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室内高通量种质资源表型平台研究进展与展望被引量：18: 1; 作者何勇李禧尧 +4 位作者杨国峰俞泽宇杨宁远冯旭萍许丽佳《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第17期127-141,共15页; 种质资源是作物育种改良的重要物质基础,精确高通量获取作物表型信息是进行种质资源评估的重要途径。基于表型数据获取、解析与管理技术的室内高通量植物表型平台具备环境精确调控、成像自动无损、效率显著提升等特点,为种质资源评估提... 展开更多; 关键词作物植物表型室内表型平台表型数据解析与管理高通量种质资源评估; 在线阅读下载PDF 职称材料

复旦大学附属儿科医院高通量测序数据分析流程(第二版)对遗传疾病候选变异基因筛选用时和准确性分析被引量：28: 2; 作者杨琳董欣然 +5 位作者彭小敏陈乡吴冰冰王慧君卢宇蓝周文浩《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2018年第2期118-123,共6页; 目的本研究旨在比较和分析复旦大学附属儿科医院(我院)分子诊断中心(本中心)2015年建立的高通量测序数据分析和临床诊断流程(复旦流程1.0)及其升级后的流程(复旦流程2.0)的临床应用效果。方法以复旦流程1.0和2.0对本中心新生儿重症监护... 展开更多; 关键词高通量数据分析及解读全外显子组序列分析临床外显子组序列分析表型基因型关联性; 在线阅读下载PDF 职称材料

丽江油橄榄品种表型及SSR标记的多样性及聚类分析被引量：3: 3; 作者耿树香杨生超 +1 位作者宁德鲁李勇杰《西部林业科学》 CAS 北大核心 2018年第6期30-34,共5页; 基于表型性状及分子标记对丽江不同油橄榄品种进行遗传多样性分析,对品种鉴定及育种工作均有重要意义。以云南丽江主要栽培的19个油橄榄品种为试验材料,利用14个表型性状(5个叶片性状和9个果实性状)及20个SSR引物荧光标记进行多样性及... 展开更多; 关键词油橄榄 SSR分子标记遗传多样性聚类分析表型性状; 在线阅读下载PDF 职称材料

油橄榄品种表型和SSR标记的多样性及聚类分析被引量：17: 4; 作者秦倩王楠楠 +1 位作者李金花苏光灿《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2016年第5期676-681,共6页; [目的]利用表型性状和分子标记,对我国油橄榄品种进行鉴定和遗传多样性研究,有利于种质资源保存和利用,对了解油橄榄品种的组成结构及未来的引种和育种工作都具有重要意义。[方法]以甘肃省陇南市17个油橄榄品种为研究材料,利用表型上15... 展开更多; 关键词油橄榄表型性状 SSR荧光标记遗传多样性聚类分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

食用豆种质资源表型数据分析系统的设计与构建被引量：1: 5; 作者王珅周斌 +9 位作者范保杰彭建祥王彦谢志春刘长友时会影沈颖超耿立格王冰冰田静《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第10期63-70,共8页; 【目的】构建食用豆种质资源表型数据分析系统,为食用豆品种改良和基础研究提供丰富的种植资源和研究信息。【方法】借助河北省农林科学院粮油作物研究所保存的食用豆种质资源表型信息,基于B/S模式开发,利用LAMP(Linux+Apache+MySQL+Per... 展开更多; 关键词食用豆种质资源表型数据分析系统; 在线阅读下载PDF 职称材料

室内植物表型平台及性状鉴定研究进展和展望被引量：21: 6; 作者徐凌翔陈佳玮 +4 位作者丁国辉卢伟丁艳锋朱艳周济《智慧农业（中英文）》 2020年第1期23-42,共20页; 植物表型组学研究正逐渐向综合化、规模化、多尺度和高通量的方向快速发展。本文首先介绍了植物表型研究的最新动向。然后针对室内表型监测平台的特点和各类室内表型针对的表型性状进行了系统介绍,包括产量、品质、胁迫抗性(包括干旱、... 展开更多; 关键词植物表型组学室内表型监测产量性状品质性状抗性表型表型数据管理和解析分类; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名室内高通量种质资源表型平台研究进展与展望被引量：18: 1; 作者何勇李禧尧杨国峰俞泽宇杨宁远冯旭萍许丽佳; 机构浙江大学生物系统工程与食品科学学院浙江大学新农村发展研究院四川农业大学机电学院; 出处《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第17期127-141,共15页; 基金浙江省重点研发计划项目(2021C02023) 浙江省“领雁”研发攻关计划项目(2022C02032)。; 文摘种质资源是作物育种改良的重要物质基础,精确高通量获取作物表型信息是进行种质资源评估的重要途径。基于表型数据获取、解析与管理技术的室内高通量植物表型平台具备环境精确调控、成像自动无损、效率显著提升等特点,为种质资源评估提供了高效、集成且规模化的解决方案,对作物育种改良、种业高质量发展具有深远影响。该研究主要阐述了四类室内高通量种质资源表型平台的研究现状,对目前室内植物表型数据解析及管理技术进行介绍与分析,并总结了室内高通量表型平台与数据解析管理方法存在的问题与挑战,对未来种质资源表型评估研究方向与趋势进行展望,以期为植物表型研究提供指导和建议。; 关键词作物植物表型室内表型平台表型数据解析与管理高通量种质资源评估; Keywords crops plant phenotyping indoor phenotyping platform phenotypic data analysis and management high-throughput germplasm resource assessment; 分类号 S-1 [农业科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名复旦大学附属儿科医院高通量测序数据分析流程(第二版)对遗传疾病候选变异基因筛选用时和准确性分析被引量：28: 2; 作者杨琳董欣然彭小敏陈乡吴冰冰王慧君卢宇蓝周文浩; 机构复旦大学附属儿科医院临床遗传中心复旦大学附属儿科医院分子诊断中心复旦大学附属儿科医院新生儿科; 出处《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2018年第2期118-123,共6页; 基金国家重点研发计划精准医学专项:2016YFC0905102 新兴前沿技术联合攻关项目:SHDC12017110 +1 种基金上海市卫计委上海市儿童健康服务能力建设专项规划高端儿科海外研究团队培养计划:GDEK201701; 文摘目的本研究旨在比较和分析复旦大学附属儿科医院(我院)分子诊断中心(本中心)2015年建立的高通量测序数据分析和临床诊断流程(复旦流程1.0)及其升级后的流程(复旦流程2.0)的临床应用效果。方法以复旦流程1.0和2.0对本中心新生儿重症监护病房送检行二代测序分子诊断的连续样本,进行初步数据分析结果、流程用时和准确性的比较和分析,并以典型病例具体说明复旦流程2.0的主要特点。结果 2017年11月7~14日取得家属的知情同意的、行临床外显子检测的112例进入本文分析,初步数据分析结果的比较,进入人工数据审核的变异数量,复旦流程1.0平均210个,复旦流程2.0平均25个;完成112例从样本送达测序完成到初步报告形成时间,复旦流程1.0为78.8 h,复旦流程2.0为19.8 h;与人工审核后阳性结果判读符合率为63.6%(7/11),阴性结果判读符合率为84.2%(85/101)。结论复旦流程2.0可以更加快速、准确和自动地进行大样本量的数据分析,可以用于临床大样本量的高通量数据分析及解读。; 关键词高通量数据分析及解读全外显子组序列分析临床外显子组序列分析表型基因型关联性; Keywords data analysis for high throughput sequencing whole-exome sequencing medical exome sequencing genotype-phenotype correlation; 分类号 R440 [医药卫生—诊断学] R725.9 [医药卫生—儿科]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名丽江油橄榄品种表型及SSR标记的多样性及聚类分析被引量：3: 3; 作者耿树香杨生超宁德鲁李勇杰; 机构云南农业大学农学与生物技术学院云南省林业科学院; 出处《西部林业科学》 CAS 北大核心 2018年第6期30-34,共5页; 基金云南省科技创新人才培养项目(2016HB004) 中央财政推广项目[2017TG03]; 文摘基于表型性状及分子标记对丽江不同油橄榄品种进行遗传多样性分析,对品种鉴定及育种工作均有重要意义。以云南丽江主要栽培的19个油橄榄品种为试验材料,利用14个表型性状(5个叶片性状和9个果实性状)及20个SSR引物荧光标记进行多样性及聚类分析。结果表明,各品种油橄榄表型性状存在显著差异,20个SSR位点共检测到124个等位基因变异,平均每个位点等位基因数为6. 2个,利用表型性状及SSR荧光分子标记可完全把19个品种油橄榄完全区分开。由此可知,云南油橄榄选育品种及引种品种均具有高水平遗传多样性,对于表型性状相似的油橄榄品种需结合SSR标记进行品种鉴定。; 关键词油橄榄 SSR分子标记遗传多样性聚类分析表型性状; Keywords Olea euyopaea L SSR molecular markers genetic diversity clustering analysis phenotypic data; 分类号 S565.7 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油橄榄品种表型和SSR标记的多样性及聚类分析被引量：17: 4; 作者秦倩王楠楠李金花苏光灿; 机构林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所凉山州中泽新技术开发有限责任公司; 出处《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2016年第5期676-681,共6页; 基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资助"油橄榄主栽品种授粉习性及杂交的研究"(CAFYBB2014MA001); 文摘 [目的]利用表型性状和分子标记,对我国油橄榄品种进行鉴定和遗传多样性研究,有利于种质资源保存和利用,对了解油橄榄品种的组成结构及未来的引种和育种工作都具有重要意义。[方法]以甘肃省陇南市17个油橄榄品种为研究材料,利用表型上15个数量性状、18个质量性状和8个SSR荧光标记分别进行多样性和聚类分析。[结果]各性状在品种间存在显著差异,数量性状和质量性状的表型多样性指数分别介于1.579 2.089和0.3621.091,8个SSR位点共检测到51个等位基因变异,平均每个位点等位基因数为6.375个,利用表型性状和SSR标记可以将17个品种完全区分开。[结论]17个油橄榄品种具有较丰富的表型和遗传多样性,基于表型数量性状、质量性状和SSR标记的聚类分析结果,判别品种间遗传关系的结果有一致的,也存在一定差异。对于表型性状相似的品种,需结合SSR标记进行品种鉴定。; 关键词油橄榄表型性状 SSR荧光标记遗传多样性聚类分析; Keywords Olea europaea L. , phenotypic data, SSR, genetic diversity, clustering analysis; 分类号 S565.7 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名食用豆种质资源表型数据分析系统的设计与构建被引量：1: 5; 作者王珅周斌范保杰彭建祥王彦谢志春刘长友时会影沈颖超耿立格王冰冰田静; 机构河北省农林科学院粮油作物研究所/河北省作物遗传育种试验室长沙百奥云数据科技有限公司; 出处《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第10期63-70,共8页; 基金国家重点研发计划项目(2019YFD1000704) 国家食用豆产业技术体系岗位专家科研专项(CARS-08-G03) +1 种基金河北省农林科学院基本科研业务费项目(2021060101)。; 文摘【目的】构建食用豆种质资源表型数据分析系统,为食用豆品种改良和基础研究提供丰富的种植资源和研究信息。【方法】借助河北省农林科学院粮油作物研究所保存的食用豆种质资源表型信息,基于B/S模式开发,利用LAMP(Linux+Apache+MySQL+Perl/Python)环境,设计并构建了在线食用豆种质资源表型数据分析系统(https://breeding.biobin.com.cn/germ),并展示了该系统的主要功能和使用方法。【结果】构建了由数据层、处理层、表现层构成,可进行表型数据导入、检索与编辑的食用豆种质资源表型数据分析系统,该系统结合相关工具可进行表型相关性、层级聚类、划分聚类、遗传多样性指标等分析,且分析结果可视化。其中,表型鉴定可进行表型相似性与性状相关性分析,分析结果以雷达图或者线性回归图形式展示;表型相似性分析可以快速比较多个材料之间的数据,综合评价多个性状,选择更符合预期的育种材料;性状相关性分析可以分析任意两个性状之间的关联性,得到性状之间的关联程度。【结论】食用豆种质资源表型数据分析系统的构建有效解决了种质资源表型数据信息保存分散、不标准、分析利用困难等问题,实现了资源数字化管理、分析和共享,可用于我国食用豆育种及相关性状分析研究。; 关键词食用豆种质资源表型数据分析系统; Keywords food legumes germplasm resources phenotype data analysis system; 分类号 S520.24 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名室内植物表型平台及性状鉴定研究进展和展望被引量：21: 6; 作者徐凌翔陈佳玮丁国辉卢伟丁艳锋朱艳周济; 机构南京农业大学作物表型组学交叉研究中心/中英植物表型组学联合研究中心/江苏省现代作物生产协同创新中心/现代作物生产省部共建协同创新中心南京农业大学工学院/江苏省现代设施农业技术与装备工程实验室国家信息农业工程技术中心/农业农村部农作物系统分析及决策重点实验室/智慧农业教育部工程研究中心/江苏省信息农业高技术研究重点实验室数字科学研发部; 出处《智慧农业（中英文）》 2020年第1期23-42,共20页; 基金中央高校基本科研专项资金(JCQY201902) 江苏省基础研究计划面上项目(BK20191311)。; 文摘植物表型组学研究正逐渐向综合化、规模化、多尺度和高通量的方向快速发展。本文首先介绍了植物表型研究的最新动向。然后针对室内表型监测平台的特点和各类室内表型针对的表型性状进行了系统介绍,包括产量、品质、胁迫抗性(包括干旱、抗冷热、盐胁迫、重金属和病虫害)等。在此基础上,本文还根据通量、传感器集成度和平台大小等把一些国内外流行的室内植物表型平台进行了分类,并介绍了这些室内表型平台在植物研究中的应用情况。同时,本文还介绍了室内表型数据的管理和解析方法。最后,本文着重讨论了室内表型平台的发展方向,并结合中国植物研究的实际情况对表型组学在中国的发展提出了展望,以期为中国植物表型研究提供指导和建议。; 关键词植物表型组学室内表型监测产量性状品质性状抗性表型表型数据管理和解析分类; Keywords plant phenomics indoor phenotyping platform yield-related traits quality-related traits resistance-related phenotypes phenotyping data management and phenotypic analysis; 分类号 S-1 [农业科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	室内高通量种质资源表型平台研究进展与展望	何勇李禧尧杨国峰俞泽宇杨宁远冯旭萍许丽佳	《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2022	18	在线阅读下载PDF 职称材料
2	复旦大学附属儿科医院高通量测序数据分析流程(第二版)对遗传疾病候选变异基因筛选用时和准确性分析	杨琳董欣然彭小敏陈乡吴冰冰王慧君卢宇蓝周文浩	《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心	2018	28	在线阅读下载PDF 职称材料
3	丽江油橄榄品种表型及SSR标记的多样性及聚类分析	耿树香杨生超宁德鲁李勇杰	《西部林业科学》 CAS 北大核心	2018	3	在线阅读下载PDF 职称材料
4	油橄榄品种表型和SSR标记的多样性及聚类分析	秦倩王楠楠李金花苏光灿	《林业科学研究》 CSCD 北大核心	2016	17	在线阅读下载PDF 职称材料
5	食用豆种质资源表型数据分析系统的设计与构建	王珅周斌范保杰彭建祥王彦谢志春刘长友时会影沈颖超耿立格王冰冰田静	《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心	2023	1	在线阅读下载PDF 职称材料
6	室内植物表型平台及性状鉴定研究进展和展望	徐凌翔陈佳玮丁国辉卢伟丁艳锋朱艳周济	《智慧农业（中英文）》	2020	21	在线阅读下载PDF 职称材料