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黑背胡狼源蜱的分子鉴定及pcox1、pnad5和ITS-1基因的遗传多样性分析
1
作者
刘晓恒
戴伶
+7 位作者
王洪亮
杨辉
刘增再
谭笑若
陆试全
阳朝伟
邱启官
刘伟
《中国兽医杂志》
北大核心
2025年第8期31-36,共6页
为鉴定黑背胡狼源蜱的种类并分析其遗传多样性,本试验于长沙市生态动物园黑背胡狼体表采集6只蜱虫,并对其线粒体部分细胞色素c氧化酶亚基1(pcox1)、部分还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷脱氢酶亚基5(pnad5)和核糖体内源转录间隔区1(ITS-1)基因...
为鉴定黑背胡狼源蜱的种类并分析其遗传多样性,本试验于长沙市生态动物园黑背胡狼体表采集6只蜱虫,并对其线粒体部分细胞色素c氧化酶亚基1(pcox1)、部分还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷脱氢酶亚基5(pnad5)和核糖体内源转录间隔区1(ITS-1)基因进行PCR扩增并测序,利用生物信息学软件分析基因序列的同源性、单倍型多样性、核苷酸多样性并构建系统进化树。结果显示,6只黑背胡狼源蜱pcox1、pnad5和ITS-1基因长度分别为780、510和1500 bp,与GenBank数据库上传的基因序列进行比对后显示基因序列同源性分别为99.9%~100%、99.4%~100%和98.2%~100%,分别检测到2、3和4个单倍型,单倍型多样性分别为0.333±0.046、0.733±0.024和0.800±0.02963,核苷酸多样性分别为0.00043±0.0000003、0.001±0.0000017和0.00778±0.0000038。系统发育树结果显示,6只黑背胡狼源蜱与已知的长角血蜱聚类形成同一分支,与其他血蜱属蜱位于同一大分支,与其他硬蜱属蜱,例如波斯锐缘蜱、特突钝缘蜱距离较远。结果表明,6只黑背胡狼源蜱为长角血蜱,pcox1、pnad5和ITS-1基因均可作为长角血蜱鉴定的遗传分子标记。本试验对黑背胡狼源蜱进行分子鉴定并分析其遗传进化关系,为长角血蜱的分类鉴定以及黑背胡狼蜱病的防治提供参考。
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关键词
长角血蜱
黑背胡狼
部分细胞色素c氧化酶亚基1(pcox1)
部分还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷脱氢酶亚基
5
(
pnad
5
)
核糖体内源转录间隔区1(ITS-1)
分子鉴定
遗传多样性
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职称材料
题名
黑背胡狼源蜱的分子鉴定及pcox1、pnad5和ITS-1基因的遗传多样性分析
1
作者
刘晓恒
戴伶
王洪亮
杨辉
刘增再
谭笑若
陆试全
阳朝伟
邱启官
刘伟
机构
湖南农业大学动物医学院
长沙市农业综合行政执法支队
长沙市动植物疫病预防控制中心
长沙生态动物园
出处
《中国兽医杂志》
北大核心
2025年第8期31-36,共6页
基金
湖南农业大学横向课题(2019xny-js053)。
文摘
为鉴定黑背胡狼源蜱的种类并分析其遗传多样性,本试验于长沙市生态动物园黑背胡狼体表采集6只蜱虫,并对其线粒体部分细胞色素c氧化酶亚基1(pcox1)、部分还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷脱氢酶亚基5(pnad5)和核糖体内源转录间隔区1(ITS-1)基因进行PCR扩增并测序,利用生物信息学软件分析基因序列的同源性、单倍型多样性、核苷酸多样性并构建系统进化树。结果显示,6只黑背胡狼源蜱pcox1、pnad5和ITS-1基因长度分别为780、510和1500 bp,与GenBank数据库上传的基因序列进行比对后显示基因序列同源性分别为99.9%~100%、99.4%~100%和98.2%~100%,分别检测到2、3和4个单倍型,单倍型多样性分别为0.333±0.046、0.733±0.024和0.800±0.02963,核苷酸多样性分别为0.00043±0.0000003、0.001±0.0000017和0.00778±0.0000038。系统发育树结果显示,6只黑背胡狼源蜱与已知的长角血蜱聚类形成同一分支,与其他血蜱属蜱位于同一大分支,与其他硬蜱属蜱,例如波斯锐缘蜱、特突钝缘蜱距离较远。结果表明,6只黑背胡狼源蜱为长角血蜱,pcox1、pnad5和ITS-1基因均可作为长角血蜱鉴定的遗传分子标记。本试验对黑背胡狼源蜱进行分子鉴定并分析其遗传进化关系,为长角血蜱的分类鉴定以及黑背胡狼蜱病的防治提供参考。
关键词
长角血蜱
黑背胡狼
部分细胞色素c氧化酶亚基1(pcox1)
部分还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷脱氢酶亚基
5
(
pnad
5
)
核糖体内源转录间隔区1(ITS-1)
分子鉴定
遗传多样性
Keywords
Haemaphysalis longicornis
black-backed jackal
part of cytochrome c oxidase
subunit
1(pcox1)
part of
nico
‐tinamide
adenine
dinucleotide
dehydrogenase
subunit
5(
pnad
5)
internal transcribed spacer 1(ITS-1)
molecular identifica‐tion
genetic diversity
分类号
S852.7 [农业科学—基础兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
黑背胡狼源蜱的分子鉴定及pcox1、pnad5和ITS-1基因的遗传多样性分析
刘晓恒
戴伶
王洪亮
杨辉
刘增再
谭笑若
陆试全
阳朝伟
邱启官
刘伟
《中国兽医杂志》
北大核心
2025
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