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天然反义RNA(NATs):基因表达的重要调控分子 被引量:3
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作者 毕延震 黄捷 姜黎 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期788-795,共8页
天然反义RNA(natural antisense transcripts,NATs)是在多个物种广泛表达的一类非编码RNA分子,可在转录水平、转录后水平、翻译水平等多个层次采取不同的机制调节靶基因的表达,对器官形成、细胞分化和疾病发生等各种生理和病理过程都有... 天然反义RNA(natural antisense transcripts,NATs)是在多个物种广泛表达的一类非编码RNA分子,可在转录水平、转录后水平、翻译水平等多个层次采取不同的机制调节靶基因的表达,对器官形成、细胞分化和疾病发生等各种生理和病理过程都有重要的调控作用.本文在总结、回顾近年来天然反义RNA研究进展的基础上,从转录碰撞、DNA甲基化修饰、小分子RNA等9个方面详细介绍和阐述NATs的作用机制,并提出未来NATs研究需要重点解决的两个问题:一是开发合适的实验系统研究特定条件下的NATs表达与生物学功能,二是深入阐明NATs的自身表达调控机制,深化对其生物学意义的认识.对天然反义RNA的研究为药物开发和疾病治疗提供了新的思路和突破口. 展开更多
关键词 天然反义RNA(nats) 正义基因 作用机制 调控
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渗透胁迫下玉米自然反义转录本cis-NAT_(ZmNAC48)启动子的功能分析 被引量:2
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作者 毛燕 郑名敏 +2 位作者 牟成香 谢吴兵 唐琦 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期354-362,共9页
前期研究发现自然反义转录本cis-NAT_(ZmNAC48)可负调控干旱响应基因ZmNAC48,为了进一步探索cisNAT_(ZmNAC48)的功能,本研究以cis-NAT_(ZmNAC48)cDNA序列、ZmNAC48蛋白质编码序列检索玉米B73参考基因组,获取基因上游启动子序列,并利用Pl... 前期研究发现自然反义转录本cis-NAT_(ZmNAC48)可负调控干旱响应基因ZmNAC48,为了进一步探索cisNAT_(ZmNAC48)的功能,本研究以cis-NAT_(ZmNAC48)cDNA序列、ZmNAC48蛋白质编码序列检索玉米B73参考基因组,获取基因上游启动子序列,并利用PlantCARE[1]和New PLACE[2]预测启动子调控元件,发现cis-NAT_(ZmNAC48)和ZmNAC48启动子序列中除含有CAAT-box,TATA-box等基本元件外,还含有激素响应元件以及转录因子结合元件等。构建cis-NAT_(ZmNAC48)和ZmNAC48启动子融合GUS的表达载体,并通过花序侵染法获得转基因拟南芥。分析GUS染色和GUS酶活性发现,Pro_(cis-NAT_(ZmNAC48)):GUS和Pro_(ZmNAC48):GUS转基因拟南芥根、茎、叶中均有GUS表达,且渗透胁迫处理后Pro_(cis-NAT_(ZmNAC48)):GUS转基因拟南芥中GUS基因的表达量和GUS酶活性显著降低,而Pro_(ZmNAC48):GUS转基因拟南芥中GUS基因的表达量和GUS酶活性显著增加,可见cis-NAT_(ZmNAC48)和ZmNAC48启动子均响应渗透胁迫。DNA甲基化是影响启动子活性的调控事件之一,本研究通过分析cis-NAT_(ZmNAC48)启动子区域DNA甲基化情况,发现在cis-NAT_(ZmNAC48)序列前400~1000 bp存在DNA甲基化修饰,渗透胁迫处理后,该甲基化区域甲基化富集情况发生了显著的变化,但发生显著性变化的甲基化位点并未在顺式调控元件上。这些结果为后续cis-NAT_(ZmNAC48)的调控分析奠定了重要的基础。 展开更多
关键词 玉米 自然反义转录本 启动子 渗透胁迫
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植物非编码RNA调控春化作用的表观遗传 被引量:13
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作者 张绍峰 李晓荣 +1 位作者 孙传宝 何玉科 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期829-834,共6页
在自然界中许多高等植物需要通过冬季的低温阶段实现从营养生长到生殖生长的时期转化,这一生物学过程称作春化作用。小麦(Triticum aestivum L.)和油菜(Brassica napus L.)等作物以种子为产品器官,生产上往往通过茬口安排和栽培措施使... 在自然界中许多高等植物需要通过冬季的低温阶段实现从营养生长到生殖生长的时期转化,这一生物学过程称作春化作用。小麦(Triticum aestivum L.)和油菜(Brassica napus L.)等作物以种子为产品器官,生产上往往通过茬口安排和栽培措施使植株尽早通过春化作用,以促进花芽形成和花器官发育,而大白菜(B rapa ssp.pekinenesis)和甘蓝(B.oleracea)等作物以叶球等营养器官作为产品器官,生产上则设法避免低温引起的春化作用,以保证产品器官的充分生长。FLOWERING LOCUS C(FLC)作为一种重要的开花抑制蛋白负调控春化作用,参与植株从营养生长向生殖生长的转化过程。文章综述了春化中FLC表达受抑制主要通过低温诱导表达FLC基因区域的非编码RNA以及VRN1、VRN2、VIN3等蛋白参与介导组蛋白甲基化,从而在表观遗传上控制春化作用的进程和产品器官的正常发育。 展开更多
关键词 FLC 表观遗传 春化作用 非编码RNA 天然反向转录本
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天然反义转录物及其调控基因的表达机制 被引量:9
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作者 谢兆辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期122-128,共7页
天然反义转录(NATs)是一组编码蛋白质或非编码蛋白质的RNAs,与其他(有义)转录物具有互补序列,可以调节有义链的表达。这种调节可以发生在转录水平或转录后水平,调节方式有转录干扰、RNA封闭、双链依赖机制或染色质重建(修饰)等。正义链... 天然反义转录(NATs)是一组编码蛋白质或非编码蛋白质的RNAs,与其他(有义)转录物具有互补序列,可以调节有义链的表达。这种调节可以发生在转录水平或转录后水平,调节方式有转录干扰、RNA封闭、双链依赖机制或染色质重建(修饰)等。正义链和反义链分别加工成小RNAs调节基因表达,也是NATs调节基因表达的重要方式,如piRNAs的"乒乓机制"。实验或计算机研究已经证明了NATs在生物中广泛存在,是一种重要的基因表达调节方式。文章论述了NATs的重要作用和机理,重点论述了NATs的调节机制和相关的小RNAs。 展开更多
关键词 天然反义转录物 转录干扰 RNA封闭 双链依赖机制 染色质重建(修饰)
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小鼠大脑皮层层次特异表达基因天然反义转录物的筛选与鉴定 被引量:1
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作者 李萍 张靖 +4 位作者 李爱花 王珊 谈小超 阴彬 彭小忠 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期620-623,共4页
目的筛选并鉴定小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因是否存在天然反义转录物(NAT)。方法对63个小鼠大脑皮层层次特异表达的基因进行生物信息学预测,筛选出31个可能存在NAT的基因,从小鼠脑组织及神经系统来源的细胞系提取总RNA... 目的筛选并鉴定小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因是否存在天然反义转录物(NAT)。方法对63个小鼠大脑皮层层次特异表达的基因进行生物信息学预测,筛选出31个可能存在NAT的基因,从小鼠脑组织及神经系统来源的细胞系提取总RNA,采用RT-PCR方法对筛选阳性基因进行鉴定并克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果 31个经生物信息学预测的基因中,8个为NAT阳性。结论小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因存在NAT,NAT可能通过调控编码基因影响小鼠皮层发育。 展开更多
关键词 天然反义转录物 小鼠大脑皮层 筛选 鉴定
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阿托伐他汀对HepG_2细胞中脂代谢相关基因表达的影响 被引量:2
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作者 王艳丽 黄鸣宇 张鹏 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期77-82,219,共7页
目的:探讨阿托伐他汀对HepG_2细胞中载脂蛋白A1 (apoA1)天然反义转录(apoA1-NAT)的作用及对脂代谢相关基因表达的影响。方法:采用不同浓度阿托伐他汀(0、1、10和100nmol·L^(-1))干预HepG_2细胞,0nmol·L^(-1)阿托伐他汀组为对... 目的:探讨阿托伐他汀对HepG_2细胞中载脂蛋白A1 (apoA1)天然反义转录(apoA1-NAT)的作用及对脂代谢相关基因表达的影响。方法:采用不同浓度阿托伐他汀(0、1、10和100nmol·L^(-1))干预HepG_2细胞,0nmol·L^(-1)阿托伐他汀组为对照组,在不同时间点(6、12、24和48h)提取各组HepG_2细胞总RNA,采用Real-time PCR法检测HepG_2细胞中apoA1-NAT和脂代谢相关基因mRNA表达水平。结果:1和10nmol·L^(-1)阿托伐他汀组HepG_2细胞形态正常。与6h时比较,12、24和48h时10nmol·L^(-1)阿托伐他汀组HepG_2细胞中apoA1-NAT表达水平明显降低(P<0.01),且呈明显的时间依赖性。在相同条件下,48h时HepG_2细胞中apoA1mRNA表达水平较6h时明显升高(P<0.01)。与对照组比较,100nmol·L^(-1)阿托代他汀组HepG_2细胞中低密度脂蛋白受体(LDLR)、10nmol·L^(-1)阿托代他汀组HepG_2细胞中清道夫受体B1(SRB1)及1和10nmol·L^(-1)阿托伐他汀组HepG_2细胞中ATP结合盒式转运体A1 (ABCA1)表达水平均有不同程度升高(P<0.01)。结论:阿托伐他汀通过抑制HepG_2细胞中apoA1-NAT表达,促进脂代谢相关基因表达,进而促进胆固醇逆转运过程。 展开更多
关键词 阿托伐他汀 载脂蛋白A1 载脂蛋白A1天然反义转录 脂代谢 HepG2细胞
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阿托伐他汀调节巨噬细胞载脂蛋白A1天然反义转录表达的研究 被引量:1
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作者 王艳丽 陈胜利 张鹏 《中国循环杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期385-390,共6页
目的:探讨阿托伐他汀调节人急性单核细胞白血病细胞1(THP1)诱导的巨噬细胞载脂蛋白A1(apoA1)天然反义转录(apoA1-NAT)表达的研究。方法:检索基因序列,设计引物,用不同浓度0、1、10、100 nmol/L阿托伐他汀干预THP1诱导的巨噬细胞,提取不... 目的:探讨阿托伐他汀调节人急性单核细胞白血病细胞1(THP1)诱导的巨噬细胞载脂蛋白A1(apoA1)天然反义转录(apoA1-NAT)表达的研究。方法:检索基因序列,设计引物,用不同浓度0、1、10、100 nmol/L阿托伐他汀干预THP1诱导的巨噬细胞,提取不同浓度和时间点(6、12、24、48 h)的RNA,检测apoA1-NAT、apoA1信使核糖核酸(mRNA)表达。同时检测与胆固醇代谢相关的三磷酸腺苷绑定的盒式转运体A1(ABCA1)、清道夫受体B1 (SRB1)及低密度脂蛋白受体(LDLR)mRNA的表达。结果:THP1诱导的巨噬细胞在10 nmol/L阿托伐他汀干预24 h,apoA1-NAT表达明显降低,同时apoA1 mRNA表达量显著升高(P<0.01),ABCA1、SRB1及LDLR mRNA表达量也出现不同程度的升高(P均<0.05)。结论:阿托伐他汀抑制巨噬细胞apoA1-NAT表达的同时,可升高apoA1、ABCA1、SRB1及LDLR mRNA表达,进而能促进巨噬细胞胆固醇的外流。 展开更多
关键词 阿托伐他汀 载脂蛋白 A1 天然反义转录 脂代谢 巨噬细胞
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Dlx1的天然反义转录物在大脑发育中的功能探索 被引量:2
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作者 吴朝 赵阿妮 +2 位作者 朱丽媛 阴彬 张靖 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期607-610,共4页
目的探索Dlx1的天然反义转录物(Dlx1as)在小鼠大脑发育过程中的功能。方法根据生物信息学分析与分子生物学实验验证Dlx1as是否具有多聚腺苷酸尾,采用实时定量PCR检测Dlx1as与Dlx1 mRNA在小鼠大脑发育过程中随时间的变化,利用原位杂交的... 目的探索Dlx1的天然反义转录物(Dlx1as)在小鼠大脑发育过程中的功能。方法根据生物信息学分析与分子生物学实验验证Dlx1as是否具有多聚腺苷酸尾,采用实时定量PCR检测Dlx1as与Dlx1 mRNA在小鼠大脑发育过程中随时间的变化,利用原位杂交的技术比较Dlx1as与Dlx1 mRNA空间表达谱。结果 Dlx1as具有多聚腺苷酸尾,在小鼠的胚胎发育过程中,从E14.5到E18.5高表达,与Dlx1 mRNA在各时间点表达水平虽比较接近,但在表达区域存在互补的特点。结论 Dlx1as在小鼠大脑发育过程中有一段时间的高表达,与蛋白编码基因Dlx1 mRNA空间互补,推测其可能是通过调控Dlx1 mRNA来影响小鼠的大脑发育。 展开更多
关键词 Dlx1as 小鼠大脑发育 天然反义转录物 原位杂交
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