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陇东绒山羊KRTAP2-1基因鉴定及其对羊绒性状影响的研究
被引量：
2
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作者
孙凯
赵孟丽
+5 位作者
郝志云
王建清
沈继源
宋宜泽
柯娜
王继卿
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1091-1098,共8页
角蛋白关联蛋白(KAPs)是羊绒纤维的主要结构成分,但尚未在山羊基因组中鉴定出KRTAP2-1基因,本研究以人类KRTAP2-1基因为模板,在山羊基因组中进行同源性搜索,在19号染色体上发现了一个399 bp的开放阅读框。采用聚合酶链反应-单链构象多态...
角蛋白关联蛋白(KAPs)是羊绒纤维的主要结构成分,但尚未在山羊基因组中鉴定出KRTAP2-1基因,本研究以人类KRTAP2-1基因为模板,在山羊基因组中进行同源性搜索,在19号染色体上发现了一个399 bp的开放阅读框。采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法,在249只陇东山羊上检测到7条不同的序列(A-G)。进化树结果表明,这7条序列与人类和绵羊的KAP2-1序列有较高的同源性,表明该序列是山羊KRTAP2-1的7个等位基因。测序结果表明,KRTAP2-1基因中存在12个单核苷酸多态性(SNPs)(5个SNPs位于编码区,7个SNPs位于非编码区),以及c.-61-63delCTC和c.9395delCCG两个碱基缺失,其中c.9395delCCG引起了第32位精氨酸的移码缺失。山羊KAP2-1蛋白含有丰富的半胱氨酸、脯氨酸、苏氨酸和丝氨酸。相关性分析表明,等位基因C的存在与较小的羊绒纤维直径相关(存在:13.4±0.05μm;缺失:13.6±0.03μm;P=0.010)。本研究表明,山羊KRTAP2-1基因有丰富的多态性,可作为陇东绒山羊羊绒纤维直径选育的分子标记用于生产实践。
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关键词
KRTAP2-1基因
山羊
聚合酶链反应-单链构象多态性(
pcr-sscp
)
羊绒纤维直径
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题名
陇东绒山羊KRTAP2-1基因鉴定及其对羊绒性状影响的研究
被引量：
2
1
作者
孙凯
赵孟丽
郝志云
王建清
沈继源
宋宜泽
柯娜
王继卿
机构
甘肃农业大学动物科学技术学院/甘肃省草食动物生物技术重点实验室
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1091-1098,共8页
基金
甘肃省基础研究创新群体项目(18JR3RA190)
甘肃农业大学“伏羲青年英才”培育计划项目(Gaufx-02Y02)
甘肃省财政厅项目(033-041041)。
文摘
角蛋白关联蛋白(KAPs)是羊绒纤维的主要结构成分,但尚未在山羊基因组中鉴定出KRTAP2-1基因,本研究以人类KRTAP2-1基因为模板,在山羊基因组中进行同源性搜索,在19号染色体上发现了一个399 bp的开放阅读框。采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法,在249只陇东山羊上检测到7条不同的序列(A-G)。进化树结果表明,这7条序列与人类和绵羊的KAP2-1序列有较高的同源性,表明该序列是山羊KRTAP2-1的7个等位基因。测序结果表明,KRTAP2-1基因中存在12个单核苷酸多态性(SNPs)(5个SNPs位于编码区,7个SNPs位于非编码区),以及c.-61-63delCTC和c.9395delCCG两个碱基缺失,其中c.9395delCCG引起了第32位精氨酸的移码缺失。山羊KAP2-1蛋白含有丰富的半胱氨酸、脯氨酸、苏氨酸和丝氨酸。相关性分析表明,等位基因C的存在与较小的羊绒纤维直径相关(存在:13.4±0.05μm;缺失:13.6±0.03μm;P=0.010)。本研究表明,山羊KRTAP2-1基因有丰富的多态性,可作为陇东绒山羊羊绒纤维直径选育的分子标记用于生产实践。
关键词
KRTAP2-1基因
山羊
聚合酶链反应-单链构象多态性(
pcr-sscp
)
羊绒纤维直径
Keywords
KRTAP2-1 gene
goat
polymerase
chain
reaction-single
stranded
conformation
polymarphism
(
pcr-sscp
)
cashmere fibre diameter
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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1
陇东绒山羊KRTAP2-1基因鉴定及其对羊绒性状影响的研究
孙凯
赵孟丽
郝志云
王建清
沈继源
宋宜泽
柯娜
王继卿
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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