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Predicting quantitative structure-activity relationship of substituted 17α-acetoxyprogesterones by molecular hybridization electronegativity-distance vector
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作者 SUN Li-Ii LAN Yu-kun +2 位作者 ZHOU Li-ping YU YU LI Zhi-liang 《Journal of Chongqing University》 CAS 2007年第2期79-87,共9页
A set of novel structural descriptors (molecular hybridization electronegativity-distance vector, VMEDh) was put forward, and the quantitative structure–activity relationship (QSAR) of a series of 17α-Acetoxyprogest... A set of novel structural descriptors (molecular hybridization electronegativity-distance vector, VMEDh) was put forward, and the quantitative structure–activity relationship (QSAR) of a series of 17α-Acetoxyprogesterones (APs) was investigated. Taking into account the effect of various hybridized orbits on atomic electronegativities, we developed the structure descriptors with amended electronegativities to build a QSAR model. The 10-parameter model based on VMEDh yields a correlation coefficient R=0.972 and standard deviation SD=0.262, which are more desirable than those of the previous molecular electonegativity-distance vector (MEDV-4) (R=0.969, SD=0.275). By stepwise multiple linear regression, several parameters are selected to construct optimal models. The 7-parameter model based on VMEDh has R=0.960 and SD=0.276; its correlation coefficient (RCV) and standard deviation (SDCV) for leave-one-out procedure crossvalidation are respectively RCV=0.890 and SDCV=0.445. The 6-parameter MEDV-4 model has R=0.946, SD=0.304, RCV=0.903 and SDCV=0.406. It is demonstrated that VMEDh has desirable estimation performance and good predictive capability for this series of chemical compounds. 展开更多
关键词 molecular hybridization electronegativity-distance vector quantitative structure-activity relationship qsar 17α- Acetoxyprogesterones
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1,4-二氢吡啶衍生物的QSAR模型构建及制备 被引量:1
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作者 刘媛媛 李玲 +1 位作者 陈学军 李壹 《化学研究与应用》 CAS 北大核心 2023年第3期515-524,共10页
采用Hyperchem 8.0软件,通过分子动力学MM+和半经验AM1算法,优化并计算得到30种1,4-二氢吡啶衍生物的17种量子化学参数。运用Statistica 8.0软件中的主成分分析法,结合线性回归分析法,筛选出3个最佳参数与1,4-二氢吡啶衍生物的抗结核活... 采用Hyperchem 8.0软件,通过分子动力学MM+和半经验AM1算法,优化并计算得到30种1,4-二氢吡啶衍生物的17种量子化学参数。运用Statistica 8.0软件中的主成分分析法,结合线性回归分析法,筛选出3个最佳参数与1,4-二氢吡啶衍生物的抗结核活性关联,构建定量构效关系(QSAR)模型。所建多元线性回归方程的相关系数R2为0.75,留一法交叉检验系数q2为0.72,活性实验值与预测值相关性较好。采用该模型设计并制备得到1种具有良好水溶性和潜在抗结核活性的N3,N5-二(对磺酸钾基)苯基-2,6-二甲基-3,5-二甲酰氨基-1,4-二氢吡啶(TM),用1H NMR、IR、MS和元素分析表征结构,并考察了紫外和荧光性能。良好的稳定性和预测能力使该QSAR模型有望用于结核病候选药物的筛选。 展开更多
关键词 1 4-二氢吡啶衍生物 抗结核活性 定量构效模型 量子化学参数 紫外和荧光性能
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苯环5位取代磺酰脲类化合物的水解动力学及三维定量构效关系初步研究 被引量:6
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作者 王美怡 马翼 +2 位作者 王海英 曹刚 李正名 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1636-1642,共7页
研究了除草活性较好的9个新型苯环5位取代的磺酰脲类化合物(A^I)分别在酸性、中性及碱性水溶液中的水解情况.采用HPLC-MS对水解产物进行分离鉴定,推测了水解产物的结构及水解路径.采用比较分子力场(Co MFA)方法,对化合物的结构与水解半... 研究了除草活性较好的9个新型苯环5位取代的磺酰脲类化合物(A^I)分别在酸性、中性及碱性水溶液中的水解情况.采用HPLC-MS对水解产物进行分离鉴定,推测了水解产物的结构及水解路径.采用比较分子力场(Co MFA)方法,对化合物的结构与水解半衰期之间的关系进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究.结果表明,苯环5位取代的苯磺酰脲类化合物的水解遵循一级动力学反应,容易发生酸性条件下的水解,水解反应第一步主要为酸催化下磺酰脲桥的断裂,形成5位取代的苯磺酰胺和氨基杂环.苯环5位取代的苯磺酰胺进一步发生5位酰胺基的水解,最后得到化合物c(6-氨基糖精)和d(糖精).苯环5位经修饰改造后,在相同条件下,其水解速度明显高于改造前的母体化合物单嘧磺酯和甲磺隆.苯环5位为酰胺基取代的化合物的水解速度随酰胺基上烷基碳原子数的增加及烷基体积的增大而降低.经计算所得的Co MFA模型能够对该系列化合物的水解半衰期进行较好的预测. 展开更多
关键词 5位取代苯磺酰脲类化合物 水解 半衰期 比较分子力场模型 三维定量构效关系
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GABA受体抑制剂的柔性原子受体模型研究 被引量:2
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作者 沈斌 陆忠华 +2 位作者 迟学斌 吕海峰 任天瑞 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第7期800-803,共4页
利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型,很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况,具有较好的预测能力,预测集的预测值与实验值的相关系数(r2)分别达到0.923和0.733,模型的结果与药效团模... 利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型,很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况,具有较好的预测能力,预测集的预测值与实验值的相关系数(r2)分别达到0.923和0.733,模型的结果与药效团模型有很大的一致性,为揭示药物与两种受体作用的区别提供了依据. 展开更多
关键词 柔性原子受体模型(Flarm) GABA受体 定量构效关系(qsar) 抑制剂
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基于密度泛函理论的细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系
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作者 易忠胜 叶廷文 +1 位作者 刘红艳 莫凌云 《桂林理工大学学报》 CAS 北大核心 2013年第1期99-106,共8页
在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P4... 在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P450 1A2抑制剂的两变量线性QSAR模型,结果表明:所选的2个分子结构描述符与50个抑制剂的活性之间具有很强的线性关系(相关系数r2=0.907 0)和内部预测能力(留多法交叉验证相关系数q2=0.751 7)。同时,将50个化合物分成奇数集和偶数集各自进行筛选建模,并彼此进行外部预测,对全部样本集、奇数集和偶数集样本模型进行了y-Randomization检验,结果表明描述符EHOMO和Vm建立的模型均非常稳定并具有很高的预测能力。 展开更多
关键词 细胞色素P450 1A2 抑制剂 定量结构-活性相关 密度泛函理论(DFT) VSMP
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