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利用5个多态蛋白(酶)位点分析6个地方猪品种的遗传结构 被引量:4
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作者 林丽 王志刚 +6 位作者 刘榜 李拥军 赵小丽 杨述林 樊斌 李奎 肖炜 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期511-515,共5页
利用 5个多态蛋白 (酶 )位点碱性磷酸酶 (Akp)、蛋白酶抑制物 1(PI 1)、后白蛋白 1(Po 1)、后白蛋白2 (Po 2 )和铜蓝蛋白 (Cp)分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪 6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。 6个品种... 利用 5个多态蛋白 (酶 )位点碱性磷酸酶 (Akp)、蛋白酶抑制物 1(PI 1)、后白蛋白 1(Po 1)、后白蛋白2 (Po 2 )和铜蓝蛋白 (Cp)分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪 6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。 6个品种的平均杂合度大小依次为 :南阳黑猪 (0 .4 14 2 )、南城黑猪 (0 .30 5 7)、阳新猪 (0 .30 32 )、东乡花猪 (0 .2 6 0 6 )、杭猪 (0 .2 4 78)、清平猪 (0 .2 4 16 ) ,通过计算Nei(1978)标准遗传距离 ,用UPGMA进行聚类分析 ,6个品种聚成 2大类 :清平猪、南城黑猪、阳新猪、南阳黑猪聚成一大类 ;东乡花猪与杭猪聚成另一类。 展开更多
关键词 蛋白多态性 遗传结构 地方品种 遗传标记 蛋白酶
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杜洛克、长白和大约克夏纯种猪微卫星多态性分析 被引量:8
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作者 赵振华 贾青 +3 位作者 墨锋涛 锡建中 康峰 宁立娜 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2007年第2期103-108,共6页
利用8个微卫星标记对杜洛克、长白、大约克夏、长大、杜长大5个种群的等位基因的频率、基因杂合度、平均杂合度、多态信息含量,F-统计量、迁移率以及3个纯种之间的遗传距离进行分析。研究结果表明:各群体的平均基因杂合度存在一定差... 利用8个微卫星标记对杜洛克、长白、大约克夏、长大、杜长大5个种群的等位基因的频率、基因杂合度、平均杂合度、多态信息含量,F-统计量、迁移率以及3个纯种之间的遗传距离进行分析。研究结果表明:各群体的平均基因杂合度存在一定差异,杜长大猪群的平均杂合度高于长大猪群,高于3个纯种群的平均杂合度;3个纯种猪群中,杜洛克平均基因杂合度最低,为0.6488,大约克夏平均基因杂合度最高,为0.7233;平均多态信息含量也出现了相同的结果。聚类结果显示:长白、大约克夏间的距离最大,长白、杜洛克间的距离最小,表明长白与大约克夏交配后与杜洛克杂交产生的杂种优势最大,这与实际的杂交组合一致,遗传距离可以预测杂种优势。Fst衡量等位基因频率群体间方差,显示群体总变异的约有3.9%-11.4%来自种群间,而剩余的88.6%~96.1%则来自种群内,Fst可以作为选育程度的一个指标。 展开更多
关键词 微卫星 遗传多态性 遗传结构 杂交群体
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大约克夏猪群遗传结构分析及其经济性状生化遗传标记筛选 Ⅱ.不同来源大约克夏猪群遗传结构分析 被引量:3
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作者 黄生强 柳小春 +2 位作者 施启顺 谢新民 贺长青 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期128-131,共4页
为探讨不同来源大约克夏猪群的遗传结构差异 ,以湖南望城种猪场不同来源大约克夏猪群为研究对象 ,采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳检测了 4个组合大约克夏猪群 (加系×加系 ,加系×法系 ,英系×加系 ,英系×法系 )10种血... 为探讨不同来源大约克夏猪群的遗传结构差异 ,以湖南望城种猪场不同来源大约克夏猪群为研究对象 ,采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳检测了 4个组合大约克夏猪群 (加系×加系 ,加系×法系 ,英系×加系 ,英系×法系 )10种血浆蛋白质 (酶 )多态性 ,共检测到 33种基因型或表型 ,2 6个等位基因 ,分析了猪群间各蛋白质 (酶 )位点基因型频率及基因频率的特点 ;用 RAPD标记分析了 4个组合猪群的平均带纹相似系数 ,结果表明 ,4个组合猪群蛋白质(酶 )位点基因平均杂合度及平均带纹相似系数均无显著差异 。 展开更多
关键词 经济性状 生化遗传标记 筛选 大约克夏猪群 蛋白质多态性 遗传结构 RAPD 蛋白质酶多态性
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浙江地方猪种遗传多样性研究 被引量:3
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作者 章胜乔 吴小秋 +2 位作者 傅衍 徐宁迎 张亚平 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期547-551,共5页
采用蛋白电泳和线粒体 DNA RFLP分析方法,研究了浙江七个地方品种猪及浙江野猪的遗传多样性状况⒚从分析的30 个遗传座位、99 个地方品种个体中发现 MDH,PEPB,6PGD,AK,ADA,PHI六个座位具有多态性... 采用蛋白电泳和线粒体 DNA RFLP分析方法,研究了浙江七个地方品种猪及浙江野猪的遗传多样性状况⒚从分析的30 个遗传座位、99 个地方品种个体中发现 MDH,PEPB,6PGD,AK,ADA,PHI六个座位具有多态性,其中AK,MDH 多态座位在家猪中为首次发现⒚多态座位百分比和平均杂合度分别为P= 0200, H= 0043⒚用UPGMA 法对由基因频率所计算的标准遗传距离进行聚类分析,结果显示:浙江地方猪种的亲缘关系很近⒚在m tDNA RFLP水平,25 种限制性内切酶在27 个地方品种个体及3 个野猪个体中共检出30 种限制性态型,可归结成三种单倍型⒚各单倍型间平均遗传距离(P)为0005,群体平均多态度(π)为0000 8,处于遗传多样性贫乏范围⒚另外对金华Ⅲ系猪的研究表明金华Ⅲ系猪可能有两个母系起源⒚浙江省地方猪种遗传多样性贫乏。 展开更多
关键词 遗传多样性 蛋白电泳 线粒体DNA 限制性
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三个品种豚鼠血液蛋白多态性的比较分析 被引量:2
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作者 蔡月琴 赵伟春 +5 位作者 宋见惠 陈民利 叶丽 徐孝平 吴尉 张利棕 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2010年第3期229-235,共7页
目的比较分析白毛黑眼(WHBE)豚鼠和DHP豚鼠、花色豚鼠三个品种豚鼠在13个血液蛋白位点上的多态性。方法采用垂直板浓度和pH均不连续的聚丙烯酰胺凝胶电泳法对WHBE豚鼠、DHP豚鼠和花色豚鼠的66只个体的后白蛋白(Po)、前转铁蛋白1(Prt1)... 目的比较分析白毛黑眼(WHBE)豚鼠和DHP豚鼠、花色豚鼠三个品种豚鼠在13个血液蛋白位点上的多态性。方法采用垂直板浓度和pH均不连续的聚丙烯酰胺凝胶电泳法对WHBE豚鼠、DHP豚鼠和花色豚鼠的66只个体的后白蛋白(Po)、前转铁蛋白1(Prt1)、前转铁蛋白2(Prt2)、转铁蛋白1(Tf1)、转铁蛋白2(Tf2)、后转铁蛋白(Ptf)、慢α球蛋白(Sag)、红细胞酯酶(Es)、血清酯酶1(Est1)、血清酯酶3(Est3)、血红蛋白α(Hbα)、血红蛋白β(Hbβ)和白蛋白(Alb)共13个蛋白位点进行了电泳及染色,再利用电泳图谱对各蛋白位点基因频率、平均杂合度和遗传距离进行计算,然后结合聚类分析。结果 Tf1、Tf2、Ptf、Est1和Es在三个豚鼠品种中表现为多态,其中Tf1可作为识别WHBE豚鼠的遗传标记。Po、Prt1、Prt2、Sag、Est3、Hbα、Hbβ和Alb等位点在三个豚鼠品种中的表型一致。Hardy-Weinberg平衡状态分析表明,Es为DHP豚鼠的高度不平衡位点。Ptf为花色豚鼠的高度不平衡位点。在WHBE豚鼠中,Tf1为高度不平衡位点,Est1为不平衡位点。在三个豚鼠品种中,所检测的13个蛋白位点的平均杂合度的排列顺序为:花色豚鼠(0.350 1)>WHBE豚鼠(0.339 0)>DHP豚鼠(0.313 5)。聚类分析结果表明,花色豚鼠和WHBE豚鼠的遗传遗传距离最近(0.064 3),DHP豚鼠与花色豚鼠的遗传距离最远(0.179 2)。结论利用这些蛋白位点可以有效鉴别WHBE豚鼠、DHP豚鼠和花色豚鼠血液蛋白的遗传多态性。 展开更多
关键词 豚鼠 血液蛋白多态性 基因频率 杂合度 遗传距离
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非乳用山羊乳蛋白结构基因座遗传多态性研究 被引量:2
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作者 白文林 尹荣焕 +3 位作者 郑玉才 赵素君 张守纯 王杰 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2007年第1期59-63,共5页
为了解非乳用山羊不同群体编码乳蛋白结构基因座的遗传多态性,揭示不同群体间的遗传关系。采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术,分析中国9个非乳用山羊群体共316只个体编码乳蛋白(酶)7个结构基因座的遗传多态性,并基于5个结构基因座等位... 为了解非乳用山羊不同群体编码乳蛋白结构基因座的遗传多态性,揭示不同群体间的遗传关系。采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术,分析中国9个非乳用山羊群体共316只个体编码乳蛋白(酶)7个结构基因座的遗传多态性,并基于5个结构基因座等位基因频率计算Nei氏遗传距离,以UPMGA法作聚类分析。研究结果表明,9个山羊群体中,编码乳蛋白(酶)的-κCN,-βCN,sα1-CN,αs2-CN,-βLg,SA和LDH7个结构基因座在PAGE上均呈现出不同程度的遗传多态性;9个山羊群体中在-κCN,-βCN,αs2-CN,-βLg和SA5个结构基因座上的平均基因一致度、平均基因杂合度和平均有效等位基因数分别为0.335 0,0.655 2和1.819 9。基于-κCN,-βCN,αs2-CN,-βLg和SA5个结构基因座的等位基因频率计算Nei氏遗传距离,以UPMGA法可将中国9个非乳用山羊群体划分为2大类。非乳用山羊群体中,乳蛋白结构基因座是1个遗传多样性相对丰富的系统;乳蛋白结构基因座在非乳用山羊群体划分中具有较强的代表性。 展开更多
关键词 非乳用山羊 乳蛋白 结构基因座 遗传多态性 聚类分析
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猪血浆蛋白质(酶)位点基因杂合度与杂优率关系 被引量:2
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作者 成廷水 柳小春 施启顺 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2000年第5期372-374,共3页
:为合理选配亲本 ,充分利用杂种优势提供依据 ,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法检测了 140头猪的 11种血浆蛋白质 (酶 )多态性 ,并测定了部分经济性状 .在此基础上计算了基因平均杂合度及其与部分经济性状杂种优势率的相关 ,结果表明 ,平均基... :为合理选配亲本 ,充分利用杂种优势提供依据 ,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法检测了 140头猪的 11种血浆蛋白质 (酶 )多态性 ,并测定了部分经济性状 .在此基础上计算了基因平均杂合度及其与部分经济性状杂种优势率的相关 ,结果表明 ,平均基因杂合度与日增重、屠宰率的杂优率呈正相关 。 展开更多
关键词 多态性 平均基因杂合度 杂优率 血浆蛋白醇
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烟台黑猪SLA-DQA基因编码区多态性及生物信息学分析 被引量:2
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作者 黄晓宇 袁军虎 +2 位作者 杨巧丽 马艳萍 滚双宝 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期86-93,共8页
采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对烟台黑猪SLA-DQA基因多态性进行研究,预测其蛋白质结构并分析其功能特征。结果显示:SLA-DQA基因exon 2、exon 3、exon 4分别检测出4种等位基因,5种基因型、6种等位基因,8种基因型、4种等位基... 采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对烟台黑猪SLA-DQA基因多态性进行研究,预测其蛋白质结构并分析其功能特征。结果显示:SLA-DQA基因exon 2、exon 3、exon 4分别检测出4种等位基因,5种基因型、6种等位基因,8种基因型、4种等位基因,7种基因型,包括3种新等位基因。SLA-DQA基因共编码255个氨基酸,编码区共发现32个核苷酸突变和13个氨基酸变异,exon 2多态性最为丰富。蛋白质结构预测结果显示二级结构中无规则卷曲和延伸链比例最高,α螺旋数量多且集中,β折叠最少。功能预测结果显示,SLA-DQA基因蛋白质在能量代谢、结构蛋白和生长因子等方面几率较高。本研究结果可为SLA-DQA基因在猪抗病分子育种中的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 烟台黑猪 SLA-DQA基因 编码区 多态性 蛋白质结构
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贵州剑河白黑香猪的亲缘关系 被引量:2
9
作者 刘若余 刘培琼 张启林 《山地农业生物学报》 1998年第6期337-340,共4页
用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,测定贵州剑河白、黑香猪血清转铁蛋白(Tf)、前白蛋白(Pa)、后白蛋白(Po)的遗传多态性,计算其基因频率。同时,利用其他学者的研究结果对贵州剑河白、黑香猪与湖南、江西等省的部分地方猪种间的... 用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,测定贵州剑河白、黑香猪血清转铁蛋白(Tf)、前白蛋白(Pa)、后白蛋白(Po)的遗传多态性,计算其基因频率。同时,利用其他学者的研究结果对贵州剑河白、黑香猪与湖南、江西等省的部分地方猪种间的遗传距离进行估算,利用类平均聚类法对它们之间的亲缘关系进行研究;并绘制了类平均聚类图。结果表明,贵州剑河白香猪与黑香猪的遗传距离最近,可以认为是同一品种而两个不同毛色的品系或亚群;贵州剑河白、黑香猪与湖南的湘西黑猪间遗传距离较小(均在0035以下)亲缘关系较近。 展开更多
关键词 香猪 蛋白态性 遗传距离 聚类分析 亲缘关系
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西南地区地方品种猪血液蛋白遗传多样性的研究 被引量:2
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作者 李谨 张沅 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2001年第2期132-136,共5页
采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶技术 ,研究了 6个品种 36 0头猪 8个基因座位的蛋白质多态性。结果表明 ,6个品种中Alb和Pi Ⅱ均呈单态 ;在Xiangzhu和Rongchang中 ,Pi Ⅰ呈单态 ;对于Po Ⅰ ,除Kele外 ,其余品种均呈单态 ;CA、Cp、Po Ⅱ、Amy ... 采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶技术 ,研究了 6个品种 36 0头猪 8个基因座位的蛋白质多态性。结果表明 ,6个品种中Alb和Pi Ⅱ均呈单态 ;在Xiangzhu和Rongchang中 ,Pi Ⅰ呈单态 ;对于Po Ⅰ ,除Kele外 ,其余品种均呈单态 ;CA、Cp、Po Ⅱ、Amy Ⅰ在 6个品种中均表现出多态性。群体遗传变异指标计算结果显示 ,6个品种蛋白座位的平均杂合度为 :0 .342 1(Dianxiao) ,0 .32 2 9(Dahe) ,0 .30 6 0 (Xiangzhu) ,0 .3479(Kele) ,0 .3377(Neijiang) ,0 .2 6 5 6 (Rongchang) (以 8个座位计算 )。根据基因频率计算奈式遗传距离 ,并用UPGMA法进行聚类分析 ,得出Neijiang和Rongchang遗传距离最近 。 展开更多
关键词 血液蛋白多态性 杂合度 遗传距离 聚类分析 遗传多样性 遗传变异 西南地区
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利用微卫星标记分析4个猪品种的遗传结构 被引量:1
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作者 赵先萍 周忠孝 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2005年第3期240-242,共3页
利用5个微卫星标记对4个猪品种(山西马身猪、大白猪、长白猪和太原花猪)的遗传结构进行了分析,计算了遗传杂合度、有效等位基因数,得到了由Nei氏标准遗传距离为基础的NJ聚类图。结果表明:大白猪与马身猪以及大白猪与太原花猪的遗传关系... 利用5个微卫星标记对4个猪品种(山西马身猪、大白猪、长白猪和太原花猪)的遗传结构进行了分析,计算了遗传杂合度、有效等位基因数,得到了由Nei氏标准遗传距离为基础的NJ聚类图。结果表明:大白猪与马身猪以及大白猪与太原花猪的遗传关系较远,而山西马身猪与太原花猪的遗传关系较近;山西马身猪与太原花猪的进化历史相近,大白猪与山西马身猪组合及大白猪与太原花猪的组合,可能产生较大的杂种优势。 展开更多
关键词 微卫星标记 多态性 遗传结构
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烟台黑猪SLA-DRA基因编码区多态性及生物信息学分析
12
作者 黄晓宇 袁军虎 +2 位作者 杨巧丽 马艳萍 滚双宝 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期86-93,共8页
为了探究烟台黑猪SLA-DRA基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对SLA-DRA基因4个外显子的多态性、蛋白质的理化性质、结构域、蛋白质的空间结构和功能进行了预测和分析。结果显示:SLA... 为了探究烟台黑猪SLA-DRA基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对SLA-DRA基因4个外显子的多态性、蛋白质的理化性质、结构域、蛋白质的空间结构和功能进行了预测和分析。结果显示:SLA-DRA基因exon 1、exon 2和exon 4共检测到11个SNPs,导致7个氨基酸发生变异,exon 3没有突变产生,exon 4的多态性最丰富。SLA-DRA基因编码区759 bp核苷酸共编码252个氨基酸和1个终止子。SLA-DRA基因蛋白质是一种偏酸性、不稳定、亲水性蛋白质,其二级结构是混合型,其中无规则卷曲最多。该蛋白质含有2个免疫球蛋白结合域、2个N-糖基化位点和10个磷酸化位点。功能分析显示:SLA-DRA基因蛋白质在信号转导、受体、胁迫应答、免疫应答、生长因子等方面的几率均较高。研究结果可为猪的抗病分子育种候选基因筛选提供理论依据。 展开更多
关键词 SLA-DRA基因 烟台黑猪 编码区 多态性 蛋白质结构 分子进化树
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八眉猪蛋白质多态位点上的遗传分化 被引量:7
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作者 吴彦虎 路兴中 《西北农业大学学报》 CSCD 1994年第3期24-29,共6页
以血清蛋白质和酶多态位点作为遗传标记,通过检测八眉猪四大产区六个亚群的遗传组成,对八眉猪群体内的遗传变异进行了分析和探讨。结果表明,八眉猪亚群间在个别位点上有较大分化,主要是Po和Hp位点;八眉猪亚群间遗传变异占其总... 以血清蛋白质和酶多态位点作为遗传标记,通过检测八眉猪四大产区六个亚群的遗传组成,对八眉猪群体内的遗传变异进行了分析和探讨。结果表明,八眉猪亚群间在个别位点上有较大分化,主要是Po和Hp位点;八眉猪亚群间遗传变异占其总群体的4.15%,八眉猪群体内的遗传变异占我国部分地方猪种(或群体)总和的10.84%;亚群间的亲缘关系以L和Ch亚群最近,与HD亚群最远;亚群间的分化具有一定的层次,即主要是中心产区与一般产区的分化。 展开更多
关键词 八眉猪 多态位点 遗传变异
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江西地方猪六个品种血清蛋白质多态性及其亲缘关系的研究 被引量:5
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作者 周奀忠 邹峄 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 1990年第2期65-70,共6页
本文采用经摸索和改进而建立起来的淀粉凝胶电泳方法,一次电泳同时测定猪血清转铁蛋白、前白蛋白、后白蛋白、铜蓝蛋白、血液结合素及淀粉酶等6种蛋白质的多态性,对江西省的乐平花猪、玉山乌猪、南城黑猪、冠朝猪、萍乡二头乌及修水杭猪... 本文采用经摸索和改进而建立起来的淀粉凝胶电泳方法,一次电泳同时测定猪血清转铁蛋白、前白蛋白、后白蛋白、铜蓝蛋白、血液结合素及淀粉酶等6种蛋白质的多态性,对江西省的乐平花猪、玉山乌猪、南城黑猪、冠朝猪、萍乡二头乌及修水杭猪等6个地方猪种的上述6个位点进行了测定。利用其基因频率,计算了其平均杂合度、标准遗传距离,并进行聚类分析,然后与湖南、东亚及欧美猪种进行分析与比较。结果表明,江西6个地方猪种的基因构造基本一致;中国猪种与东亚猪种之间的亲缘关系较近,而与欧美猪种之间的亲缘关系则较远。 展开更多
关键词 血清蛋白质 多态性 亲缘关系
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豚鼠个体及品系间多态性微卫星位点筛选 被引量:4
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作者 卫振 洪胜辉 刘迪文 《中国比较医学杂志》 北大核心 2017年第11期32-37,共6页
目的筛选豚鼠多态性微卫星标记,为鉴定豚鼠遗传结构及基因定位提供基础信息。方法从国外网站筛查得豚鼠基因组DNA资料,选择AC、GT为核心的微卫星序列,根据其旁侧序列用软件设计400对引物。经过二轮PCR及电泳等实验,以电泳条带作为遗传标... 目的筛选豚鼠多态性微卫星标记,为鉴定豚鼠遗传结构及基因定位提供基础信息。方法从国外网站筛查得豚鼠基因组DNA资料,选择AC、GT为核心的微卫星序列,根据其旁侧序列用软件设计400对引物。经过二轮PCR及电泳等实验,以电泳条带作为遗传标记,通过豚鼠微卫星结构的评价筛选出多态性引物。结果第一步用5个品系豚鼠的10份DNA样本进行PCR,从400对引物中筛选出约110对具有多态性的豚鼠引物,其产物电泳条带数为1~3条。第二步用5个品系豚鼠的60份DNA样本进行PCR,从上述110对引物中筛选出51对电泳条带分辨率高的多态性引物,其中10余对引物在品系间呈标记一致或多数一致的差异。结论筛选出的51对引物在个体及品系间呈多态性,未见其他报道,可用于常规检测研究,部分可能用于豚鼠性状基因定位。 展开更多
关键词 豚鼠 微卫星标记 多态性 遗传结构
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