,但两种来源的菌株在两大类中的比例无明显差异(P>0.1),提示幽门螺杆菌临床分离株REP PCR基因型与致病性之间不存在明显相关性。
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关键词
幽门螺杆菌
临床分离株
rep-pcr
分析
基因
分型
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职称材料
多杀巴氏杆菌REP—PCR分析
5
作者
Town.,KM
李凯年
《国外兽医学(畜禽传染病)》
1998年第4期55-56,共2页
关键词
多杀巴氏杆菌
rep-pcr
分析
菌株
离病
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职称材料
桑树根际解磷细菌的分离鉴定及解磷能力测定
被引量:
14
6
作者
吴凡
崔萍
+3 位作者
夏尚远
杨少波
辛磊
刘训理
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期521-527,共7页
桑树根际解磷细菌能够改善桑树营养,促进根系生长。利用选择性培养基,从桑树根际分离获得32个具有解磷能力的细菌分离物,经rep-PCR基因指纹分析得到19株解磷细菌。经解磷能力测定,PYP2、PYP4、PYP6、FYP2菌株具有较强的解有机磷能力,FWP...
桑树根际解磷细菌能够改善桑树营养,促进根系生长。利用选择性培养基,从桑树根际分离获得32个具有解磷能力的细菌分离物,经rep-PCR基因指纹分析得到19株解磷细菌。经解磷能力测定,PYP2、PYP4、PYP6、FYP2菌株具有较强的解有机磷能力,FWP7、PWP4菌株具有较强的解无机磷能力,FWP1、FWP9、FWP11、PYP6和PWP1菌株的解有机磷和无机磷能力均较强。利用菌落形态特征观察及16S rDNA碱基序列测定和同源性分析,对具有较高解磷能力的菌株进行了鉴定:FWP1、FWP11、PYP2、PYP6、FYP2菌株为假单胞菌属(Pseudomonas sp.),FWP9和PWP1菌株为贪噬菌属(Variovorax sp.),FWP7、PWP4菌株为根瘤菌属(Rhizobium sp.)。
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关键词
桑树
解磷细菌
rep-pcr基因指纹分析
解磷能力
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职称材料
题名
江西稻瘟病菌DNA指纹分析及遗传宗谱结构
被引量:
16
1
作者
马辉刚
朱有勇
胡水秀
黄瑞荣
何霞红
机构
江西省农业科学院植保研究所
云南农业大学植病实验室
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
2003年第3期407-411,共5页
基金
国家 8 63项目 (Z1 6-0 3 -M)
江西省科技厅重点攻关项目
文摘
应用Rep-PCR (Repetitiveelement-basedPCR)分子指纹技术 ,完成了江西 99个稻瘟病菌株DNA指纹谱型的分析。结果表明 ,以相似度 75 %为界 ,可以将江西省不同稻区采集的 99个菌株划分为 1 4个遗传宗谱。其中 ,4、1和 1 0三个宗谱为优势宗谱 ,宗谱 4有 3 7个菌株 ,宗谱 1有 1 8个菌株 ,宗谱 1 0有 1 2个菌株 ,分别占总数的 3 7.3 7%、1 8.1 8%、1 2 .1 2 % ,宗谱 5、2、7、1 2、3、1 3的菌株数分别为 7、6、5、5、2和 2株 ,其余 5个宗谱所含菌株数均为 1株。宗谱GL4分布最广 ,在赣东丘陵山地区 (GD)、赣南山地丘陵区 (GN)、赣西丘陵山地区 (GX)、赣北鄱阳湖平原区 (GB)和赣中吉泰盆地区 (GZ) 5大稻区均有分布。其次是宗谱 1、5和 1 0 ,在GD、GN、GX和GB 4大稻区有分布。同一稻作区的病菌存在多个不同的遗传宗谱。从中可以看出江西省稻瘟病菌群体结构的多样性和复杂性。
关键词
稻瘟病菌
DNA
指纹
分析
遗传宗谱
rep-pcr
Keywords
Magnaporthe grisea
rep-pcr
DNA fingerprinting
genetic lineage
分类号
S435.111.41 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
四川部分稻瘟病菌的DNA指纹分析
被引量:
6
2
作者
卢代华
叶慧丽
龚学书
周西全
陈国华
蒋国荣
毛建辉
余桂蓉
机构
四川省农科院植保所
四川省农科院生物技术核技术研究所
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
2003年第2期126-128,144,共4页
基金
四川省应用基础研究项目(01NY051-30)。
文摘
应用rep PCR(repetitiveelement basedpolymerasechainreaction)分子指纹技术,对28个四川稻瘟病菌菌株进行了DNA指纹特征分析和相似百分率比较。结果表明,供试菌株基因组用Pot2-1和Pot2-2引物共扩增出26条DNA谱带,其中11条为多态性DNA带,各菌株分别扩增出10条左右不等的带谱;供试菌株传统的小种划分与DNA指纹特征的相似百分率比较没有明显的相关性。
关键词
稻瘟病菌
rep-pcr
DNA
指纹
分析
Keywords
Magnaporth.grisea
rep-pcr
DNA fingerprinting
分类号
S435.111.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
四川稻瘟病菌分子指纹聚类分析及与病菌致病型比较研究
被引量:
2
3
作者
卢代华
叶慧丽
周西全
陈国华
蒋国荣
毛建辉
何霞红
机构
四川省农科院植保所
云南农业大学云南省植物病理重点实验室
出处
《西南农业学报》
CSCD
2004年第3期328-330,共3页
基金
四川省应用基础研究项目(01NY051-30)
文摘
应用rep PCR(repetitiveelement basedpolymerasechainreaction)分子指纹技术,对75个四川稻瘟病菌菌株进行了DNA分子指纹扩增和聚类分析。结果表明,供试菌株基因组用Pot2 1和Pot2 2引物共扩增出29条DNA谱带,其中14条为多态性DNA带,各菌株分别扩增出4到17条不等的带谱;经聚类分析,在0 19连锁距离点,所有供试菌株分为7个遗传宗亲群组,其中第5宗亲群和7宗亲群分别为优势宗亲群。供试菌株传统小种划分的致病型与遗传宗亲群之间没有明显的相关性。
关键词
稻瘟病菌
rep-pcr
聚类
分析
致病型
Keywords
Magnaporth grisea
rep-pcr
cluster analysis
pathotypes
分类号
S435.111.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
幽门螺杆菌临床分离株的REPPCR分析
被引量:
2
4
作者
彭颖
吕建新
叶嗣颖
黄庆华
机构
温州医学院细胞与分子医学研究所
华中科技大学同济医学院微生物学教研室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期684-686,共3页
基金
卫生部科学研究基金(No.98-1-123)资助
文摘
应用REP PCR对来自20例单纯性胃炎和20例消化性溃疡病人的幽门螺杆菌菌株进行基因分型,并运用SAS软件进行聚类分析。结果显示这些菌株按照基因型被分为两大类,但两种来源的菌株在两大类中的比例无明显差异(P>0.1),提示幽门螺杆菌临床分离株REP PCR基因型与致病性之间不存在明显相关性。
关键词
幽门螺杆菌
临床分离株
rep-pcr
分析
基因
分型
Keywords
Helicobacter pylori
REPPCR
genotype
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
多杀巴氏杆菌REP—PCR分析
5
作者
Town.,KM
李凯年
出处
《国外兽医学(畜禽传染病)》
1998年第4期55-56,共2页
关键词
多杀巴氏杆菌
rep-pcr
分析
菌株
离病
分类号
S855.12 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
桑树根际解磷细菌的分离鉴定及解磷能力测定
被引量:
14
6
作者
吴凡
崔萍
夏尚远
杨少波
辛磊
刘训理
机构
山东农业大学林学院
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期521-527,共7页
基金
山东省科技攻关项目(编号02201010102)
文摘
桑树根际解磷细菌能够改善桑树营养,促进根系生长。利用选择性培养基,从桑树根际分离获得32个具有解磷能力的细菌分离物,经rep-PCR基因指纹分析得到19株解磷细菌。经解磷能力测定,PYP2、PYP4、PYP6、FYP2菌株具有较强的解有机磷能力,FWP7、PWP4菌株具有较强的解无机磷能力,FWP1、FWP9、FWP11、PYP6和PWP1菌株的解有机磷和无机磷能力均较强。利用菌落形态特征观察及16S rDNA碱基序列测定和同源性分析,对具有较高解磷能力的菌株进行了鉴定:FWP1、FWP11、PYP2、PYP6、FYP2菌株为假单胞菌属(Pseudomonas sp.),FWP9和PWP1菌株为贪噬菌属(Variovorax sp.),FWP7、PWP4菌株为根瘤菌属(Rhizobium sp.)。
关键词
桑树
解磷细菌
rep-pcr基因指纹分析
解磷能力
Keywords
Mulberry
Phosphbacteria
rep-pcr
fingerprint
Phosphate solubirizing capacity
分类号
S888 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江西稻瘟病菌DNA指纹分析及遗传宗谱结构
马辉刚
朱有勇
胡水秀
黄瑞荣
何霞红
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
2003
16
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职称材料
2
四川部分稻瘟病菌的DNA指纹分析
卢代华
叶慧丽
龚学书
周西全
陈国华
蒋国荣
毛建辉
余桂蓉
《四川农业大学学报》
CSCD
2003
6
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职称材料
3
四川稻瘟病菌分子指纹聚类分析及与病菌致病型比较研究
卢代华
叶慧丽
周西全
陈国华
蒋国荣
毛建辉
何霞红
《西南农业学报》
CSCD
2004
2
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职称材料
4
幽门螺杆菌临床分离株的REPPCR分析
彭颖
吕建新
叶嗣颖
黄庆华
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2002
2
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职称材料
5
多杀巴氏杆菌REP—PCR分析
Town.,KM
李凯年
《国外兽医学(畜禽传染病)》
1998
0
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职称材料
6
桑树根际解磷细菌的分离鉴定及解磷能力测定
吴凡
崔萍
夏尚远
杨少波
辛磊
刘训理
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007
14
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职称材料
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