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GST pull-down技术验证CIPK7蛋白激酶与CBL1蛋白的相互作用 被引量:3
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作者 黄聪琳 丁硕 +1 位作者 姜华 安黎哲 《兰州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期828-832,共5页
采用DNA重组技术,构建pGEX-4T-3-CIPK7和pET28-CBL1蛋白表达载体,转化大肠杆菌并诱导表达目的蛋白,利用亲和层析纯化法纯化GST标签、His标签融合蛋白,通过GST pull-down试验验证CIPK7与CBL1之间的相互作用.成功构建了CBL1和CIPK7的重组... 采用DNA重组技术,构建pGEX-4T-3-CIPK7和pET28-CBL1蛋白表达载体,转化大肠杆菌并诱导表达目的蛋白,利用亲和层析纯化法纯化GST标签、His标签融合蛋白,通过GST pull-down试验验证CIPK7与CBL1之间的相互作用.成功构建了CBL1和CIPK7的重组质粒,经诱导表达及纯化获得了可溶性GSTCIPK7和CBL1-His融合蛋白,GST pull-down试验证实了CBL1能够与CIPK7结合.CIPK7蛋白与CBL1蛋白之间存在直接的相互作用,为进一步研究蛋白激酶CIPK7的功能奠定了基础. 展开更多
关键词 CBL1蛋白 GST pull-down CIPK7蛋白 蛋白质相互作用
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GST pull-down验证流感病毒PB1-F2蛋白与热休克蛋白40的相互作用 被引量:2
2
作者 侯佩莉 关振宏 +2 位作者 张茂林 李影 段铭 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期202-207,共6页
为体外验证流感病毒PB1-F2与热休克蛋白Hsp40相互作用,通过两个方向的GST pull-down试验验证PB1-F2与Hsp40的相互作用。构建GST-多肽融合蛋白原核表达载体pGEX-6P-1-PB1-F2和pGEX-6P-1-Hsp40,并在大肠杆菌(E.co-li)BL21中诱导表达;构建... 为体外验证流感病毒PB1-F2与热休克蛋白Hsp40相互作用,通过两个方向的GST pull-down试验验证PB1-F2与Hsp40的相互作用。构建GST-多肽融合蛋白原核表达载体pGEX-6P-1-PB1-F2和pGEX-6P-1-Hsp40,并在大肠杆菌(E.co-li)BL21中诱导表达;构建真核表达载体pLEGFP-Hsp40及pCAGGS-PB1-F2,并分别转染293T细胞使其表达Hsp40及PB1-F2融合蛋白,然后进行GST pull-down试验验证二者的相互作用。成功地构建了两种蛋白的各种表达载体,经表达、纯化获得了可溶性的GST-多肽融合蛋白,GST pull-down试验正反两方向都证实了PB1-F2与Hsp40的相互作用,初步证实了流感病毒PB1-F2在体外能与Hsp40发生相互作用。 展开更多
关键词 GST pull-down 流感病毒PB1-F2蛋白 热休克蛋白40 蛋白质相互作用
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基于时间竞争的Push & Pull供应链运营机制 被引量:10
3
作者 马士华 沈玲 《管理学报》 2005年第3期347-351,共5页
在对传统的供应链运营模式Push模式和Pull模式进行基本要素比较和流程比较的基础之上,提出了基于时间竞争的Push &Pull综合供应链运营机制,阐述了该模式的运作构架,以及Push &Pull结合点的确定和运作。
关键词 供应链运营机制 多阶响应周期 Push模式 pull模式
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大粒度Pull Request描述自动生成 被引量:2
4
作者 邝砾 施如意 +2 位作者 赵雷浩 张欢 高洪皓 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2021年第6期1597-1611,共15页
在GitHub平台中,许多项目贡献者在提交Pull Request(PR)时往往会忽略提交PR描述,这使得提交的PR容易被评审者忽略或者拒绝.因此,自动生成PR描述以帮助项目贡献者提高PR通过率是很有必要的.然而,现有PR描述生成方法的表现会受到PR粒度影... 在GitHub平台中,许多项目贡献者在提交Pull Request(PR)时往往会忽略提交PR描述,这使得提交的PR容易被评审者忽略或者拒绝.因此,自动生成PR描述以帮助项目贡献者提高PR通过率是很有必要的.然而,现有PR描述生成方法的表现会受到PR粒度影响,无法有效为大粒度的PR生成描述.因此,该工作专注于大粒度PR描述的自动生成.首先对PR中的文本信息进行预处理,将文本中的单词作为辅助节点构建词-句异质图,以建立PR语句间的联系;随后对异质图进行特征提取,并将提取后的特征输入至图神经网络进行图表示学习,通过节点间的消息传递,使句子节点学习到更丰富的内容信息;最后,选择带有关键信息的句子组成PR描述.此外,针对PR数据集缺少人工标注的真实标签而无法进行监督学习的问题,使用强化学习指导PR描述的生成,以最小化获得奖励的负期望为目标训练模型,该过程与标签无关,并且直接提升了生成结果的表现.在真实的数据集上进行了实验,实验结果表明,提出的大粒度PR描述生成方法在F1值和可读性上优于现有方法. 展开更多
关键词 pull Request描述 异质图神经网络 强化学习 非结构性文档 摘要生成
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GST pull-down验证新城疫病毒基质蛋白与鸡importinβ1蛋白的相互作用 被引量:1
5
作者 胡焱 段志强 +4 位作者 嵇辛勤 赵佳福 邓珊珊 李世静 熊建民 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期126-133,共8页
旨在利用GST pull-down技术验证新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)基质(matrix,M)蛋白与鸡importinβ1蛋白在体外的相互作用。根据NDV ZJ1株M基因和鸡importinβ1基因序列设计引物,通过PCR扩增获得NDV M基因和鸡importinβ1基因... 旨在利用GST pull-down技术验证新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)基质(matrix,M)蛋白与鸡importinβ1蛋白在体外的相互作用。根据NDV ZJ1株M基因和鸡importinβ1基因序列设计引物,通过PCR扩增获得NDV M基因和鸡importinβ1基因,将其分别定向插入到原核表达载体pGEX-6p-1和pET-32a(+)构建重组原核表达载体pGEX-6p-M、pET-32a-importinβ1,然后转化至大肠杆菌BL21(DE3)后进行IPTG诱导表达,SDSPAGE检测重组蛋白的表达情况,并对包涵体重组蛋白进行变性和复性处理。然后以GST-M重组蛋白为诱饵蛋白,His-importinβ1重组蛋白为猎物蛋白,利用GST pull-down技术验证M蛋白与importinβ1蛋白的相互作用。结果表明,成功构建了重组原核表达载体pGEX-6p-M和pET-32a-importinβ1,将其转化至大肠杆菌BL21(DE3)获得了正确表达。SDS-PAGE电泳检测显示GST-M重组蛋白主要以包涵体形式存在,而His-importinβ1重组蛋白以可溶性和包涵体两种形式存在。利用蛋白重折叠试剂盒获得了有活性的GST-M重组蛋白,将其作为诱饵蛋白,可以捕获并检测到His-importinβ1重组蛋白,但是GST标签蛋白不能结合His-importinβ1重组蛋白。利用GST pull-down技术证实了NDV M蛋白与鸡importinβ1蛋白在体外具有直接的相互作用,这为深入研究importinβ1蛋白在NDV M蛋白细胞核定位的分子机制以及在NDV复制和致病中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 新城疫病毒 基质蛋白 importinβ1蛋白 GSTpull-down 蛋白相互作用
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分销网络多级存储的RFID使能的Pull控制系统 被引量:3
6
作者 李国家 汪定伟 《系统管理学报》 CSSCI 北大核心 2016年第3期571-576,共6页
射频识别(RFID)和物联网技术能够实现出入库产品快速自动扫描、精确计量以及订发货数量等物流信息在供应链上下游节点企业间的实时传递,为供应链存储控制提供了新方法。基于此,设计了RFID使能的远程电子看板系统,实现了供应链分销网络... 射频识别(RFID)和物联网技术能够实现出入库产品快速自动扫描、精确计量以及订发货数量等物流信息在供应链上下游节点企业间的实时传递,为供应链存储控制提供了新方法。基于此,设计了RFID使能的远程电子看板系统,实现了供应链分销网络多级存储的RFID使能的Pull控制,并对涉及的RFID使能的电子看板、分销网络多级存储的Pull控制以及网络数据库等关键技术进行了分析。最后,通过分别对RFID使能的Pull策略与(r,Q)策略下多种结构供应链分销网络多级存储的仿真,验证了RFID使能的Pull策略能够有效降低存储成本、提高服务水平。 展开更多
关键词 射频识别 供应链 多级存储 pull控制 仿真
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基于信息熵的Push/Pull策略下供应链不确定性 被引量:2
7
作者 赵文丹 汪定伟 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期457-460,466,共5页
以3级多产品供应链为例,分别采用Push/Pull/混合Push&Pull/改进Push 4种控制策略运行供应链,采用总熵比量化供应链的全局不确定性.将基于仿真优化(SBO)与遗传算法(GA)相结合,解决了计算量大与不确定因素多的难题.以控制规律中的增... 以3级多产品供应链为例,分别采用Push/Pull/混合Push&Pull/改进Push 4种控制策略运行供应链,采用总熵比量化供应链的全局不确定性.将基于仿真优化(SBO)与遗传算法(GA)相结合,解决了计算量大与不确定因素多的难题.以控制规律中的增益为决策变量,对不确定性进行优化,计算出最优决策变量下的客户满意度、超量库存、延迟交货和总成本等常用性能指标.仿真结果表明:供不应求时,采用混合Push&Pull策略可以降低总成本;供大于求时,采用改进Push策略能最大程度降低供应链的不确定性. 展开更多
关键词 供应链 不确定性 信息熵 pull/Push策略 仿真优化
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供应链库存的RFID使能的Push/Pull控制策略优化 被引量:1
8
作者 李国家 汪定伟 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第3期336-341,共6页
射频识别(RFID)技术的产生为供应链多级库存性能的改善提供了新的方法.基于RFID技术借鉴单工厂多阶段生产存储系统的Push/Pull策略,以供应链分销网络三级库存系统为例设计了8种RFID使能的Push/Pull混合控制策略.为得到各策略的更优性能... 射频识别(RFID)技术的产生为供应链多级库存性能的改善提供了新的方法.基于RFID技术借鉴单工厂多阶段生产存储系统的Push/Pull策略,以供应链分销网络三级库存系统为例设计了8种RFID使能的Push/Pull混合控制策略.为得到各策略的更优性能,采用基于仿真的粒子群优化方法对各策略参数进行了优化,验证了基于仿真的粒子群优化算法对优化RFID使能的Push/Pull混合控制策略的可行性和有效性,优化后各策略的仿真结果表明8种混合策略中制造商阶段采用Push控制,分销商和零售商阶段采用Pull控制的策略性能最优. 展开更多
关键词 RFID 多级网络库存 Push/pull 基于仿真的优化 粒子群优化方法
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供应链管理环境下Push/Pull生产方式研究 被引量:1
9
作者 马士华 王高英 《科技进步与对策》 CSSCI 北大核心 2005年第12期19-21,共3页
根据供应链管理环境对企业生产计划的新要求,提出了供应链管理环境下的Push/Pull生产方式,并介绍了这种生产方式的组织形式,描述了这种以看板控制体系为依托的供应链环境下的生产运作模式。
关键词 供应链环境 Push/pull生产方式 组织模式 看板控制系统
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基于时间竞争的CONWIP/Pull供应链运营模式 被引量:1
10
作者 乐晓娟 林勇 《管理学报》 2005年第z1期178-181,共4页
在分析目前汽车行业供应链管理存在问题的基础上,结合生产控制系统的CONWIP/Pull生产控制模式的特点提出了基于时间竞争的CONWIP/Pull供应链运营模式.
关键词 供应链 运营模式 基于时间的竞争 CONWIP/pull
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生产控制与市场决策一体化的PUSH/PULL混合优化问题
11
作者 华中生 梁悦盈 杨国梁 《预测》 CSSCI 2000年第6期43-45,共3页
文献 [1~ 3]提出了运用马尔可夫决策模型研究了生产控制中的 PU SH/ PUL L混合问题。本文通过在模型中引入市场需求与价格决策变量 ,研究在生产控制与市场决策一体化条件下 ,即以总收益为决策目标的最优 PUSH/ PUL L混合策略问题。
关键词 生产控制 市场决策 一体化 PUSH/pull混合策略
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WAP应用中的PUSH/PULL集成机制研究 被引量:3
12
作者 李志飞 万麟瑞 +1 位作者 胡宏 孙红星 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2001年第10期1178-1181,共4页
针对 WAP不同于有线 Internet的特点研究新的信息获取模式具有重要的意义 .本文在对比分析 PUSH和PUL L 两种信息获取模式的基础上 ,提出了更有效的 PU SH/ PU L L 集成应用模式 ,详细阐述了 WAP针对 PUSH定义的实体、相关协议及其实体... 针对 WAP不同于有线 Internet的特点研究新的信息获取模式具有重要的意义 .本文在对比分析 PUSH和PUL L 两种信息获取模式的基础上 ,提出了更有效的 PU SH/ PU L L 集成应用模式 ,详细阐述了 WAP针对 PUSH定义的实体、相关协议及其实体分布体系 ,重点探讨了 PUSH机制的实现方法 .本文所提出的集成应用思想 ,通过最后给出的 展开更多
关键词 无线应用协议 WAP PUSH/pull模式 信息集成 INTERNET
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Push/Pull技术及在Domino上的实现 被引量:4
13
作者 蔡丽娟 邹涛 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 1999年第10期63-64,79,共3页
Pull是传统的信息传送模式,Push则是近年来得到迅速发展的与Pull相对的一种信息传送模式。该文对两种传送模式技术作了简要论述,并介绍了一个采用Push/Pull技术的系统的设计与实现。
关键词 PUSH pull 信息传输模式 DOMINO 电子出版
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GST-pull down技术筛选毛白杨天冬氨酸蛋白酶PtoAED3互作蛋白 被引量:4
14
作者 赵杰 王兵 +4 位作者 骆梅 莫黎杰 李慧 刘迪 陆海 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期64-74,共11页
【目的】天冬氨酸蛋白酶属于蛋白水解酶家族,为了解析毛白杨天冬氨酸蛋白酶PtoAED3在植物生长发育中的分子调节机制,利用GST-pull down联合质谱技术,对PtoAED3的互作蛋白进行鉴定和分析。【方法】通过同源克隆获得了毛白杨PtoAED3的CDS... 【目的】天冬氨酸蛋白酶属于蛋白水解酶家族,为了解析毛白杨天冬氨酸蛋白酶PtoAED3在植物生长发育中的分子调节机制,利用GST-pull down联合质谱技术,对PtoAED3的互作蛋白进行鉴定和分析。【方法】通过同源克隆获得了毛白杨PtoAED3的CDS序列,构建含GST标签的原核表达载体pGEX-4T-PtoAED3。使用IPTG诱导GST-PtoAED3融合蛋白表达后,利用GST标签对PtoAED3蛋白进行纯化,纯化后的PtoAED3蛋白与毛白杨植株总蛋白共孵育,应用GST-pull down技术获得毛白杨总蛋白中与PtoAED3蛋白相互作用的候选蛋白,随后通过质谱技术对筛选到的候选蛋白进行鉴定与分析。【结果】通过质谱技术鉴定这些蛋白的氨基酸序列,共筛选出128个与PtoAED3特异性结合的候选互作蛋白,这些互作蛋白涉及到细胞进程、代谢过程、应激反应、生物调节、发育过程等多个生物学过程。【结论】通过GSTpull down实验联合质谱技术,筛选出毛白杨中与PtoAED3互作的候选蛋白,为研究毛白杨PtoAED3与底物或复合物的互作及其影响毛白杨生长发育的分子调节机制提供了初步方向。 展开更多
关键词 PtoAED3 GST-pull down 质谱 互作蛋白
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基于G1-Pull Up灰色关联分析的明渠安全评价 被引量:5
15
作者 路瑞琴 靳春玲 贡力 《人民长江》 北大核心 2020年第2期205-211,共7页
为了对我国西部地区众多引水明渠的安全状态进行合理地赋权及评价,构建了多指标参数的引水明渠运行安全影响因素指标体系,运用序关系分析(G1)和拉开档次法(Pull Up)分别确定各指标的主观权重和客观权重,结合专家主观经验确定指标综合权... 为了对我国西部地区众多引水明渠的安全状态进行合理地赋权及评价,构建了多指标参数的引水明渠运行安全影响因素指标体系,运用序关系分析(G1)和拉开档次法(Pull Up)分别确定各指标的主观权重和客观权重,结合专家主观经验确定指标综合权重值,最后根据明渠工程的运行特点,选取灰色关联分析法的安全评价模型计算引水明渠的安全运行等级,并将该方法应用于引大入秦工程引水明渠工程中。结果表明:G1-Pull Up法对于指标权重的确定更加客观合理,既能满足所得权重的客观性,也能保证评估结果具有一定的解释性,同时能够减少单一权重计算的偏差;灰色关联分析评价模型对于引水明渠安全运行等级的确定较为有效,并得出其安全等级为较安全状态,与实际情况一致。研究证实了该模型对西部地区引水明渠安全评价的有效性和实用性,可以为明渠的安全管理提供重要依据。 展开更多
关键词 明渠安全 序关系分析法 pull Up法 灰色关联分析 引大入秦工程
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GST pull-down联合质谱分析技术筛选鸡NOS2的互作蛋白 被引量:2
16
作者 周鑫琦 王颖洁 +1 位作者 张文慧 张亚妮 《中国家禽》 北大核心 2020年第9期19-25,共7页
为了筛选NOS2在鸡雄性生殖细胞形成过程中的互作蛋白,通过克隆NOS2序列,构建pGEX-6p-NOS2原核表达载体且诱导表达NOS2蛋白,采用GST pull-down联合质谱分析技术筛选与鸡NOS2相互作用的蛋白质。结果显示:经GST pull-down质谱分析鉴定到31... 为了筛选NOS2在鸡雄性生殖细胞形成过程中的互作蛋白,通过克隆NOS2序列,构建pGEX-6p-NOS2原核表达载体且诱导表达NOS2蛋白,采用GST pull-down联合质谱分析技术筛选与鸡NOS2相互作用的蛋白质。结果显示:经GST pull-down质谱分析鉴定到316个与鸡NOS2相互作用的候选蛋白质,其中12个高评分蛋白具有相同的功能注释,参与精子运动调控,且主要分布在细胞质、细胞核等细胞组分中,可能通过与其它蛋白质、核酸等分子结合而参与MAPK、Notch等信号通路;质谱分析还发现GOT1蛋白与NOS2互作最为明显,该蛋白参与Notch信号通路,后续将作为重点候选互作蛋白以探究其与NOS2蛋白的互作方式。该结果为进一步探究NOS2在鸡胚胎干细胞向雄性生殖细胞分化中的调控机制奠定了实验基础。 展开更多
关键词 NOS2 GST pull-down 质谱分析技术 蛋白质相互作用
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利用GST pull-down联合质谱技术鉴定H7N9禽流感病毒PA-X的互作蛋白 被引量:1
17
作者 徐国双 姜童潇 +3 位作者 郭艺迪 段铭 张茂林 关振宏 《广东农业科学》 CAS 2022年第1期121-127,共7页
【目的】为探究H7N9亚型禽流感病毒(AIV)PA-X蛋白的功能,采用GST pull-down联合质谱技术筛选与鉴定与PA-X相互作用的宿主蛋白。【方法】构建PA-X的重组表达载体pGEX-4T-PA-X,转化大肠杆菌BL21(DE3)中表达重组蛋白,并利用GST亲合树脂进... 【目的】为探究H7N9亚型禽流感病毒(AIV)PA-X蛋白的功能,采用GST pull-down联合质谱技术筛选与鉴定与PA-X相互作用的宿主蛋白。【方法】构建PA-X的重组表达载体pGEX-4T-PA-X,转化大肠杆菌BL21(DE3)中表达重组蛋白,并利用GST亲合树脂进行纯化得到GST-PA-X融合蛋白。利用GST pull-down技术,将GST-PA-X和GST对照蛋白分别与A549细胞裂解液总蛋白进行体外孵育,得到的蛋白复合物经SDS-PAGE分离后进行质谱检测分析。【结果】经GST pull-down筛选与质谱分析鉴定后得到39个高可信度的可能与PA-X互作的候选蛋白质。通过GO注释和KEGG等通路富集分析发现,这些蛋白主要参与RNA的代谢及加工、mRNA翻译及运输、多肽生物合成及基因表达的转录后调节等生物学过程。对其中评分最高的蛋白Hsp70-2与PA-X的相互作用作进一步验证,免疫荧光试验结果表明Hsp70-2与PA-X可以在细胞浆中共定位。【结论】利用GST pulldown联合质谱技术筛选到39种与PA-X互作的候选蛋白,且经免疫荧光试验证明候选蛋白Hsp70-2与PA-X存在共定位,为深入探讨PA-X在AIV生命周期中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 禽流感病毒H7N9 PA-X GST pull-down 质谱 Hsp70-2 蛋白互作
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His-pull down联合质谱鉴定谷氨酸棒杆菌中乙酰羟酸合酶IlvN的相互作用蛋白 被引量:1
18
作者 侯正杰 张权威 +5 位作者 莫晓琳 夏利 谭淼 孙全伟 马倩 陈宁 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2019年第16期11-17,共7页
以谷氨酸棒杆菌关键酶乙酰羟酸合酶调节亚基IlvN的相互作用蛋白研究为切入点,筛选出与其存在相互作用的蛋白.针对实验室选育的1株缬氨酸高产菌株Corynebacterium glutamicum XV,利用his-pull down技术捕获与乙酰羟酸合酶存在相互作用的... 以谷氨酸棒杆菌关键酶乙酰羟酸合酶调节亚基IlvN的相互作用蛋白研究为切入点,筛选出与其存在相互作用的蛋白.针对实验室选育的1株缬氨酸高产菌株Corynebacterium glutamicum XV,利用his-pull down技术捕获与乙酰羟酸合酶存在相互作用的蛋白质,通过液质联用的方法对差异蛋白进行鉴定,经蛋白电泳和液质分析后,鉴定得到45种蛋白,其中,大部分蛋白为参与翻译过程的核糖体蛋白,此外,还包括参与能量产生与转换、氨基酸转运与代谢、碳水化合物转运与代谢、脂转运与代谢、信号传导等过程的蛋白质.乙酰羟酸合酶是支链氨基酸合成过程中的一个重要关键酶,与其存在相互作用的蛋白涉及代谢过程中的多个方面,这些相互作用的蛋白对于支链氨基酸的合成代谢可能产生影响,所得蛋白相互作用结果对进一步指导协调代谢工程改造具有重要的意义. 展开更多
关键词 谷氨酸棒杆菌 分支链氨基酸 蛋白相互作用 his-pull DOWN IlvN
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大菱鲆(Scophthalmus maximus)热休克蛋白SmHsp47相互作用蛋白His-pull down和质谱鉴定
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作者 朱春月 孙志宾 +3 位作者 马爱军 刘志峰 杨敬昆 赵亭亭 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期971-982,共12页
首次克隆了大菱鲆(Scophthalmus maximus)热休克蛋白SmHsp47基因。该基因cDNA序列全长为1927 bp,其中开放阅读框长度为1218 bp,编码一条长度为405个氨基酸的多肽链。结果表明,大菱鲆SmHsp47基因在肝脏、皮肤、鳃和肠等4个组织中都有表达... 首次克隆了大菱鲆(Scophthalmus maximus)热休克蛋白SmHsp47基因。该基因cDNA序列全长为1927 bp,其中开放阅读框长度为1218 bp,编码一条长度为405个氨基酸的多肽链。结果表明,大菱鲆SmHsp47基因在肝脏、皮肤、鳃和肠等4个组织中都有表达,表达量最高的组织是肝脏,表达量最低组织是鳃;25℃处理6 h后SmHsp47在皮肤中的表达量增加150多倍。利用大肠杆菌原核表达系统表达了SmHsp47的his标签融合蛋白,然后利用His-pull down技术捕获了SmHsp47的相互作用蛋白质,通过质谱分析鉴定出31种候选蛋白,其中大部分蛋白为参与翻译后修饰,蛋白转换及分子伴侣;此外还包括参与脂转运与代谢、能量产生与转换、细胞骨架、防御机制等过程的蛋白质。从31种候选蛋白中进一步筛选出3种分值较高的蛋白:未知蛋白(uncharacterized protein,A0A6A4TFV0)、胎球蛋白B(Fetuin B,A0A2U9C388)和胶原结合蛋白(collagen-binding protein,A0A2U9B608),可为后续的研究提供方向。 展开更多
关键词 大菱鲆(Scophthalmus maximus) SmHsp47 蛋白相互作用 His-pull down
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CTCPPre: A prediction method for accepted pull requests in GitHub 被引量:3
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作者 JIANG Jing ZHENG Jia-teng +1 位作者 YANG Yun ZHANG Li 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS CSCD 2020年第2期449-468,共20页
As the popularity of open source projects,the volume of incoming pull requests is too large,which puts heavy burden on integrators who are responsible for accepting or rejecting pull requests.An accepted pull request ... As the popularity of open source projects,the volume of incoming pull requests is too large,which puts heavy burden on integrators who are responsible for accepting or rejecting pull requests.An accepted pull request prediction approach can help integrators by allowing them either to enforce an immediate rejection of code changes or allocate more resources to overcome the deficiency.In this paper,an approach CTCPPre is proposed to predict the accepted pull requests in GitHub.CTCPPre mainly considers code features of modified changes,text features of pull requests’description,contributor features of developers’previous behaviors,and project features of development environment.The effectiveness of CTCPPre on 28 projects containing 221096 pull requests is evaluated.Experimental results show that CTCPPre has good performances by achieving accuracy of 0.82,AUC of 0.76 and F1-score of 0.88 on average.It is compared with the state of art accepted pull request prediction approach RFPredict.On average across 28 projects,CTCPPre outperforms RFPredict by 6.64%,16.06%and 4.79%in terms of accuracy,AUC and F1-score,respectively. 展开更多
关键词 accepted pull request PREDICTION code review GitHub pull-based software development
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