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基于宏基因组的西藏拉鲁湿地原生生物多样性研究 被引量:1
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作者 杨方典 张鹏 +3 位作者 罗帅 熊雄 熊杰 缪炜 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第1期81-89,共9页
探究拉鲁湿地原生生物群落结构特征及其与环境因子的关系,为生物资源保护及水环境保护提供资料。2020年8—9月在拉鲁湿地10个采样点进行环境DNA样品采集和水环境因子的测定,并基于宏基因组技术,鉴定了拉鲁湿地原生生物的种类和群落结构... 探究拉鲁湿地原生生物群落结构特征及其与环境因子的关系,为生物资源保护及水环境保护提供资料。2020年8—9月在拉鲁湿地10个采样点进行环境DNA样品采集和水环境因子的测定,并基于宏基因组技术,鉴定了拉鲁湿地原生生物的种类和群落结构,考察了影响拉鲁湿地原生生物多样性的环境因素。主要结果如下:(1)拉鲁湿地原生生物共鉴定421个OTUs,隶属于21门35纲84目105科140属,其中裸藻门、纤毛门和丝足虫门种类最多,丝足虫门、硅藻门和纤毛门丰度最高;(2)拉鲁湿地不同区域原生生物多样性存在显著差异,源头处生物多样性高,各类群分布较均匀;湿地内部生物多样性也处于较高水平,主要为丝足虫门和硅藻门;下游生物多样性较低,主要为丝足虫门和纤毛门;(3)拉鲁湿地原生生物多样性受到多种水环境因子的影响,水体富营养化程度高的区域原生生物多样性相对低。不同类群原生生物与环境因子呈以下相关性:裸藻门与总磷、总氮和浊度呈正相关,硅藻则与总磷和总氮呈负相关,纤毛门与总磷和酸碱度呈正相关,丝足虫门与水中溶氧和酸碱度呈明显负相关。 展开更多
关键词 原生生物 生物多样性 宏基因组测序 拉鲁湿地
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白蚁肠道原生动物研究进展
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作者 张洁 杜贺 +1 位作者 莫振钻 张爽 《环境昆虫学报》 北大核心 2025年第2期323-336,共14页
白蚁的后肠膨大特化,为肠道微生物提供了栖息地。除了白蚁科的白蚁外,其它白蚁肠道内都含有原生动物。白蚁肠道原生动物归属于副基体门Parabasalia和前轴柱门Preaxostyla锐滴虫目Oxymonadida。白蚁肠道原生动物与多种细菌共生,二者存在... 白蚁的后肠膨大特化,为肠道微生物提供了栖息地。除了白蚁科的白蚁外,其它白蚁肠道内都含有原生动物。白蚁肠道原生动物归属于副基体门Parabasalia和前轴柱门Preaxostyla锐滴虫目Oxymonadida。白蚁肠道原生动物与多种细菌共生,二者存在共进化现象。白蚁、原生动物与细菌形成了一个三重共生系统。肠道原生动物在肠道内的分布具有异质性。肠道原生动物的传递机制既保证了肠道微生物群落的稳定性,也使白蚁肠道微生物群落不断进化。此外,白蚁肠道原生动物丰度受到白蚁品级和食物等多种因素的影响。肠道原生动物对于白蚁至关重要,能够进行木质纤维素的分解和固氮作用,参与肠道内的气体代谢,并为白蚁提供营养物质。本文对肠道原生动物的分类、原生动物共生细菌、原生动物的空间分布、传递和功能等方面进行了综述,以期为后续研究提供有益参考。 展开更多
关键词 鞭毛虫 原生动物依赖型白蚁 共生 协同物种形成 交哺行为 产乙酸作用
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荒漠草原土壤原生生物群落对长期放牧的响应
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作者 岳梅 德海山 +5 位作者 叶贺 赵宇 尚星玲 李硕 黄开春 红梅 《土壤学报》 北大核心 2025年第4期1221-1232,共12页
放牧是内蒙古荒漠草原最主要、最简便、最经济的草地利用途径之一,是影响植物、生物和土壤环境变化的重要因素。土壤原生生物在荒漠草原生态系统的物质循环和能量流动过程中起着重要作用,但原生生物群落对放牧强度变化如何响应仍知之甚... 放牧是内蒙古荒漠草原最主要、最简便、最经济的草地利用途径之一,是影响植物、生物和土壤环境变化的重要因素。土壤原生生物在荒漠草原生态系统的物质循环和能量流动过程中起着重要作用,但原生生物群落对放牧强度变化如何响应仍知之甚少。以短花针茅(Stipa breviflora)荒漠草原为对象,通过随机区组试验,设置对照(Control,CK)、轻度放牧(Light grazing,LG)、中度放牧(Moderate grazing,MG)和重度放牧(Heavy grazing,HG)四个处理组,采用高通量测序技术分析土壤原生生物群落的多样性和组成,并结合植被特征和土壤理化性质分析探究驱动土壤原生生物群落变化的关键环境因子。研究结果表明,短花针茅(Stipa breviflora)荒漠草原土壤原生生物群落主要由未分类-真核生物门(Unclassified_Eukaryota)、隐藻门(Cryptophyta)、绿藻类门(Chlorophyta)、节肢动物门(Arthropoda)、链形植物门(Streptophyta)及毛霉门(Mucoromycota)等构成。其中,优势类群(相对丰度占总丰度20%及以上)为未分类-真核生物门(Unclassified_ukaryota)、隐藻门(Cryptophyta),常见类群(相对丰度占总丰度2%~20%)为绿藻类门(Chlorophyta)、节肢动物门(Arthropoda)、链形植物门(Streptophyta)及毛霉门(Mucoromycota),稀有类群(相对丰度占总丰度2%及以下)为壶菌门(Chytridiomycota)、顶复亚门(Apicomplexa)、脊索动物门(Chordata)和担子菌门(Basidiomycota)等,其中优势类群和常见类群对放牧强度变化较敏感。放牧强度改变了荒漠草原的植被特性、土壤理化性质和土壤原生生物群落多样性。植被Margalef丰富度指数、Shannon-Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数和生物量对原生生物群落的变化均敏感;而土壤理化性质中总孔隙度、容重、有机质、全氮、全磷、有效磷、速效钾及pH是影响原生生物群落的关键环境因子。总之,放牧通过改变植被特征和土壤环境因子进而影响土壤原生生物群落,证明了养分资源相对匮乏的生态系统中原生生物与环境因子之间具有较强的连通性,同时明确了对荒漠草原放牧管理措施变化反应敏感的原生生物类群。 展开更多
关键词 荒漠草原 原生生物 群落组成 多样性 放牧 环境因子
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混合培养对破囊壶菌中Aurantiochytrium sp.生物量的影响
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作者 刘倩 王润智 +1 位作者 惠瑞雪 王秋珍 《河北渔业》 2025年第8期28-31,共4页
本研究通过藻(Chlorella sp.)—菌和菌(Talaromyces sp.、Aurantiochytrium sp.)—菌共培养对破囊壶菌(Thraustochytrid)中Aurantiochytrium sp.S3D(以下简称A.sp.S3D)生物量积累的影响。结果表明,光照显著促进破囊壶菌中A.sp.S3D的生长... 本研究通过藻(Chlorella sp.)—菌和菌(Talaromyces sp.、Aurantiochytrium sp.)—菌共培养对破囊壶菌(Thraustochytrid)中Aurantiochytrium sp.S3D(以下简称A.sp.S3D)生物量积累的影响。结果表明,光照显著促进破囊壶菌中A.sp.S3D的生长(P<0.01),但藻—菌共培养模式不利于破囊壶菌A.sp.S3D的生长。甘油—酵母提取物培养体系中,A.sp.S3D与T sp.混合培养生物量可达到(11.41±0.25)g/L,而葡萄糖—酵母提取物培养体系中,A.sp.S3D与A.sp.S3E以1∶4共培养时,生物量提升至(12.62±0.67)g/L。研究证实,酵母提取物是破囊壶菌培养的理想氮源,A.sp.S3D与A.sp.S3E培养更有利于破囊壶菌生物量的积累。 展开更多
关键词 破囊壶菌(Thraustochytrid) 微藻 混合培养 异养生物
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胶州湾浮游原生生物时空分布特征--丰度周年变化及与环境因子间的关系 被引量:7
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作者 姜勇 许恒龙 +6 位作者 朱明壮 陈旭淼 范鑫鹏 姜佳枚 Alan Aarren 胡晓钟 宋微波 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期17-23,共7页
为了解胶州湾浮游原生生物时空分布特征及与环境因子间的关系,自2007年6月-2008年5月,对青岛胶州湾内5个站点表层水的浮游原生生物丰度及环境因子进行了累计24次的周年采样调查及定性、定量分析。结果显示:(1)浮游原生生物周年变动具... 为了解胶州湾浮游原生生物时空分布特征及与环境因子间的关系,自2007年6月-2008年5月,对青岛胶州湾内5个站点表层水的浮游原生生物丰度及环境因子进行了累计24次的周年采样调查及定性、定量分析。结果显示:(1)浮游原生生物周年变动具有2个高峰,分别出现在4月和8月;(2)浮游硅藻、鞭毛藻和纤毛虫的丰度周年变动均为双峰型:春节(4月)高峰、秋节(8月)高峰;(3)浮游原生生物丰度与叶绿素a和溶解氧呈显著性相关,而其群落结构的变化与盐度、溶解氧、硝态氮和亚硝态氮的组合呈显著性相关。本工作为进一步探讨富营养化的内湾型近岸水体内原生生物生态学结构与功能提供了一份必要的基础资讯。 展开更多
关键词 浮游原生生物 丰度 群落结构 胶州湾
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样品保藏方式与时间对海洋底栖细菌及原生生物荧光计数效能的影响 被引量:3
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作者 孟昭翠 类彦立 +1 位作者 和莹莹 徐奎栋 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期13-20,共8页
DAPI荧光染色技术已广泛应用于浮游细菌及原生生物的定量研究,但对底栖生物的定量效能尚缺必要的研究。比较了冷冻和冷藏两种保藏方式以及保存时间对DAPI荧光计数底栖细菌、蓝细菌、硅藻、不同粒级自养小鞭毛虫(PNF)和异养小鞭毛虫(... DAPI荧光染色技术已广泛应用于浮游细菌及原生生物的定量研究,但对底栖生物的定量效能尚缺必要的研究。比较了冷冻和冷藏两种保藏方式以及保存时间对DAPI荧光计数底栖细菌、蓝细菌、硅藻、不同粒级自养小鞭毛虫(PNF)和异养小鞭毛虫(HNF)的影响。对黄海冷水固三个站位表层2cm底栖样品进行的4℃冷藏与-20℃冷冻避光保存的比较研究表明,两种保藏方式下两个站位的所有研究对象均无显著差异,但另一站位的PNF(2~5μm和5~10μm)的冷藏保存显著优于冷冻保存。对选取的另外两个站位(0~2cm和2~5cm分层)的样品经1个月和4个月冷藏保存后的分析表明,对于底栖细菌、蓝细菌、PNF(5~10μm)、PNF(〉10gm)、HNF(〉10μm)和硅藻在保存1个月和4个月后的计数没有显著差异,而对于PNF(2~5μm)、HNF(2~5μm1、HNF(5~10μm)保存4个月的数量明显低于保存1个月的样品,如其中一个站位的0~2cm分层的PNF(2~5μm)丰度减少了47.4%,2~5cm分层的丰度减少了59.6%,HNF(2—5gm)和HNF(5~10μm)经4个月后丰度降为0。本研究表明,对底栖细菌、蓝细菌以及原生生物的定量计数可因样品、保藏方式及保存时间的不同而产生差异,因此对于底栖样品短期内宜采用避光、冷藏保存,并在带回实验室后尽快分析。 展开更多
关键词 冷冻 冷藏 保存时间 底栖细菌 原生生物 DAPI荧光计数
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隐真菌的研究进展 被引量:3
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作者 龚骏 邢贝贝 张倩倩 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期27-34,共8页
隐真菌门(Cryptomycota)是最近才建立的、隶属于真菌界的一个新的门。本文简要回顾了隐真菌门的来历及建立的依据,介绍了隐真菌的研究进展。系统进化分析显示,隐真菌位于真菌进化树的基部;依据已有的分子序列估计其种类非常丰富,在土壤... 隐真菌门(Cryptomycota)是最近才建立的、隶属于真菌界的一个新的门。本文简要回顾了隐真菌门的来历及建立的依据,介绍了隐真菌的研究进展。系统进化分析显示,隐真菌位于真菌进化树的基部;依据已有的分子序列估计其种类非常丰富,在土壤、海洋与淡水环境中广泛分布。隐真菌细胞壁无几丁质,但其基因组中存在具有肌球蛋白结构域的II型几丁质合成酶基因;生活史相对简单,包括游动孢子、孢囊与孢子囊等阶段;通常在壶菌等真菌细胞内寄生,可通过吞噬作用吸收营养。由于壶菌可侵染浮游植物,因此推测隐真菌可能在水体初级生产及碎屑食物网中发挥调节作用。最后,对有关隐真菌的分子系统、分离与培养、基因组、多样性及分子生态学研究进行展望。 展开更多
关键词 原生生物 寄生食物链 系统分类与进化 分子微生物生态 微食物网
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桑沟湾养殖生态系统微食物环对长牡蛎(Crassostrea gigas)碳需求的贡献 被引量:1
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作者 杜美荣 李凤雪 +4 位作者 方建光 高亚平 房景辉 蒋增杰 王同勇 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1334-1342,共9页
采用海域大规模调查和模拟现场流水法测定了桑沟湾海域微食物环主要组分生物(微微型浮游生物、微型鞭毛虫和纤毛虫)在桑沟湾的季节分布和对长牡蛎食物来源的贡献。对桑沟湾海域浮游生物现存量的调查结果显示:微食物环生物丰度和生物量... 采用海域大规模调查和模拟现场流水法测定了桑沟湾海域微食物环主要组分生物(微微型浮游生物、微型鞭毛虫和纤毛虫)在桑沟湾的季节分布和对长牡蛎食物来源的贡献。对桑沟湾海域浮游生物现存量的调查结果显示:微食物环生物丰度和生物量以冬季最低(P<0.05)。微食物环组成生物的生物量以微型鞭毛虫最大,占51.69%(无色素体微型鞭毛虫HNF贡献37.31%,有色素体微型鞭毛虫PNF贡献14.38%),其次是异养细菌(39.03%),纤毛虫和微微型真核浮游生物贡献较小,分别为2.31%和0.66%。使用模拟现场流水法,测定了长牡蛎对浮游生物的摄食,其清滤率变化范围为0.26-3.50L/(g·h),随着粒径的增大,长牡蛎对浮游生物的清滤率增加。长牡蛎对不同浮游生物的清滤率由大到小依次为:2μm以上有色素体浮游生物>纤毛虫>2μm以下有色素体浮游生物>无色素体微型鞭毛虫>异养细菌,长牡蛎对2μm以上有色素体浮游生物碳截留最大(289.20±62.36μg/(g·h)),其次是无色素体微型鞭毛虫,异养细菌和纤毛虫。传统的对于贝类食物来源的测定忽略了异养细菌、HNF以及纤毛虫,对微食物环框架的研究得出三种生物对长牡蛎的碳贡献为1563.58μg/(g·d)(17.94%),指示原生动物(异养鞭毛虫和纤毛虫)在长牡蛎的食谱组成中的地位不可忽视。异养细菌除了参与微食物环,还能被长牡蛎直接或者间接的摄食,成为长牡蛎的食物来源之一。本文结果为长牡蛎的养殖容量评估和微食物环生物对养殖生态系统的贡献分析提供了重要的数据支撑。 展开更多
关键词 微食物环 微微型浮游生物 原生动物 纤毛虫 长牡蛎 碳需求
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亚高山草地土壤原生生物群落结构和多样性海拔分布格局 被引量:15
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作者 罗正明 刘晋仙 +3 位作者 周妍英 杜京旗 吴强 柴宝峰 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2783-2793,共11页
生物多样性分布格局与维持机制即群落构建机制,是群落生态学研究的热点领域。微生物生态学中的一个关键问题是量化确定性过程和随机过程对微生物群落构建的相对贡献。尽管原生生物是土壤微生物群落中重要的组成部分,在微生物食物链中扮... 生物多样性分布格局与维持机制即群落构建机制,是群落生态学研究的热点领域。微生物生态学中的一个关键问题是量化确定性过程和随机过程对微生物群落构建的相对贡献。尽管原生生物是土壤微生物群落中重要的组成部分,在微生物食物链中扮演着关键角色,但与细菌和真菌相比,目前对原生生物群落构建机制知之甚少。运用Illumina Miseq高通量测序技术,分析了五台山亚高山草地生态系统(海拔2000—3061 m范围内)土壤原生生物群落组成和多样性维持机制。结果表明,四个海拔梯度的土壤共获得有效序列520673条,分属于8个超群、24个门、65个纲、125个目、222个科和350个属。门水平上,丝足虫门(Cercozoa)、褐藻门(Ochrophyta)、纤毛门(Ciliophora)和顶复门(Apicomplexa)为主要优势类群。LEfSe分析显示,17个生物标志物对海拔梯度非常敏感,不同海拔梯度富集了不同的原生生物种群。尽管海拔对土壤原生生物群落的α多样性没有显著影响,但非度量多维尺度分析(NMDS)和相似性分析(ANOSIM)结果表明,原生生物群落组成和结构在海拔梯度上存在显著的差异(P<0.05)。冗余分析(RDA)显示海拔、土壤含水量、总氮和植物丰富度指数与原生生物群落结构存在显著相关性(P<0.05)。方差分解分析(VPA)和偏Mantel分析表明环境因子和空间变量对原生生物群落海拔分布格局均有显著影响,但是环境因子的相对作用(7.9%)明显大于空间变量(1.8%)。土壤原生生物群落之间的Bray⁃Curtis距离与海拔距离呈显著正相关关系(P<0.05),说明选择过程可能是亚高山草地土壤原生生物群落分布格局的主要驱动因素。零模型分析进一步证实了确定性过程在原生生物群落构建中的相对作用大于随机过程。总之,五台山亚高山草地土壤原生生物群落组成和结构沿海拔梯度具有显著的变化格局,群落构建主要由确定性过程和随机过程驱动,但确定性过程占主导地位。 展开更多
关键词 原生生物群落 亚高山草地 多样性 海拔分布格局 群落构建
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微型生物碳泵研究进展 被引量:6
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作者 蔡阮鸿 郑强 +4 位作者 陈晓炜 徐大鹏 王煜 骆庭伟 张锐 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期355-366,共12页
人类活动导致大气二氧化碳(CO2)浓度持续升高,加剧了气候变化,引发全球关注.海洋是地球表面最大的活跃碳库,工业革命以来吸收了近1/3人类活动排放的CO2,调控着全球气候变化.海洋吸收和储藏CO2的机制包含物理、化学和生物过程,其中“微... 人类活动导致大气二氧化碳(CO2)浓度持续升高,加剧了气候变化,引发全球关注.海洋是地球表面最大的活跃碳库,工业革命以来吸收了近1/3人类活动排放的CO2,调控着全球气候变化.海洋吸收和储藏CO2的机制包含物理、化学和生物过程,其中“微型生物碳泵(MCP)”是一种新认识的生物机制,阐述了由微型生物(异养细菌、古菌、病毒和原生生物等)参与的将活性有机质转化为惰性溶解有机质(RDOM)的生态过程,在海洋循环和储藏中发挥重要作用.本文回顾自MCP理论提出以来的重要研究进展,包括:MCP介导的RDOM解析方法及其分子特征,海洋微型生物与DOM的相互作用机制,病毒及原生生物介导的碳循环对海洋有机质的影响等,并展望MCP未来研究方向. 展开更多
关键词 微型生物碳泵 气候变化 海洋微型生物 浮游植物 异养细菌 古菌 病毒 原生生物
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土壤原生生物的生态功能及其影响因素 被引量:3
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作者 曹文超 王娅静 +9 位作者 宋贺 李艳青 赵飞 徐海成 田素波 李英杰 尹俊慧 郭景恒 王敬国 潘好芹 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期160-179,共20页
【目的】土壤原生生物是指土壤中除植物、动物和真菌以外的所有真核生物,具有明显的系统发育和功能多样性特征,是地下生态系统的关键组成部分之一。与原核生物(细菌与古菌)和真菌相比,原生生物在土壤食物网中的作用常被忽视。本文系统... 【目的】土壤原生生物是指土壤中除植物、动物和真菌以外的所有真核生物,具有明显的系统发育和功能多样性特征,是地下生态系统的关键组成部分之一。与原核生物(细菌与古菌)和真菌相比,原生生物在土壤食物网中的作用常被忽视。本文系统论述了土壤原生生物的多样性及其生态功能,并综述了土壤养分、水分、pH、温度、重金属、微塑料等因子对土壤原生生物的影响,旨在阐明原生生物对土壤养分转化、土壤食物网和植物健康的生态作用及对主要环境因子的响应。【进展】土壤原生生物的数量、大小与形态各异,且营养级类群多样性丰富,它们可作为光合藻类、微生物捕食者、植物与动物的寄生者,在土壤食物网中扮演重要角色。光合型原生生物除潜在提高土壤氧浓度外,对陆地生态系统的碳储存具有重要贡献。消费型原生生物可通过捕食改变微生物群落,推动土壤微生物环,抑制植物病害,并提高植物性能。寄生型原生生物常被认为对宿主具有负面效应,如改变动物多样性,并引起植物病害。然而,寄生型原生生物对推动养分(如磷)循环也有贡献,且对植物的叶际细菌具有生防功能。总的来看,原生生物推动了陆地生态系统物质循环与能量流动向更高营养级的转移,并在土壤食物网中占据中心位置,发挥着关键生态功能。【展望】未来可从原生生物多样性特征及其维持机制、原生生物与其他土壤微生物或动物(如蚯蚓、线虫等)的互作与代谢关系、原生生物对土壤食物网物质循环与能量流动的贡献及相关影响因素进行深入研究。此外,原生生物生防剂的资源开发与应用,将利于缓解土壤与植物农药残留,也对保障土壤健康及其可持续利用与发展具有重要意义。 展开更多
关键词 原生生物 多样性 生态功能 功能类群 环境因子
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有机肥施用对红壤原生生物与微生物互作的影响 被引量:5
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作者 曾昭阳 栾璐 +2 位作者 薛敬荣 孙波 蒋瑀霁 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期2938-2948,共11页
为明确不同施肥处理对土壤原生生物群落、微生物碳代谢活性的影响,以南方典型旱地红壤为研究对象,基于中国科学院鹰潭红壤生态实验站玉米单作系统有机培肥长期定位试验,选取不施肥(M0)、低量猪粪(M1)、高量猪粪(M2)、高量猪粪+石灰(M3)... 为明确不同施肥处理对土壤原生生物群落、微生物碳代谢活性的影响,以南方典型旱地红壤为研究对象,基于中国科学院鹰潭红壤生态实验站玉米单作系统有机培肥长期定位试验,选取不施肥(M0)、低量猪粪(M1)、高量猪粪(M2)、高量猪粪+石灰(M3)4个处理,利用高通量测序技术研究不同猪粪处理下红壤原生生物多样性、群落结构的变化,揭示原生生物与微生物互作对土壤微生物碳代谢活性和玉米产量的影响。结果表明:(1)长期施用猪粪处理下,土壤pH、有机质(SOM)、全氮(TN)、全磷(TP)、速效磷(AP)和速效钾(AK)的含量显著提高;(2)与M0处理相比,施肥处理显著提高了原生生物生物量和多样性,并且显著改变了其群落结构,其中土壤TP、pH、AP、TN、SOM和AK是原生生物群落结构变化的重要驱动因子;(3)施肥处理显著提高了土壤细菌和真菌生物量,增加了微生物碳代谢活性(Average well color development,AWCD);(4)土壤pH和AP通过影响原生生物多样性和群落结构,间接提高了微生物碳代谢活性和玉米产量。本研究结果为提升旱地红壤的生物多样性,保障土壤健康和维持生态系统服务功能提供了科学依据。 展开更多
关键词 原生生物 多样性 群落结构 微生物碳代谢 猪粪 玉米产量
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eDNA宏条形码监测沉积物原生生物群落多样性 被引量:4
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作者 薛棋文 杨江华 +2 位作者 张丽娟 张效伟 雷春生 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期175-186,共12页
原生生物个体小、繁殖快,对污染物敏感,是沉积物环境污染重要指示类群。传统基于形态学的方法难以快速准确地反映沉积物中原生生物的群落组成和物种多样性,严重制约了其在水生态评估中的应用。本研究采用环境DNA宏条形码方法,基于真核18... 原生生物个体小、繁殖快,对污染物敏感,是沉积物环境污染重要指示类群。传统基于形态学的方法难以快速准确地反映沉积物中原生生物的群落组成和物种多样性,严重制约了其在水生态评估中的应用。本研究采用环境DNA宏条形码方法,基于真核18S rRNA基因片段分析了太湖流域沉积物原生生物的群落结构及其时空差异,筛选了可用于太湖流域沉积物生态评估的原生生物指标,建立了基于原生生物的水生态评估方法。结果显示,利用环境DNA技术在太湖流域沉积物共检出原生生物群落有2468个分类单元(OTU),属于13门44纲,至少在2个平行样本出现的OTU占总OTU的84.25%,春季(3月)与秋季(8月)原生生物群落组成差异明显。评价结果表明,目前太湖流域原生生物群落完整性整体处于亚健康和一般水平。 展开更多
关键词 eDNA宏条形码 原生生物 生态健康评价 监测技术
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香蕉根际土壤原生动物群落特征及与枯萎病病原菌的关系 被引量:2
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作者 任翔宇 刘满意 +3 位作者 孙铭泽 杨劲明 王蓓蓓 李荣 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期558-567,共10页
香蕉枯萎病由病原真菌尖孢镰刀菌4号生理小种引起,其根际微生物组是抵御病原菌入侵的关键屏障。根际原生动物群落在根际微生物群落调控以及植物健康方面有不可忽视的作用。利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析连作蕉园中植株发病前后... 香蕉枯萎病由病原真菌尖孢镰刀菌4号生理小种引起,其根际微生物组是抵御病原菌入侵的关键屏障。根际原生动物群落在根际微生物群落调控以及植物健康方面有不可忽视的作用。利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析连作蕉园中植株发病前后根际土壤原生动物群落特征变化以及其与病原菌的相互关系。结果表明:相较于可培养细菌与真菌,原生动物的数量对病原菌的种群数量变化的影响更大;根际原生动物的群落多样性与丰富度都随植株生长而降低,且在发病植株中更低;抽蕾前后的健康与发病植株中根际原生动物群落结构存在显著差异;总体而言,吞噬型原生动物的相对丰度显著高于其他功能类型的原生动物,且在健康与发病植株中差异显著;吞噬型原生动物中与病原菌具有显著相关性的多为丝足虫门;在抽蕾期的健康植株中,丝足虫门的高丰度属中Group-Te与Cercomonas属与病原菌呈显著负相关;在抽蕾期的患病植株中,相对丰度较高的植物致病型原生动物Pythium属与病原菌呈显著正相关。综上所述,根际土壤中原生动物对病原菌的影响较大,在植株生长过程中,原生动物的群落特征发生改变,且在发病与健康植株中存在差异。与病原菌具有显著负相关的吞噬型原生动物,尤其是丝足虫门的部分高丰度属,可能会在防控香蕉枯萎病上产生一定潜力。 展开更多
关键词 香蕉土传枯萎病病原菌 根际 土壤原生动物 吞噬型原生动物 土传病害防治
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祁连山国家公园青海片区河流和湿地原生生物多样性研究 被引量:2
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作者 王浩骅 张鹏 +6 位作者 罗帅 谷思雨 熊雄 于瑶 李仑 缪炜 熊杰 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第5期9-19,共11页
探索祁连山国家公园河流与湿地的原生生物群落结构特征及其对环境的响应,为片区生物多样性保护与利用提供依据。2020年7-8月对祁连山国家公园青海片区河流和湿地的21个水环境样点进行了水样采集和DNA分离,共获得DNA样品58份,利用宏基因... 探索祁连山国家公园河流与湿地的原生生物群落结构特征及其对环境的响应,为片区生物多样性保护与利用提供依据。2020年7-8月对祁连山国家公园青海片区河流和湿地的21个水环境样点进行了水样采集和DNA分离,共获得DNA样品58份,利用宏基因组测序探究祁连山国家公园青海片区的原生生物种类组成和群落结构,并分析了其与环境因子之间的关系。结果显示:(1)共鉴定和注释到393个原生生物分类单元(operational taxonomic units,OTUs),分属于24门40纲95目126科162属,其中裸藻门、纤毛门种类最多,硅藻门、纤毛门丰度最高;(2)片区不同河流或湿地的原生生物群落结构存在显著差异,河流原生生物多样性显著高于湿地;(3)RDA分析显示原生生物群落主要受水体总磷、水温、pH、总有机碳、溶解氧、盐度、总氮、硝酸盐氮、氨氮和水流速度等环境因子的显著影响;(4)物种共现网络分析显示湿地原生生物群落共现网络较河流更稳定。 展开更多
关键词 原生生物 多样性 宏基因组 河流 湿地 祁连山国家公园
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联合接种原生动物和木霉对黄瓜生长及土壤微生物区系的影响 被引量:1
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作者 莫雅旎 郭赛 +6 位作者 欧燕楠 焦子轩 黄若菱 李荣 沈宗专 Geisen Stefan 沈其荣 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期297-305,共9页
[目的]本文旨在探究吞噬性原生动物、真菌及两者联合对黄瓜生长和土壤微生物群落组成的影响。[方法]供试黄瓜品种为‘露丰黄瓜’,采用盆栽试验,设计不接种对照(CK)、单独接种贵州木霉(Trichoderma guizhouense NJAU 4742)(T处理)、单独... [目的]本文旨在探究吞噬性原生动物、真菌及两者联合对黄瓜生长和土壤微生物群落组成的影响。[方法]供试黄瓜品种为‘露丰黄瓜’,采用盆栽试验,设计不接种对照(CK)、单独接种贵州木霉(Trichoderma guizhouense NJAU 4742)(T处理)、单独接种丝竹虫(Cercomomnas lenta)(C处理)、组合接种丝竹虫和贵州木霉(T+C处理)4个处理,处理2周后采集植株及土壤样品,评估各处理对黄瓜性状及土壤细菌和真菌群落的影响。[结果]相较于CK,T、C和T+C 3个处理黄瓜株高分别增加6.0%、12.5%和21.5%,生物量分别提高5.6%、12.9%和24.0%,即贵州木霉和丝竹虫均能促进黄瓜生长且两者组合能够进一步增强促生效应。基于主坐标分析发现,3个处理均显著改变了土壤细菌和真菌群落组成,随机森林模型进一步发现细菌和真菌群落组成是影响黄瓜生物量的主要因素。线性判别分析发现,与CK相比,3个处理分别激发22、51和82个关键细菌操作分类单元(OTU),2、6和16个关键真菌OTU;T+C处理激发了更多的与黄瓜促生相关的OTU,其中,有21个关键细菌OTU仅在T+C处理中被激发,对黄瓜促生贡献最大的分别归属于Parasediminibacterium、Fluviicola和Roseimaritima;有11个关键真菌OTU仅在T+C处理中被激发,对黄瓜促生贡献最大的分别归属于隔指孢属、Melanoleuca和毛壳菌属。[结论]相比于单一接种,丝竹虫和木霉组合接种后能更显著促进黄瓜生长,两者协同调控土著细菌和真菌群落,激发并富集潜在的土著功能微生物以塑造更有利于黄瓜生长的土壤微生物群落。 展开更多
关键词 黄瓜 原生动物 木霉 接种 土壤微生物群落 促生
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基于高通量测序技术的北冰洋典型环境原生生物多样性研究进展 被引量:4
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作者 陈一璇 孔菏君 徐大鹏 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期81-88,共8页
原生生物指可独立生存的单细胞或群体真核生物,其多样性高、结构功能复杂、分布广泛,是海洋微型浮游生物群落的重要组成部分,在维持海洋生态系统结构与功能中发挥着重要作用。早期使用显微镜、流式细胞术等传统方法对原生生物多样性的... 原生生物指可独立生存的单细胞或群体真核生物,其多样性高、结构功能复杂、分布广泛,是海洋微型浮游生物群落的重要组成部分,在维持海洋生态系统结构与功能中发挥着重要作用。早期使用显微镜、流式细胞术等传统方法对原生生物多样性的研究具有若干局限性,随着分子生物学技术的发展,测序技术(尤其高通量测序)为深入研究原生生物多样性、群落组成、时空变化及甄别其环境驱动因素等做出重要贡献。北冰洋是受全球气候变暖影响最为严重的大洋,作为水体生态系统的重要组成者,原生生物所受影响仍待深入探讨。因此,探究北冰洋典型环境(如海水、海冰、融池等)中原生生物的群落组成、动态变化等,有助于了解全球变暖过程中北冰洋生态系统的变化。然而,由于极地自然环境恶劣、样品采集困难等原因,北冰洋原生生物多样性的相关研究十分欠缺,许多研究空白亟待补充。本文对基于高通量测序技术的北冰洋原生生物多样性研究进行了文献搜集与整理,以期为全球变化背景下原生生物多样性研究提供参考。 展开更多
关键词 北极 原生生物 群落组成 海冰 微型真核生物 全球变暖 融池
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强还原土壤灭菌对土壤原生生物群落的影响 被引量:1
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作者 陈弘杰 廖洪凯 +4 位作者 龙健 赵雨鑫 湛凯翔 冉泰山 杨国梅 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期539-547,共9页
强还原土壤灭菌(Reductive soil disinfestation,RSD)是一种高效、安全以及环保的土壤灭菌方法。土壤原生生物是土壤微生物的重要组成部分,对土壤养分循环和植物生长起到一定的促进作用。目前关于强还原土壤灭菌对微生物群落影响的研究... 强还原土壤灭菌(Reductive soil disinfestation,RSD)是一种高效、安全以及环保的土壤灭菌方法。土壤原生生物是土壤微生物的重要组成部分,对土壤养分循环和植物生长起到一定的促进作用。目前关于强还原土壤灭菌对微生物群落影响的研究报道较多,但大都集中于细菌和真菌群落,较少关注原生生物群落。以长期连作番茄土壤为研究对象,设置4种不同RSD处理(对照组、添加玉米秸秆、添加甘蔗渣和添加玉米秸秆+甘蔗渣),RSD步骤为:按照上述4种不同处理添加有机物料,采用淹水和覆膜的方式隔绝空气,并在35℃条件下处理21 d,处理结束后在自然风干的第1、3、7和21天取样,选取第21天的土样进行高通量测序。通过高通量18S rRNA基因扩增子测序技术分析RSD处理后土壤原生生物群落组成和功能群落的变化,利用冗余分析明确影响原生生物群落的关键环境因子。结果表明,在自然风干期间不同RSD处理增加了土壤全碳含量,土壤速效磷含量呈先下降后上升再下降的变化趋势。RSD处理后丝足虫门(Cercozoa)、纤毛门(Cilipohora)以及变形虫门(Amoebozoa)为优势类群,其相对丰度分别为19.2%-25.9%、13.8%-26.9%和12.0%-28.8%。RSD处理提高了捕食型和寄生型原生生物群落的相对丰度,降低了自养型原生生物的相对丰度,并没有改善土壤原生生物群落多样性。土壤速效磷含量和土壤铵态氮含量是影响土壤原生生物群落的关键环境因子,其中土壤速效磷含量与捕食型、自养型和寄生型原生生物功能群落的相对丰度呈现显著相关性。该研究证明了RSD处理对土壤原生生物群落组成和群落功能组成有显著的影响。 展开更多
关键词 强还原土壤灭菌 土壤原生生物群落 多样性 群落功能组成 高通量测序
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黄海南部海域不同类群微型浮游原生生物生长对亚洲沙尘和磷添加的响应
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作者 晨曦 刘光兴 +4 位作者 白晓岩 史冬婉 张潮 赵阳国 高会旺 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期22-30,共9页
海洋原生生物是微食物环的重要组成部分,在海洋生态系统的物质循环和食物传递中发挥着不可替代的作用;亚洲沙尘颗粒经长距离输运后沉降入黄海,会对海洋生态系统产生显著影响。本研究在黄海南部海域进行了现场模拟培养实验,分析了不同浓... 海洋原生生物是微食物环的重要组成部分,在海洋生态系统的物质循环和食物传递中发挥着不可替代的作用;亚洲沙尘颗粒经长距离输运后沉降入黄海,会对海洋生态系统产生显著影响。本研究在黄海南部海域进行了现场模拟培养实验,分析了不同浓度沙尘和P添加对不同粒径、异养类型浮游原生生物生长速率的影响。结果表明,在培养早期,P和沙尘的添加都会促进各营养类型浮游原生生物的生长,特别是对10~20μm自养型生长速率的促进作用最为显著,其在高、低浓度P和高、低浓度沙尘添加组的生长速率分别为1.39、0.96、0.69和0.47 d-1,分别是对照组的5.35、3.69倍和2.65、1.81倍(P<0.05),表明研究海区为P潜在限制海区,沙尘对原生生物的促进作用可能和P的溶出有关;沙尘对异养型和兼养型原生生物早期是抑制作用。在培养后期,沙尘添加对各类群原生生物的生长以促进作用为主,对2~5μm异养型的促进作用最为显著,其在高、低浓度沙尘组的生长速率分别为0.84和0.40 d-1,显著高于对照组的-0.46 d-1(P<0.05)。沙尘沉降早期对大粒径自养型原生生物生长的促进作用会加速富营养海区赤潮的发生,但对异养型的抑制作用会削弱海区物质循环和食物传递的效率;沙沉降对不同粒径和营养类型浮游原生生物生长的影响会改变黄海南部海区微型食物网的结构,影响原生生物在该海区物质转化和食物产出中的生态功能,研究结果可为深入探讨沙沉降对海洋生态系统的作用机制和生态效应提供科学参考。 展开更多
关键词 原生生物 促进作用 海洋生态系统 物质循环 生长速率 物质转化 生态效应 沙尘
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原生生物基因重复研究进展
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作者 黄丽娟 伊珍珍 林晓凤 《华南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2013年第5期1-6,共6页
详述了原生生物的大规模和小规模基因重复2种类型,以及重复基因新功能化、亚功能化和假基因化等3种分化途径的研究现状,简要介绍了重复基因保留偏好性和3种进化模型等方面的相关研究,揭示了基因重复对原生生物进化的重要意义.建议多开... 详述了原生生物的大规模和小规模基因重复2种类型,以及重复基因新功能化、亚功能化和假基因化等3种分化途径的研究现状,简要介绍了重复基因保留偏好性和3种进化模型等方面的相关研究,揭示了基因重复对原生生物进化的重要意义.建议多开展原生生物非模式生物的研究工作. 展开更多
关键词 基因重复 原生生物 基因保留 进化模型
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