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应用ARDRA技术对细菌性阴道病的微生态分析: 1; 作者张瑜杨宇 +3 位作者师舞阳蔡净亭杨立张怡《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1626-1629,1633,共5页; 目的了解细菌性阴道病(BV)患者阴道细菌种群微生态变化。方法采用ARDRA方法对3例BV患者及1例健康妇女阴道分泌物的细菌16S rDNA进行分析。结果3例BV患者分别检测到37、36和31个OTUs,而正常妇女中仅检测到16个;健康妇女阴道的优势菌群为... 展开更多; 关键词细菌性阴道病微生态 dna限制性分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

热带雨林土壤真菌18S rRNA基因多样性分析被引量：3: 2; 作者赵志祥肖敏 +3 位作者郑芬梁延坡谢丙炎陈绵才《安徽农业科学》 CAS 2012年第11期6378-6382,共5页; [目的]探讨热带雨林土壤真菌群落结构,阐释微生物与植物之间的互作关系,以期为开发利用热带雨林这一特殊生态环境中丰富的微生物基因资源提供理论依据。[方法]运用扩增18S rDNA限制性分析(Amplified 18S ribosomal DNA restriction anal... 展开更多; 关键词热带雨林土壤真菌 18S rRNA基因克隆文库酶切分型系统进化分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

油烟污染对土壤假单胞菌种群多样性的影响被引量：1: 3; 作者马艳玲陈邦《西北大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1026-1030,共5页; 目的确定油烟污染土壤中假单胞菌种群结构的组成情况。方法采用未培养技术直接从长期受油烟污染的土壤样品中提取微生物基因组总DNA,构建基于假单胞菌特异性引物PCR扩增的16S rRNA基因克隆文库,通过HaeⅢ限制性内切酶对基因文库的克隆... 展开更多; 关键词油烟污染土壤假单胞菌种群多样性限制性片段多态性分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

金钗石斛内生细菌的组成及多样性分析被引量：16: 4; 作者吴庆珊雷珣 +3 位作者雷友梅蒲星刘颖翁庆北《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期79-90,共12页; 采用9种培养基对贵州省的赤水市旺隆镇(P1)、贵阳市贵州师范大学生命科学学院大棚(P2)和金沙县台金生态农业观光园(P3)内栽培的金钗石斛(Dendrobium nobile Lindl.)根、茎和叶中的内生细菌进行了分离,并采用扩增核糖体DNA限制性分析(ARD... 展开更多; 关键词金钗石斛内生细菌扩增核糖体dna限制性分析(ardra) 组成分析多样性分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

刺参消化道中蛭弧菌类的生物多样性分析被引量：1: 5; 作者韩民泳陈慧黠 +2 位作者斯晗刘洋陈亚东《微生物学杂志》 CAS CSCD 2015年第6期44-48,共5页; 研究了刺参消化道中蛭弧菌类生物多样性。用刺参肠道内容物提取微生物总DNA,分别使用蛭弧菌类生物特异性引物Bd、Bac扩增获得16S r DNA目的片段,连接p MD19-T载体,转化到大肠埃希菌DH5α感受态细胞,经蓝白斑筛选及阳性克隆筛选,通过核糖... 展开更多; 关键词蛭弧菌类生物刺参肠道核糖体dna扩增片段限制性内切酶分析(ardra) 双酶切多样性; 在线阅读下载PDF 职称材料

金钗石斛提取物对便秘模型小鼠通便功能的影响被引量：4: 6; 作者王微微范红结 +5 位作者杨文红夏开艳黎华贵李晓丽王诗满张艳《食品工业科技》 CAS 北大核心 2021年第20期342-347,共6页; 目的:探讨金钗石斛提取物对小鼠便秘的改善作用及其对肠道中乳酸杆菌多样性的影响。方法:构建复方地芬诺酯便秘小鼠模型,灌胃高(300 mg/kg)、中(100 mg/kg)、低(30 mg/kg)三个剂量的金钗石斛提取物,观察小鼠的排便功能和小肠推进率;采... 展开更多; 关键词金钗石斛便秘通便功能乳酸杆菌扩增核糖体dna 限制性分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

湖北黄石典型水域超微型真核浮游生物多样性研究被引量：3: 7; 作者于佳骏段钰涵 +3 位作者刘科赛刘细霞侯建军李运涛《生态科学》 CSCD 2019年第1期137-142,共6页; 为探讨湖北省黄石市典型水域中超微型真核浮游生物多样性,采用18SrDNA扩增片段限制性酶切技术,结合优势类群测序及相关统计学分析,对2015年夏季湖北黄石境内营养程度不同的典型水域(长江,磁湖,青山湖,青港湖)中超微型真核浮游生物的群... 展开更多; 关键词超微型真核浮游生物生物多样性 ardra技术淡水水域; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用ARDRA技术对细菌性阴道病的微生态分析: 1; 作者张瑜杨宇师舞阳蔡净亭杨立张怡; 机构中南大学湘雅医院妇产科中南大学资源加工与生物工程系; 出处《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1626-1629,1633,共5页; 基金湖南省自然科学基金(08JJ3055); 文摘目的了解细菌性阴道病(BV)患者阴道细菌种群微生态变化。方法采用ARDRA方法对3例BV患者及1例健康妇女阴道分泌物的细菌16S rDNA进行分析。结果3例BV患者分别检测到37、36和31个OTUs,而正常妇女中仅检测到16个;健康妇女阴道的优势菌群为乳酸杆菌,而BV患者中的优势菌群包括纤毛菌属、普氏菌属、埃氏巨型球菌属等。3例BV患者所检测的11个优势克隆子中,仅2个为已纯培养的细菌,其余9个均为未纯培养细菌。结论细菌性阴道病患者与健康妇女的微生态存在明显差异,DNA限制性分析技术是对阴道菌群微生态进行快速分析的有力工具,可以鉴定出常规培养方法不能鉴定的潜在致病菌。; 关键词细菌性阴道病微生态 dna限制性分析; Keywords bacterial vaginosis microbial ecology amplified ribosomal dna restriction analysis; 分类号 R711.3 [医药卫生—妇产科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名热带雨林土壤真菌18S rRNA基因多样性分析被引量：3: 2; 作者赵志祥肖敏郑芬梁延坡谢丙炎陈绵才; 机构海南省农业科学院农业环境与植物保护研究所海南省植物病虫害综合防控重点实验室中国农业科学院蔬菜花卉研究所; 出处《安徽农业科学》 CAS 2012年第11期6378-6382,共5页; 基金国家自然科学基金(31160024); 文摘 [目的]探讨热带雨林土壤真菌群落结构,阐释微生物与植物之间的互作关系,以期为开发利用热带雨林这一特殊生态环境中丰富的微生物基因资源提供理论依据。[方法]运用扩增18S rDNA限制性分析(Amplified 18S ribosomal DNA restriction analysis,ARDRA)和18S rRNA基因序列分析技术,分析了热带雨林土壤真菌物种丰度、优势种群和进化关系等群落结构特征。试验采用PVPP洗涤-CTAB-溶菌酶-蛋白酶K-SDS热处理等方法,提纯微生物总DNA,构建真菌18S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行ARDRA分析,选取有代表性的克隆测序,利用DOTUR软件将真菌序列按照97%相似性的标准分成若干个可操作分类单元(Operational taxonomic u-nit,OTU)。[结果]构建的克隆文库包含21个OTU,其中以子囊菌和担子菌为主,各占克隆文库的64.7%和15.5%。子囊菌中以盘菌为主,占到整个克隆文库的47.4%;担子菌中以伞菌为主,占到整个克隆文库的10.4%。接合菌和壶菌均有少量克隆出现在文库中。首次从海南岛热带雨林土壤中发现牛肝菌。研究显示该环境真菌多样性极其丰富,涵盖了真菌主要门的绝大多数。[结论]该研究结果为揭示热带雨林土壤真菌群落结构多样性、挖掘该环境样品的真菌基因资源提供了参考依据。; 关键词热带雨林土壤真菌 18S rRNA基因克隆文库酶切分型系统进化分析; Keywords Soil fungi in tropical rain forest 18S rRNA gene cloning library amplified 18S ribosomal dna restriction analysis Phylogenetic analysis; 分类号 S432.41 [农业科学—植物病理学] Q93 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油烟污染对土壤假单胞菌种群多样性的影响被引量：1: 3; 作者马艳玲陈邦; 机构西北大学生命科学学院西北大学化学与材料学院; 出处《西北大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1026-1030,共5页; 基金国家自然科学基金资助项目(31000069) 陕西省自然科学基金资助项目(2010JM3012) 陕西省教育厅专项基金资助项目(2010JK853); 文摘目的确定油烟污染土壤中假单胞菌种群结构的组成情况。方法采用未培养技术直接从长期受油烟污染的土壤样品中提取微生物基因组总DNA,构建基于假单胞菌特异性引物PCR扩增的16S rRNA基因克隆文库,通过HaeⅢ限制性内切酶对基因文库的克隆进行限制性片段多态性分析(ARDRA)。结果随着油烟污染的加剧,油烟污染区土壤中假单胞菌多样性指数显著升高,其优势种群主要是P.putida,P.stuzeri,P.fluorescens和P.aeruginosa。结论在长期污染胁迫下,4种假单胞菌分别得到了不同程度的富集,推测可能与油烟的自然降解有一定的相关性。; 关键词油烟污染土壤假单胞菌种群多样性限制性片段多态性分析; Keywords oil fume contaminated soil Pseudomonas community diversity amplified ribosomal dna restriction analysis（ardra）; 分类号 X173 [环境科学与工程—环境科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名金钗石斛内生细菌的组成及多样性分析被引量：16: 4; 作者吴庆珊雷珣雷友梅蒲星刘颖翁庆北; 机构贵州师范大学生命科学学院; 出处《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期79-90,共12页; 基金贵州师范大学研究生创新基金(研创[2016]22) 贵州省优秀科技教育人才省长专项资金([2011]47) +1 种基金贵州省大学生创新创业训练计划项目(201410663004); 文摘采用9种培养基对贵州省的赤水市旺隆镇(P1)、贵阳市贵州师范大学生命科学学院大棚(P2)和金沙县台金生态农业观光园(P3)内栽培的金钗石斛(Dendrobium nobile Lindl.)根、茎和叶中的内生细菌进行了分离,并采用扩增核糖体DNA限制性分析(ARDRA)法对分离的内生细菌进行了多样性分析。结果表明:从3个样地金钗石斛的根、茎和叶中共分离出1 081株内生细菌,隶属2门5科12属40种1亚种,可分成41个OTUs;其中,芽孢杆菌属(Bacillus)和短芽孢杆菌属(Brevibacillus)为优势属,Bacillus subtilis subsp.subtilis和Brevibacillus invocatus为优势种(亚种)。金钗石斛的内生细菌在不同器官中的分布存在差异,根中内生细菌的菌株数量最多(695),且根中内生细菌的Shannon-Wiener多样性指数(2.20)和Margalef丰富度指数(5.81)均高于茎和叶中内生细菌,而叶中内生细菌的Pielou均匀度指数却最高(0.69);并且,茎和叶间内生细菌的Sorenson相似性系数最高(0.82),显著高于根和茎间以及根和叶间内生细菌的Sorenson相似性系数。3个样地金钗石斛内生细菌的共有OTUs有14个,分离菌株数占金钗石斛内生细菌分离菌株总数的96.5%;并且,3个样地金钗石斛内生细菌的Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数差异较小,仅P1样地金钗石斛内生细菌的Margalef丰富度指数明显高于P2和P3样地。NA、TSA、LB、KB、R2A和TB培养基从金钗石斛中分离出的内生细菌菌落数和OTU数量均高于YPD、YT和YG培养基。研究结果显示:金钗石斛体内含有丰富的内生细菌资源,并且,其内生细菌的组成和多样性与分离器官、种植地和培养基密切相关。; 关键词金钗石斛内生细菌扩增核糖体dna限制性分析(ardra) 组成分析多样性分析; Keywords Dendrobium nobile Lindl. endophytic bacteria amplified ribosomal dna restriction analysis (ardra) composition analysis diversity analysis; 分类号 Q948.122.3 [生物学—植物学] Q949.718.43 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名刺参消化道中蛭弧菌类的生物多样性分析被引量：1: 5; 作者韩民泳陈慧黠斯晗刘洋陈亚东; 机构大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室; 出处《微生物学杂志》 CAS CSCD 2015年第6期44-48,共5页; 基金辽宁省教育厅计划项目(L2012255); 文摘研究了刺参消化道中蛭弧菌类生物多样性。用刺参肠道内容物提取微生物总DNA,分别使用蛭弧菌类生物特异性引物Bd、Bac扩增获得16S r DNA目的片段,连接p MD19-T载体,转化到大肠埃希菌DH5α感受态细胞,经蓝白斑筛选及阳性克隆筛选,通过核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析(ARDAR)对阳性克隆进行分型,使用HaeⅢ和MspⅠ双酶切各60个阳性克隆,选取不同ARDAR型的阳性克隆测序,并进行生物学分析。结果显示:引物Bd、Bac的16S r DNA扩增产物分别分离获得3个和2个差异性序列,各属于一个类群,分属于蛭弧菌属(Bdellovibrio)和噬菌弧菌属(Bacteriovorax)。这些序列与数据库中相应菌株序列的最大相似性均为95.0%,这5个序列的菌株可能为潜在的新种。; 关键词蛭弧菌类生物刺参肠道核糖体dna扩增片段限制性内切酶分析(ardra) 双酶切多样性; Keywords Bdellovibrio-like organisms spiny sea cucumber （Apostichopus japonicus） intestine amplified ribosomal dna restriction analysis （ardra） double enzyme digestion diversity; 分类号 Q978 [生物学] Q93 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名金钗石斛提取物对便秘模型小鼠通便功能的影响被引量：4: 6; 作者王微微范红结杨文红夏开艳黎华贵李晓丽王诗满张艳; 机构遵义医科大学基础医学院南京农业大学动物医学院遵义医科大学临床学院遵义医科大学药学院; 出处《食品工业科技》 CAS 北大核心 2021年第20期342-347,共6页; 基金贵州省自然科学基金资助项目(黔科合基础[2020]1Y385) 贵州省中医药、民族医药科学技术研究专项课题项目(QZYY-2015-143) 贵州省大学生创新创业训练计划(20195200184)。; 文摘目的:探讨金钗石斛提取物对小鼠便秘的改善作用及其对肠道中乳酸杆菌多样性的影响。方法:构建复方地芬诺酯便秘小鼠模型,灌胃高(300 mg/kg)、中(100 mg/kg)、低(30 mg/kg)三个剂量的金钗石斛提取物,观察小鼠的排便功能和小肠推进率;采集小鼠粪便,提取微生物基因组DNA,采用特异性引物PCR扩增后进行扩增核糖体DNA限制性分析(ARDRA)分析乳酸杆菌多样性的变化。结果:金钗石斛提取物可显著地缩短小鼠首次排黑便时间(P<0.01),增加排出粪便颗粒数,显著地增加粪便含水量(P<0.01),高、中剂量组可显著地增加小鼠小肠推进率(P<0.05)。金钗石斛提取物增加了小鼠肠道乳酸杆菌的多样性且高剂量组小鼠肠道中乳酸杆菌均匀度更稳定。结论:金钗石斛提取物通过提高小鼠的粪便含水量,促进肠道蠕动,调节了小鼠肠道中乳酸杆菌,在本实验中表现出对小鼠便秘症状的改善作用。; 关键词金钗石斛便秘通便功能乳酸杆菌扩增核糖体dna 限制性分析; Keywords Dendrobium nobile Lindl constipation laxative effect Lactobacillus rapid amplified ribosomal dna restriction analysis(ardra); 分类号 TS201.4 [轻工技术与工程—食品科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名湖北黄石典型水域超微型真核浮游生物多样性研究被引量：3: 7; 作者于佳骏段钰涵刘科赛刘细霞侯建军李运涛; 机构湖北师范大学食用野生植物保育与利用湖北省重点实验室; 出处《生态科学》 CSCD 2019年第1期137-142,共6页; 基金国家自然科学基金项目(No.41171045) 食用野生植物保育与利用湖北省重点实验室开放基金项目 +1 种基金湖北师范大学创新团队项目(T201504); 文摘为探讨湖北省黄石市典型水域中超微型真核浮游生物多样性,采用18SrDNA扩增片段限制性酶切技术,结合优势类群测序及相关统计学分析,对2015年夏季湖北黄石境内营养程度不同的典型水域(长江,磁湖,青山湖,青港湖)中超微型真核浮游生物的群落组成及遗传多样性进行了研究。结果表明,4个水域的超微型真核浮游生物多样性有明显差异,多样性随水域营养化程度的增高而降低。优势克隆的测序结果显示,优势类群藻类包括隐藻、绿藻、甲藻,真菌包括隐真菌和壶菌,此外还有纤毛虫及未分类的浮游生物,隐藻在4个水域中都占优势。不同水域的优势类群差别较大。优势类群的种类随水域营养化程度的增加而减少。群落的多样性与总磷呈极显著的负相关。; 关键词超微型真核浮游生物生物多样性 ardra技术淡水水域; Keywords eukaryotic ultraplankton biodiversity amplified ribosomal dna restriction analysis freshwater; 分类号 Q89 [生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	应用ARDRA技术对细菌性阴道病的微生态分析	张瑜杨宇师舞阳蔡净亭杨立张怡	《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2008	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	热带雨林土壤真菌18S rRNA基因多样性分析	赵志祥肖敏郑芬梁延坡谢丙炎陈绵才	《安徽农业科学》 CAS	2012	3	在线阅读下载PDF 职称材料
3	油烟污染对土壤假单胞菌种群多样性的影响	马艳玲陈邦	《西北大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2010	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	金钗石斛内生细菌的组成及多样性分析	吴庆珊雷珣雷友梅蒲星刘颖翁庆北	《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心	2018	16	在线阅读下载PDF 职称材料
5	刺参消化道中蛭弧菌类的生物多样性分析	韩民泳陈慧黠斯晗刘洋陈亚东	《微生物学杂志》 CAS CSCD	2015	1	在线阅读下载PDF 职称材料
6	金钗石斛提取物对便秘模型小鼠通便功能的影响	王微微范红结杨文红夏开艳黎华贵李晓丽王诗满张艳	《食品工业科技》 CAS 北大核心	2021	4	在线阅读下载PDF 职称材料
7	湖北黄石典型水域超微型真核浮游生物多样性研究	于佳骏段钰涵刘科赛刘细霞侯建军李运涛	《生态科学》 CSCD	2019	3	在线阅读下载PDF 职称材料