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Study on the Mechanism of Nanopatterning in Printed Electronics Based on Molecular Dynamics Simulation
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作者 HUANG Hai-yang LI Yan ZHANG Run-liang 《印刷与数字媒体技术研究》 CAS 北大核心 2024年第4期237-244,共8页
In order to research the feasibility of using the selective adsorption principle to achieve automatic shaping of nano patterns,in this study,using the liquid gallium as the conductive ink and graphene as the printing ... In order to research the feasibility of using the selective adsorption principle to achieve automatic shaping of nano patterns,in this study,using the liquid gallium as the conductive ink and graphene as the printing plate surface,by changing the surface wettability of patterned areas on the nanoscale of graphene printed boards,the automatic formation of liquid gallium patterns on the graphene printed plate surface was simulated.The results indicated that liquid gallium can achieve automatic patterning on the surface of graphene patterned areas;the greater the interaction energy between gallium and carbon atoms,the clearer the pattern;gallium liquid is prone to remain in complex local positions of the pattern,making it difficult to shape the pattern;if the spacing between adjacent pattern lines is too large or too small,it will result in residual gallium liquid between the lines;increasing the thickness of the gallium film will cause the pattern to expand beyond the boundary,but increasing the thickness of the gallium film can also enhance the thickness and uniformity of the pattern lines.In summary,the principle of selective adsorption can be used to achieve the automatic formation of nano patterns,and the pattern formation effect is influenced by factors such as atomic interaction energy and pattern configuration. 展开更多
关键词 molecular dynamics Liquid gallium GRAPHENE pattern forming
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病原真菌CFEM蛋白功能及分子机制研究进展 被引量:1
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作者 王艳玲 郭勇 高洁 《华中农业大学学报》 北大核心 2025年第1期156-167,共12页
CFEM (common in fungi extracellular membrane)蛋白是仅存在于真菌的一种细胞外膜蛋白,在真菌中往往起到效应子的作用。本文阐述了不同病原真菌CFEM蛋白的结构、起源、进化及其作用和分子机制,强调了致病性真菌中CFEM蛋白在获取铁元... CFEM (common in fungi extracellular membrane)蛋白是仅存在于真菌的一种细胞外膜蛋白,在真菌中往往起到效应子的作用。本文阐述了不同病原真菌CFEM蛋白的结构、起源、进化及其作用和分子机制,强调了致病性真菌中CFEM蛋白在获取铁元素、维护真菌细胞壁完整性、影响真菌生长发育、侵染结构形成及引发宿主免疫反应等方面的重要作用。同时对扩展青霉的CFEM蛋白进行生物信息学分析,并针对未来CFEM蛋白在侵染致病中的作用及分子机制等研究进行讨论和展望。旨在进一步解析CFEM蛋白在侵染致病中的作用和分子机理,为防控植物病原真菌病害提供理论基础和参考。 展开更多
关键词 CFEM效应蛋白 病原真菌 病原体相关分子模式 信号肽
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中华蜜蜂14-3-3ζ基因的克隆、分子特征及时空表达谱分析
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作者 陈颖 康婧 +8 位作者 臧贺 王勇杰 张凯遥 叶道有 冯睿蓉 陈大福 徐国钧 郭睿 邱剑丰 《昆虫学报》 北大核心 2025年第8期1031-1039,共9页
【目的】本研究旨在丰富中华蜜蜂Apis cerana cerana 14-3-3ζ基因的基本信息,为其进一步的功能研究提供参考和依据。【方法】通过PCR扩增14-3-3ζ基因的编码序列(coding sequence,CDS),再进行TA克隆和Sanger测序;使用相关软件预测14-3-... 【目的】本研究旨在丰富中华蜜蜂Apis cerana cerana 14-3-3ζ基因的基本信息,为其进一步的功能研究提供参考和依据。【方法】通过PCR扩增14-3-3ζ基因的编码序列(coding sequence,CDS),再进行TA克隆和Sanger测序;使用相关软件预测14-3-3ζ的理化性质和分子特征,并对14-3-3ζ进行系统进化分析;利用RT-qPCR检测14-3-3ζ基因在中华蜜蜂不同发育阶段(卵、幼虫、预蛹、蛹和成虫)、刚出房工蜂成虫不同组织(触角、中肠、脂肪体、咽下腺、脑、表皮和毒腺)及蜜蜂球囊菌Ascospaera apis接种中华蜜蜂工蜂3日龄幼虫后4,5和6日龄幼虫肠道中的表达量。【结果】成功克隆到中华蜜蜂14-3-3ζ基因的CDS,含744个核苷酸,编码247个氨基酸,中华蜜蜂14-3-3ζ的分子量约为28.0 kD,含26个磷酸化位点、4个结构域和1个保守基序,不含跨膜结构域与信号肽;中华蜜蜂、西方蜜蜂Ap.mellifera、黑大蜜蜂Ap.laboriosa、小蜜蜂Ap.florea、芦蜂Ceratina calcarata、火红熊蜂Bombus pyrosoma、地熊蜂B.terrestris、苜蓿切叶蜂Megachile rotundata、壁蜂Osmia lignaria和东南蓝莓蜂Habropoda laboriosa 14-3-3ζ均包含4个相同的保守基序和1个相同的结构域(14-3-3_1),中华蜜蜂和西方蜜蜂的14-3-3ζ在系统进化树上聚为一支。14-3-3ζ基因在中华蜜蜂卵中的表达量显著高于3日龄幼虫、1和2日龄预蛹及4日龄蛹中的表达量,在中华蜜蜂各日龄工蜂成虫体内的表达量无显著差异;14-3-3ζ基因的表达量在中华蜜蜂刚出房工蜂成虫毒腺中最高,且显著高于触角、中肠、咽下腺、脑、表皮和脂肪体中的表达量;蜜蜂球囊菌接种中华蜜蜂工蜂3日龄幼虫后,14-3-3ζ基因在中华蜜蜂工蜂4,5和6日龄幼虫肠道中的表达量与对照组比显著下调。【结论】中华蜜蜂14-3-3ζ基因在工蜂的毒腺和卵中特异性高量表达,幼虫肠道中14-3-3ζ基因的表达在蜜蜂球囊菌侵染过程中被激活,14-3-3ζ是一种潜在的亲水性、非跨膜和胞内蛋白,中华蜜蜂与上述其他10种蜂的14-3-3ζ较为保守,中华蜜蜂和西方蜜蜂的14-3-3ζ之间亲缘关系最近。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 14-3-3 分子特征 表达模式 蜜蜂球囊菌
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东方蜜蜂基质金属蛋白酶14基因AcMMP 14的分子特征与表达模式 被引量:2
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作者 刘治滩 叶道有 +8 位作者 宓诗雨 王宁 郑一荻 蒋海宾 吴鹰 徐细建 陈大福 邱剑丰 郭睿 《昆虫学报》 北大核心 2025年第3期282-290,共9页
【目的】本研究旨在克隆东方蜜蜂Apis cerana基质金属蛋白酶14(matrix metalloproteinase-14,MMP14)基因AcMMP 14,分析其分子特征和表达模式,为持续深入开展AcMMP 14的功能研究提供参考和依据。【方法】提取东方蜜蜂6日龄工蜂幼虫肠道总... 【目的】本研究旨在克隆东方蜜蜂Apis cerana基质金属蛋白酶14(matrix metalloproteinase-14,MMP14)基因AcMMP 14,分析其分子特征和表达模式,为持续深入开展AcMMP 14的功能研究提供参考和依据。【方法】提取东方蜜蜂6日龄工蜂幼虫肠道总RNA,PCR扩增AcMMP 14的编码序列(coding sequence,CDS)。使用相关生物信息学软件预测AcMMP14的理化性质和分子特征,鉴定东方蜜蜂和其他蜂种MMP14的结构域和保守基序,并进行系统进化分析。采用RT-qPCR检测AcMMP 14在工蜂卵、幼虫、预蛹、蛹和不同日龄成虫,工蜂成虫触角、脑、表皮、脂肪体、毒腺、中肠和咽下腺及东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae接种刚出房的1日龄工蜂后1-4 d时中肠中的相对表达量。【结果】AcMMP14的分子式为C 3068 H 4581 N 803 O 915 S 20,分子量约为68.00 kD,脂溶系数为64.12,等电点为5.85,平均亲水系数为-0.47,含1个信号肽和36个磷酸化位点,可同时定位于线粒体、细胞核和细胞质。东方蜜蜂与其他10种蜂的MMP14中均含有3个相同的结构域和5个相同的保守基序。东方蜜蜂与大蜜蜂A.dorsata的MMP14的氨基酸序列一致性达94.23%,且在进化树上聚为一支。AcMMP 14在东方蜜蜂工蜂卵、3日龄幼虫、1和2日龄预蛹及4日龄蛹中差异表达,在4日龄蛹中的表达量最高且显著高于3日龄幼虫和2日龄预蛹中的表达量。AcMMP 14在不同日龄工蜂成虫体内差异表达,在15日龄成虫体内的表达量最高且显著高于1,2,6,12和17日龄成虫体内的表达量。AcMMP 14在东方蜜蜂工蜂成虫的7种不同组织中差异表达,在触角中的表达量最高且显著高于脑、表皮、脂肪体、毒腺、中肠和咽下腺中的表达量。与未接种的对照组相比,东方蜜蜂微孢子虫接种后1和2 d时工蜂成虫中肠中AcMMP14的表达量显著下调,3和4 d时工蜂成虫中肠中AcMMP14的表达量下调但差异不显著。【结论】AcMMP14为潜在的亲水性蛋白和分泌蛋白;AcMMP 14在东方蜜蜂工蜂不同发育阶段和成虫组织中发挥潜在的重要功能;工蜂成虫中肠中AcMMP 14在东方蜜蜂微孢子虫的第一个增殖周期前期被激活表达。 展开更多
关键词 东方蜜蜂 基质金属蛋白酶 东方蜜蜂微孢子虫 表达模式 分子特征
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西方蜜蜂AmSTPKD3蛋白的分子特征与基因表达模式 被引量:1
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作者 董舒楠 邹培缘 +8 位作者 任亚萍 杜丽婷 李坤泽 臧贺 邱剑丰 周彤 傅佳妮 陈大福 郭睿 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第6期29-36,共8页
[目的]对西方蜜蜂(Apis mellifera)的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AmSTPKD3)进行生物信息学分析,测定AmSTPKD3基因在西方蜜蜂工蜂的组织和发育阶段的表达模式,为AmSTPKD3的功能研究提供科学依据。[方法]利用相关生物信息学软件,预测AmSTPKD3... [目的]对西方蜜蜂(Apis mellifera)的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AmSTPKD3)进行生物信息学分析,测定AmSTPKD3基因在西方蜜蜂工蜂的组织和发育阶段的表达模式,为AmSTPKD3的功能研究提供科学依据。[方法]利用相关生物信息学软件,预测AmSTPKD3的理化性质和分子特征,鉴定西方蜜蜂和其他物种(黑大蜜蜂(Apis laboriosa)、欧洲雄蜂(Bombus terrestris)、大蜜蜂(Apis dorsata)、小蜜蜂(Apis florea)、田野熊蜂(Bombus pascuorum)、东方蜜蜂(Apis cerana)、美洲东部熊蜂(Bombus impatiens)和巴西无刺蜜蜂(Frieseomelitta varia))STPKD3的结构域和保守基序。通过Mega 11.0软件对西方蜜蜂和其他物种的STPKD3进行系统进化分析。采用RT-qPCR方法,检测AmSTPKD3在西方蜜蜂不同组织(触角、毒腺、脑、中肠、脂肪体、表皮和咽下腺)和发育阶段(卵、3日龄幼虫、7和8日龄预蛹、12日龄蛹及1,2,6,12,15和18日龄成虫)的相对表达量。[结果]AmSTPKD3包含3 269个核苷酸,可编码831个氨基酸。AmSTPKD3的分子式为C4141H6511N1155O1283S40,分子质量约为94.29 ku,脂溶系数为77.36,等电点为6.09,平均亲水系数为-0.510,有99个磷酸化位点,但不含跨膜结构域和信号肽。在西方蜜蜂和其他8种蜜蜂的STPKD3中均鉴定到4个相同结构域和5个相同保守基序。西方蜜蜂与东方蜜蜂的STPKD3在进化树上聚为一支。AmSTPKD3在西方蜜蜂工蜂的触角、毒腺、脑、中肠、脂肪体、表皮和咽下腺中差异表达,在咽下腺中的表达量最高,且显著高于脑、中肠、脂肪体和表皮;AmSTPKD3在卵、3日龄幼虫、7和8日龄预蛹及12日龄蛹中差异表达,在卵和8日龄预蛹中的表达量相近,且显著高于3日龄幼虫和12日龄蛹;AmSTPKD3在1,2,6和12日龄成虫体内差异表达,在1日龄成虫体内的表达量最高且显著高于15和18日龄成虫。[结论]AmSTPKD3是潜在的亲水性蛋白和胞内蛋白,西方蜜蜂和其他9种蜂的STPKD3具有较高的保守性,西方蜜蜂与东方蜜蜂STPKD3的同源性最高,AmSTPKD3在西方蜜蜂工蜂的不同组织和发育阶段呈现动态差异表达。 展开更多
关键词 西方蜜蜂 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 理化性质 分子特征 系统进化 时空表达谱
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鳗弧菌及脂多糖刺激下大菱鲆肝脾凝集素和Toll样受体基因的时序表达分析
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作者 苟冬惠 孙志宾 +6 位作者 马爱军 田蜜 王新安 黄智慧 孙伟恒 朱春月 刘志峰 《海洋与湖沼》 北大核心 2025年第4期989-1001,共13页
凝集素和Toll样受体对激活先天免疫系统以应对入侵的病原体至关重要,为探究革兰氏阴性菌鳗弧菌、灭活鳗弧菌以及LPS刺激大菱鲆PAMP识别受体基因的免疫应答机制,以平均体质量为(19.37±4.31)g、平均体长为(10.71±0.69)cm的大菱... 凝集素和Toll样受体对激活先天免疫系统以应对入侵的病原体至关重要,为探究革兰氏阴性菌鳗弧菌、灭活鳗弧菌以及LPS刺激大菱鲆PAMP识别受体基因的免疫应答机制,以平均体质量为(19.37±4.31)g、平均体长为(10.71±0.69)cm的大菱鲆为实验对象,分别于免疫后0、12、24、48、72和96 h采集肝和脾组织,提取总RNA,采用qPCR检测肝脏和脾脏中LEC、SAP、TLR5M、TLR14基因的表达水平。结果显示:在肝脏中,活菌刺激下LEC、SAP、TLR5M和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达,上调表达高峰均在0~24 h,基因表达量最高值是对照组的14~3857倍;灭活菌和LPS刺激下LEC、TLR5M和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达,表达高峰分别在24~72 h和48~72 h,最高表达量分别是对照组的52~447倍和18~184倍。在脾脏中,活菌刺激下LEC和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达,上调表达高峰均在0~24 h,基因表达量最高值是对照组的5~223倍;灭活菌和LPS刺激下LEC、SAP和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达,LEC和SAP表达高峰在0~12 h,TLR14表达高峰在48~72 h,最高表达量分别是对照组的4~28倍和2~68倍,其他基因表现为显著下调或无明显变化。研究结果表明:不同免疫刺激能引起肝脏和脾脏PAMP识别受体基因的快速变化,并且这些基因的表达变化具有组织特异性。免疫后肝脏和脾脏在0~72 h中,可用更为简单的免疫增强剂LPS或灭活菌代替活菌注射,通过LEC、SAP、TLR5M和TLR14 PAMP识别受体基因表达作为评价指标。研究结果可为抗鳗弧菌新品种选育和海水鱼类免疫增强剂筛选提供理论依据。 展开更多
关键词 病原相关分子模式 模式识别受体 凝集素 Toll样受体 革兰氏阴性菌 鳗弧菌
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空间飞行条件下小鼠不同组织中多组学分子互作模式挖掘及关键基因识别
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作者 张彦 杨青 +2 位作者 杜晓辉 赵磊 孙野青 《空间科学学报》 北大核心 2025年第2期529-555,共27页
为了从系统生物学的角度探究空间生物学效应,本文基于单样本网络(Single-Sample Network,SSN)开发了一种生物信息学分析方法.首先,为来自空间飞行小鼠不同组织的每个样本分别构建了转录组、DNA甲基化、蛋白质组层面的SSN.然后,提取每个... 为了从系统生物学的角度探究空间生物学效应,本文基于单样本网络(Single-Sample Network,SSN)开发了一种生物信息学分析方法.首先,为来自空间飞行小鼠不同组织的每个样本分别构建了转录组、DNA甲基化、蛋白质组层面的SSN.然后,提取每个SSN中所有节点的拓扑特征,并使用T检验识别出不同组学层面的差异互作分子.结果表明,虽然不同组学层面互作模式改变的分子交集有限,但其调控的生物过程和通路具有相似性,主要包括代谢过程、DNA损伤响应、细胞周期、氧化应激、昼夜节律等.本文还分别构建了不同组学层面的共互作网络,并识别了枢纽(Hub)基因.此外,空间飞行改变的分子互作模式可能与一系列疾病发生和病毒重激活有关. 展开更多
关键词 空间环境 单样本网络 分子互作模式 多组学
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SPINK7识别和聚集细菌启动家蚕血细胞介导的抗细菌感染免疫防御
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作者 安玲娜 李卓俞 +5 位作者 张艳 郭鹏超 郭凯雨 刘文月 董照明 赵萍 《昆虫学报》 北大核心 2025年第9期1242-1250,共9页
【目的】阐明Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂7(serine protease inhibitor Kazal-type 7, SPINK7)的生物学功能及其在家蚕Bombyx mori抵抗细菌侵染中的免疫识别机制。【方法】对家蚕SPINK7蛋白进行生物信息学分析和原核表达;利用圆二色谱分... 【目的】阐明Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂7(serine protease inhibitor Kazal-type 7, SPINK7)的生物学功能及其在家蚕Bombyx mori抵抗细菌侵染中的免疫识别机制。【方法】对家蚕SPINK7蛋白进行生物信息学分析和原核表达;利用圆二色谱分析SPINK7的二级结构及其耐热性;利用非还原性电泳及Western blot检测SPINK7的聚体形成趋势;利用大肠杆菌Escherichia coli和金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus分别侵染家蚕5龄幼虫,利用qPCR和Western blot分别检测SPINK7基因在血细胞和脂肪体中的表达量及SPINK7在血清中的蛋白含量;通过细菌抑制曲线分析SPINK7对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和藤黄微球菌Micrococcus luteus的抑菌活性;通过免疫荧光定位和酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)方法检测SPINK7与肽聚糖和脂多糖等病原体相关分子模式(pathogen associated molecular patterns, PAMPs)的结合,以及SPINK7与大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和藤黄微球菌的结合。【结果】SPINK7由3个保守的Kazal结构域组成,各结构域含有6个半胱氨酸,分别形成3对二硫键;二级结构主要为α-螺旋结构,与Kazal结构域典型二级结构一致,耐热性好,且在80℃时结构依然较为稳定。大肠杆菌和金黄色葡萄球菌诱导后,SPINK7会形成多聚体结构,并在家蚕5龄幼虫的血细胞和脂肪体中的表达量以及在血清中的蛋白含量均比磷酸缓冲液(PBS)对照组发生显著上调。SPINK7并非直接抑制细菌活性,而是通过与细菌PAMPs结合并促使细菌聚集。【结论】SPINK7是一种Kazal型的免疫相关蛋白,其在家蚕受到细菌侵染后表达上调并形成多聚体,通过识别并结合细菌PAMPs帮助家蚕血细胞聚集细菌并发挥免疫效应。 展开更多
关键词 家蚕 病原体相关分子模式 Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂7 细胞免疫 吞噬作用
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蜜蜂球囊菌几丁质酶3基因的生物信息学和表达模式分析
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作者 王梦怡 吴陶 +8 位作者 范小雪 胡艳雯 王炜 郑一荻 邱剑丰 张荣华 严提珍 陈大福 郭睿 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期640-646,共7页
【目的】丰富蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)几丁质酶3(AaCHIT3)的理化性质和分子特征信息,为AaCHIT3基因的功能研究提供科学依据。【方法】利用Expasy网站的ProtParam和ProtScale软件分别预测AaCHIT3蛋白的理化性质和亲水性,采用MEME软... 【目的】丰富蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)几丁质酶3(AaCHIT3)的理化性质和分子特征信息,为AaCHIT3基因的功能研究提供科学依据。【方法】利用Expasy网站的ProtParam和ProtScale软件分别预测AaCHIT3蛋白的理化性质和亲水性,采用MEME软件鉴定保守基序和结构域,通过Mega 11.0软件对蜜蜂球囊菌及其他真菌的CHIT3进行系统进化分析。使用RT-qPCR检测蜜蜂球囊菌侵染意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica)工蜂幼虫过程中AaCHIT3的表达模式。【结果】AaCHIT3由372个氨基酸组成,分子质量约为43.03 ku,理论等电点为5.05,分子式为C_(1953)H_(2986)N_(514)O_(559)S_(13),平均亲水系数为-0.39。AaCHIT3中,α-螺旋含102个氨基酸,延长链由53个氨基酸组成,无规则卷曲结构由217个氨基酸构成。AaCHIT3的三级结构与模板A0A168BB95.1.A的序列一致性达100%。AaCHIT3包含2个结构域(GH18和CCDC50),而疏棉状嗜热丝孢菌(Thermomyces lanuginosus)、石膏样奈尼兹皮真菌(Nannizzia gypsea)等其他9种真菌的CHIT3仅含有1个相同结构域(GH18-CTS3)。AaCHIT3含有7个保守基序,疏棉状嗜热丝孢菌、奥菲迪菌(Ophidiomyces ophidiicola)、石膏样奈尼兹皮真菌、副球孢子菌(Paracoccidioides lutzii)和印度块菌(Tuber indicum)的CHIT3均包含9个相同保守基序,曲霉菌(Aspergillus hiratsukae)、烟曲霉(Aspergillus fumigatus)、灰青霉(Penicillium canescens)和紫红曲霉(Monascus purpureus)包含10个相同保守基序。系统进化分析显示,蜜蜂球囊菌和印度块菌的CHIT3在进化树上各自单独为一支。与蜜蜂球囊菌接种后1 d(1 dpi)相比,AaCHIT3的表达水平在2 dpi显著上调,3 dpi时则下调。【结论】AaCHIT3是一种潜在的亲水性蛋白;蜜蜂球囊菌与上述其他真菌的CHIT3在保守性和同源性方面均较低。在蜜蜂球囊菌侵染意大利蜜蜂工蜂幼虫过程中,AaCHIT3的表达呈现先上调后下调的趋势,提示AaCHIT3可能在蜜蜂球囊菌的侵染过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 蜜蜂白垩病 蜜蜂球囊菌 意大利蜜蜂 几丁质 几丁质酶 分子特征 表达模式
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三仁汤通过抑制DAMPs/TLR4/NF-κB通路减轻HIV/AIDS湿热内蕴证患者炎症反应
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作者 姜庆成 张淼 +3 位作者 马素娜 王娟 潘万旗 许前磊 《辽宁中医杂志》 北大核心 2025年第10期116-121,共6页
目的 探究DAMPs/TLR4/NF-κB信号通路在HIV/AIDS湿热内蕴证炎症反应的作用机制和三仁汤的干预机制。方法 该研究选取某地区HIV/AIDS湿热内蕴证患者15例为实验组,健康人15例为对照组,HIV/AIDS湿热内蕴证患者接受中药三仁汤颗粒剂干预2个... 目的 探究DAMPs/TLR4/NF-κB信号通路在HIV/AIDS湿热内蕴证炎症反应的作用机制和三仁汤的干预机制。方法 该研究选取某地区HIV/AIDS湿热内蕴证患者15例为实验组,健康人15例为对照组,HIV/AIDS湿热内蕴证患者接受中药三仁汤颗粒剂干预2个月。利用流式细胞技术,检测分析CD^(+)_(3)T、CD^(+)_(4)T、CD^(+)_(8)T、CD^(+)_(4)/CD^(+)_(8)T等免疫学指标。运用Elisa、qPCR技术检测DAMPs/TLR4/NF-κB信号通路相关蛋白及炎症因子和mRNA的表达情况。结果 与健康对照组相比,HIV/AIDS湿热内蕴证组CD^(+)_(4)T淋巴细胞数显著降低,CD^(+)_(4)/CD^(+)_(8)T比值发生倒置,CRP、TNF-α、IL-6、HSP60、S100A8/A9、TLR4、NF-κB等蛋白及NF-κB p65、HMGB1、HSP70、IL-1β、IL-8等mRNA表达均显著上升,差异具统计学意义(P<0.05)。经三仁汤干预后,HIV/AIDS湿热内蕴证患者CD^(+)_(4)T淋巴细胞数回升,临床症状明显改善。同时,患者体内CRP、TNF-α、IL-1β、IL-6、HMGB1、HSP60、S100A8/A9、TLR4、NF-κB等蛋白及NF-κB p65、HMGB1、HSP60、HSP70、IL-1β、IL-8等mRNA表达均显著降低,差异同样具有统计学意义(P<0.05)。结论 DAMPs/TLR4/NF-κB信号通路在HIV/AIDS湿热内蕴证炎症反应中发挥重要作用,三仁汤可能通过抑制DAMPs/TLR4/NF-κB通路活化,减轻HIV/AIDS湿热内蕴证患者炎症反应。 展开更多
关键词 HIV/AIDS湿热内蕴证 炎症 DAMPS TLR4/NF-κB信号通路 三仁汤
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松辽盆地大陆科学钻探井天然氢气吸附特征及赋存规律
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作者 韩双彪 王缙 +1 位作者 黄劼 王成善 《石油与天然气地质》 北大核心 2025年第2期462-477,共16页
松辽盆地大陆科学钻探井松科2井中发现了高含量天然氢气,氢气在不同类型岩石储层中吸附特征复杂。通过钻探井天然氢异常显示储层实验测试数据并结合分子动力学方法研究了不同地质条件下不同类型岩石储层中天然氢气吸附特征,根据温度、... 松辽盆地大陆科学钻探井松科2井中发现了高含量天然氢气,氢气在不同类型岩石储层中吸附特征复杂。通过钻探井天然氢异常显示储层实验测试数据并结合分子动力学方法研究了不同地质条件下不同类型岩石储层中天然氢气吸附特征,根据温度、压力、孔隙直径、孔隙类型及气体竞争吸附因素研究了天然氢气赋存变化规律。研究结果表明:①天然氢异常显示储层中氢气含量最高达26.89%,矿物以黏土矿物及石英为主,有机质含量相对较高。有机质与黏土矿物的孔隙为富氢天然气吸附孔隙,储层中相对较小尺寸孔隙(孔径0.4~7.0 nm)可能是氢气赋存的主要空间。②当氢气与甲烷共同存在于孔径大于0.5 nm的孔隙中时,吸附态氢气含量较低,孔隙尺寸变大使得游离态氢气含量升高。蒙脱石吸附氢气能力最强。甲烷的竞争吸附会减少孔隙内的氢气含量,不利于氢气富集。③压力增大使孔隙对氢气吸附能力明显增强,温度升高则会使氢气脱附作用增强。石英与伊利石孔隙中吸附态氢气会随着温度升高更容易转化为游离态。微孔对氢气的吸附作用较强,氢气吸附量主要在微孔中。④研究区深部富铁岩层或地幔活动具有充足的氢气供给,天然氢气可以赋存于深部沉积储层中。烃类气体的生成、氢气吸附向游离状态转化及逸散作用使得氢气含量逐渐降低,形成了以甲烷为主的富氢天然气聚集区域。 展开更多
关键词 吸附特征 分子模拟 赋存规律 大陆科钻 天然氢气 松辽盆地
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西方蜜蜂AKHR基因的生物信息学及表达模式分析 被引量:2
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作者 刘彩珍 范小雪 +4 位作者 吴伯文 吴杨 付志英 陈大福 郭睿 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期1193-1200,共8页
本研究对西方蜜蜂Apis mellifera脂动激素受体(Adipokinetic hormone receptor,AKHR)基因AmAKHR CDS区进行RT-PCR扩增和生物信息学分析,并测定了AmAKHR在工蜂不同组织和不同发育阶段的表达模式,旨在为进一步的功能研究提供参考和基础。... 本研究对西方蜜蜂Apis mellifera脂动激素受体(Adipokinetic hormone receptor,AKHR)基因AmAKHR CDS区进行RT-PCR扩增和生物信息学分析,并测定了AmAKHR在工蜂不同组织和不同发育阶段的表达模式,旨在为进一步的功能研究提供参考和基础。通过PCR扩增AmAKHR的CDS,使用相关软件预测AmAKHR蛋白的理化性质、分子特征及蛋白互作网络。采用RT-qPCR技术检测AmAKHR在工蜂不同组织和不同发育阶段的相对表达量。结果表明,AmAKHR基因CDS长度为1050 bp,编码349个氨基酸;AmAKHR的相对分子量约为40.63 kDa,分子式为C1873H2939N471O484S26,含39个磷酸化位点,7个α-跨膜螺旋结构及8个保守基序,不含信号肽,主要分布于质膜;AmAKHR与小蜜蜂Apis florea的AKHR在进化树上聚为一支;AmAKHR的二级结构包含127个无规则卷曲,124个α-螺旋,87条延伸链和11个β-转角;AmAKHR与卵黄原蛋白和神经肽Corazonin等10个蛋白构成1个互作网络;AmAKHR在西方蜜蜂工蜂的毒腺、中肠、咽下腺、脂肪体、脑和触角等6个组织中差异表达,在脂肪体中的表达量最高,而在中肠中的表达量最低;AmAKHR在西方蜜蜂工蜂1日龄幼虫、3日龄幼虫、5日龄幼虫、2日龄预蛹、1日龄蛹中均有表达,且表达量随着日龄的增长而持续上调。研究结果揭示AmAKHR为疏水性蛋白和膜蛋白,并与卵黄原蛋白和神经肽等10个蛋白潜在互作,AmAKHR可能在西方蜜蜂工蜂的能量代谢、脂类分解和变态发育中发挥作用。 展开更多
关键词 西方蜜蜂 脂动激素受体 分子特性 系统进化 表达特征
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四川盆地南部下寒武统筇竹寺组页岩孔隙结构特征与页岩气赋存模式 被引量:14
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作者 梁峰 吴伟 +5 位作者 张琴 罗超 王玉满 刘宇 姜巍 卢斌 《天然气工业》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第3期131-142,共12页
近年来,四川盆地南部地区(以下简称川南地区)下寒武统筇竹寺组页岩气勘探开发取得了实质性的突破,但是,关于筇竹寺组页岩气储层孔隙结构特征及其对页岩气赋存模式影响的研究还较为薄弱。为此,以川南地区W207井筇竹寺组页岩为例,以总有... 近年来,四川盆地南部地区(以下简称川南地区)下寒武统筇竹寺组页岩气勘探开发取得了实质性的突破,但是,关于筇竹寺组页岩气储层孔隙结构特征及其对页岩气赋存模式影响的研究还较为薄弱。为此,以川南地区W207井筇竹寺组页岩为例,以总有机碳含量(TOC)不小于1.0%为界,将筇竹寺组页岩划分出4个高有机碳页岩层段(H1—H4层),并基于大视域扫描电镜、流体注入法孔隙定量表征、三维分子结构建模与分子模拟等方法,研究了不同富有机质层段页岩孔隙特征,并着重分析了H3层页岩孔隙发育特征与页岩气赋存模式。研究结果表明:(1)筇竹寺组页岩纵向上孔隙发育差异较大,其中H3层页岩孔隙系统最为有利,发育粒缘缝—有机质纳米连通孔隙—有机质基质分子内孔隙3级孔隙网络,其矿物粒缘缝与有机质纳米孔隙提供了较大的游离气储集空间,页岩有机质分子结构中普遍发育微孔,提供了较大的吸附空间;(2)微孔对总吸附量的贡献随压力增高而降低,但在30.0 MPa时仍贡献了56%以上的总吸附气量;(3)高温高压下(30.0 MPa、70℃),页岩中游离气甲烷含量占总含气量的57%,当压力由30.0 MPa降低至16.5 MPa,游离气贡献总开采气量超过80%;(4)粒缘缝、有机质纳米连通孔隙和有机质基质分子内孔隙良好的配置关系为页岩气富集及开发提供了良好的连通体系,远离风化壳的超压层段有利于页岩孔隙发育。结论认为,川南地区筇竹寺组H3层页岩孔隙系统发育,具备页岩气高产地质条件,是筇竹寺组下一步重点关注层段,在此基础上寻找远离风化壳、孔隙发育的超压页岩储层是筇竹寺组选区选层的关键。 展开更多
关键词 四川盆地南部 下寒武统筇竹寺组 甜点段 孔裂隙系统 分子结构 页岩游离气 页岩气赋存模式
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黄曲条跳甲短链气味结合蛋白基因PstrOBP-sc分子和功能特点分析
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作者 田晓丽 宋旭荣 +2 位作者 毛永娜 李传仁 张国辉 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2464-2472,共9页
【目的】分析黄曲条跳甲(Phyllotreta striolata)短链气味结合蛋白(Odorant binding protein,OBP)基因PstrOBP-sc分子和功能特点,为揭示昆虫短链OBP基因的功能提供参考。【方法】利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)克隆黄曲条跳甲短链Class... 【目的】分析黄曲条跳甲(Phyllotreta striolata)短链气味结合蛋白(Odorant binding protein,OBP)基因PstrOBP-sc分子和功能特点,为揭示昆虫短链OBP基因的功能提供参考。【方法】利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)克隆黄曲条跳甲短链Classic OBP基因,并对其进行生物信息学分析;通过逆转录聚合酶链反应技术分析短链OBP基因在黄曲条跳甲雌、雄成虫不同组织中的表达情况;构建重组表达载体异源表达短链OBP基因,以聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和蛋白质印迹法(Western blotting)验证目的蛋白;运用荧光结合试验检测短链OBP的配体结合能力。【结果】通过逆转录聚合酶链反应克隆验证,成功获得1条具有完整开放阅读框的黄曲条跳甲短链OBP基因PstrOBP-sc。PstrOBP-sc基因含有1个357 bp的开放阅读框,编码118个氨基酸残基,N末端具有1个由20个氨基酸残基组成的信号肽,成熟蛋白PSTROBP-SC仅由98个氨基酸残基组成,序列中含有6个保守的半胱氨酸,属于典型短链OBP基因。蛋白二级结构预测结果显示,PSTROBP-SC蛋白仅存在5个α-螺旋,且在第5个α-螺旋的下游仅有2个氨基酸残基。PstrOBP-sc基因组织表达模式及异源表达的PSTROBP-SC蛋白配体结合能力研究结果表明,PstrOBP-sc基因在黄曲条跳甲雌、雄成虫的所有供试组织中均有表达,而非特异性表达于嗅觉器官。同时,异源表达PSTROBP-SC不能结合荧光探针1-NPN。【结论】PstrOBP-sc基因的分子和功能特点不同于当前广泛研究的中长链OBP基因,其在生物体内很可能行使嗅觉以外的其他生理功能。 展开更多
关键词 黄曲条跳甲 短链气味结合蛋白 分子特征 组织表达模式 荧光结合试验
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铁死亡在肿瘤免疫中的作用研究进展 被引量:4
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作者 吉江红 刘赛 +2 位作者 廖翔 王冬青 朱海涛 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期362-366,共5页
铁死亡(ferroptosis)是由亚铁离子和脂质过氧化物过量堆积所导致的新型细胞死亡模式,能够以自噬依赖的方式释放损伤相关分子模式,作为免疫原性细胞死亡的佐剂,激活适应性免疫和固有免疫。肿瘤细胞和免疫细胞铁死亡受多种因素的调控且相... 铁死亡(ferroptosis)是由亚铁离子和脂质过氧化物过量堆积所导致的新型细胞死亡模式,能够以自噬依赖的方式释放损伤相关分子模式,作为免疫原性细胞死亡的佐剂,激活适应性免疫和固有免疫。肿瘤细胞和免疫细胞铁死亡受多种因素的调控且相互影响,对肿瘤的发展、治疗和预后起着重要作用。文中总结了肿瘤微环境中,T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、 B细胞等免疫细胞与肿瘤细胞铁死亡之间的相关生物学效应。 展开更多
关键词 铁死亡 免疫原性细胞死亡 免疫细胞 损伤相关分子模式 综述
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免疫原性细胞死亡在肺癌治疗中的研究进展 被引量:4
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作者 李健伦 黄思剑 +6 位作者 牟漫 卫向红 操媛 王丽娟 卓可星 李旭 钟茂华 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期552-557,共6页
肺癌是一种发病率和致死率均较高的恶性肿瘤,具有分型多、恶性程度高及预后不良等特点。免疫疗法通过激发和增强机体的免疫功能,达到控制和杀伤肿瘤细胞的目的,已被证实对多种类型的恶性肿瘤具有良好的治疗效果。免疫原性细胞死亡(immun... 肺癌是一种发病率和致死率均较高的恶性肿瘤,具有分型多、恶性程度高及预后不良等特点。免疫疗法通过激发和增强机体的免疫功能,达到控制和杀伤肿瘤细胞的目的,已被证实对多种类型的恶性肿瘤具有良好的治疗效果。免疫原性细胞死亡(immunogenic cell death,ICD)是一种程序性细胞死亡方式,其特点是损伤相关分子模式(damage-associated molecular patterns,DAMPs)的大量释放。在经过某些化疗药物、物理疗法、生物疗法或联合治疗后,肺癌细胞会发生ICD,由非免疫原性转变为免疫原性,进而募集和活化免疫细胞,最终激活和增强机体抗肿瘤免疫应答。该文就ICD的发生机制以及ICD在肺癌治疗中的应用作一综述。 展开更多
关键词 肺癌 免疫原性细胞死亡 损伤相关分子模式 ICD诱导剂
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损伤相关分子模式作为内在驱动力参与骨关节炎进程的研究进展 被引量:1
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作者 孔舒祎 钱轩韬 +1 位作者 王靖 王开强 《中国疼痛医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期325-330,共6页
骨关节炎(osteoarthritis,OA)作为中老年人群常见的退行性疾病,其迁延不愈这一特征长期以来困扰着人们,并且造成了医疗消费与日俱增和生活质量下降等一系列问题。目前,OA的治疗方案较多集中于关节内部炎症性疼痛的改善,尚无有效根治手... 骨关节炎(osteoarthritis,OA)作为中老年人群常见的退行性疾病,其迁延不愈这一特征长期以来困扰着人们,并且造成了医疗消费与日俱增和生活质量下降等一系列问题。目前,OA的治疗方案较多集中于关节内部炎症性疼痛的改善,尚无有效根治手段。相关文献指出巨噬细胞的激活和炎症级联反应的启动与损伤相关分子模式(damage-associated molecular patterns,DAMP)的介导密切相关,DAMP作为驱动剂在关节慢性炎症进程中发挥着至关重要的作用,其不仅存在于关节内部损伤,还可释放入血参与关节外部炎症进程,关节内外的DAMP炎症诱导作用可作为重要驱动力参与OA的进展。本文将从DAMP这一靶点入手,探究DAMP相关的关节慢性炎症正反馈调节机制以及DAMP在OA病人关节外部炎性微环境中的介导作用。 展开更多
关键词 骨关节炎 损伤相关分子模式 正反馈调节 慢性炎症
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超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱结合GNPS分子网络技术检测抗生素类兽药残留 被引量:4
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作者 王伟 任丽秋 +7 位作者 方志娟 胡文涛 张芬 张雪婧 赵紫薇 马家辉 李晓芹 成向荣 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第24期321-330,共10页
为研究兽药残留高通量检测方法,使用超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱(ultra performance liquid chromatography-quadrupole time of flight tandem mass spectrometry,UPLC-Q-TOF-MS/MS)对畜禽基质样品以及21种兽药标准品进行检... 为研究兽药残留高通量检测方法,使用超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱(ultra performance liquid chromatography-quadrupole time of flight tandem mass spectrometry,UPLC-Q-TOF-MS/MS)对畜禽基质样品以及21种兽药标准品进行检测,得到各兽药标准品的保留时间和特征碎片离子质谱图等信息,获得各目标化合物的线性方程、相关系数、线性范围以及测定底限。利用GNPS(global natural products social molecular networking)网站进一步探究了兽药的二级质谱裂解规律,对化合物进行结构解析和确证,发现同一种类的兽药分子裂解规律存在相似性,可以借助兽药分子的二级质谱裂解碎片实现畜禽肉中兽药残留的快速高通量筛查。基于UPLC-Q-TOF-MS/MS及GNPS分子网络技术,在24个猪肉、鱼肉样品中检出10种抗生素阳性,其中有3种不包含在已建立的兽药标准品信息库中。结果表明,相比于常规检测方法,UPLC-Q-TOF-MS/MS结合GNPS分子网络技术可以快速、简便地实现畜禽肉中兽药残留检测,且能发现未知兽药。 展开更多
关键词 兽药残留 质谱裂解规律 GNPS分子网络 超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱
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基于UPLC-Q-TOF-MS/MS联和GNPS技术对凤凰雪茶的化学成分分析
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作者 吴娟 龚友兰 +4 位作者 滕建裕 王雅静 冯敏 周思倩 龙红萍 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1484-1498,共15页
凤凰雪茶是一种药食两用植物,具有较大的应用开发价值,本研究拟采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱技术(ultra performance liquid chromatography-quadrupole-time of flight tandem mass spectrometry,UPLC-Q-TOF-MS/MS)联... 凤凰雪茶是一种药食两用植物,具有较大的应用开发价值,本研究拟采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱技术(ultra performance liquid chromatography-quadrupole-time of flight tandem mass spectrometry,UPLC-Q-TOF-MS/MS)联和全球天然产物交互分子网络(global natural products social molecular networking,GNPS)技术对凤凰雪茶的化学成分进行快速分析鉴定。在正、负离子模式下采集质谱数据,通过软件分析、数据库匹配、对照品比对等鉴别出相应化合物,并根据MS/MS碎片的相似性创建分子网络。从凤凰雪茶中共鉴定出58个化学成分,主要包括33个黄酮类、11个酚类、4个生物碱类、3个三萜类和其他类化合物。原儿茶酸-4-葡萄糖苷、杨梅素-3-芸香糖苷、积雪草酸等32个化合物首次在葡萄科蛇葡萄属得到鉴定,并进一步探讨了各类别化合物的质谱裂解规律以及黄酮类网络节点的关联分析。本研究运用液质联用结合GNPS技术可以快速实现对凤凰雪茶的成分的系统性分析,为其探究临床应用、质量控制及药效物质基础提供参考。 展开更多
关键词 凤凰雪茶 全球天然产物交互分子网络 超高效液相串联质谱法 裂解规律 黄酮类
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中华按蚊保幼激素受体基因AsMet分子特性、表达模式及在生殖中的作用分析
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作者 幸晓清 陈斌 司风玲 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1475-1483,共9页
【目的】为明确保幼激素受体Methoprene-tolerant基因AsMet在中华按蚊Anopheles sinensis体内的时空表达模式,并探究其对中华按蚊生殖调控和发育的影响。【方法】基于中华按蚊转录组数据,采用RACE克隆AsMet全长cDNA序列并进行分子特征分... 【目的】为明确保幼激素受体Methoprene-tolerant基因AsMet在中华按蚊Anopheles sinensis体内的时空表达模式,并探究其对中华按蚊生殖调控和发育的影响。【方法】基于中华按蚊转录组数据,采用RACE克隆AsMet全长cDNA序列并进行分子特征分析;利用qPCR分析AsMet在不同发育阶段(蛹和雌成蚊)、3日龄雌成蚊不同组织[头、胸、腹部前端(腹部前3节)、腹部后端(腹部剩余部分)、中肠、马氏管、脂肪体、卵巢和体壁]中的表达量;通过向中华按蚊末期雌蛹显微注射ds AsMet进行RNAi后,测定AsMet,AsKr-h1和AsVg的表达量,并观测雌成蚊卵巢发育情况、羽化率、产卵量和卵孵化率。【结果】中华按蚊AsMet(GenBank登录号:OR783325)的cDNA序列全长6841 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)长3159 bp,编码1052个氨基酸,预测其分子质量为114.46 kD,等电点为6.63。AsMet有4个保守结构域,包括1个螺旋-环-螺旋结构域、2个PAS结合域和1个C末端保守基序。AsMet与冈比亚按蚊An.gambiae、埃及伊蚊Aedes aegypti和尖音库蚊Culex pipiens的Met聚为一支。AsMet在化蛹后30 h和成蚊大部分阶段显著高表达,且在雌成蚊头和胸部中显著高表达,在中肠、马氏管和卵巢中呈现低表达。显微注射ds AsMet到末期雌蛹后24,48和72 h时,AsMet的表达量较显微注射ds EGFP的对照组分别下调70.05%,41.05%和68.64%,羽化率低于显微注射ds EGFP且在雌蚊交配吸血后卵巢发育不良,产卵量比正常注射ds EGFP的低67.58%,卵孵化率比正常注射ds EGFP的下降93.10%。【结论】AsMet表达被降低后影响中华按蚊卵巢的正常发育且使产卵量和孵化率显著降低。研究结果为深入研究JH调控中华按蚊生殖发育机理奠定基础,对保幼激素信号通路和昆虫生殖调控的分子机制的认识提供理论依据。 展开更多
关键词 中华按蚊 保幼激素受体基因 分子特性 表达模式 生殖调控
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