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陆川猪MYL9基因克隆及其表达差异分析
被引量：
6
1
作者
焦迪
谢婉
+6 位作者
潘鹏丞
陈宝剑
关志惠
杨秀荣
兰干球
郭亚芬
谢炳坤
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期454-460,共7页
【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克...
【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆陆川猪MYL9基因,利用在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测陆川猪和杜洛克猪背最长肌中MYL9基因的表达情况。【结果】陆川猪MYL9基因编码区(CDS)序列长519bp,共编码172个氨基酸;与NCBI上已公布的家猪MYL9基因(NM_001244472.1)CDS序列比对,陆川猪MYL9基因存在2处碱基突变,分别是195 bp处C→A和498 bp处T→C,均为同义突变;陆川猪MYL9基因推导氨基酸序列与家猪MYL9基因推导氨基酸序列的同源性最高,为99.6%,与鸡的同源性最低,为88.4%。陆川猪MYL9蛋白存在3个N糖基化位点和15个磷酸化位点,不存在跨膜结构域和信号肽,符合一般EFh-PEF超家族的结构特征。陆川猪MYL9蛋白二级结构中α-螺旋占54.65%,无规则卷曲占35.47%,β-转角占8.14%,延伸链占1.74%。MYL9基因在杜洛克猪背最长肌中的相对表达量极显著高于陆川猪背最长肌(P<0.01)。【结论】MYL9基因序列在不同物种中具有较高的保守性,其在10周龄陆川猪背最长肌中的相对表达量极显著低于杜洛克猪,与其在不同猪种背最长肌中的磷酸化程度有关,也说明MYL9基因对猪肌肉生长速度有一定影响。
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关键词
陆川猪
肌球蛋白轻链
9
基因(MYL
9
)
克隆
生物信息学分析
肌肉
磷酸化
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职称材料
肌球蛋白轻链9在恶性肿瘤中的研究进展
被引量：
1
2
作者
游伊梦
刘庭波
沈建箴
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1153-1158,共6页
肌球蛋白轻链9(myosin light chain 9,MYL9)是组成肌球蛋白的调节性轻链,其在细胞收缩、增殖与侵袭等不同生物学过程中发挥重要作用。该基因在肺癌、乳腺癌、前列腺癌、恶性黑色素瘤等多种不同类型恶性肿瘤中均有异常表达,且往往与不良...
肌球蛋白轻链9(myosin light chain 9,MYL9)是组成肌球蛋白的调节性轻链,其在细胞收缩、增殖与侵袭等不同生物学过程中发挥重要作用。该基因在肺癌、乳腺癌、前列腺癌、恶性黑色素瘤等多种不同类型恶性肿瘤中均有异常表达,且往往与不良预后密切相关,其表达的临床意义根据癌组织的不同而不同。MYL9作为分子标志物和潜在的靶标,在恶性肿瘤的早期诊断、预后预测以及靶向治疗中将具有极大的临床应用价值。
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关键词
肌球蛋白轻链
9
恶性肿瘤
分子标志物
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职称材料
题名
陆川猪MYL9基因克隆及其表达差异分析
被引量：
6
1
作者
焦迪
谢婉
潘鹏丞
陈宝剑
关志惠
杨秀荣
兰干球
郭亚芬
谢炳坤
机构
广西大学动物科学技术学院
广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期454-460,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31360544)
文摘
【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆陆川猪MYL9基因,利用在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测陆川猪和杜洛克猪背最长肌中MYL9基因的表达情况。【结果】陆川猪MYL9基因编码区(CDS)序列长519bp,共编码172个氨基酸;与NCBI上已公布的家猪MYL9基因(NM_001244472.1)CDS序列比对,陆川猪MYL9基因存在2处碱基突变,分别是195 bp处C→A和498 bp处T→C,均为同义突变;陆川猪MYL9基因推导氨基酸序列与家猪MYL9基因推导氨基酸序列的同源性最高,为99.6%,与鸡的同源性最低,为88.4%。陆川猪MYL9蛋白存在3个N糖基化位点和15个磷酸化位点,不存在跨膜结构域和信号肽,符合一般EFh-PEF超家族的结构特征。陆川猪MYL9蛋白二级结构中α-螺旋占54.65%,无规则卷曲占35.47%,β-转角占8.14%,延伸链占1.74%。MYL9基因在杜洛克猪背最长肌中的相对表达量极显著高于陆川猪背最长肌(P<0.01)。【结论】MYL9基因序列在不同物种中具有较高的保守性,其在10周龄陆川猪背最长肌中的相对表达量极显著低于杜洛克猪,与其在不同猪种背最长肌中的磷酸化程度有关,也说明MYL9基因对猪肌肉生长速度有一定影响。
关键词
陆川猪
肌球蛋白轻链
9
基因(MYL
9
)
克隆
生物信息学分析
肌肉
磷酸化
Keywords
Luchuan pig
myosin
regulatory
light
chain
9
gene(MYL
9
)
cloning
bioinformatics analysis
muscle
phosphorylation
分类号
S828.89 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
肌球蛋白轻链9在恶性肿瘤中的研究进展
被引量：
1
2
作者
游伊梦
刘庭波
沈建箴
机构
福建省血液病研究所
出处
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1153-1158,共6页
基金
福建省科技创新联合资金项目(2019Y9069)。
文摘
肌球蛋白轻链9(myosin light chain 9,MYL9)是组成肌球蛋白的调节性轻链,其在细胞收缩、增殖与侵袭等不同生物学过程中发挥重要作用。该基因在肺癌、乳腺癌、前列腺癌、恶性黑色素瘤等多种不同类型恶性肿瘤中均有异常表达,且往往与不良预后密切相关,其表达的临床意义根据癌组织的不同而不同。MYL9作为分子标志物和潜在的靶标,在恶性肿瘤的早期诊断、预后预测以及靶向治疗中将具有极大的临床应用价值。
关键词
肌球蛋白轻链
9
恶性肿瘤
分子标志物
Keywords
myosin light chain 9
malignant tumor
molecular markers
分类号
R730 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陆川猪MYL9基因克隆及其表达差异分析
焦迪
谢婉
潘鹏丞
陈宝剑
关志惠
杨秀荣
兰干球
郭亚芬
谢炳坤
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
在线阅读
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职称材料
2
肌球蛋白轻链9在恶性肿瘤中的研究进展
游伊梦
刘庭波
沈建箴
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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