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Application of molecular interaction volume model in separation of Sn-Zn alloy by vacuum distillation 被引量:1
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作者 孔令鑫 杨斌 +4 位作者 李一夫 徐宝强 韩龙 刘大春 戴永年 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS 2013年第12期3372-3378,共7页
The activity of components of Sn-Zn binary alloy system was predicted based on the molecular interaction volume model (MIVM). The calculated values are in good agreement with available experimental data of activitie... The activity of components of Sn-Zn binary alloy system was predicted based on the molecular interaction volume model (MIVM). The calculated values are in good agreement with available experimental data of activities, which indicates that this model is of stability and reliability because the MIVM has a good physical basis. The vapor-liquid phase equilibrium of Sn-Zn alloy system in vacuum distillation was calculated as a function of the activity coefficient. The results show that the content of Sn in vapor phase is 4.2x 10-7 (mass fraction) while in liquid phase it is 90% (mass fraction) at 1 073 K, and the content of Sn in vapor phase increases with increasing the melt temperature and content of Sn in liquid phase. Vacuum distillation experiments were carried out on Sn-Zn alloy for the proper interpretation of the results of the MIVM in the temperature range of 973-1 273 K under pressures of 15-200 Pa. The experimental results show that the content of Sn in vapor phase is 5x 10 6 (mass fraction) while in liquid phase it is 90% (mass fraction) under the operational condition of 1 073 K, 100 rain and 15 Pa. The experimental results are in good agreement with the predicted values of the MIVM for Zn-Sn binary alloy system. 展开更多
关键词 vacuum distillation molecular interaction volume model (MIVM) SEPARATION
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不同分子结构表面活性剂复配体系对超稠油乳化降黏影响 被引量:1
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作者 陈阳 罗进 +5 位作者 王典林 杨祖国 杨鹏 陈勇 钟翔 唐丽 《化工进展》 北大核心 2025年第7期3838-3849,共12页
为了实现塔河油田超稠油高效乳化降黏,本文对8种表面活性剂(阴离子、阳离子、非离子、两性离子)进行筛选复配,构建了一种高效降黏的超稠油降黏体系。通过旋转流变仪在宏观尺度对超稠油进行物性分析,对单一、复配表面活性剂进行降黏效果... 为了实现塔河油田超稠油高效乳化降黏,本文对8种表面活性剂(阴离子、阳离子、非离子、两性离子)进行筛选复配,构建了一种高效降黏的超稠油降黏体系。通过旋转流变仪在宏观尺度对超稠油进行物性分析,对单一、复配表面活性剂进行降黏效果评价;通过偏光显微镜、扫描冷冻电子显微镜(SEM)在微观尺度对表面活性剂微观形貌、粒径尺寸及交联结构进行了表征,获得了宏观和微观尺度下复配体系乳化性能与稠油降黏性能的关系。实验结果表明:十二烷基硫酸钠(SDS)与辛基酚聚氧乙烯醚(OP-10)的复配体系,在质量比1∶1、复配浓度1.0%、油水比3∶7、掺稀比0.5∶1条件下降黏效果最佳,降黏率最高达到98.81%;表面活性剂微观交联网状结构、微观OP-10聚氧乙基长链和SDS硫酸根基团可与超稠油分子充分结合,促进油水界面膜形成,最终乳化超稠油降黏,本文构建的超稠油降黏体系为塔河油田的高效降黏提供了技术支持。 展开更多
关键词 超稠油 乳化降黏 表面活性剂 微观形貌 分子模型
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皮秒脉冲激光对4H-SiC材料内部烧蚀改性的分子动力学模拟研究 被引量:1
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作者 华军 谢云龙 +2 位作者 黄磊 王宇烜 姚建武 《激光技术》 北大核心 2025年第4期597-603,共7页
为了分析超快脉冲激光与4H-SiC在原子尺度的相互作用,采用双温模型的分子动力学方法,模拟研究了皮秒激光烧蚀4H-SiC内部的表现过程,并对不同激光能量强度辐照下4H-SiC内部的熔化温度、温度场、原子轨迹、烧蚀区域进行了分析。结果表明,... 为了分析超快脉冲激光与4H-SiC在原子尺度的相互作用,采用双温模型的分子动力学方法,模拟研究了皮秒激光烧蚀4H-SiC内部的表现过程,并对不同激光能量强度辐照下4H-SiC内部的熔化温度、温度场、原子轨迹、烧蚀区域进行了分析。结果表明,皮秒激光与4H-SiC相互作用的过程主要是热烧蚀,烧蚀过程在激光脉冲结束后才会剧烈进行,且激光能量强度越大烧蚀过程越剧烈,烧蚀区域也越不规则;4H-SiC晶格熔化温度与体系压强有关,当系统体系压强为6.1 GPa时,晶格熔化温度为3230 K,高于其常压下晶格熔化温度2827 K约400 K,且当体系压强越大时,晶格熔化所需温度越高。这一结果为皮秒激光用于隐形切割4H-SiC提供了理论参考。 展开更多
关键词 激光技术 隐形切割 分子动力学 双温模型 4H-SIC
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汉麻籽多肽靶向抑制胰脂肪酶/胆固醇酯酶的分子作用机制 被引量:3
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作者 尹浩 朱将雄 +3 位作者 赵海云 钟宇 王丹凤 邓云 《食品科学》 EI CAS 北大核心 2025年第2期38-49,共12页
采用酶活动力学、联合抑制、荧光光谱、等温滴定量热法和分子对接等技术系统探究两种多肽(APAM和RLPA)对胰脂肪酶(pancreatic lipase,PL)和胆固醇酯酶(cholesterol esterase,CE)活性调控效果及分子结合机制。结果表明,RLPA对PL和CE具有... 采用酶活动力学、联合抑制、荧光光谱、等温滴定量热法和分子对接等技术系统探究两种多肽(APAM和RLPA)对胰脂肪酶(pancreatic lipase,PL)和胆固醇酯酶(cholesterol esterase,CE)活性调控效果及分子结合机制。结果表明,RLPA对PL和CE具有更强的抑制活性,其半抑制浓度分别为(79.62±3.20)μmol/L和(301.27±14.40)μmol/L。抑制动力学分析表明APAM对两种酶的抑制机制为竞争性抑制,而RLPA则为混合性抑制。联合抑制表明APAM和RLPA在低浓度下均可与奥利司他协同抑制PL和CE,但在高浓度下协同作用减弱,甚至出现拮抗现象。荧光光谱结果表明两种多肽可以通过与PL和CE发生结合产生静态猝灭,改变了酶中脂肪族氨基酸的疏水环境。等温滴定量热法证明多肽与酶的结合过程是自发且放热,主要通过氢键和静电相互作用实现。分子对接模拟进一步分析表明氢键、盐桥和阳离子-π相互作用在多肽与酶的结合中起着至关重要的作用。这项研究丰富了对多肽与PL和CE的相互作用机制的认识,为开发基于汉麻籽蛋白的功能性食品提供了科学依据。 展开更多
关键词 脂质消化酶 抑制机制 荧光光谱 等温滴定量热法 分子模拟
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不同煤阶煤大分子模型构建及对比 被引量:3
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作者 张晨 张松航 +3 位作者 唐书恒 张守仁 李哲 范志辉 《现代地质》 北大核心 2025年第3期839-855,共17页
煤大分子模型是研究煤的物理化学性质和高效利用的基础,然而,当前尚缺乏反映不同煤阶煤性质的大分子模型的构建和对比。为此,本研究利用工业分析和元素分析,以及核磁共振碳谱、红外光谱、X射线光电子能谱等测试手段,结合前人数据,构建... 煤大分子模型是研究煤的物理化学性质和高效利用的基础,然而,当前尚缺乏反映不同煤阶煤性质的大分子模型的构建和对比。为此,本研究利用工业分析和元素分析,以及核磁共振碳谱、红外光谱、X射线光电子能谱等测试手段,结合前人数据,构建并搜集了河曲煤、孝义煤、店坪煤、高阳煤、阳泉煤、赵庄煤等横跨褐煤到无烟煤(R_(O)=0.46%~3.21%)的13个不同煤阶煤大分子模型序列。煤大分子结构参数显示,随煤阶升高,芳香结构中芳碳率呈3阶段增加演化趋势;桥周比、桥接芳碳均线性增加,侧支芳碳、氧接芳碳在煤变质第一次跃变点以前快速减少。脂肪结构中脂碳率与芳碳率相反,呈3阶段减小趋势;甲基碳第一次跃变点之前增加最后减小;亚甲基碳呈波动变化与三次煤化跃变对应;氧接脂碳的变化情况规律不明显。含氧官能团含量则随煤阶的升高而减少。范德华能和键伸缩能的降低对分子稳定性起主导作用,氢键能只在低阶煤(褐煤)和中阶煤(长焰煤、气煤)及分子之间起作用。低阶煤(褐煤)和中阶煤(长焰煤到瘦煤)的多分子总能量低于等量单分子的能量,而高阶煤(贫煤和无烟煤)由于π-π作用多分子能量高于等量单分子能量。总体上,文中所建大分子模型序列反映了煤变质规律,揭示了煤分子能量构成。研究成果有望能为进一步的煤大分子模拟工作提供基础煤分子构型。 展开更多
关键词 分子模型 官能团 能量构型 煤阶
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考虑货车影响的匝道合流区车辆微观换道行为建模
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作者 龙科军 寇诗雨 +3 位作者 邢璐 高志波 唐幼仪 费怡 《交通运输系统工程与信息》 北大核心 2025年第3期117-131,共15页
为精确刻画匝道合流区客货混行条件下的车辆微观换道行为,本文以量化客货交互为切入点,构建并验证考虑货车影响的微观换道模型。首先,引入“压迫”概念,构建改进Morse势函数模型描述周边货车行驶对小汽车横纵驾驶行为产生的“压迫”影响... 为精确刻画匝道合流区客货混行条件下的车辆微观换道行为,本文以量化客货交互为切入点,构建并验证考虑货车影响的微观换道模型。首先,引入“压迫”概念,构建改进Morse势函数模型描述周边货车行驶对小汽车横纵驾驶行为产生的“压迫”影响;随后,分析小汽车换道过程中的横纵向“压迫”变化,提出一种考虑货车“压迫”影响的车辆换道决策模型(Modified Morse-Based Lane-Changing model,MMBLC);最后,基于实测轨迹数据进行数值仿真,验证模型的稳定性与有效性,并进一步利用Python与SUMO(Simulation of Urban Mobility)联合仿真,对比MMBLC模型和现有换道模型在交通流中的表现。结果表明:在稳定性分析中,MMBLC模型对交通流的影响更小,恢复稳定的速度更快;在货车占比30%和交通量3600 veh·h-1的主路3车道客货混行匝道合流区中,MMBLC模型相比LC2013和MOBIL(Model of Optimal Control Based on Interacting Trajectories)模型,换道成功率分别提高11.9%和53.1%,危险场景占比分别降低10.5%和52.8%。 展开更多
关键词 交通工程 换道模型 分子动力学 客货混行 货车压迫 匝道合流区
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Bayesian inference towards the resolution of molecular evolution: application to the “Trichoderma harzianum sensu lato” clade
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作者 Druzhinina I S Kubicek C P 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期458-458,共1页
The Hypocrea lixii/Trichoderma harzianum species aggregate contains a group of taxa (H. lixii /T. harzianum, T. aggressivum, T. tomentosum, T. cerinum, T. velutinum, H. tawa) of which some (e.g. T. harzianum) are impo... The Hypocrea lixii/Trichoderma harzianum species aggregate contains a group of taxa (H. lixii /T. harzianum, T. aggressivum, T. tomentosum, T. cerinum, T. velutinum, H. tawa) of which some (e.g. T. harzianum) are important for biocontrol of plant pathogenic fungi in agriculture, whereas others are aggressive pathogens of Agaricus spp. and Pleurotus spp. in mushroom farms (T. aggressivum), or opportunistic pathogens of immunocompromised mammals including humans (T. harzianum). We characterized the evolutionary properties of three genomic regions in Hypocrea/Trichoderma: the internal transcribed spacer regions ITS1 and 2 of rDNA, the large intron of translation elongation factor 1-alpha (tef1a), and a portion of the large exon of the endochitinase 42 gene (ech42), selected the best model which describes the evolution of every fragment, tested the molecular clock hypothesis and made an estimation of the usability of the combined three fragments data matrix for the phylogenetic analysis of the genus as a whole as well as on the level of the holomorphic H. lixii/T. harzianum species clade and separate clonal lineages. To this end, we applied Bayesian phylogenetic inferences to 124 sequences of ITS1 and 2 and of the large tef1a intron, and to 64 ech42 gene sequences to resolve the evolution of H. lixii/T. harzianum with respect to the position of other taxa with closely related phenotypes. The resulting phylogram clearly identified T. aggressivum, T. velutinum, H. tawa, T. cerinum and T. tomentosum as phylogenetic species, and in addition identified three new unknown phylogenetic species as members of this clade. The clear distinction between T. tomentosum and T. cerinum was not recognized in all trees, but was supported by multivariate analysis of phenotype micro arrays. In contrast, H. lixii/T. harzianum did not form a single phylogenetic species in this study, as its monophyly was not supported in any analysis. Strains morphologically identified as H. lixii or T. harzianum formed either a proliferating megaclade (three loci combined tree) or appeared as several independent branches on the star-like phylogram (ITS1 and 2 and large tef1a intron) . However most terminal clades had a high posterior probability and thus fulfilled the criterion to consider their member isolates as a phylogenetic species. The clade containing the ex-neotype strain of T. harzianum included exclusively clonally propagating isolates from temperate climates, and was clearly distinguished from all other “H. lixii/T. harzianum” lineages by multivariate analysis of phenotype microarray data. We propose that only this lineage should be regarded as T. harzianum sensu stricto, and that the other lineages be regarded as T. harzianum sensu lato until phenetic characters have been defined which allow their description as separate taxa. 展开更多
关键词 分子进化 进化枝 贝叶斯定理 rDNA 木霉属 真菌
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“E+C”混合式教学在动物分子生物学课程的探究与实践
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作者 金玉兰 罗丽健 +1 位作者 陈学秋 吴小锋 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第11期1729-1736,共8页
动物分子生物学课程是动物医学和动物科学2个专业的核心专业基础课,讲授分子生物学的基本规律和原理,及其在动物科学研究工作中的应用和进展,对学生在动物科学领域的深入学习和研究能力的培养具有基础性的地位和作用。信息化浪潮下,数... 动物分子生物学课程是动物医学和动物科学2个专业的核心专业基础课,讲授分子生物学的基本规律和原理,及其在动物科学研究工作中的应用和进展,对学生在动物科学领域的深入学习和研究能力的培养具有基础性的地位和作用。信息化浪潮下,数字化教育融合传统教学模式的需求逐渐增加,本文根据教学团队在动物分子生物学课程多年的教学实践,从教学资源建设、教学内容重构、学时调整和考评方式完善4个方面入手,围绕线上自主学习“E(Electronic-Learning)”、线下课堂精讲“C(Classroom)”和课后拓展,构建线上线下混合式教学模式,即“E+C”混合式教学模式,将线下课堂教学和线上自主学习进行有机融合。线下教学注重理论和知识体系的完整性,线上内容注重科普和趣味性,更易激发学生的学习兴趣和热情。经5年的实践证明,“E+C”混合式教学模式具有良好的教学效果,学生反馈本课程收获大,线下教学与线上学习连接紧密和互补性强,对专业知识的掌握具有很强的助力,同时也培养学习的内驱力,提高知识的获得感,显著提升教学效果。 展开更多
关键词 动物分子生物学 “E+C”混合式教学模式 课程建设
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抑郁症动物模型的建立及评价方法研究进展 被引量:2
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作者 刘子轩 霍清 +2 位作者 孙雅煊 戴雪伶 李昕 《中国实验动物学报》 北大核心 2025年第2期249-258,共10页
抑郁症是一种常见的慢性精神疾病,抑郁症动物模型被广泛应用于抑郁症发病机制的研究和抗抑郁新药的研发,其模拟人类抑郁症状的同一性和可靠性会直接影响研究结果。然而,目前还尚未发现与人类抑郁症发病完全契合的动物模型,阻碍了对抑郁... 抑郁症是一种常见的慢性精神疾病,抑郁症动物模型被广泛应用于抑郁症发病机制的研究和抗抑郁新药的研发,其模拟人类抑郁症状的同一性和可靠性会直接影响研究结果。然而,目前还尚未发现与人类抑郁症发病完全契合的动物模型,阻碍了对抑郁症的深入研究。然而通过采用科学、合理的造模和评价方法,能够在较大程度上模拟抑郁症的病理状态,为深入理解抑郁症的发病机制和进一步研发有效的抗抑郁药物提供基础。本文旨在通过综述几种常用的动物抑郁模型及行为测试方法,为研究者提供参考。 展开更多
关键词 抑郁症 动物模型 发病机制
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水热处理对银耳多糖溶出及物理特性的影响 被引量:2
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作者 朱叶力 王一涵 +3 位作者 谢清芸 滕建文 黄丽 夏宁 《食品工业科技》 北大核心 2025年第2期64-73,共10页
银耳多糖是银耳中的主要成分,其溶出规律影响多糖的物理特性。本文以Fick第二定律为基础构建常压热水浸提(HWE)及加压热水浸提(PHWE)银耳多糖的溶出动力学模型并解析相关参数,采用凝胶渗透色谱和流变仪对溶出过程中多糖的分子量和浸提... 银耳多糖是银耳中的主要成分,其溶出规律影响多糖的物理特性。本文以Fick第二定律为基础构建常压热水浸提(HWE)及加压热水浸提(PHWE)银耳多糖的溶出动力学模型并解析相关参数,采用凝胶渗透色谱和流变仪对溶出过程中多糖的分子量和浸提液的黏度特性进行表征。结果表明,HWE和PHWE的多糖溶出率随着浸提温度升高和浸提时间的延长而增大,最大多糖溶出率分别为42.75%和62.03%。二者的溶出动力学参数:溶出速率常数k、有效扩散系数D_s与表观活化能Ea分别为0.0128~0.0175和0.057~0.1509 min^(-1)、3.2532~4.4348和14.4428~38.2676 mm^(2)/min、2.82~6.38和19.49~31.43 kJ/mol,动力学曲线线性决定系数R2均大于0.87,溶出动力学符合Fick第二定律。此外,浸提温度的升高及浸提时间的延长均会降低多糖的分子量,且HWE的分子量分布范围明显大于PHWE的分子量分布范围,并表现出更高的表观黏度。 展开更多
关键词 银耳多糖 溶出 动力学模型 黏度 分子量
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基于结构导向集总的炼油全流程分子水平模拟研究 被引量:1
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作者 王杭州 陈起 +7 位作者 欧阳镫浩 孙兰霞 王正元 罗贯纬 田文君 杨德志 刘一心 袁子晴 《石油学报(石油加工)》 北大核心 2025年第2期319-331,共13页
基于结构导向集总开发了分子水平炼油全流程模拟方法,首先使用原油分子组成数据库和原油评价数据解析进料分子组成,其次根据各炼油装置反应机理和参数构建了各装置的分子水平模型,最后构建炼油全流程分子水平模型。基于此方法建立了A石... 基于结构导向集总开发了分子水平炼油全流程模拟方法,首先使用原油分子组成数据库和原油评价数据解析进料分子组成,其次根据各炼油装置反应机理和参数构建了各装置的分子水平模型,最后构建炼油全流程分子水平模型。基于此方法建立了A石化公司炼油全流程分子水平模型,包含12套炼油装置与182条反应规则。在8030种分子进料下,模型内发生反应46443种,涉及反应分子24380种,模拟计算耗时约42 min。各装置产物收率绝对误差小于5%,产物性质与实际值基本一致。全流程分子水平模型可指导分子水平的炼油流程设计与优化,促进企业数字化转型与智能化发展。 展开更多
关键词 分子管理 分子炼油 全流程分子水平模型 结构导向集总 反应动力学模型
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准东脱灰煤焦O_(2)/H_(2)O燃烧ReaxFF MD模拟仿真实验
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作者 钱琳 马超 陶超 《实验技术与管理》 北大核心 2025年第9期183-192,共10页
煤焦的反应性受其化学结构影响,该文基于碳-13固体核磁共振(^(13)C solid-state nuclear magnetic resonance,^(13)C-NMR)技术构建了准东脱灰煤焦大分子结构模型,采用反应力场分子动力学模拟方法(reactive force field molecular dynami... 煤焦的反应性受其化学结构影响,该文基于碳-13固体核磁共振(^(13)C solid-state nuclear magnetic resonance,^(13)C-NMR)技术构建了准东脱灰煤焦大分子结构模型,采用反应力场分子动力学模拟方法(reactive force field molecular dynamics,ReaxFF MD)对准东脱灰煤焦在O_(2)/H_(2)O条件下的燃烧过程进行模拟。结果表明:不同O_(2)/H_(2)O浓度下,C+H_(2)O气化和C+O_(2)氧化反应相互竞争,O、H、OH自由基对准东脱灰煤焦活性位的竞争程度不同。压力越高,则C+O_(2)氧化反应较C+H_(2)O气化反应的化学活性越大,燃烧程度也越深,故温度升高有利于提高煤焦的燃烧转化率、缩短燃尽时间。准东脱灰煤焦燃烧始于侧支链及脂肪碳的分解,随后稠环芳烃开环断裂为小分子结构碎片,与活性自由基相互作用形成燃烧产物。该文从分子层面直观地追踪了燃烧的中间产物及演变过程,有利于深入理解燃烧机理,为后续燃烧技术及应用提供理论支持。 展开更多
关键词 准东脱灰煤 ^(13)C-NMR 大分子结构模型 焦炭燃烧 反应分子动力学
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无烟煤聚集态分子模型的构建与验证 被引量:5
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作者 李金雨 李懿欣 +3 位作者 纪和 王永军 张河猛 王伟业 《煤炭转化》 北大核心 2025年第1期1-11,共11页
深入探究煤聚集态分子的结构特征对于理解煤的化学性质具有重要意义。以贵州林华煤为研究对象,利用工业分析、元素分析、固体核磁共振碳谱(^(13)C-NMR)分析、傅立叶红外光谱(FTIR)分析和X射线光电子能谱(XPS)分析等方法并结合ChemDraw... 深入探究煤聚集态分子的结构特征对于理解煤的化学性质具有重要意义。以贵州林华煤为研究对象,利用工业分析、元素分析、固体核磁共振碳谱(^(13)C-NMR)分析、傅立叶红外光谱(FTIR)分析和X射线光电子能谱(XPS)分析等方法并结合ChemDraw绘图软件得出了煤聚集态分子模型,最终采用实验测试与数值模拟相结合的手段验证了分子结构的合理性。结果表明:该煤样中的碳元素主要以芳香碳为主,芳环桥碳与周碳含量之比为0.33;氧元素主要以醚、酚、羧基、羰基等形式存在,氮元素主要以吡啶和吡咯形式存在,硫元素主要以砜型硫、亚砜和噻吩形式存在。构建了林华煤大分子平面结构模型,其分子式为C_(212)H_(156)O_(9)N_(2)S_(3),其中芳香结构单元包括1个苯环、6个萘环、2个菲环、2个蒽环、1个四元芳香环、1个五元芳香环、1个吡啶、1个吡咯、1个噻吩。利用Material Studio软件对煤大分子结构模型进行分子力学及分子动力学优化,得到林华煤聚集态分子模型,对优化后的模型进行密度校验、孔隙特征校验和甲烷吸附测试,证明了该模型的合理性。 展开更多
关键词 煤结构 聚集态模型 分子模拟 结构优化 动力学模拟
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X射线辐照铝箔热效应多尺度建模模拟研究
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作者 刘佳文 范杰清 +7 位作者 赵强 范闯 张硕 张芳 薛碧曦 公延飞 郝建红 董志伟 《强激光与粒子束》 北大核心 2025年第9期166-172,共7页
通过多尺度建模模拟,同时考虑电子系统和晶格系统的温度变化,选用TTM-MD模型开展X射线与材料相互作用时的热效应仿真模拟,对X射线辐照铝箔的能量沉积及其在材料内的热传导过程进行深入研究。通过分析X射线能量对铝箔热效应的具体影响,... 通过多尺度建模模拟,同时考虑电子系统和晶格系统的温度变化,选用TTM-MD模型开展X射线与材料相互作用时的热效应仿真模拟,对X射线辐照铝箔的能量沉积及其在材料内的热传导过程进行深入研究。通过分析X射线能量对铝箔热效应的具体影响,得到了电子和晶格温度、材料密度等物理参数随时间的演化规律。在X射线辐照铝箔的过程中,X射线的能量被铝箔材料吸收并转化为热能,这种加热效应会导致其表面密度下降并逐渐向深层沉积;同时,辐照引起的温度升高还导致了铝箔内部压力的动态响应,先急剧增加后逐渐稳定。 展开更多
关键词 铝箔 X射线 双温模型 分子动力学 TTM-MD模型
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西安市大气PM_(2.5)分子演化和来源对其氧化潜势的影响 被引量:1
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作者 王帝伟 沈振兴 +5 位作者 白鸽子 李昊楠 黄沙沙 杨雪婷 孙健 徐红梅 《中国环境科学》 北大核心 2025年第2期629-636,共8页
为探究西安市大气细颗粒物(PM_(2.5))氧化潜势(OP)的季节变化及来源,采用二硫苏糖醇(DTT)法测定了质量归一化的OP水平(OP^(DTTm)),分析了PM_(2.5)化学组分对OP的影响,结合正矩阵因子分解耦合人工神经网络-多层感知器(PMF-ANN-MLP)模型... 为探究西安市大气细颗粒物(PM_(2.5))氧化潜势(OP)的季节变化及来源,采用二硫苏糖醇(DTT)法测定了质量归一化的OP水平(OP^(DTTm)),分析了PM_(2.5)化学组分对OP的影响,结合正矩阵因子分解耦合人工神经网络-多层感知器(PMF-ANN-MLP)模型定量排放源对OP^(DTTm)的贡献.结果表明:西安市大气OP^(DTTm)在夏季最高((13.2±5.4)pmol/(min·μg)),冬季最低((5.6±2.7)pmol/(min·μg)).相关性分析结果表明,含硝基的芳香族化合物和羧酸类有机分子对OP^(DTTm)生成具有重要作用,其分子丰度的差异是导致OP^(DTTm)呈现季节变化的主要原因.源解析揭示,扬尘源对OP^(DTTm)的贡献在春季最高(26.7%),夏季交通源的贡献最高(35.1%),二次源的贡献在秋季最高(23.2%),生物质燃烧(24.5%)和燃煤(25.8%)的贡献均在冬季最高.研究结果可为制定有效的大气污染防治措施以保护人群健康提供科学依据. 展开更多
关键词 氧化潜势 分子组成 源解析 MLP模型
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新型α-葡萄糖苷酶Aga432分子改造及酶学性质分析 被引量:1
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作者 路涵 方婷 +2 位作者 牛晓旭 翁晓敏 严芬 《食品工业科技》 北大核心 2025年第11期185-193,共9页
本研究旨在从类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)中克隆新型α-葡萄糖苷酶Aga432基因并通过定点突变提高α-葡萄糖苷酶Aga432的活性。从Paenibacillus sp.全基因组中获得表达α-葡萄糖苷酶的基因片段,进行序列分析,通过同源建模与分子对接... 本研究旨在从类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)中克隆新型α-葡萄糖苷酶Aga432基因并通过定点突变提高α-葡萄糖苷酶Aga432的活性。从Paenibacillus sp.全基因组中获得表达α-葡萄糖苷酶的基因片段,进行序列分析,通过同源建模与分子对接并构建基因工程菌获得8株正向突变菌株,对重组Aga432和相对活性最高的正向突变体AT-2进行酶学性质研究,并探究重组α-葡萄糖苷酶Aga432、AT-2对生物膜的分散作用,评价其对小鼠胚胎成纤维细胞的毒性。结果表明,Aga432比活力为45.05 U/mg,突变体AT-2比活力为84.09 U/mg。与Aga432相比,AT-2的最适反应温度、最适反应pH改变并不明显,热稳定性有较大的提高,并且在酸性条件下较为稳定。突变体AT-2的K_(m)为Aga432的2.18倍,V_(max)值为Aga432的3.19倍,K_(cat)值为Aga432的2.33倍,K_(cat)/K_(m)值为Aga432的1.07倍。体外细胞实验表明,15.0~30.0μg/mL的Aga432、AT-2对细胞无明显毒性作用,具有良好的细胞相容性。生物膜分散作用结果表明,10.0~50.0μg/mL浓度的两种重组α-葡萄糖苷酶对细菌生物膜具有显著的分散作用(P<0.0001)。本研究通过分子改造提升α-葡萄糖苷酶Aga432的热稳定性,为开发新型α-葡萄糖苷酶以及后续定向改造研究提供了基础和参考依据。 展开更多
关键词 Α-葡萄糖苷酶 同源建模 分子对接 酶学性质 生物膜分散作用
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ChemRB:基于双向分子环约束的新型生成模型
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作者 王庆勇 唐良贵 +1 位作者 王振宇 辜丽川 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期45-59,共15页
在药物发现的早期阶段,深度生成模型正逐渐成为分子设计的关键工具。简化分子线输入系统(simplified moleaclar input line entry system,SMILES)作为标准的化学表示法,被广泛用于模型训练与生成。然而,由于分子环系统线性表示的非唯一... 在药物发现的早期阶段,深度生成模型正逐渐成为分子设计的关键工具。简化分子线输入系统(simplified moleaclar input line entry system,SMILES)作为标准的化学表示法,被广泛用于模型训练与生成。然而,由于分子环系统线性表示的非唯一性和非方向性,现有的单向编码器在捕捉样本全局语义结构和生成有效分子环时存在局限性。因此,提出一种名为Chemical RWKV BERT(ChemRB)的方法,旨在从海量的未标记数据中深度挖掘双向信息。为实现这一目标,创新性地设计了2个预训练任务:环级特征预测与全局跨度闭合预测。这些预训练任务不仅为模型提供了丰富多元的上下文信息,更进一步提升了其对复杂分子结构特性的深入理解。实验结果显示:ChemRB模型不仅在性能上取得了显著提升,而且在新分子/样本的评估指标上也达到了最优的基准性能。结果充分验证了ChemRB在精准捕获分子固有结构信息方面的有效性,为其在相关领域的应用提供了坚实的实证基础。最后,通过在EGFR抑制剂上的测试和应用,进一步验证了ChemRB模型的实用性和广泛应用前景。 展开更多
关键词 分子建模 分子生成 分子环系统 SMILES 深度学习
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基于不同密度组分的不黏煤大分子结构及聚集态结构模型构建
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作者 白来平 李振 +4 位作者 姚雷 廉鑫 谢永鑫 王宏 袁雪 《洁净煤技术》 北大核心 2025年第S1期57-66,共10页
为深入解析南露天煤的分子结构特征,促进煤炭资源的高效开发与清洁利用,采用工业分析、元素分析、X射线光电子能谱、固体核磁等表征手段,确定了南露天煤中的结构参数,再结合分子动力学计算,构建了南露天煤的低密度组(NLTL)和高密度组(NL... 为深入解析南露天煤的分子结构特征,促进煤炭资源的高效开发与清洁利用,采用工业分析、元素分析、X射线光电子能谱、固体核磁等表征手段,确定了南露天煤中的结构参数,再结合分子动力学计算,构建了南露天煤的低密度组(NLTL)和高密度组(NLTH)的大分子结构模型,并对构建的大分子结构模型进行优化,得到NLTL和NLTH大分子最低能量结构及能量参数,并按照原煤真相对密度以及原煤中的低密度组与高密度组的比例构建了南露天原煤(NLTC)的聚集态结构。结果表明:南露天煤具有氧含量较高和硫含量较低的特点,其中氧元素主要以羧基、酚羟和醚等形式存在,比例约为1∶1∶1,NLTL中氮元素主要以吡咯形式存,NLTH中氮元素主要以吡啶形式存在。NLTL和NLTH结构中的芳香碳为碳骨架中的主体,芳香碳占比分别为61.32%、57.06%,脂肪碳占比分别为25.15%、28.99%,XBP分别为0.140和0.221,NLTL的芳香结构主体是苯和萘,NLTH芳香结构主体是萘,芳环碳原子总数分别为81和78个,NLTL和NLTH大分子结构的分子式分别为C_(132)H_(109)N_(3)O_(28)和C_(136)H_(117)N_(3)O_(25),分子量分别为2 185.32和2 193.43,模型优化后,NLTL和NLTH的总势能分别为2 048.05 kJ/mol和1 612.60 kJ/mol,NLTH的总势能更低,其大分子结构更加稳定。在模拟构建聚集态结构的过程中,分别以26个NLTL和25个NLTH的大分子结构模拟真实密度下的南露天原煤的聚集态结构,通过几何优化和退火动力学模拟得到能量最低且稳定的聚集态结构,其优化后总势能下降了7 470.57 kJ/mol,其中范德华能降低最多,其次是扭转能、角能、静电能和反转能,最终得到密度为1.45 g/cm^(3)的NLTC聚集态结构,这与原煤密度相符。 展开更多
关键词 分子模型 结构优化 动力学模拟 聚集态结构
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超声波降解桃胶多糖动力学及其对结构的影响
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作者 徐美雯 罗良亢 +4 位作者 杨弛 李嘉澍 夏永军 艾连中 张汇 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第15期208-216,共9页
为探究超声波降解纯化后桃胶多糖(peach gum polysaccharide,PGP)的规律特征,以多糖重均分子质量(molecular mass,M_(w))为因变量,考察了超声波时间、多糖浓度和超声波振幅对降解效果的影响,分析PGP降解动力学并探讨超声波降解对其结构... 为探究超声波降解纯化后桃胶多糖(peach gum polysaccharide,PGP)的规律特征,以多糖重均分子质量(molecular mass,M_(w))为因变量,考察了超声波时间、多糖浓度和超声波振幅对降解效果的影响,分析PGP降解动力学并探讨超声波降解对其结构的影响。结果表明,在质量浓度5 mg/mL,振幅30%下,PGP的M_(w)随时间的增加先快速下降再缓慢降低;多糖质量浓度和超声波振幅分析表明,低浓度有助于PGP的降解,10 min后,浓度10 mg/mL的降解效果更明显,同时,振幅越大,越利于PGP的降解。动力学分析表明,超声波降解PGP符合二阶动力学方程(1/M_(t)-1/M_(0)=k_t),其降解速率随浓度增加呈先升后降趋势,于10 mg/mL达到最大降解速率5.317×10^(-5)[1/(kDa·min)];振幅10%~30%时,降解速率急剧上升,30%~50%时,降解速率趋于平缓,表明振幅30%为高效降解的阈值。进一步以质量浓度10 mg/mL,振幅30%制备了不同超声波时间(1、2、5、10、20、30 min)的降解产物(UP1~UP30),通过分子参数、溶液构象和单糖组成进行初步结构表征。结果表明,超声波降解了PGP主链,分子质量分布变窄,溶液构象从球形结构向无规线团转变。该研究揭示了超声波对PGP降解的规律特征及其动力学机制,表明超声波降解可有效断裂PGP主链,优化其分子质量分布和溶液构象,为拓展其在食品、医药等领域的应用提供了理论依据。 展开更多
关键词 桃胶多糖 超声波降解 分子质量 动力学模型 降解速率
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蜂巢小甲虫气味结合蛋白OBP3的分子对接
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作者 聂佳婷 刘德荣 +1 位作者 王超 刘召 《西南大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第7期82-92,共11页
以蜂巢小甲虫(Aethina tumida)触角特异性表达的气味结合蛋白(odorant binding proteins,OBPs)为研究对象,通过分子对接技术筛选调控昆虫嗅觉行为的寄主挥发物。首先利用Swiss-Model软件进行同源建模,进而通过Procheck、Verify 3D和ERRA... 以蜂巢小甲虫(Aethina tumida)触角特异性表达的气味结合蛋白(odorant binding proteins,OBPs)为研究对象,通过分子对接技术筛选调控昆虫嗅觉行为的寄主挥发物。首先利用Swiss-Model软件进行同源建模,进而通过Procheck、Verify 3D和ERRAT对蛋白质模型构象合理性进行评价;最后用AutoDock软件对OBP3与挥发物进行分子对接。结果显示:在拉氏构象图中,90%以上的氨基酸位于最合理区,Verify 3D评分>0.2,ERRAT值达98.2%,说明三维结构准确合理。分子对接显示,5种对蜂巢小甲虫具有行为调控作用的寄主挥发物均可通过疏水作用结合于OBP3疏水结合腔。其中,对蜂巢小甲虫有引诱作用的(Z,Z,Z)-9,12,15-十八碳三烯酸乙基酯和十六烷酸乙酯,结合能分别为-6.34 kcal/mol和-5.48 kcal/mol;对蜂巢小甲虫有驱避作用的二十四烷、(Z)-9-十八碳烯酰胺和5-甲基-2-苯基-1H-吲哚,结合能分别为-5.70 kcal/mol、-5.53 kcal/mol和-6.80 kcal/mol。利用分子对接方法,通过比较寄主挥发物与OBP3结合能力的强弱,可快速、大批量筛选对蜂巢小甲虫嗅觉行为有潜在调控能力的挥发物。 展开更多
关键词 蜂巢小甲虫 挥发物 同源建模 分子对接 嗅觉识别
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