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基于集成学习算法构建有机化学品鱼体生物富集因子的QSAR预测模型 被引量:13
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作者 丁蕊 陈景文 +4 位作者 于洋 林军 王中钰 唐伟豪 李雪花 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1295-1304,共10页
生物富集因子(BCF)是评价化学品生物累积能力的重要参数。目前全球市场上使用的化学品数量已超过了35万种,但是只有一千多种化学品具有BCF值。定量构效关系(QSAR)模型被认为是一种有效填补数据空缺的方法。目前大多数预测BCF的QSAR模型... 生物富集因子(BCF)是评价化学品生物累积能力的重要参数。目前全球市场上使用的化学品数量已超过了35万种,但是只有一千多种化学品具有BCF值。定量构效关系(QSAR)模型被认为是一种有效填补数据空缺的方法。目前大多数预测BCF的QSAR模型为单一模型,而集成模型可能会对BCF的预测效果有所改进。本研究建立了一个全面的鱼类BCF数据库,涵盖1300多种有机化学品的BCF实测值。基于此数据库,依据QSAR模型构建和验证导则,使用多种机器学习算法建立了预测鱼类BCF的5种单一模型和11种集成模型。结果表明,与单一模型相比,集成模型具有更好的拟合能力、稳健性、预测准确性以及更广泛的应用域。进一步使用最优集成模型对《中国现有化学物质清单》(IECSC)中化学物质的BCF进行了预测,结果表明该清单中有1066种化学物质具有生物累积性,86种化学物质具有强生物累积性。本研究所构建的模型可为化学品生物累积能力评估提供必要数据,支持化学品风险评价与管理工作。 展开更多
关键词 生物富集因子 定量构效关系 机器学习 集成模型 应用域
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1,4-二氢吡啶衍生物的QSAR模型构建及制备 被引量:2
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作者 刘媛媛 李玲 +1 位作者 陈学军 李壹 《化学研究与应用》 CAS 北大核心 2023年第3期515-524,共10页
采用Hyperchem 8.0软件,通过分子动力学MM+和半经验AM1算法,优化并计算得到30种1,4-二氢吡啶衍生物的17种量子化学参数。运用Statistica 8.0软件中的主成分分析法,结合线性回归分析法,筛选出3个最佳参数与1,4-二氢吡啶衍生物的抗结核活... 采用Hyperchem 8.0软件,通过分子动力学MM+和半经验AM1算法,优化并计算得到30种1,4-二氢吡啶衍生物的17种量子化学参数。运用Statistica 8.0软件中的主成分分析法,结合线性回归分析法,筛选出3个最佳参数与1,4-二氢吡啶衍生物的抗结核活性关联,构建定量构效关系(QSAR)模型。所建多元线性回归方程的相关系数R2为0.75,留一法交叉检验系数q2为0.72,活性实验值与预测值相关性较好。采用该模型设计并制备得到1种具有良好水溶性和潜在抗结核活性的N3,N5-二(对磺酸钾基)苯基-2,6-二甲基-3,5-二甲酰氨基-1,4-二氢吡啶(TM),用1H NMR、IR、MS和元素分析表征结构,并考察了紫外和荧光性能。良好的稳定性和预测能力使该QSAR模型有望用于结核病候选药物的筛选。 展开更多
关键词 1 4-二氢吡啶衍生物 抗结核活性 定量构效模型 量子化学参数 紫外和荧光性能
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多氯酚定量构效关系人工神经网络信息流分析 被引量:8
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作者 高大文 王鹏 +1 位作者 郑彤 彭永臻 《中国环境科学》 EI CAS CSSCI CSCD 北大核心 2002年第6期561-564,共4页
针对目前有机污染物定量构效关系(QSAR)人工神经网络(ANN)模型构建中存在的问题,在多氯酚QSAR-ANN模型数据研究基础上,提出了人工神经网络信息流分析方法.通过比较多氯酚定量构效关系人工神经网络模型中的连接权值与阈值,绘制人工神经... 针对目前有机污染物定量构效关系(QSAR)人工神经网络(ANN)模型构建中存在的问题,在多氯酚QSAR-ANN模型数据研究基础上,提出了人工神经网络信息流分析方法.通过比较多氯酚定量构效关系人工神经网络模型中的连接权值与阈值,绘制人工神经网络模型信息流流向分布图,可直观地显示网络内部信息的传播途径,找出影响输出层信息的隐含层的主要节点,进而由隐含层主要节点确定输入层主要节点,达到对人工神经网络模型输入节点的筛选. 展开更多
关键词 定量构效关系 人工神经网络 信息流 多氯酚 有机污染物 环境污染化学
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结构-活性关系对氯代多环芳烃性质的预测 被引量:10
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作者 马静 吴明红 +2 位作者 徐刚 王文华 程金平 《上海大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期536-540,共5页
氯代多环芳烃(chlorinated polycyclic aromatic hydrocarbons,Cl-PAHs)作为多环芳烃的氯代衍生物,具有类似二噁英的致癌、致突变毒性,并在环境中广泛存在.利用结构-活性关系及逸度模型对该新型有机污染物进行性质及环境归趋的预测.结... 氯代多环芳烃(chlorinated polycyclic aromatic hydrocarbons,Cl-PAHs)作为多环芳烃的氯代衍生物,具有类似二噁英的致癌、致突变毒性,并在环境中广泛存在.利用结构-活性关系及逸度模型对该新型有机污染物进行性质及环境归趋的预测.结果表明,随着氯原子取代数的增加,Cl-PAHs的毒性会有所增强,且在环境中更趋向富集于土壤和底泥中,具有与二噁英类似的环境行为. 展开更多
关键词 结构-活性关系 逸度模型 氯代多环芳烃 环境归趋
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苯环5位取代磺酰脲类化合物的水解动力学及三维定量构效关系初步研究 被引量:6
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作者 王美怡 马翼 +2 位作者 王海英 曹刚 李正名 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1636-1642,共7页
研究了除草活性较好的9个新型苯环5位取代的磺酰脲类化合物(A^I)分别在酸性、中性及碱性水溶液中的水解情况.采用HPLC-MS对水解产物进行分离鉴定,推测了水解产物的结构及水解路径.采用比较分子力场(Co MFA)方法,对化合物的结构与水解半... 研究了除草活性较好的9个新型苯环5位取代的磺酰脲类化合物(A^I)分别在酸性、中性及碱性水溶液中的水解情况.采用HPLC-MS对水解产物进行分离鉴定,推测了水解产物的结构及水解路径.采用比较分子力场(Co MFA)方法,对化合物的结构与水解半衰期之间的关系进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究.结果表明,苯环5位取代的苯磺酰脲类化合物的水解遵循一级动力学反应,容易发生酸性条件下的水解,水解反应第一步主要为酸催化下磺酰脲桥的断裂,形成5位取代的苯磺酰胺和氨基杂环.苯环5位取代的苯磺酰胺进一步发生5位酰胺基的水解,最后得到化合物c(6-氨基糖精)和d(糖精).苯环5位经修饰改造后,在相同条件下,其水解速度明显高于改造前的母体化合物单嘧磺酯和甲磺隆.苯环5位为酰胺基取代的化合物的水解速度随酰胺基上烷基碳原子数的增加及烷基体积的增大而降低.经计算所得的Co MFA模型能够对该系列化合物的水解半衰期进行较好的预测. 展开更多
关键词 5位取代苯磺酰脲类化合物 水解 半衰期 比较分子力场模型 三维定量构效关系
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GABA受体抑制剂的柔性原子受体模型研究 被引量:2
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作者 沈斌 陆忠华 +2 位作者 迟学斌 吕海峰 任天瑞 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第7期800-803,共4页
利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型,很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况,具有较好的预测能力,预测集的预测值与实验值的相关系数(r2)分别达到0.923和0.733,模型的结果与药效团模... 利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型,很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况,具有较好的预测能力,预测集的预测值与实验值的相关系数(r2)分别达到0.923和0.733,模型的结果与药效团模型有很大的一致性,为揭示药物与两种受体作用的区别提供了依据. 展开更多
关键词 柔性原子受体模型(Flarm) GABA受体 定量构效关系(qsar) 抑制剂
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基于密度泛函理论的细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系
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作者 易忠胜 叶廷文 +1 位作者 刘红艳 莫凌云 《桂林理工大学学报》 CAS 北大核心 2013年第1期99-106,共8页
在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P4... 在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P450 1A2抑制剂的两变量线性QSAR模型,结果表明:所选的2个分子结构描述符与50个抑制剂的活性之间具有很强的线性关系(相关系数r2=0.907 0)和内部预测能力(留多法交叉验证相关系数q2=0.751 7)。同时,将50个化合物分成奇数集和偶数集各自进行筛选建模,并彼此进行外部预测,对全部样本集、奇数集和偶数集样本模型进行了y-Randomization检验,结果表明描述符EHOMO和Vm建立的模型均非常稳定并具有很高的预测能力。 展开更多
关键词 细胞色素P450 1A2 抑制剂 定量结构-活性相关 密度泛函理论(DFT) VSMP
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定量构效关系应用于水中有机污染物降解过程的研究进展 被引量:5
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作者 张丹 晁聪 +2 位作者 李玉坤 炊衣琦 杨凯峰 《化工环保》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期418-426,共9页
基于化合物分子结构与反应活性之间的定量构效关系(QSAR)研究在化工、环境、医药等领域受到广泛关注,对于模拟预测未知化合物的反应活性和作用机制具有重要意义。本文介绍了QSAR的原理及常用的建模方法,综述了QSAR在水中有机污染物光降... 基于化合物分子结构与反应活性之间的定量构效关系(QSAR)研究在化工、环境、医药等领域受到广泛关注,对于模拟预测未知化合物的反应活性和作用机制具有重要意义。本文介绍了QSAR的原理及常用的建模方法,综述了QSAR在水中有机污染物光降解、高级氧化降解、生物降解过程中反应活性模拟预测以及机理解释研究领域的应用,最后对QSAR在有机污染物降解过程研究领域的发展趋势进行了展望。 展开更多
关键词 定量构效关系 建模方法 多元线性回归 分子结构描述符 高级氧化过程
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