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基于AEViT与先验知识的胶质瘤IDH1突变状态预测
1
作者
徐华畅
许倩
+3 位作者
赵钰琳
梁峰宁
徐凯
朱红
《智能系统学报》
CSCD
北大核心
2024年第4期952-960,共9页
针对目前预测胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase1,IDH1)突变状态存在的数据不足、准确率较低等问题,提出一种基于AEViT(auto-encoder vision Transformer)与先验知识的胶质瘤IDH1突变状态预测方法。首先使用改进的K-Mean...
针对目前预测胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase1,IDH1)突变状态存在的数据不足、准确率较低等问题,提出一种基于AEViT(auto-encoder vision Transformer)与先验知识的胶质瘤IDH1突变状态预测方法。首先使用改进的K-Means聚类算法为无IDH1突变状态标签的胶质瘤磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)数据标注伪标签,并采用ViT(vision Transformer)网络对伪标签进行修正,得到最终的胶质瘤IDH1突变状态。为避免不准确的伪标签数据影响模型精度,采用果蝇优化算法为伪标签数据赋予最优权重;然后提出基于Auto-Encoder和ViT的分类模型AEViT,利用Auto-Encoder提取胶质瘤MRI特征;再将特征输入ViT中对胶质瘤IDH1突变状态进行分类;最后将基于胶质瘤位置信息的先验知识加入模型,达到99.01%的预测准确率。结果表明该方法优于其他现有模型,能够实现胶质瘤数据扩增和术前无创、准确地预测胶质瘤IDH1突变状态,从而辅助诊疗过程。
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关键词
胶质瘤
异柠檬酸脱氢酶1
K-MEANS聚类算法
伪标签
auto-encod
er
vision
transform
er
果蝇优化算法
先验知识
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职称材料
题名
基于AEViT与先验知识的胶质瘤IDH1突变状态预测
1
作者
徐华畅
许倩
赵钰琳
梁峰宁
徐凯
朱红
机构
徐州医科大学医学信息与工程学院
徐州医科大学附属医院医学影像科
出处
《智能系统学报》
CSCD
北大核心
2024年第4期952-960,共9页
基金
江苏省卫生健康委医学科研项目(Z2020032)
徐州市重点研发计划项目(KC22117)
徐州市卫生健康委员会青年医学科技创新项目(XWKYHT20210586).
文摘
针对目前预测胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase1,IDH1)突变状态存在的数据不足、准确率较低等问题,提出一种基于AEViT(auto-encoder vision Transformer)与先验知识的胶质瘤IDH1突变状态预测方法。首先使用改进的K-Means聚类算法为无IDH1突变状态标签的胶质瘤磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)数据标注伪标签,并采用ViT(vision Transformer)网络对伪标签进行修正,得到最终的胶质瘤IDH1突变状态。为避免不准确的伪标签数据影响模型精度,采用果蝇优化算法为伪标签数据赋予最优权重;然后提出基于Auto-Encoder和ViT的分类模型AEViT,利用Auto-Encoder提取胶质瘤MRI特征;再将特征输入ViT中对胶质瘤IDH1突变状态进行分类;最后将基于胶质瘤位置信息的先验知识加入模型,达到99.01%的预测准确率。结果表明该方法优于其他现有模型,能够实现胶质瘤数据扩增和术前无创、准确地预测胶质瘤IDH1突变状态,从而辅助诊疗过程。
关键词
胶质瘤
异柠檬酸脱氢酶1
K-MEANS聚类算法
伪标签
auto-encod
er
vision
transform
er
果蝇优化算法
先验知识
Keywords
glioma
IDH1
K-Means clustering algorithm
pseudo-label
auto-encod
er
vision
transform
er
fruit fly optimization algorithm
priori knowledge
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于AEViT与先验知识的胶质瘤IDH1突变状态预测
徐华畅
许倩
赵钰琳
梁峰宁
徐凯
朱红
《智能系统学报》
CSCD
北大核心
2024
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