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金银花MYB基因家族的功能鉴定与组织表达差异分析
1
作者
孙晓丽
武艳芳
+3 位作者
王永丽
高璐
陈寻峰
蒋建雄
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第8期41-48,共8页
为了探究金银花MYB家族转录因子的调控功能,挖掘对绿原酸生物合成具有调控作用的MYB转录因子,从金银花的转录组数据中鉴定出37个MYB转录因子,并对其所编码蛋白的理化性质、进化关系、启动子序列、保守基序区域和不同组织中的相对表达量...
为了探究金银花MYB家族转录因子的调控功能,挖掘对绿原酸生物合成具有调控作用的MYB转录因子,从金银花的转录组数据中鉴定出37个MYB转录因子,并对其所编码蛋白的理化性质、进化关系、启动子序列、保守基序区域和不同组织中的相对表达量进行系统分析。保守基序(motif)区域分析结果表明,37个MYB转录因子含有保守的R2R3-MYB结构域,属于R2R3-MYB亚族。上游启动子元件分析结果显示,这些MYB转录因子参与植物激素、外界非生物胁迫、生长发育的应答等。组织差异性表达分析结果显示,LjMYB6-1、LjMYB12-2、LjMYB4为代表的12个转录因子的基因在白花中相对表达量较高,以LjMYB6、LjMYB11、LjMYB12为代表的12个转录因子的基因在青蕾中相对表达量较高,而金银花中的白花和青蕾是绿原酸含量最高的药用部位。系统进化树结果显示,LjMYB11、LjMYB4、LjMYB6、LjMYB6-1、LjMYB12、LjMYB12-2共6个MYB转录因子位于参与植物苯丙素代谢途径调控的进化分支中,表明它们具有潜在的调控苯丙素代谢途径的作用。综合分析,认为这6个转录因子可能参与对金银花绿原酸生物合成的调控。
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关键词
金银花
MYB
转录因子
功能
分析
组织表达
motif分析
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职称材料
气味结合蛋白OBPs在意大利蜜蜂头部表达模式的研究
被引量：
2
2
作者
赵慧婷
彭竹
+3 位作者
黄丽
郭丽娜
杜亚丽
吕建华
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2021年第5期1229-1236,共8页
昆虫气味结合蛋白(OBPs)是脂溶性化学物质的载体,参与了嗅觉识别和化学传输等生理过程。本研究利用MEME在线软件对意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica OBPs基因家族21条氨基酸序列进行Motif预测分析;采用RT-PCR初步筛选出在意大利蜜蜂...
昆虫气味结合蛋白(OBPs)是脂溶性化学物质的载体,参与了嗅觉识别和化学传输等生理过程。本研究利用MEME在线软件对意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica OBPs基因家族21条氨基酸序列进行Motif预测分析;采用RT-PCR初步筛选出在意大利蜜蜂头部表达量较高的OBPs基因,然后利用qPCR技术对筛选出的基因进一步分析其在不同日龄内勤蜂头部的表达情况。结果表明,在预测获得的6个motif中,motif 1为21个OBPs所共有,具有极高的保守性,推测该序列元件可能是意大利蜜蜂OBPs与底物结合的区域;表达谱分析结果表明,13个OBPs基因的凝胶电泳条带明显(即在头部的表达量较高),且大多数基因在4日龄时表达量达到最高值,推测这类蛋白可能参与了幼虫信息素和糖类物质的识别过程。本研究结果丰富了蜜蜂OBPs表达特性的研究数据,同时也为探讨昆虫OBPs广泛的生理功能奠定了基础。
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关键词
意大利蜜蜂
气味结合蛋白
motif
预测
分析
荧光定量PCR
时序表达
分析
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职称材料
题名
金银花MYB基因家族的功能鉴定与组织表达差异分析
1
作者
孙晓丽
武艳芳
王永丽
高璐
陈寻峰
蒋建雄
机构
江苏大学生物质能源研究院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第8期41-48,共8页
文摘
为了探究金银花MYB家族转录因子的调控功能,挖掘对绿原酸生物合成具有调控作用的MYB转录因子,从金银花的转录组数据中鉴定出37个MYB转录因子,并对其所编码蛋白的理化性质、进化关系、启动子序列、保守基序区域和不同组织中的相对表达量进行系统分析。保守基序(motif)区域分析结果表明,37个MYB转录因子含有保守的R2R3-MYB结构域,属于R2R3-MYB亚族。上游启动子元件分析结果显示,这些MYB转录因子参与植物激素、外界非生物胁迫、生长发育的应答等。组织差异性表达分析结果显示,LjMYB6-1、LjMYB12-2、LjMYB4为代表的12个转录因子的基因在白花中相对表达量较高,以LjMYB6、LjMYB11、LjMYB12为代表的12个转录因子的基因在青蕾中相对表达量较高,而金银花中的白花和青蕾是绿原酸含量最高的药用部位。系统进化树结果显示,LjMYB11、LjMYB4、LjMYB6、LjMYB6-1、LjMYB12、LjMYB12-2共6个MYB转录因子位于参与植物苯丙素代谢途径调控的进化分支中,表明它们具有潜在的调控苯丙素代谢途径的作用。综合分析,认为这6个转录因子可能参与对金银花绿原酸生物合成的调控。
关键词
金银花
MYB
转录因子
功能
分析
组织表达
motif分析
分类号
S567.790.1 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
气味结合蛋白OBPs在意大利蜜蜂头部表达模式的研究
被引量：
2
2
作者
赵慧婷
彭竹
黄丽
郭丽娜
杜亚丽
吕建华
机构
山西农业大学生命科学学院
山西农业大学动物科技学院
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2021年第5期1229-1236,共8页
基金
国家自然科学基金(31502021)
山西省“省1331”高校科技创新(2019L0357)。
文摘
昆虫气味结合蛋白(OBPs)是脂溶性化学物质的载体,参与了嗅觉识别和化学传输等生理过程。本研究利用MEME在线软件对意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica OBPs基因家族21条氨基酸序列进行Motif预测分析;采用RT-PCR初步筛选出在意大利蜜蜂头部表达量较高的OBPs基因,然后利用qPCR技术对筛选出的基因进一步分析其在不同日龄内勤蜂头部的表达情况。结果表明,在预测获得的6个motif中,motif 1为21个OBPs所共有,具有极高的保守性,推测该序列元件可能是意大利蜜蜂OBPs与底物结合的区域;表达谱分析结果表明,13个OBPs基因的凝胶电泳条带明显(即在头部的表达量较高),且大多数基因在4日龄时表达量达到最高值,推测这类蛋白可能参与了幼虫信息素和糖类物质的识别过程。本研究结果丰富了蜜蜂OBPs表达特性的研究数据,同时也为探讨昆虫OBPs广泛的生理功能奠定了基础。
关键词
意大利蜜蜂
气味结合蛋白
motif
预测
分析
荧光定量PCR
时序表达
分析
Keywords
Apis mellifera ligustica
odorant binding proteins
motif
predictive analysis
quantitative real-time PCR
temporal expression analysis
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
S89 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
金银花MYB基因家族的功能鉴定与组织表达差异分析
孙晓丽
武艳芳
王永丽
高璐
陈寻峰
蒋建雄
《江苏农业科学》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
气味结合蛋白OBPs在意大利蜜蜂头部表达模式的研究
赵慧婷
彭竹
黄丽
郭丽娜
杜亚丽
吕建华
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2021
2
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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