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番木瓜果实膨胀素基因部分序列的克隆及分析 被引量:3
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作者 牛艳梅 沈文涛 +1 位作者 卢雅薇 周鹏 《热带作物学报》 CSCD 2007年第4期47-50,共4页
膨胀素(Expansin)是一类存在于植物细胞壁上,并能快速缓冲张力,使植物细胞壁松驰的蛋白质。以成熟番木瓜果实总RNA反转录得到的cDNA为模板,设计简并引物进行PCR,得到1个大小为531bp的基因片段,编码177个氨基酸,并存在expansin的保守区域... 膨胀素(Expansin)是一类存在于植物细胞壁上,并能快速缓冲张力,使植物细胞壁松驰的蛋白质。以成熟番木瓜果实总RNA反转录得到的cDNA为模板,设计简并引物进行PCR,得到1个大小为531bp的基因片段,编码177个氨基酸,并存在expansin的保守区域,命名为Cp-EXP1。番木瓜expansin的成功克隆为研究番木瓜的生长发育以及其品种的改良等打下了良好的基础。 展开更多
关键词 番木瓜果实 expansin 基因克隆 序列分析
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矮牵牛果实特异表达启动子FBP7的基因克隆及序列分析 被引量:2
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作者 柏锡 纪巍 +3 位作者 才华 李勇 张秀芹 朱延明 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2008年第6期77-81,共5页
为进一步实现外源基因在草莓果实中的特异表达,克隆了矮牵牛果实特异表达启动子FBP7。根据GenBank发表序列设计引物,以矮牵牛(Petunia hybrida)总DNA为模板,通过PCR扩增获得约500 bp的DNA片段,回收该片段并克隆至PUC18载体上,测序后将... 为进一步实现外源基因在草莓果实中的特异表达,克隆了矮牵牛果实特异表达启动子FBP7。根据GenBank发表序列设计引物,以矮牵牛(Petunia hybrida)总DNA为模板,通过PCR扩增获得约500 bp的DNA片段,回收该片段并克隆至PUC18载体上,测序后将所得序列与原序列进行比对,其同源性为97%。为分析这些差异序列是否影响启动子功能,进行了启动子功能预测及顺式作用元件分析。结果表明,所克隆的启动子序列应具有启动子功能,且能实现果实特异表达,其序列分析差异可能是由于个体差异及多态性的影响,为草莓果实特异表达启动子的选择提供新思路。 展开更多
关键词 矮牵牛 果实特异表达启动子 FBP7 克隆 序列分析
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7种番木瓜环斑病毒分离株外壳蛋白基因的克隆与序列比较 被引量:4
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作者 魏军亚 刘德兵 +2 位作者 蔡群芳 黎小瑛 周鹏 《华南热带农业大学学报》 2006年第4期1-5,共5页
采用RT-PCR技术对我国海南、云南、广西和广东等不同番木瓜生产区的7个番木瓜环斑病毒外壳蛋白基因(PRSV-CP)进行克隆和鉴定分析。PRSV-CP编码区在864~873核苷酸之间,编码288~291氨基酸。对分离的7个PRSV-CP的核苷酸及氨基酸序列的比... 采用RT-PCR技术对我国海南、云南、广西和广东等不同番木瓜生产区的7个番木瓜环斑病毒外壳蛋白基因(PRSV-CP)进行克隆和鉴定分析。PRSV-CP编码区在864~873核苷酸之间,编码288~291氨基酸。对分离的7个PRSV-CP的核苷酸及氨基酸序列的比较结果表明大部分序列差异都处于N端,而各产区番木瓜PRSV-CP基因的3′端586~864bp区段,即278bpDNA片断的同源率最高,达到98.5%。这一同源序列的获得为利用植物基因工程培育广谱抗病性的番木瓜新品系奠定了基础。 展开更多
关键词 番木瓜环斑病毒 外壳蛋白基因 克隆 序列比较
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云南番木瓜环斑病毒部分ci基因的克隆及序列分析
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作者 朱静 谭冠林 +3 位作者 李晓静 刘芳 包改丽 李凡 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期637-641,共5页
对云南昆明、楚雄、保山、德宏、临沧、玉溪、红河等地番木瓜、南瓜和罗汉果上获得的番木瓜环斑病毒(Papayaringspotvirus,PRSV)不同分离物进行了部分ci基因的克隆和序列分析,获得的部分ci基因长666nt,编码221个氨基酸。关于13个P... 对云南昆明、楚雄、保山、德宏、临沧、玉溪、红河等地番木瓜、南瓜和罗汉果上获得的番木瓜环斑病毒(Papayaringspotvirus,PRSV)不同分离物进行了部分ci基因的克隆和序列分析,获得的部分ci基因长666nt,编码221个氨基酸。关于13个PRSV云南分离物部分ci基因核苷酸序列的同源性为80%。98%,氨基酸同源性为92%-100%。选取本文具有代表性的9个PRSV分离物与国内外12个PRSV分离物相比,核苷酸序列的同源性为79%-93%,氨基酸序列同源性为92%-99%。运用MEGA软件绘制的基于部分ci基因核苷酸序列的系统进化树表明,这些PRSV病毒可以分为两个大组,本文获得的9个云南分离物中的8个分离物与印度分离物(India—W—EU475877)聚为第1组,第Ⅱ组成员比较复杂,包括大部分的亚洲分离物及全部美洲分离物。 展开更多
关键词 番木瓜环斑病毒 ci基因 克隆 序列分析
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重瓣榆叶梅PrtSHP的基因克隆与序列结构分析
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作者 刘志雄 于先泥 《湖北农业科学》 北大核心 2012年第10期2124-2127,共4页
采用同源克隆法结合3′-RACE技术从重瓣榆叶梅(Prunus triloba var.Plena)中分离得到了1个雌蕊和果实发育调控基因SHP的同源基因PrtSHP的全长cDNA(GenBank登录号:JF911701)。其cDNA全长970 bp,包括1个编码244个氨基酸的735 bp的完整开... 采用同源克隆法结合3′-RACE技术从重瓣榆叶梅(Prunus triloba var.Plena)中分离得到了1个雌蕊和果实发育调控基因SHP的同源基因PrtSHP的全长cDNA(GenBank登录号:JF911701)。其cDNA全长970 bp,包括1个编码244个氨基酸的735 bp的完整开放阅读框。蛋白质序列比对和分子系统发生分析表明,PrtSHP是拟南芥的SHP的同源基因,其编码的蛋白质的C末端结构域具有2个高度保守的模体(AG I模体和AG II模体),属C类转录因子中PLE进化系。 展开更多
关键词 重瓣榆叶梅(Prunus triloba VAR. Plena) 雌蕊和果实发育 基因克隆 序列分析
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两个枣树扩展蛋白基因cDNA全序列的克隆及分析
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作者 孟玉平 曹秋芬 +1 位作者 魏玮 孙海峰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期113-118,125,共7页
用定向克隆法构建了枣树(Ziziphus jujubaMill.)快速生长初期结果枝的cDNA文库,经过重组质粒的筛选,克隆获得两个扩展蛋白基因cDNA全序列,分别命名为ZjEXP1(GenBank登录号:FJ449891)和ZjEXP2(GenBank登录号:FJ449892)。ZjEXP1全长1 037 ... 用定向克隆法构建了枣树(Ziziphus jujubaMill.)快速生长初期结果枝的cDNA文库,经过重组质粒的筛选,克隆获得两个扩展蛋白基因cDNA全序列,分别命名为ZjEXP1(GenBank登录号:FJ449891)和ZjEXP2(GenBank登录号:FJ449892)。ZjEXP1全长1 037 bp,包含编码254个氨基酸的完整开放阅读框;ZjEXP2全长905 bp,包含编码251个氨基酸的完整开放阅读框。两个序列有共同的结构特征,即在N-末端有8个保守的半胱氨酸残基的丰富域,C-末端有4个保守的色氨酸残基的丰富域,中间有一个组氨酸(His-Phe-Asp,HFD)功能域。两者之间的氨基酸同源性为74.0%。从已知的扩展蛋白基因家族的进化分析表明,ZjEXP1和ZjEXP2由一个祖先进化而来,又分别属于两个不同的分支。 展开更多
关键词 枣树 扩展蛋白基因 CDNA克隆 序列分析
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