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OPLS方法的原理及其在代谢组学数据判别分析中的应用 被引量：16
1
作者 李俊南 侯艳 +1 位作者 孙凤宇 李康 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2014年第5期765-769,共5页
目的探讨orthogonal projection to latent structures(OPLS)方法的原理、特点及其在代谢组学高维数据分析中的应用。方法通过R语言编程实现OPLS方法,利用模拟试验探索OPLS的特性及适用条件,并通过实际数据进行验证。结果利用一个OPLS... 目的探讨orthogonal projection to latent structures(OPLS)方法的原理、特点及其在代谢组学高维数据分析中的应用。方法通过R语言编程实现OPLS方法,利用模拟试验探索OPLS的特性及适用条件,并通过实际数据进行验证。结果利用一个OPLS预测主成分的模型拟合效果与利用偏最小二乘(PLS)多个主成分的模型拟合效果相同,同时具有较好的判别能力,其得分图的可视化效果优于PLS。结论 OPLS能够有效去除自变量矩阵X中与因变量Y无关的信息,使模型变得简单、易于解释,同时具有较好的可视化效果,可有效地用于代谢组学数据分析中。 展开更多
关键词 orthogonal projection to latent structures(opls) 模型拟合 可视化 代谢组学
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基于K-OPLS的无线传感网络室内定位跟踪算法 被引量：1
2
作者 李军 后新燕 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期265-271,298,共8页
针对基于指纹的无线传感网络室内定位,提出了一种基于核隐变量正交投影(Kernel-based orthogonal projection to latent structures, K-OPLS)的定位算法。在O-PLS的模型框架下,K-OPLS算法应用“核技巧”将描述变量映射至高维特征空间,... 针对基于指纹的无线传感网络室内定位,提出了一种基于核隐变量正交投影(Kernel-based orthogonal projection to latent structures, K-OPLS)的定位算法。在O-PLS的模型框架下,K-OPLS算法应用“核技巧”将描述变量映射至高维特征空间,给出了描述变量和响应变量之间的非线性关系,以实现对模型的预测成分及与响应正交成分的计算。K-OPLS算法集核偏最小二乘建模和正交信号校正预处理方法于一体,在一定程度上有效地改进了模型性能,增强了模型解释性。基于RSSI指纹信息,构建锚节点与处于参考位置的非锚节点之间的非线性映射关系,K-OPLS算法可以实现WSN的室内定位跟踪。将所提出的算法应用于仿真与物理环境下的不同实例中,在同等条件下,还与核岭回归(KRR)、核极限学习机(KELM)、核信噪比(KSNR)、核偏最小二乘(KPLS)、核自适应滤波等其他核学习算法进行比较。仿真实验中,基于小波核的WK-OPLS算法在无噪声和有噪声环境下的跟踪估计误差分别为0.232 6、1.320 5 m。物理实验中,基于小波核的该算法跟踪估计误差为0.249 3 m。实验结果表明,所提算法有效提高了定位精度,而且具有一定的除噪能力。 展开更多
关键词 无线传感网络 室内定位 核方法 隐变量正交投影 跟踪
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红外光谱结合核隐变量正交投影法判别掺杂牛奶 被引量：3
3
作者 杨延荣 杨仁杰 +2 位作者 张志勇 董桂梅 杨士春 《光学精密工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第10期2549-2556,共8页
为了快速、准确地检测掺杂牛奶,采用基于核隐变量正交投影(K-OPLS)法分析了掺杂牛奶的光谱。选用高斯函数作为核函数,内部交叉验证均方根(RMSECV)最小值作为评价指标,优选了核函数中的核宽度σ以及Y正交成分数。配置含四环素牛奶(0.01～... 为了快速、准确地检测掺杂牛奶,采用基于核隐变量正交投影(K-OPLS)法分析了掺杂牛奶的光谱。选用高斯函数作为核函数,内部交叉验证均方根(RMSECV)最小值作为评价指标,优选了核函数中的核宽度σ以及Y正交成分数。配置含四环素牛奶(0.01～0.3gL-1)、三聚氰胺牛奶(0.01～0.3gL-1)和葡萄糖牛奶(0.01～0.3gL-1)各36个,采集纯牛奶及掺杂牛奶样品的红外光谱,采用K-OPLS建立各掺杂牛奶与纯牛奶的判别模型。利用这些模型对未知样品进行判别,结果显示对掺杂四环素、三聚氰胺、葡萄糖牛奶的判别正确率分别为100%、100%、95.8%。建立了同时判别3种掺杂牛奶与纯牛奶的K-OPLS模型,该模型对未知样品的判别正确率为93.1%;同时,与偏最小二乘判别PLS-DA方法的预测结果进行了比较,结果表明:K-OPLS建模方法对于复杂的牛奶体系具有较好的预测能力。 展开更多
关键词 红外光谱 核隐变量正交投影 掺杂牛奶 四环素 三聚氰胺 葡萄糖
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代谢组学数据处理方法——主成分分析 被引量：164
4
作者 阿基业 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2010年第5期481-489,共9页
代谢组学在生命科学领域得到了越来越广泛的应用并展现出良好的前景。代谢组学分析产生的含有大量变量的数据难以用常规方法进行分析,如何正确分析和解释代谢组学的数据是研究的关键。本文主要介绍了在代谢组学数据分析中占主导地位的... 代谢组学在生命科学领域得到了越来越广泛的应用并展现出良好的前景。代谢组学分析产生的含有大量变量的数据难以用常规方法进行分析,如何正确分析和解释代谢组学的数据是研究的关键。本文主要介绍了在代谢组学数据分析中占主导地位的主成分分析基本方法,旨在加强代谢组学数据分析的基础知识并规范数据分析的方法。 展开更多
关键词 代谢组学 主成分分析 偏最小二乘投影关联分析 偏最小二乘投影判别分析 正交偏最小二乘投影分析
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核正交偏最小二乘在代谢组学数据分析中的应用 被引量：6
5
作者 李俊南 侯艳 李康 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2015年第1期14-17,共4页
目的探索核正交偏最小二乘方法的特点及其在代谢组学数据分析中的应用。方法通过模拟实验和真实代谢组学数据,评价核正交偏最小二乘方法的模型预测能力及其可视化效果。结果模拟数据分析表明,当数据间存在线性关系时,KOPLS与传统的线性O... 目的探索核正交偏最小二乘方法的特点及其在代谢组学数据分析中的应用。方法通过模拟实验和真实代谢组学数据,评价核正交偏最小二乘方法的模型预测能力及其可视化效果。结果模拟数据分析表明,当数据间存在线性关系时,KOPLS与传统的线性OPLS具有相同的效果;当数据间存在非线性关系时,KOPLS具有相对更高的预测能力,得分图的可视化效果更好。实际数据分析结果显示,应用KOPLS能够提高模型预测能力和改善可视化效果。结论对于高维非线性关系的代谢组学数据更适合使用KOPLS方法。 展开更多
关键词 核正交偏最小二乘 非线性 代谢组学
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核磁共振波谱法结合化学计量学判别油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜和加工蜜 被引量：4
6
作者 陈辉 张佳琳 +3 位作者 鞠晶 高帅 范春林 张紫娟 《北京大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第4期614-622,共9页
应用核磁共振波谱法,对采集自安徽、内蒙古和江苏3个地区油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜及加工蜜共计80个样品的氢谱进行测定,建立区分3种蜂蜜的方法,解析油菜蜜组分中未重叠的特征峰,对比3个地区3种蜜代表性样品的核磁波谱图(NOESY 1D),并... 应用核磁共振波谱法,对采集自安徽、内蒙古和江苏3个地区油菜蜜的成熟蜜、非成熟蜜及加工蜜共计80个样品的氢谱进行测定,建立区分3种蜂蜜的方法,解析油菜蜜组分中未重叠的特征峰,对比3个地区3种蜜代表性样品的核磁波谱图(NOESY 1D),并分析不同蜂蜜中部分组分的含量。运用隐结构双向正交投影‒判别分析法(O2PLS-DA),对上述蜂蜜进行分组判别,选取R2Y和Q2值最大的积分间隔,可清晰地区分3个地区的成熟蜜。虽然加工蜜与非成熟蜜有部分重叠,但在三维图中可以区分。对同一地区的3种蜂蜜可以清晰地分组区分,3组R2Y值均大于0.97,Q2值均大于0.81。所建立的方法可用于鉴别同一地区的成熟、非成熟与加工油菜蜜,具有样品用量少、检测用时短和结果重现性好等优势。 展开更多
关键词 成熟蜜 非成熟蜜 加工蜜(浓缩蜜) 核磁共振波谱(NMR) 隐结构双向正交投影‒判别分析(O2PLS-DA)
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超临界流体萃取-GC-MS分析西黄丸中挥发性成分 被引量：8
7
作者 王秀文 刘艳之 +3 位作者 卫春红 胡婧萍 王旭文 王颖莉 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期423-429,共7页
建立西黄丸中挥发油成分乙酸辛酯的含量测定方法,为西黄丸的质控标准提供依据。方法:超临界CO2萃取西黄丸中挥发油成分,采用气相色谱法测定乙酸辛酯含量;研究压力、温度、时间和粒度因素对挥发油得率与乙酸辛酯含量的影响,并进行了化学... 建立西黄丸中挥发油成分乙酸辛酯的含量测定方法,为西黄丸的质控标准提供依据。方法:超临界CO2萃取西黄丸中挥发油成分,采用气相色谱法测定乙酸辛酯含量;研究压力、温度、时间和粒度因素对挥发油得率与乙酸辛酯含量的影响,并进行了化学计量学分析。采用GC-MS分析了适宜条件的挥发油的成分。综合考虑挥发油得率和乙酸辛酯含量双指标,确定的西黄丸挥发油萃取条件为:粉碎粒度为80目,萃取压力为25 MPa,温度为40℃,时间为2 h。在此条件下,挥发油得率达到7.76%,乙酸辛酯含量达到0.72 mg·g^(-1)。通过指纹图谱、主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)化学计量学分析可知,不同萃取条件对所提取的挥发油物质组分及其含量没有显著性差异。GC-MS鉴定出的主要成分有(1S-endo)-2-甲基-3-亚甲基-2-(4-甲基-3--3-戊烯基)-二环[2.2.1庚烷、10α-羟基日本刺参萜、(±)-麝香酮、4-亚甲基-2,8,8-三甲基-2-乙烯基-双环[5.2.0]壬烷和2-甲基-4-(2,6,6-三甲基-1-环己烯-1-基)丁醛。结论:西黄丸挥发油成分适宜萃取条件,及建立的乙酸辛酯含量测定方法准确、可靠,为有效控制西黄丸质量,完善其质量标准及进一步的药效成分研究提供了科学依据。 展开更多
关键词 西黄丸 超临界CO_(2)萃取 挥发油 乙酸辛酯 正交偏最小二乘判别分析 GC-MS
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基于快速蒸发离子化质谱实时检测空气油炸鲳鱼的脂质组学轮廓 被引量：2
8
作者 张蒙娜 薛静 +3 位作者 宋恭帅 王海星 王宏海 沈清 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第5期502-510,I0005,共10页
快速蒸发离子化质谱(rapid evaporative ionization mass spectrometry,REIMS)是一种无需样品预处理的新型质谱技术,通过手持智能手术刀切割样品采集数据从而获得脂质组学轮廓。本研究采用REIMS技术和主成分分析(principal component an... 快速蒸发离子化质谱(rapid evaporative ionization mass spectrometry,REIMS)是一种无需样品预处理的新型质谱技术,通过手持智能手术刀切割样品采集数据从而获得脂质组学轮廓。本研究采用REIMS技术和主成分分析(principal component analysis,PCA)、隐结构正交投影(orthogonal projection to latent structure,OPLS)等数理统计方法实时监测鲳鱼在空气油炸过程中脂质组学轮廓变化,并探究不同空气油炸温度对鲳鱼肌肉组织脂质组成的影响。通过单因素条件优化得到适宜的REIMS系统参数,电刀输出功率20 W、电刀切割功率1 mm/s、辅助溶剂流速100μL/min,从而获得稳定可靠的质谱轮廓图。在PCA分析的基础上进行OPLS分析,得到10个重要的特征离子(VIP>1),其中PE(O-16∶1/22∶6)只在原料中检测到,为4.61%;此外,PE(22∶5/22∶6)在10个磷脂离子中的不饱和度最高,其相对含量随油炸温度的升高而降低,同样可见于PA(18∶1/22∶6)和PI(18∶0/22∶6),说明磷脂的饱和度有随油炸温度升高而上升的趋势。经方法验证显示,REIMS检测离子的信噪比范围为49.58~205.30,日内和日间精密度的相对标准偏差为3.10%~7.28%,灵敏度和精密度均较高,因此,该方法将成为脂质组学研究过程中一种简单、高效、准确的新型技术手段。 展开更多
关键词 快速蒸发离子化质谱(REIMS) 脂质组学 主成分分析(PCA) 隐结构正交投影(opls) 空气油炸
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