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基于病菌孢子捕捉和real-time PCR技术的田间空气中小麦白粉病菌孢子动态监测及病情估计模型研究 被引量:1
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作者 王奥霖 商昭月 +8 位作者 张美惠 王贵 胡小平 徐飞 孙振宇 曹世勤 刘伟 范洁茹 周益林 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期49-56,72,共9页
利用Burkard定容式孢子捕捉器结合real-time PCR定量技术,分别对种植高抗、中感和高感白粉病小麦品种的田间空气中白粉病菌分生孢子浓度进行监测,结果表明,real-time PCR定量与传统的显微观察计数两种方法测得的孢子浓度呈显著正相关(P... 利用Burkard定容式孢子捕捉器结合real-time PCR定量技术,分别对种植高抗、中感和高感白粉病小麦品种的田间空气中白粉病菌分生孢子浓度进行监测,结果表明,real-time PCR定量与传统的显微观察计数两种方法测得的孢子浓度呈显著正相关(P≤0.01),且两种病菌孢子计数方法在同一抗性品种上监测到的孢子浓度动态相近。此外,两种方法测得的孢子浓度与各气象因子的相关性分析结果一致,空气中的白粉病菌孢子浓度主要与空气相对湿度显著正相关。在此基础上,利用两种方法测定的田间空气中白粉病菌孢子浓度分别建立了基于累积孢子浓度的田间病情估计模型。分析发现,基于两种孢子浓度测定方法建立的病情估计模型间无显著性差异,表明real-time PCR定量技术测定的孢子浓度在构建白粉病病情估计模型上具有一定可行性。该结果为real-time PCR定量技术与病菌孢子捕捉技术相结合用于小麦白粉病的监测和预测提供理论依据。 展开更多
关键词 小麦白粉病 病菌孢子捕捉 实时荧光定量pcr 病原菌监测 病情估计模型
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基于Real-time PCR法检测乳粉中牛源性成分定量研究
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作者 陈晨 史国华 +5 位作者 陈勃旭 张瑞 王玉欣 贾文珅 陈佳 周巍 《粮油食品科技》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期159-164,共6页
基于Real-timePCR建立了乳粉中牛源性成分相对定量检测方法,并对牛的特异性引物与探针进行了特异性、灵敏度和稳定性测试。通过模拟不同浓度牛乳粉与马乳粉混合样本,根据其△Ct值的函数关系进行线性拟合进而绘制标准曲线,建立乳粉中牛... 基于Real-timePCR建立了乳粉中牛源性成分相对定量检测方法,并对牛的特异性引物与探针进行了特异性、灵敏度和稳定性测试。通过模拟不同浓度牛乳粉与马乳粉混合样本,根据其△Ct值的函数关系进行线性拟合进而绘制标准曲线,建立乳粉中牛源性成分的相对定量检测。结果显示,该方法的最低检测限为0.00001 mg/mL,回收率为91.11%~119.2%,组间变异系数≤0.58%、组内变异系数≤1.44%。说明该方法在特异性与稳定性上适用于乳粉中牛源性成分及含量的掺假检测。 展开更多
关键词 牛乳粉 马乳粉 real-time pcr 掺假检测
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24重荧光real-time PCR技术在食物中毒快速检测中的应用
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作者 卢媛 钟颖涛 《食品安全导刊》 2024年第6期85-88,共4页
目的:应用24重荧光real-time PCR检测技术快速筛检食物中毒病原菌,结合国家标准中的培养法探讨24重荧光real-time PCR检测技术符合性和应用价值。方法:采用高灵敏度、高特异性的24重荧光real-time PCR检测技术作为中毒病原菌的初筛方法... 目的:应用24重荧光real-time PCR检测技术快速筛检食物中毒病原菌,结合国家标准中的培养法探讨24重荧光real-time PCR检测技术符合性和应用价值。方法:采用高灵敏度、高特异性的24重荧光real-time PCR检测技术作为中毒病原菌的初筛方法,国标方法进行细菌分离培养,并对分离出的病原菌进行生化鉴定。结果:5份食物中毒患者肛拭子在增菌前检出4份霍乱弧菌核酸(非O1/非O139群,24重荧光real-time PCR),9份患者肛拭子在增菌后检出5株霍乱弧菌(非O1/非O139群,国标培养法),其中包含4份PCR技术初筛阳性样品,两个方法的符合率为80%。所有样本均未检出沙门氏菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻性大肠埃希菌以及金黄色葡萄球菌。结论:应用24重荧光real-time PCR检测技术同时检测24种常见致病病原菌,能高效锁定中毒病原菌。将其与国标培养法相结合,对临床治疗和食物中毒快速处置能起到积极作用,值得应用和推广。 展开更多
关键词 24重荧光real-time pcr技术 培养法 食物中毒
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转基因番茄植株Mi1.2表达水平的Real Time PCR检测体系的建立 被引量:3
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作者 魏振林 田志环 +1 位作者 焦传珍 董玲 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第18期7589-7590,共2页
[目的]为转基因番茄植株的高通量筛选奠定基础。[方法]利用CTAB法提取番茄叶片总RNA进行Real Time PCR扩增,分析转MI1、2基因的番茄植株表达水平的检测体系。[结果]提取RNA的A260/A280为1.78~1.88,RNA无明显降解。在严谨扩增条件... [目的]为转基因番茄植株的高通量筛选奠定基础。[方法]利用CTAB法提取番茄叶片总RNA进行Real Time PCR扩增,分析转MI1、2基因的番茄植株表达水平的检测体系。[结果]提取RNA的A260/A280为1.78~1.88,RNA无明显降解。在严谨扩增条件下,引物SYBR2的扩增效率高于SYBR1。Mg^2+的适宜浓度为2.0mg/L。Real Time PCR扩增产物具有良好的特异性,熔解曲线特异峰出现在84.5℃附近,在熔解曲线略低于83℃附近有极微弱的非特异峰。因此在定量反应中信号检测步骤应放在84℃。以4种不同模板分子数条件下扩增曲线Ct值得到的回归方程为Y=-3.78×log(copynumber)+39.50,相关系数为0.998。[结论]该试验获得的Real Time PCR体系可用于转基因植株表达水平的检测。 展开更多
关键词 real time pcr 检测体系 转基因番茄植株 熔解曲线
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Real-time PCR及预测微生物学在白酒酿造中的应用构想 被引量:7
5
作者 孙超 卢慧丽 刘勇 《中国酿造》 CAS 2012年第10期7-10,共4页
利用实时荧光定量PCR技术及预测微生物学建立可培养酿酒微生物资源数据库和预测微生物学数学模型,可探究在白酒酿造过程中可培养酿酒微生物的变化规律及不同环境因素对可培养酿酒微生物菌群变化的影响,为白酒酿造工艺优化提供重要参数。
关键词 real—time pcr 预测微生物学 白酒酿造
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用DGGE和Real-Time PCR对低温沼气池中产甲烷古菌群落的研究 被引量:23
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作者 王彦伟 徐凤花 +3 位作者 阮志勇 宋金龙 王庆 赵斌 《中国沼气》 北大核心 2012年第1期8-12,共5页
利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。... 利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。结果表明,沼气低温发酵的过程中,不同沼泥样品发酵前期、后期产甲烷古菌的优势群落差异明显且数量上也存在较大差异;主要变化的产甲烷古菌的优势群落为甲烷粒菌属(Methanocor-pusculum),甲烷八叠球菌属(Methanosarcina),甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)。甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)在黑龙江沼泥样品(A1)发酵后期成为优势群落,甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)在山东发酵前期(B1),后期样品(B2)及安徽发酵前期样品(C1)中占有绝对优势。产甲烷古菌的数量介于104~105个.mL-1之间,其中黑龙江样品中产甲烷菌数量最多,而安徽样品中产甲烷菌数量最少。 展开更多
关键词 沼泥 产甲烷古菌 DGGE real-time pcr
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运用Real-time quantification PCR方法建立副溶血性弧菌在即食虾中的生长预测模型 被引量:5
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作者 彭织云 王敬敬 +2 位作者 唐晓阳 潘迎捷 赵勇 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期108-110,共3页
运用Real-time quantification PCR(real-time qPCR)方法建立副溶血性弧菌在即食虾中生长预测模型。首先构建质粒标准品,梯度稀释后建立标准曲线,然后用Real-time qPCR方法检测虾中副溶血性弧菌的数量,最后建立37℃下即食虾中副溶血性... 运用Real-time quantification PCR(real-time qPCR)方法建立副溶血性弧菌在即食虾中生长预测模型。首先构建质粒标准品,梯度稀释后建立标准曲线,然后用Real-time qPCR方法检测虾中副溶血性弧菌的数量,最后建立37℃下即食虾中副溶血性弧菌生长预测模型,并与传统涂布计数方法进行比较。结果表明,Real-time qPCR方法和传统计数方法均可建立Gmopertz模型、Logistic模型和Richards模型,模型拟合的相关系数R2均在0.9以上。基于Real-timeqPCR方法省时省力、特异性好等优点,用Real-time qPCR方法建立微生物预测模型是未来预测微生物学领域的一种发展趋势。 展开更多
关键词 real-time quantification pcr 副溶血性弧菌 生长预测模型
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应用SYBR GreenI的Real-time PCR方法定量检测空肠弯曲杆菌 被引量:10
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作者 阳成波 蒋原 +1 位作者 黄克和 祝长青 《动物医学进展》 CSCD 2003年第1期74-78,共5页
空肠弯曲杆菌(Campylobacterjejuni)被认为是人类主要食源性病原菌之一。由于空肠弯曲杆菌特殊的生长条件和容易进入不可培养但存活的状态(Viablebutnonculturable,VNC),所以传统的生化鉴定结果不一定可靠,并且是一项费时而繁琐的工作... 空肠弯曲杆菌(Campylobacterjejuni)被认为是人类主要食源性病原菌之一。由于空肠弯曲杆菌特殊的生长条件和容易进入不可培养但存活的状态(Viablebutnonculturable,VNC),所以传统的生化鉴定结果不一定可靠,并且是一项费时而繁琐的工作。核酸检测方法的出现为空肠弯曲杆菌的检测带来了方便。本文基于LightCycler为平台,利用SYBRGreenI染料能特异与双链DNA结合而发荧光的特性,建立一种Real-timePCR方法来定量检测空肠弯曲杆菌。用该方法检测时,发现所有空肠弯曲杆菌(11株)都呈阳性,所有其它弯曲菌(3株)和其它菌株(5株)都是阴性。整个检测过程60min内可以完成,检测限度为5CFU,标准曲线的相关系数为1。结果表明基于SYBRGreenI的定量PCR方法既为空肠弯曲杆菌提供了一种特异、敏感、快速和简洁的定量检测方法,又为研究空肠弯曲杆菌致病机理提供了一种重要方法。 展开更多
关键词 空肠弯曲杆菌 定量检测 SYBRGreenI染料 real-timepcr方法 致病机理 食源性病原菌
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利用SYBR Green检测衣原体Real-Time PCR方法的建立 被引量:2
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作者 杨建民 郝永新 +1 位作者 赵德明 何诚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期84-90,共7页
利用SYBR Green建立了检测种特异性衣原体的Real-Time PCR方法。本方法应用衣原体种特异性的高度保守特异引物,能够扩增627bp特异片段;使用定量标准基因组DNA,本方法能准确检测最少250fg衣原体DNA。Real-TimePCR方法与免疫荧光方法... 利用SYBR Green建立了检测种特异性衣原体的Real-Time PCR方法。本方法应用衣原体种特异性的高度保守特异引物,能够扩增627bp特异片段;使用定量标准基因组DNA,本方法能准确检测最少250fg衣原体DNA。Real-TimePCR方法与免疫荧光方法的检测结果表明:检测4种衣原体临床样本,Real-TimePCR敏感性均在96%~98%;特异性均为100%;这两种方法符合率达97%以上(n=60);批内和批间重复性试验结果表明,本方法具有良好的准确性。本方法的建立对于快速、准确检测临床样本种特异性衣原体提供了一种切实有效的方法。 展开更多
关键词 SYBR Green 衣原体 real-time pcr 检测
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O型口蹄疫病毒Real-time PCR检测方法的建立 被引量:9
10
作者 胡骑 信爱国 李华春 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第1期50-53,共4页
为建立一种可以快速、准确检测O型口蹄疫病毒的TaqMan荧光定量PCR方法,根据O型口蹄疫病毒VP1基因保守区序列设计特异性引物和TaqMan探针,使用MagMax Express核酸自动提取系统提取O型口蹄疫病毒FMD/O/YM/YN/2000株病毒核酸,建立了检测O... 为建立一种可以快速、准确检测O型口蹄疫病毒的TaqMan荧光定量PCR方法,根据O型口蹄疫病毒VP1基因保守区序列设计特异性引物和TaqMan探针,使用MagMax Express核酸自动提取系统提取O型口蹄疫病毒FMD/O/YM/YN/2000株病毒核酸,建立了检测O型口蹄疫病毒的实时荧光定量PCR方法。该方法标准曲线相关系数达0.999 3,最低检测量达到1.79个拷贝,比传统荧光定量PCR方法灵敏10倍以上,特异性强。该方法可以在2.5h内检测96份临床样品,相对于传统荧光定量PCR方法,效率提高2倍以上。采用MagMax Express核酸自动提取系统配合7500Fast real-time PCR system建立的方法可以实现快速、准确检测O型口蹄疫病毒。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 实时荧光定量pcr 大通量检测
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一种豇豆重花叶病毒IC-RT real-time PCR检测方法的建立 被引量:3
11
作者 李彬 粟寒 +2 位作者 吴翠萍 周明华 安榆林 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期491-496,共6页
为建立豇豆重花叶病毒(Cowpeasevere mosaic virus,CPSMV)免疫捕获-反转录-实时荧光(IC-RTreal-time)PCR分子检测方法,利用从ATCC和DSMZ引进的CPSMV标准毒株,先建立CPSMVRTreal-time PCR检测方法;在此基础上,建立用于CPSMV检测的IC-RTre... 为建立豇豆重花叶病毒(Cowpeasevere mosaic virus,CPSMV)免疫捕获-反转录-实时荧光(IC-RTreal-time)PCR分子检测方法,利用从ATCC和DSMZ引进的CPSMV标准毒株,先建立CPSMVRTreal-time PCR检测方法;在此基础上,建立用于CPSMV检测的IC-RTreal-time PCR方法.结果表明:IC-RTreal-time PCR方法的灵敏度可达500 pg叶组织;该方法具有特异性好、灵敏度高、操作简便等优点,省去了RNA的提取过程,适用于豇豆等豆类种子及种苗中对豇豆重花叶病毒的快速检测. 展开更多
关键词 豇豆重花叶病毒 免疫捕获反转录 实时荧光pcr
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猴逆转录病毒RT-PCR和Real-time RT-PCR检测方法的建立 被引量:2
12
作者 熊炜 蒋静 +5 位作者 张强 盘宝进 李健 魏晓锋 黄忠荣 胡建华 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第12期51-54,共4页
猴逆转录病毒(Simian type D retrovirus,SRV)是引起猴获得性免疫缺陷综合征(Simian acquired immunodeficiency syndrome,SAIDS)的病原之一,其严重危害猴的健康,并威胁与猴接触人员的健康,是无特定病原体(SPF)猴必须排除的病毒之一。... 猴逆转录病毒(Simian type D retrovirus,SRV)是引起猴获得性免疫缺陷综合征(Simian acquired immunodeficiency syndrome,SAIDS)的病原之一,其严重危害猴的健康,并威胁与猴接触人员的健康,是无特定病原体(SPF)猴必须排除的病毒之一。为了应对口岸对进出境野生及实验用灵长类动物SRV感染情况的监测和流行病学调查的需要,建立了RT-PCR和real-time RT-PCR检测SRV的方法,并对方法的特异性、敏感性和稳定性进行了验证。 展开更多
关键词 猴逆转录病毒 RT-pcr real-time RT-pcr TAQ Man探针
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猪PD-1及其配体PD-L1和PD-L2 SYBR Green Ⅰ Real-time PCR检测方法的建立及应用 被引量:2
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作者 岳锋 周娟娟 +3 位作者 朱艳平 李鹏 孙国鹏 王选年 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第11期2892-2899,共8页
本试验旨在研究猪PD-1及其配体在疾病状态下的转录水平,建立检测猪PD-1及其配体的Real-time PCR方法。根据GenBank中猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因序列,分别设计3对特异性引物,PCR扩增目的基因片段,回收目的基因片段与pMD18-T连接后转化至... 本试验旨在研究猪PD-1及其配体在疾病状态下的转录水平,建立检测猪PD-1及其配体的Real-time PCR方法。根据GenBank中猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因序列,分别设计3对特异性引物,PCR扩增目的基因片段,回收目的基因片段与pMD18-T连接后转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,提取重组质粒,经PCR及测序鉴定正确,作为标准品绘制标准曲线,并进行特异性和重复性检测。结果显示,Real-time PCR的Ct值与模板浓度对数呈良好的线性反比关系,相关系数R2>0.99,熔解曲线出现狭窄单一峰;Real-time PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,呈单一目的条带,无引物二聚体,特异性强;组内和组间重复性检测结果显示,组内和组间的变异系数均小于3%,重复性好;用建立的Real-time PCR方法检测猪自然感染PCV2后PD-1及其配体转录水平,PD-L1和PD-L2转录水平极显著或显著升高(P<0.01;P<0.05),PD-1转录水平无显著变化(P>0.05)。本试验建立了检测猪PD-1、PDL1和PD-L2mRNA的Real-time PCR方法并进行了初步应用,为猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因表达模式研究奠定基础。 展开更多
关键词 real-time pcr PD-1 PD-L1 PD-L2
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猪IL-2、IL-12p40和IFN-γ SYBR Green Ⅰ real-time PCR检测方法的建立 被引量:2
14
作者 施开创 莫胜兰 +4 位作者 许瑞胜 李向涛 陈宏备 郑敏 刘棋 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第7期74-79,共6页
针对猪Th1型细胞因子IL-2、IL-12p40、IFN-γ以及管家基因β-actin的基因序列分别设计一对特异性引物,构建含有各自引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测IL-2、IL-12p40、IFN-γ及β-actin的SYBR Green Ⅰ real-ti mePCR方... 针对猪Th1型细胞因子IL-2、IL-12p40、IFN-γ以及管家基因β-actin的基因序列分别设计一对特异性引物,构建含有各自引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测IL-2、IL-12p40、IFN-γ及β-actin的SYBR Green Ⅰ real-ti mePCR方法。该方法线性关系好,标准曲线的相关系数均达到0.997以上;敏感性高,初始模板的检出下限均达到100拷贝/μL;特异性强,扩增产物形成单一的特异性熔解峰;重复性好,组内与组间的变异系数均小于3.5%。应用所建立的方法对猪繁殖与呼吸综合征病毒感染仔猪外周血单个核细胞中IL-2、IL-12p40和IFN-γ mRNA的表达水平进行了检测。结果表明,所建立的real-time PCR检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好。 展开更多
关键词 TH1型细胞因子 荧光定量pcr SYBR Green
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应用real-time PCR定量检测土壤中小麦纹枯病菌方法的建立 被引量:4
15
作者 徐娜娜 李鹏昌 于金凤 《山东农业科学》 2014年第3期106-109,共4页
根据小麦纹枯病菌Rhizoctonia cerealis AG-D融合群ITS区的DNA序列设计特异性引物对WKF-8/WKR-8,对引物的特异性和灵敏性进行检测,建立并优化基于 SYBR GreenⅠ荧光染料法的 real -time PCR反应体系,绘制标准曲线。检测范围在1.0... 根据小麦纹枯病菌Rhizoctonia cerealis AG-D融合群ITS区的DNA序列设计特异性引物对WKF-8/WKR-8,对引物的特异性和灵敏性进行检测,建立并优化基于 SYBR GreenⅠ荧光染料法的 real -time PCR反应体系,绘制标准曲线。检测范围在1.0×10-3~10 ng/μl之间有良好的线性关系,相关系数R2为0.995,扩增效率为99.7%,灵敏度比常规PCR方法高100倍。结果表明,该方法具有快速、特异性强、敏感度高等特点。 展开更多
关键词 小麦纹枯病菌 SYBR GreenⅠ荧光染色法
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Real time PCR检测L1-CAM在大肠癌中的表达及其临床意义 被引量:1
16
作者 郑小春 林敬阳 +1 位作者 方晴霞 曹鸿峰 《中国医药导报》 CAS 2016年第26期92-95,共4页
目的探讨L1细胞黏附分子(L1-CAM)在大肠癌中的表达情况及其与临床病理的相关性。方法应用实时荧光定量PCR检测浙江省人民医院58例大肠癌组织及其癌旁正常组织中L1-CAM的表达,分析L1-CAM在大肠癌中的表达及其与临床病理学特征和预后的关... 目的探讨L1细胞黏附分子(L1-CAM)在大肠癌中的表达情况及其与临床病理的相关性。方法应用实时荧光定量PCR检测浙江省人民医院58例大肠癌组织及其癌旁正常组织中L1-CAM的表达,分析L1-CAM在大肠癌中的表达及其与临床病理学特征和预后的关系。结果癌组织和癌旁正常组织L1-CAM m RNA表达差异有统计学意义(P<0.05)。癌组织L1-CAM m RNA表达与肿瘤分化程度、静脉侵犯、淋巴管侵犯、淋巴结转移、Dukes分期密切相关(均P<0.05),而与性别、年龄、肿瘤大小、肿瘤类型无明显相关(均P>0.05)。结论 L1-CAM在大肠癌组织中高表达,并且与大肠癌的浸润、转移有关。 展开更多
关键词 大肠癌 L1细胞黏附分子 实时荧光定量pcr
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猪NLRP3基因Real-time PCR检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 刘博 张倩 +6 位作者 莫玲 林盼盼 谷英华 刘海隆 蔡青云 张艳 王文秀 《动物医学进展》 北大核心 2023年第9期19-23,共5页
根据NCBI NLRP3 cds(NM-001256770)序列设计1对特异性引物,构建标准品质粒pMD18T-NLRP3-189。通过反应条件优化、稳定性、敏感性等试验,成功建立了NLRP3的SYBR GreenⅠreal-time PCR检测方法,用该方法定量检测猪肺炎支原体(Mycoplasma h... 根据NCBI NLRP3 cds(NM-001256770)序列设计1对特异性引物,构建标准品质粒pMD18T-NLRP3-189。通过反应条件优化、稳定性、敏感性等试验,成功建立了NLRP3的SYBR GreenⅠreal-time PCR检测方法,用该方法定量检测猪肺炎支原体(Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp)感染后的猪肺组织中NLRP3表达水平。最佳引物浓度为0.15μmol/L,建立的标准曲线方程为y=-3.5196x+36.968,E值为0.96,最低检测量为84个拷贝,熔解曲线有单一峰,批内变异系数CV为0.067%~0.184%,批间变异系数为0.221%~0.594%,重复性好。该方法检测仔猪在感染Mhp后肺组织中的NLRP3 mRNA表达水平,感染组与健康组相比差异显著(P<0.01),NLRP3表达水平明显增高,在感染后14 d可达到高峰,平均mRNA拷贝数达18000左右,可持续42 d。表明该检测方法稳定性良好,精确度高,特异性强,为进一步研究猪炎症小体NLRP3的激活及其相关炎症反应机制提供了技术支持。 展开更多
关键词 NLRP3基因 实时荧光定量pcr 猪肺炎支原体
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扇棘单睾吸虫Real-time PCR与常规PCR检测方法的建立
18
作者 李树清 梅雪芳 +8 位作者 林颖峥 石云良 黄腾飞 王巧全 张强 陈志飞 宋青 唐智芳 黄维义 《动物医学进展》 北大核心 2015年第12期62-67,共6页
根据扇棘单睾吸虫核糖体DNA第一内转录间隔区(ITS1)序列,应用Primer premier 5.0软件自行设计一对可同时应用于real-time PCR和常规PCR的特异引物,建立real-time PCR与常规PCR鉴定扇棘单睾吸虫的方法,评估其特异性及灵敏性。应用建立的... 根据扇棘单睾吸虫核糖体DNA第一内转录间隔区(ITS1)序列,应用Primer premier 5.0软件自行设计一对可同时应用于real-time PCR和常规PCR的特异引物,建立real-time PCR与常规PCR鉴定扇棘单睾吸虫的方法,评估其特异性及灵敏性。应用建立的方法鉴定犬猫内脏中收集的吸虫,并用测序进行验证,检验方法的准确性和实用性。结果表明,建立的两种方法均只能特异性扩增扇棘单睾吸虫目的片段,不与横川后殖吸虫、钩棘单睾吸虫、华支睾吸虫、瓦氏瓦特松吸虫、棘口属吸虫、背孔属吸虫、心形咽口吸虫、野牛平腹盘吸虫、东方次睾吸虫、卫氏并殖吸虫、异尖属线虫、宫脂属线虫发生交叉扩增;敏感性试验表明,real-time PCR和常规PCR检测扇棘单睾吸虫质粒的最低检测限分别为43拷贝和86拷贝。建立的realtime PCR标准曲线的循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈良好的线性关系(R2=0.998)。鉴定来自犬猫的吸虫17条,结果显示两种方法均能准确鉴定出扇棘单睾吸虫。 展开更多
关键词 扇棘单睾吸虫 实时荧光定量pcr 常规pcr 鉴定
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大鲵虹彩病毒TaqManreal·timePCR检测方法的建立
19
作者 周勇 曾令兵 +5 位作者 孟彦 周群兰 张辉 高正勇 肖艺 孙建滨 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2013年第B07期18-25,共8页
利用PCR技术扩增出大鲵虹彩病毒(Giantsalamanderiridovirus,GSIV)主要衣壳蛋白(MCP)编码区长度为1392bp的片段,克隆到pMD19-T载体上,构建重组质粒pMD19-T—MCP。经PCR鉴定确认正确后,以10倍梯度稀释pMD19-T—MCP重组质粒,作... 利用PCR技术扩增出大鲵虹彩病毒(Giantsalamanderiridovirus,GSIV)主要衣壳蛋白(MCP)编码区长度为1392bp的片段,克隆到pMD19-T载体上,构建重组质粒pMD19-T—MCP。经PCR鉴定确认正确后,以10倍梯度稀释pMD19-T—MCP重组质粒,作为标准模板进行TaqMan实时荧光定量PCR扩增,制作标准曲线,建立了大鲵虹彩病毒的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。制作的标准曲线有极好的线性关系,且线性范围宽,相关系数为0.99019。组内重复试验的Ct值标准偏差为0.52%。检测结果显示,该方法对大鲵虹彩病毒的检测有高度的特异性,与锦鲤疱疹病毒、弗氏柠檬酸杆菌、嗜水气单胞菌以及鲤鱼上皮瘤细胞基因组DNA之间均无交叉反应,特异性好,检测总DNA灵敏度为10个病毒核酸分子拷贝数,约1.1×10^-3g/μL病毒核酸,较之常规PCR的敏感度高出约1000倍。本研究建立的大鲵虹彩病毒TaqMan实时荧光定量PCR方法灵敏度高、特异性强,对大鲵虹彩病毒病的快速诊断与病毒病原定量检测有重要意义。 展开更多
关键词 大鲵出血病 虹彩病毒 MCP基因 TaqMan实时荧光定量pcr
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应用细菌磁颗粒real-time RT-PCR检测百合无症病毒
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作者 邓丛良 双龙海 +2 位作者 孙宁 陈继峰 魏海燕 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期95-98,共4页
为研究细菌磁颗粒分离提取不同样本材料中的植物病毒RNA的效果,以及结合实时荧光RT-PCR技术检测LSV的灵敏性,选取感染病毒的西葫芦叶片(CGMMV和SqMV)、大豆种子(BPMV)与百合叶片(LSV和ArMV)3种样本材料,利用细菌磁颗粒分别提取这5种病毒... 为研究细菌磁颗粒分离提取不同样本材料中的植物病毒RNA的效果,以及结合实时荧光RT-PCR技术检测LSV的灵敏性,选取感染病毒的西葫芦叶片(CGMMV和SqMV)、大豆种子(BPMV)与百合叶片(LSV和ArMV)3种样本材料,利用细菌磁颗粒分别提取这5种病毒RNA,与Trizol方法提取效果进行比较,同时与Trizol real-time RT-PCR检测LSV的灵敏度进行了比较。结果表明:BMPs方法能够从3种植物样本中提取病毒RNA,其检测LSV的灵敏性与Trizol方法相当。 展开更多
关键词 细菌磁颗粒 实时荧光RT-pcr 灵敏度
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