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代谢组学数据处理方法——主成分分析
被引量:
165
1
作者
阿基业
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2010年第5期481-489,共9页
代谢组学在生命科学领域得到了越来越广泛的应用并展现出良好的前景。代谢组学分析产生的含有大量变量的数据难以用常规方法进行分析,如何正确分析和解释代谢组学的数据是研究的关键。本文主要介绍了在代谢组学数据分析中占主导地位的...
代谢组学在生命科学领域得到了越来越广泛的应用并展现出良好的前景。代谢组学分析产生的含有大量变量的数据难以用常规方法进行分析,如何正确分析和解释代谢组学的数据是研究的关键。本文主要介绍了在代谢组学数据分析中占主导地位的主成分分析基本方法,旨在加强代谢组学数据分析的基础知识并规范数据分析的方法。
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关键词
代谢组学
主成分分析
偏最小二乘投影关联分析
偏最小二乘投影判别分析
正交偏最小二乘投影分析
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职称材料
核磁共振波谱法结合化学计量学判别油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜和加工蜜
被引量:
4
2
作者
陈辉
张佳琳
+3 位作者
鞠晶
高帅
范春林
张紫娟
《北京大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期614-622,共9页
应用核磁共振波谱法,对采集自安徽、内蒙古和江苏3个地区油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜及加工蜜共计80个样品的氢谱进行测定,建立区分3种蜂蜜的方法,解析油菜蜜组分中未重叠的特征峰,对比3个地区3种蜜代表性样品的核磁波谱图(NOESY 1D),并...
应用核磁共振波谱法,对采集自安徽、内蒙古和江苏3个地区油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜及加工蜜共计80个样品的氢谱进行测定,建立区分3种蜂蜜的方法,解析油菜蜜组分中未重叠的特征峰,对比3个地区3种蜜代表性样品的核磁波谱图(NOESY 1D),并分析不同蜂蜜中部分组分的含量。运用隐结构双向正交投影‒判别分析法(O2PLS-DA),对上述蜂蜜进行分组判别,选取R2Y和Q2值最大的积分间隔,可清晰地区分3个地区的成熟蜜。虽然加工蜜与非成熟蜜有部分重叠,但在三维图中可以区分。对同一地区的3种蜂蜜可以清晰地分组区分,3组R2Y值均大于0.97,Q2值均大于0.81。所建立的方法可用于鉴别同一地区的成熟、非成熟与加工油菜蜜,具有样品用量少、检测用时短和结果重现性好等优势。
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关键词
成熟蜜
非成熟蜜
加工蜜(浓缩蜜)
核磁共振波谱(NMR)
隐结构双向正交投影‒判别分析(O2PLS-DA)
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职称材料
超临界流体萃取-GC-MS分析西黄丸中挥发性成分
被引量:
8
3
作者
王秀文
刘艳之
+3 位作者
卫春红
胡婧萍
王旭文
王颖莉
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期423-429,共7页
建立西黄丸中挥发油成分乙酸辛酯的含量测定方法,为西黄丸的质控标准提供依据。方法:超临界CO2萃取西黄丸中挥发油成分,采用气相色谱法测定乙酸辛酯含量;研究压力、温度、时间和粒度因素对挥发油得率与乙酸辛酯含量的影响,并进行了化学...
建立西黄丸中挥发油成分乙酸辛酯的含量测定方法,为西黄丸的质控标准提供依据。方法:超临界CO2萃取西黄丸中挥发油成分,采用气相色谱法测定乙酸辛酯含量;研究压力、温度、时间和粒度因素对挥发油得率与乙酸辛酯含量的影响,并进行了化学计量学分析。采用GC-MS分析了适宜条件的挥发油的成分。综合考虑挥发油得率和乙酸辛酯含量双指标,确定的西黄丸挥发油萃取条件为:粉碎粒度为80目,萃取压力为25 MPa,温度为40℃,时间为2 h。在此条件下,挥发油得率达到7.76%,乙酸辛酯含量达到0.72 mg·g^(-1)。通过指纹图谱、主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)化学计量学分析可知,不同萃取条件对所提取的挥发油物质组分及其含量没有显著性差异。GC-MS鉴定出的主要成分有(1S-endo)-2-甲基-3-亚甲基-2-(4-甲基-3--3-戊烯基)-二环[2.2.1庚烷、10α-羟基日本刺参萜、(±)-麝香酮、4-亚甲基-2,8,8-三甲基-2-乙烯基-双环[5.2.0]壬烷和2-甲基-4-(2,6,6-三甲基-1-环己烯-1-基)丁醛。结论:西黄丸挥发油成分适宜萃取条件,及建立的乙酸辛酯含量测定方法准确、可靠,为有效控制西黄丸质量,完善其质量标准及进一步的药效成分研究提供了科学依据。
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关键词
西黄丸
超临界CO_(2)萃取
挥发油
乙酸辛酯
正交偏最小二乘判别分析
GC-MS
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职称材料
基于快速蒸发离子化质谱实时检测空气油炸鲳鱼的脂质组学轮廓
被引量:
2
4
作者
张蒙娜
薛静
+3 位作者
宋恭帅
王海星
王宏海
沈清
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期502-510,I0005,共10页
快速蒸发离子化质谱(rapid evaporative ionization mass spectrometry,REIMS)是一种无需样品预处理的新型质谱技术,通过手持智能手术刀切割样品采集数据从而获得脂质组学轮廓。本研究采用REIMS技术和主成分分析(principal component an...
快速蒸发离子化质谱(rapid evaporative ionization mass spectrometry,REIMS)是一种无需样品预处理的新型质谱技术,通过手持智能手术刀切割样品采集数据从而获得脂质组学轮廓。本研究采用REIMS技术和主成分分析(principal component analysis,PCA)、隐结构正交投影(orthogonal projection to latent structure,OPLS)等数理统计方法实时监测鲳鱼在空气油炸过程中脂质组学轮廓变化,并探究不同空气油炸温度对鲳鱼肌肉组织脂质组成的影响。通过单因素条件优化得到适宜的REIMS系统参数,电刀输出功率20 W、电刀切割功率1 mm/s、辅助溶剂流速100μL/min,从而获得稳定可靠的质谱轮廓图。在PCA分析的基础上进行OPLS分析,得到10个重要的特征离子(VIP>1),其中PE(O-16∶1/22∶6)只在原料中检测到,为4.61%;此外,PE(22∶5/22∶6)在10个磷脂离子中的不饱和度最高,其相对含量随油炸温度的升高而降低,同样可见于PA(18∶1/22∶6)和PI(18∶0/22∶6),说明磷脂的饱和度有随油炸温度升高而上升的趋势。经方法验证显示,REIMS检测离子的信噪比范围为49.58~205.30,日内和日间精密度的相对标准偏差为3.10%~7.28%,灵敏度和精密度均较高,因此,该方法将成为脂质组学研究过程中一种简单、高效、准确的新型技术手段。
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关键词
快速蒸发离子化质谱(REIMS)
脂质组学
主成分分析(PCA)
隐结构正交投影(OPLS)
空气油炸
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职称材料
题名
代谢组学数据处理方法——主成分分析
被引量:
165
1
作者
阿基业
机构
中国药科大学药代动力学重点实验室&代谢组学研究室
出处
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2010年第5期481-489,共9页
文摘
代谢组学在生命科学领域得到了越来越广泛的应用并展现出良好的前景。代谢组学分析产生的含有大量变量的数据难以用常规方法进行分析,如何正确分析和解释代谢组学的数据是研究的关键。本文主要介绍了在代谢组学数据分析中占主导地位的主成分分析基本方法,旨在加强代谢组学数据分析的基础知识并规范数据分析的方法。
关键词
代谢组学
主成分分析
偏最小二乘投影关联分析
偏最小二乘投影判别分析
正交偏最小二乘投影分析
Keywords
Metabolomics
Principal components
analysis
(PCA)
Partial least squares
project
to
latent
structure(PLS)
Partial least squares
project
to
latent
structure-discriminant
analysis
(PLS-DA)
orthogonal
partial least squares
project
to
latent
structure(OPLS)
分类号
R969.1 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
核磁共振波谱法结合化学计量学判别油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜和加工蜜
被引量:
4
2
作者
陈辉
张佳琳
鞠晶
高帅
范春林
张紫娟
机构
中国检验检疫科学研究院农产品安全研究中心
北京大学化学与分子工程学院
出处
《北京大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期614-622,共9页
基金
中国检验检疫科学研究院基本科研业务费(2018JK026)资助。
文摘
应用核磁共振波谱法,对采集自安徽、内蒙古和江苏3个地区油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜及加工蜜共计80个样品的氢谱进行测定,建立区分3种蜂蜜的方法,解析油菜蜜组分中未重叠的特征峰,对比3个地区3种蜜代表性样品的核磁波谱图(NOESY 1D),并分析不同蜂蜜中部分组分的含量。运用隐结构双向正交投影‒判别分析法(O2PLS-DA),对上述蜂蜜进行分组判别,选取R2Y和Q2值最大的积分间隔,可清晰地区分3个地区的成熟蜜。虽然加工蜜与非成熟蜜有部分重叠,但在三维图中可以区分。对同一地区的3种蜂蜜可以清晰地分组区分,3组R2Y值均大于0.97,Q2值均大于0.81。所建立的方法可用于鉴别同一地区的成熟、非成熟与加工油菜蜜,具有样品用量少、检测用时短和结果重现性好等优势。
关键词
成熟蜜
非成熟蜜
加工蜜(浓缩蜜)
核磁共振波谱(NMR)
隐结构双向正交投影‒判别分析(O2PLS-DA)
Keywords
ripe honey
unripe honey
processed honey(concentrated honey)
nuclear magnetic resonance Spectro-scopy(NMR)
orthogonal
bidirectional
projection
s to
latent
structures-discriminant
analysis
(O2PLS-DA)
分类号
O657.2 [理学—分析化学]
S896.1 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
超临界流体萃取-GC-MS分析西黄丸中挥发性成分
被引量:
8
3
作者
王秀文
刘艳之
卫春红
胡婧萍
王旭文
王颖莉
机构
山西中医药大学中药与食品工程学院
山西振东安特生物制药有限公司
出处
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期423-429,共7页
基金
山西振东安特生物制药有限公司项目(SXZY201807)资助
山西省科技攻关项目(2016ZD0401)资助
山西省教育厅2019年度研究生教育创新计划项目(2019SY504)资助。
文摘
建立西黄丸中挥发油成分乙酸辛酯的含量测定方法,为西黄丸的质控标准提供依据。方法:超临界CO2萃取西黄丸中挥发油成分,采用气相色谱法测定乙酸辛酯含量;研究压力、温度、时间和粒度因素对挥发油得率与乙酸辛酯含量的影响,并进行了化学计量学分析。采用GC-MS分析了适宜条件的挥发油的成分。综合考虑挥发油得率和乙酸辛酯含量双指标,确定的西黄丸挥发油萃取条件为:粉碎粒度为80目,萃取压力为25 MPa,温度为40℃,时间为2 h。在此条件下,挥发油得率达到7.76%,乙酸辛酯含量达到0.72 mg·g^(-1)。通过指纹图谱、主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)化学计量学分析可知,不同萃取条件对所提取的挥发油物质组分及其含量没有显著性差异。GC-MS鉴定出的主要成分有(1S-endo)-2-甲基-3-亚甲基-2-(4-甲基-3--3-戊烯基)-二环[2.2.1庚烷、10α-羟基日本刺参萜、(±)-麝香酮、4-亚甲基-2,8,8-三甲基-2-乙烯基-双环[5.2.0]壬烷和2-甲基-4-(2,6,6-三甲基-1-环己烯-1-基)丁醛。结论:西黄丸挥发油成分适宜萃取条件,及建立的乙酸辛酯含量测定方法准确、可靠,为有效控制西黄丸质量,完善其质量标准及进一步的药效成分研究提供了科学依据。
关键词
西黄丸
超临界CO_(2)萃取
挥发油
乙酸辛酯
正交偏最小二乘判别分析
GC-MS
Keywords
Xihuang Pill
supercritical CO_(2)extraction
volatile oil
octyl acetate
orthogonal
projection
to
latent
structure-discriminant
analysis
(
opls-da
)
GC-MS
分类号
O657.7 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
基于快速蒸发离子化质谱实时检测空气油炸鲳鱼的脂质组学轮廓
被引量:
2
4
作者
张蒙娜
薛静
宋恭帅
王海星
王宏海
沈清
机构
浙江工商大学海洋食品研究院
南京农业大学食品科技学院
温州医科大学附属第二医院育英儿童医院
出处
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期502-510,I0005,共10页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31601542)
浙江省自然科学基金(LY19C190001)
浙江省水产品质量安全技术支撑团队项目(QS2018001)资助。
文摘
快速蒸发离子化质谱(rapid evaporative ionization mass spectrometry,REIMS)是一种无需样品预处理的新型质谱技术,通过手持智能手术刀切割样品采集数据从而获得脂质组学轮廓。本研究采用REIMS技术和主成分分析(principal component analysis,PCA)、隐结构正交投影(orthogonal projection to latent structure,OPLS)等数理统计方法实时监测鲳鱼在空气油炸过程中脂质组学轮廓变化,并探究不同空气油炸温度对鲳鱼肌肉组织脂质组成的影响。通过单因素条件优化得到适宜的REIMS系统参数,电刀输出功率20 W、电刀切割功率1 mm/s、辅助溶剂流速100μL/min,从而获得稳定可靠的质谱轮廓图。在PCA分析的基础上进行OPLS分析,得到10个重要的特征离子(VIP>1),其中PE(O-16∶1/22∶6)只在原料中检测到,为4.61%;此外,PE(22∶5/22∶6)在10个磷脂离子中的不饱和度最高,其相对含量随油炸温度的升高而降低,同样可见于PA(18∶1/22∶6)和PI(18∶0/22∶6),说明磷脂的饱和度有随油炸温度升高而上升的趋势。经方法验证显示,REIMS检测离子的信噪比范围为49.58~205.30,日内和日间精密度的相对标准偏差为3.10%~7.28%,灵敏度和精密度均较高,因此,该方法将成为脂质组学研究过程中一种简单、高效、准确的新型技术手段。
关键词
快速蒸发离子化质谱(REIMS)
脂质组学
主成分分析(PCA)
隐结构正交投影(OPLS)
空气油炸
Keywords
rapid evaporative ionization mass spectrometry(REIMS)
lipidomics
principal component
analysis
(PCA)
orthogonal
projection
to
latent
structure(OPLS)
air frying
分类号
O657.63 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
代谢组学数据处理方法——主成分分析
阿基业
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2010
165
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职称材料
2
核磁共振波谱法结合化学计量学判别油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜和加工蜜
陈辉
张佳琳
鞠晶
高帅
范春林
张紫娟
《北京大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
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职称材料
3
超临界流体萃取-GC-MS分析西黄丸中挥发性成分
王秀文
刘艳之
卫春红
胡婧萍
王旭文
王颖莉
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2021
8
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职称材料
4
基于快速蒸发离子化质谱实时检测空气油炸鲳鱼的脂质组学轮廓
张蒙娜
薛静
宋恭帅
王海星
王宏海
沈清
《质谱学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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