烟酰胺酶催化水解脱氨反应的QM/MM分子动力学模拟

1

作者 段新丽 张欣 雷鸣 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2491-2496,共6页

采用QM(PM3)/MM分子动力学(MD)方法模拟了烟酰胺酶催化烟酰胺水解脱氨形成烟碱酸的反应过程.计算结果表明,硫的亲核进攻是整个反应的速率控制步骤.当改变Ala155所在Loop区的位置,在亲核进攻时,底物能够自由旋转,可以加速亲核进攻过程并... 采用QM(PM3)/MM分子动力学(MD)方法模拟了烟酰胺酶催化烟酰胺水解脱氨形成烟碱酸的反应过程.计算结果表明,硫的亲核进攻是整个反应的速率控制步骤.当改变Ala155所在Loop区的位置,在亲核进攻时,底物能够自由旋转,可以加速亲核进攻过程并降低整个催化反应的能垒.讨论了氨分子的离去过程和质子传递过程的相关细节.为烟酰胺酶的定点突变以及脱氨酶的设计提供了有益的参考. 展开更多

关键词 烟酰胺酶 脱氨 反应机理 qm/mm方法 分子动力学模拟

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基于结合自由能计算和激活实验探讨玉米肽激活乙醇脱氢酶机制

2

作者 邱智军 魏亚楠 龚明贵 《中国粮油学报》 北大核心 2025年第5期105-114,共10页

玉米肽具有显著的醒酒活性,大量实验表明,激活乙醇脱氢酶(ADH)是其发挥醒酒作用的重要途径。为了研究玉米肽激活ADH是否通过变构作用实现的,使用口袋特征(AlloSite)和盲对接(HPEPDOCK)2种预测方法识别到共同一致的ADH变构位点Site2;然... 玉米肽具有显著的醒酒活性,大量实验表明,激活乙醇脱氢酶(ADH)是其发挥醒酒作用的重要途径。为了研究玉米肽激活ADH是否通过变构作用实现的,使用口袋特征(AlloSite)和盲对接(HPEPDOCK)2种预测方法识别到共同一致的ADH变构位点Site2;然后采用分子对接(AutoDock Vina)和分子力学/广义波恩表面积(Uni-GBSA)方法计算玉米肽与变构位点Site2的结合自由能,在考虑结合自由能预测方法能力边界的前提下,分析得到玉米肽的结合自由能与其实验测定激活率之间具有较强相关性,反过来验证了变构位点预测以及玉米肽与ADH发生变构作用结果。另外,直观构效关系分析表明,玉米肽-ADH结合构象模式能够解释83%的激活活性差异案例,进一步肯定了结合自由能预测结果的可靠性及其分析结果的可信性。 展开更多

关键词 醒酒肽 变构作用 分子对接 分子力学/广义波恩表面积(mm/GBSA)

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氧化石墨烯对CL-20/HMX共晶的抑制效应和机理分析

3

作者 赵希同 付小龙 +5 位作者 聂菲 孟赛钦 王伦 肖立群 张恒宁 张伟 《火炸药学报》 北大核心 2025年第8期746-755,I0003,共11页

为了解决含硝酸酯推进剂中CL-20与HMX共晶析出导致的性能劣化及安全隐患问题,通过量子化学计算和分子动力学模拟得到了氧化石墨烯(GO)对CL-20/HMX共晶分子结构、相互作用的影响规律,结合SEM、XRD等表征方法,验证分析了氧化石墨烯对CL-20... 为了解决含硝酸酯推进剂中CL-20与HMX共晶析出导致的性能劣化及安全隐患问题,通过量子化学计算和分子动力学模拟得到了氧化石墨烯(GO)对CL-20/HMX共晶分子结构、相互作用的影响规律,结合SEM、XRD等表征方法,验证分析了氧化石墨烯对CL-20/HMX共晶的抑制作用。结果表明,GO表面极性基团(羟基、环氧基)通过O—H…O氢键强烈吸附CL-20和HMX分子,削弱二者间的C—H…O氢键作用,降低其结合能,并破坏溶剂诱导效应;XRD测试结果显示,添加GO后乙酸乙酯中CL-20/HMX共晶率由13.08%降至6.61%,混合硝酸酯中由6.24%降至2.13%;实验证实GO与CL-20形成复合物时抑制效果更显著,SEM观测到共晶特征形貌消失,CL-20以微小晶核附着于HMX表面。说明GO通过吸附分子及干扰溶剂微环境,可有效抑制CL-20/HMX共晶形成。 展开更多

关键词 量子化学 CL-20/HMX 共晶 分子动力学 氧化石墨烯 GO 老化机理

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应用ABEEM/MM模型研究水分子团簇(H_2O)_n(n=11～16)的性质 被引量：9

4

作者 钱萍 杨忠志 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第5期561-568,共8页

应用ABEEM/MM模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n(n=11￣16)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,以及结构参数、平均氢键个数和强度,增加的团簇结合能等.结果表明,从立方体结构到笼状结构的过渡... 应用ABEEM/MM模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n(n=11￣16)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,以及结构参数、平均氢键个数和强度,增加的团簇结合能等.结果表明,从立方体结构到笼状结构的过渡出现在n=12的水分子团簇中,随着类似于笼状结构特点的不断增强,五元环的富集程度有所增加. 展开更多

关键词 ABEEM/mm模型 原子-键电负性均衡方法 分子力场 水分子团簇

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原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)应用于蛋白质分子(Crambin)模拟 被引量：9

5

作者 张强 杨忠志 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2345-2347,共3页

建立应用于多肽和蛋白质模拟的ABEEM/MM浮动电荷力场.利用该模型和参数,对实际蛋白质分子Cramb in(植物种子中的一种小的蛋白质)进行模拟,得到了满意的结果,为其更广泛的应用开辟了道路.

关键词 原子-键电负性均衡方法 分子力场 CRAMBIN

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基于计算化学的木质素热解机理研究进展

6

作者 汪峣 陶雨洁 张会岩 《东南大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期912-924,共13页

木质素热解机理研究是高效制备液体燃料、炭材料、化学品等高值产品的重要前提。综述了近年来利用计算化学方法包括分子动力学模拟和量子化学计算所揭示的木质素热解机理最新研究进展。首先,对木质素的结构特征进行了介绍,并阐述了在计... 木质素热解机理研究是高效制备液体燃料、炭材料、化学品等高值产品的重要前提。综述了近年来利用计算化学方法包括分子动力学模拟和量子化学计算所揭示的木质素热解机理最新研究进展。首先,对木质素的结构特征进行了介绍,并阐述了在计算化学中使用的典型木质素模型化合物。然后,分别基于木质素热解机理的分子动力学模拟和量子化学计算,讨论了木质素热解过程中的整体演化行为、单体间C—O和C—C连接键断裂、木质素单体的转化以及木质素热解过程中产物的相互作用机理。最后,阐述了木质素热解机理研究中的现存问题和值得深入研究的方向,为未来生物质高值化利用提供参考。 展开更多

关键词 木质素 热解机理 量子化学计算 分子动力学模拟

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LLM-105的ReaxFF参数优化与分子动力学模拟

7

作者 宋亮 张泳 +5 位作者 叶婧 陈博聪 侯方超 苏浩龙 蒋俊 周素芹 《火炸药学报》 北大核心 2025年第2期138-149,I0006,共13页

针对ReaxFF初始力场描述2,6-二氨基-3,5-二硝基-1-氧化物(LLM-105)的不足,采用了一种基于梯度下降算法JAX-ReaxFF框架策略,对ReaxFF反应力场进行了重新参数化,特别关注不同键和键角的势能面解离变化;在模拟不同温度和分解速率的反应过程... 针对ReaxFF初始力场描述2,6-二氨基-3,5-二硝基-1-氧化物(LLM-105)的不足,采用了一种基于梯度下降算法JAX-ReaxFF框架策略,对ReaxFF反应力场进行了重新参数化,特别关注不同键和键角的势能面解离变化;在模拟不同温度和分解速率的反应过程中,深入分析了LLM-105的反应机制。结果表明,当温度为1500 K时,分子反应主要聚焦于聚合和脱氢反应;随着温度的逐渐升高,LLM-105的反应模式呈现出了新的变化,当温度不小于2000 K时,除了原有的聚合和脱氢反应外,还观察到了C-NO_(2)键和C-NH_(2)键的断裂现象;值得注意的是,C-NO_(2)键的断裂成为触发这一系列反应的关键因素;随着分子中的C-NO_(2)和C-NH_(2)键开始发生均裂反应,促进了中间产物HON_(2)、NO_(2)和NH_(3)的形成,并经历一系列复杂的相互反应,最终生成了N_(2)、H_(2)O和CO_(2)等稳定产物,表明该力场能够有效模拟在不同温度和加热速率下的化学反应变化。 展开更多

关键词 量子化学 LLM-105 梯度下降算法 分解机制 分子动力学模拟 ReaxFF力场

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应用ABEEM/MM力场探究Na^+与氮-甲基乙酰胺及水的相互作用

8

作者 潘一鸣 张静 +4 位作者 田博 姚菁菁 宫利东 刘翠 杨忠志 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2468-2476,共9页

应用量子化学方法 MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对[Na(H_2O)n]+(n=3～8),[Na(NMA)n]+(n=3～8)和[Na(NMA)n(H_2O)m]+(n+m=4,6)(NMA=氮-甲基乙酰胺)体系的结构、结合能和电荷分... 应用量子化学方法 MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对[Na(H_2O)n]+(n=3～8),[Na(NMA)n]+(n=3～8)和[Na(NMA)n(H_2O)m]+(n+m=4,6)(NMA=氮-甲基乙酰胺)体系的结构、结合能和电荷分布进行研究.在计算结果的基础上,构建上述体系的ABEEM/MM可极化势能函数,优选并确定相关参数.结果表明,ABEEM/MM的计算结果与量子化学的计算结果相符:Na+与配体间距离的平均绝对偏差(AAD)小于0. 007 nm,相对均方根偏差(RRMSD)小于3. 5%,夹角的AAD小于2. 4°,RRMSD小于2. 0%,结合能的AAD小于8. 9 k J/mol,RRMSD小于12. 4%;ABEEM/MM电荷分布与量子力学(QM)电荷分布的线性相关系数在0. 97以上. 展开更多

关键词 原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场 钠离子 氮-甲基乙酰胺 可极化力场

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基于分子模拟的降混剂分子设计与混相作用

9

作者 贾军红 范伟 +4 位作者 李梅 戴姗姗 秦森 杨嘉龙 王瑞瑶 《油田化学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期671-679,共9页

探索性地将分子模拟技术引入降混剂分子结构设计及混相机理研究,在一定程度上解决了细管实验步骤繁琐、周期长且成本高的问题。首先,初步确定了5类具有降混潜力的官能团结构,基于量子力学,利用电子密度和福井函数研究过程中的电子转移... 探索性地将分子模拟技术引入降混剂分子结构设计及混相机理研究,在一定程度上解决了细管实验步骤繁琐、周期长且成本高的问题。首先,初步确定了5类具有降混潜力的官能团结构,基于量子力学,利用电子密度和福井函数研究过程中的电子转移情况及吸附反应能和前线轨道研究过程中的能量变化,以判断各类官能团与CO_(2)的亲和性。在充分考虑官能团数量和空间位阻等因素的基础上,进行了双亲性降混剂的分子结构设计。基于分子动力学,考察了3种降混剂、模拟油与CO_(2)的相互作用及分散聚集情况,结合扩散系数综合评价降混剂的混相能力。结果表明,增加亲CO_(2)基团数与适当的空间位阻相协同,有利于提升降混效果。 展开更多

关键词 量子力学 分子动力学 降混剂 CO_(2)混相驱

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环保型缓蚀剂壳寡糖对304不锈钢化学机械抛光的影响 被引量：1

10

作者 张鑫 陈国美 +4 位作者 倪自丰 季明捷 郑世坤 卞达 钱善华 《润滑与密封》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期97-104,共8页

为研究环保型缓蚀剂壳寡糖对304不锈钢化学机械抛光过程和抛光效果的影响,探讨其在抛光过程中与金属表面的作用方式及吸附机制,采用化学机械抛光试验、接触角测量、扫描电子显微镜(SEM)和X-射线色散能谱仪(EDS)分析等方法,研究壳寡糖有... 为研究环保型缓蚀剂壳寡糖对304不锈钢化学机械抛光过程和抛光效果的影响,探讨其在抛光过程中与金属表面的作用方式及吸附机制,采用化学机械抛光试验、接触角测量、扫描电子显微镜(SEM)和X-射线色散能谱仪(EDS)分析等方法,研究壳寡糖有机分子对304不锈钢化学机械抛光的影响,采用量子化学计算研究壳寡糖分子的全局反应参数,分析计算反应活性位点,采用分子动力学模拟有机分子在金属表面的吸附并分析活性原子的径向分布。结果表明:CMP抛光过程中添加壳寡糖能够通过吸附作用在304不锈钢表面形成一层疏水性的薄膜,抑制氧化剂对不锈钢表面的刻蚀,提高抛光后的表面质量;在壳寡糖质量浓度为400 mg/L时得到表面粗糙度为1.65 nm的最佳表面质量。量子化学研究表明,壳寡糖的活性反应位点主要为O原子,能够在金属表面形成多中心吸附。分子动力学模拟表明,壳寡糖有机分子能够平行吸附在金属表面,有机分子中的O原子能够与铁原子形成配位键,在吸附中占据主导地位。 展开更多

关键词 壳寡糖 化学机械抛光 吸附机制 量子化学研究 分子动力学模拟

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含Cl反应力场ReaxFF的评估

11

作者 肖卓君 肖斌 +6 位作者 何祺 王晴晴 刘馥 刘艳洁 王宁 李伟 刘轶 《火炸药学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第1期81-90,共10页

为考察反应分子力场ReaxFF对高氯酸铵(AP)推进剂材料模拟的适应性,从文献中选取了两种含C/H/O/N/Cl有机反应力场,对AP系统中含Cl的典型小分子进行结构和能量扫描计算,并对AP高温裂解过程进行了反应分子动力学模拟。通过对比反应力场与... 为考察反应分子力场ReaxFF对高氯酸铵(AP)推进剂材料模拟的适应性,从文献中选取了两种含C/H/O/N/Cl有机反应力场,对AP系统中含Cl的典型小分子进行结构和能量扫描计算,并对AP高温裂解过程进行了反应分子动力学模拟。通过对比反应力场与量子力学计算结果发现,现有的含Cl有机反应力场在计算HCl以及部分含H、Cl元素的小分子能量时表现较好,但无法合理描述含高价Cl小分子以及含N、O元素小分子的化学键形成和断裂行为。根据力场分子动力学模拟结果的物种分析,现有的反应力场模拟获得了H_(2)O、O_(2)、NH_(3)、HCl等产物小分子,但未能复现ClO_(2)、HClO 4等高价Cl产物以及NO_(2)、N_(2)O的生成,与实验观测有显著差距。 展开更多

关键词 量子力学 含Cl反应力场ReaxFF 反应分子动力学 高氯酸铵 AP 固体推进剂

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不同晶型CL-20冲击分解机理的分子动力学模拟

12

作者 唐梅 曾淑琼 +1 位作者 刘桂林 牛振威 《火炸药学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1000-1009,I0002,共11页

为深入理解含能材料在极端条件下的冲击起爆、冲击点火、爆轰过程和爆轰产物状态等,利用自洽电荷紧束缚密度泛函理论(SCC-DFTB)结合多尺度冲击模拟技术(MSST)研究了4种晶型(α、β、γ、和ε)CL-20在冲击波加载下的分解反应过程;考虑到... 为深入理解含能材料在极端条件下的冲击起爆、冲击点火、爆轰过程和爆轰产物状态等,利用自洽电荷紧束缚密度泛函理论(SCC-DFTB)结合多尺度冲击模拟技术(MSST)研究了4种晶型(α、β、γ、和ε)CL-20在冲击波加载下的分解反应过程;考虑到α-CL-20通常以含水加合物的形式存在,同时也计算了水分子对α-CL-20冲击分解过程的影响。结果表明,在同一冲击波速下,4种晶型(α-、β-、γ-、和ε-)CL-20中,γ-CL-20密度最小,具有最大的压缩比。当冲击波速为8km/s时,γ-CL-20完全分解,而其余3种晶型CL-20直到冲击波速达到9km/s时才完全分解,但4种晶型CL-20分解反应平衡后小分子产物组分和含量是一致的。此外,水分子的加入则会显著提高CL-20分子的活性,加速固相α-CL-20的裂解,增加固相α-CL-20的冲击感度。冲击加载下固相CL-20的初始分解路径受晶型影响较小,主要受冲击波速影响,当冲击波速低于8km/s时,分解反应主要源于N—NO_(2)键的断裂;当冲击波速超过9km/s时,CL-20分子中N—NO_(2)键受到高压抑制,C—H键中H可能优先与相邻的NO_(2)基形成五元环,进一步生成NO和OH。 展开更多

关键词 爆炸力学 量子化学 SSC-DFTB CL-20 初始反应机理 分子动力学模拟 晶型

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量子化学计算研究自由基相互作用的双稳态轮烷的穿梭机理

13

作者 王涛 李晓毅 《中国科学院大学学报（中英文）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期427-431,共5页

设计了一种氧化还原驱动的可切换的双稳态轮烷。以双百草枯-对苯双自由基双阳离子环(CBPQT^(2(·+)))作为大环分子,主链分子上有2个结合位点,即4,4′-联吡啶自由基阳离子BIPY^(·+)和2,6-二氧亚萘基(DOP)位点。运用密度泛函理... 设计了一种氧化还原驱动的可切换的双稳态轮烷。以双百草枯-对苯双自由基双阳离子环(CBPQT^(2(·+)))作为大环分子,主链分子上有2个结合位点,即4,4′-联吡啶自由基阳离子BIPY^(·+)和2,6-二氧亚萘基(DOP)位点。运用密度泛函理论对大环分子在主链分子上的运动机理进行研究,并通过量子力学理论计算分析大环分子CBPQT^(2(·+))与主链分子上2个结合位点BIPY^(·+)和DOP之间的弱相互作用,证明了氧化还原反应控制自由基络合物的形成和解离可以驱动CBPQT^(2(·+))环沿着主链分子的2个结合位点间实现往复运动。 展开更多

关键词 分子梭 双稳态轮烷 量子力学计算 自由基相互作用

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兖州煤大分子结构模型构建及其分子模拟 被引量：27

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作者 相建华 曾凡桂 +4 位作者 梁虎珍 孙蓓蕾 张莉 李美芬 贾建波 《燃料化学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第7期481-488,共8页

结合兖州煤的工业分析与元素分析及13C CP/MAS NMR实验结果构建了其大分子结构模型;芳香化合物以苯为主;脂肪结构以脂肪侧链、环烷烃和氢化芳环的形式存在,且甲基、亚甲基和次甲基的含量相当;17个氧原子分别以羧基、羰基与羟基型式存在... 结合兖州煤的工业分析与元素分析及13C CP/MAS NMR实验结果构建了其大分子结构模型;芳香化合物以苯为主;脂肪结构以脂肪侧链、环烷烃和氢化芳环的形式存在,且甲基、亚甲基和次甲基的含量相当;17个氧原子分别以羧基、羰基与羟基型式存在;三个氮原子分别以吡啶与吡咯的形式存在;五个硫原子以噻吩型硫的型式存在。采用分子力学(MM)和分子动力学(MD)对兖州原煤化学结构模型进行能量最小化模拟,显示稳定大分子结构的主要能量按大小排序依次为范德华能、键扭转能、键角能与键伸缩能;分子内芳香层片之间的π-π相互作用,使其以近似平行的方式排列。量子化学半经验方法(AM1)模拟结果表明,羰基碳原子相连的C-C键的活性比较高;模型中与S相连的C原子、边缘C原子都有较多的负电荷,易于发生氧化反应,而芳香碳原子所带电荷较少,稳定性很高。 展开更多

关键词 兖州煤 大分子结构模型 分子力学 分子动力学 量子化学

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含能材料感度判别理论研究——从分子、晶体到复合材料 被引量：21

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作者 肖鹤鸣 朱卫华 +2 位作者 肖继军 王桂香 裴晓琴 《含能材料》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第5期514-527,共14页

近30多年来,通过量子化学计算和分子动力学模拟,国内外已提出过许多关于含能材料撞击感度的微观理论判据。本文主要介绍我们研究小组从高能分子、高能晶体到高能复合材料的热解机理和感度判别的相关工作,其中关于高能晶体和复合材料的... 近30多年来,通过量子化学计算和分子动力学模拟,国内外已提出过许多关于含能材料撞击感度的微观理论判据。本文主要介绍我们研究小组从高能分子、高能晶体到高能复合材料的热解机理和感度判别的相关工作,其中关于高能晶体和复合材料的感度判别的一些结果和判据是首次报道。 展开更多

关键词 量子化学 含能材料 热解机理 感度 分子动力学

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咪唑啉缓蚀剂缓蚀性能的理论研究 被引量：29

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作者 张军 李中谱 +2 位作者 赵卫民 郭文跃 王勇 《石油学报（石油加工）》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第5期598-604,共7页

采用量子化学计算、分子动力学模拟和分子力场相结合的方法,评价了5种具有不同烷基链长的2-烷基-1-氨乙基咪唑啉缓蚀剂抑制CO2腐蚀的性能,并分析了其缓蚀机理。结果表明,5种缓蚀剂分子的反应活性区域均集中在咪唑环上,亲电反应中心为3个... 采用量子化学计算、分子动力学模拟和分子力场相结合的方法,评价了5种具有不同烷基链长的2-烷基-1-氨乙基咪唑啉缓蚀剂抑制CO2腐蚀的性能,并分析了其缓蚀机理。结果表明,5种缓蚀剂分子的反应活性区域均集中在咪唑环上,亲电反应中心为3个N原子,可在金属表面形成多中心吸附;当烷基碳链长度大于11时,缓蚀剂在金属表面可形成一层高覆盖度、致密的疏水膜,可有效阻碍溶液中的腐蚀介质向金属表面扩散,从而达到阻碍或延缓腐蚀的目的;缓蚀剂膜的稳定性以及膜与金属基体的结合强度随链长的增加而增大。缓蚀剂缓蚀性能的理论评价结果与实验结果基本吻合。 展开更多

关键词 咪唑啉缓蚀剂 评价 量子化学计算 分子力学

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煤显微组分分子结构模型的量子化学研究 被引量：18

17

作者 孙庆雷 李文 +1 位作者 陈皓侃 李保庆 《燃料化学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第3期282-286,共5页

采用分子力学和半经验量子化学方法,研究了神木煤显微组分的分子结构模型,比较了镜质组和惰质组分子模型的能量构成、不同类型键的键长和键裂解能。研究结果表明,扭转能和范德华能是分子中的主要作用力,取代基对体系能量有明显影响,烷... 采用分子力学和半经验量子化学方法,研究了神木煤显微组分的分子结构模型,比较了镜质组和惰质组分子模型的能量构成、不同类型键的键长和键裂解能。研究结果表明,扭转能和范德华能是分子中的主要作用力,取代基对体系能量有明显影响,烷基取代基使体系能量增加,而苯基取代基使体系能量降低;脂肪C—C键长比芳香C—C键长长,说明脂肪C—C在受热过程中比芳香C—C更容易断裂分解。对各键裂解能的计算结果表明,Car—Cal键的裂解能高于Cal—Cal,Car—O醚键的裂解能高于Cal—O醚键。而惰质组结构模型中除C—O醚键外,各键的裂解能均高于镜质组,说明惰质组结构模型比镜质组有较高的热稳定性。 展开更多

关键词 煤 显微组分 分子力学 半经验计算 量子化学

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量子化学计算法分析蒙古黄芪中部分黄酮类化合物抗氧化作用机制 被引量：9

18

作者 苏彦雷 张骥 +2 位作者 蒋建勤 林克江 沈剑刚 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期39-43,共5页

运用量子化学计算方法,研究蒙古黄芪中12个黄酮类化合物量子化学参数与抗氧化活性的关系。结果发现,用最高占据分子轨道(HOMO)能级逐差(ΔEHOMO)法预测的目标化合物活性强弱顺序与文献报道的实验结果非常接近。在表征化合物抗氧化活性方... 运用量子化学计算方法,研究蒙古黄芪中12个黄酮类化合物量子化学参数与抗氧化活性的关系。结果发现,用最高占据分子轨道(HOMO)能级逐差(ΔEHOMO)法预测的目标化合物活性强弱顺序与文献报道的实验结果非常接近。在表征化合物抗氧化活性方面,该方法可能会为预测化合物的抗氧化活性提供参考。 展开更多

关键词 量子化学 黄酮 抗氧化 机制 最高占据分子轨道

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分子计算科学——化学工程新的生长点 被引量：20

19

作者 刘志平 黄世萍 汪文川 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第4期464-476,共13页

当今化学工业面临的巨大挑战是如何推出性能卓越、功能齐备同时环境友好的新产品新材料 .分子计算科学是研究物质结构 性质关系的强大工具 ,在新产品新材料的设计中举足轻重 ,因而会成为化学工程新的生长点 .在层次化研究的框架下 ,分... 当今化学工业面临的巨大挑战是如何推出性能卓越、功能齐备同时环境友好的新产品新材料 .分子计算科学是研究物质结构 性质关系的强大工具 ,在新产品新材料的设计中举足轻重 ,因而会成为化学工程新的生长点 .在层次化研究的框架下 ,分子计算科学包括量子力学层次、统计力学层次、介观层次以及连接各个层次的对接技术 .本文分别介绍了各个层次的主要内容 ,特别是统计力学层次最近的研究进展 ,以及分子计算科学越来越趋向应用到实际复杂体系的发展趋势 . 展开更多

关键词 分子计算科学 量子计算化学 分子模拟 介观层次 对接技术 复杂体系

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计算材料科学中桥域多尺度方法的若干进展 被引量：10

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作者 张征 刘更 +1 位作者 刘天祥 崔俊芝 《计算力学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第6期652-658,共7页

材料科学中存在固有的多尺度特性,桥域多尺度方法是在宏观尺度(如连续介质力学)中引入不同的细微观尺度的计算区域,乃至纳米尺度的分子动力学、量子力学计算区域,将不同尺度的研究方法通过一定的数学模型耦合在一起。该方法既能节约计... 材料科学中存在固有的多尺度特性,桥域多尺度方法是在宏观尺度(如连续介质力学)中引入不同的细微观尺度的计算区域,乃至纳米尺度的分子动力学、量子力学计算区域,将不同尺度的研究方法通过一定的数学模型耦合在一起。该方法既能节约计算成本,又能保证所研究问题的物理特性。本文对多尺度方法的基本概念、跨尺度桥域多尺度方法的发展、基本原理、耦合方法和离散方程进行了讨论,给出了几个应用算例,并在最后进行了总结,展望了今后的可能发展方向。 展开更多

关键词 多尺度方法 桥域多尺度方法 连续介质力学 分子动力学 量子力学

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