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基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析: 1; 作者张政希莫凡 +3 位作者郭妍徐学敏林标扬李伟《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期129-134,共6页; 从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA,构建小RNA的cDNA文库,然后用illum ina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序。从测序获得的序列数据中去除冗余数据后,与已知人类m iRNA序列数据库进行比对,获得IGROV-1/CP细胞m iRNA表达谱。以... 展开更多; 关键词卵巢癌顺铂耐药性 IGROV-1/CP细胞系 mirna illumina测序技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

高通量测序技术在猪miRNA功能研究中的研究进展: 2; 作者许栋何俊 +1 位作者贺长青马海明《猪业科学》 2017年第3期115-116,共2页; miRNA的研究是近几年生命科学领域的研究热点,该文对miRNA的形成及作用机制进行了论述。当前研究miRNA最主要的手段是高通量测序技术,文章对该技术的起源、发展、原理、分类及近几年在猪miRNA功能研究中的应用进行了综述。高通量测序技... 展开更多; 关键词猪高通量测序技术 mirna; 在线阅读下载PDF 职称材料

新一代测序技术应用于microRNA检测被引量：9: 3; 作者汤海明陈红 +2 位作者张静任景怡许宁《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期784-792,共9页; MicroRNAs（miRNAs）是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链RNA（~22nt）,在基因转录后调控中发挥至关重要的作用。越来越多的证据表明,miRNAs参与很多重要的生理和病理过程,例如发育、器官形成、调亡、细胞增殖、肿瘤发生等。近年... 展开更多; 关键词 microRNAs(mirnas)检测新一代测序技术新mirna检测 mirna靶基因检测; 在线阅读下载PDF 职称材料

高通量测序技术在植物MicroRNA研究中的应用被引量：1: 4; 作者康巧林《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期114-117,共4页; MicroRNA是一类广泛存在于动植物中长约21 nt的非编码小分子RNA,主要通过内切核苷酸或者翻译抑制调节基因转录后表达。植物MicroRNA在植物的生长发育、开花时序、新陈代谢及环境胁迫等方面起重要作用。简述了植物MicroRNA的生物发生、... 展开更多; 关键词高通量测序技术 solexa 454-FLX 小分子RNA mirna; 在线阅读下载PDF 职称材料

下一代测序技术数据分析进展: 5; 作者朱智东孙明明 +4 位作者王海彬郭长全牛申汤溢飞肖华胜《生物产业技术》 2014年第1期60-66,共7页; 简要综述了序列读取后对基因组的定位和比对后的分析进展，结合RNA测序、miRNA测序、捕获测序探讨了基因组数据分析及其应用。; 关键词测序技术数据分析 mirna 基因组; 在线阅读下载PDF 职称材料

果树MicroRNA检测技术研究进展被引量：1: 6; 作者李彦杰杨俊年刘仁华《中国南方果树》北大核心 2013年第5期47-49,共3页; 微RNA(MicroRNAs,miRNA)是一类广泛存在于真核生物中具有调控功能的内源性非编码RNA分子,miRNA表达谱系的差异与各种各样的生物调节途径有关。对目前果树miRNA研究中常见的检测方法——Northern blotting检测、ISH检测、miRNA芯片检测... 展开更多; 关键词 mirna 检测技术下一代测序法; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于高通量测序研究猪功能microRNA的研究进展被引量：1: 7; 作者张振倪和民 +3 位作者郭勇张永红邢凯王楚端《中国畜牧业》 2020年第1期83-86,共4页; microRNA(miRNA)是一类由大约22个核苷酸组成的小非编码RNA,广泛的参与了生物的各种生命活动。高通量测序技术为miRNA的发现、挖掘miRNA生物学功能提供了新的技术手段和平台。本文综述了高通量测序技术挖掘猪在脂肪代谢、肌肉发育、繁... 展开更多; 关键词繁殖生理高通量测序技术肌肉发育免疫应答核苷酸组成猪品种脂肪代谢 mirna; 在线阅读下载PDF 职称材料

细粒棘球绦虫miRNAs的鉴定及分析: 8; 作者郝力力李锐李必富《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期654-657,共4页; 细粒棘球绦虫具有复杂的基因调控模式,在中间宿主和终末宿主体内具有截然不同的生物学特性。miRNA是真核生物内存在的非常重要的调控因子,本研究采用Solexa高通量测序技术,对G1株原头蚴mi-croRNAs进行了鉴定和分析,总共发现了108条miRN... 展开更多; 关键词细粒棘球绦虫 mirnaS Solexa高通量测序技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

一种高通量自动化血浆miRNA文库构建方法及其跨批次性能评估被引量：1: 9; 作者么欣彤孙善月 +2 位作者刘雅晴石乐明郑媛婷《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期425-434,共10页; 目的建立一种适用于低起始量血浆样本的高通量(96样本/批次)、自动化miRNA文库构建方法,并系统评估该方法的可靠性与跨批次一致性。方法基于PerkinElmer公司的NEXTFLEX^(■)small RNA-seq试剂盒和Sciclone^(■)NGSx液体工作站,建立自动... 展开更多; 关键词二代测序 mirna测序技术(mirna-seq) 文库构建性能评估跨批次一致性; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析: 1; 作者张政希莫凡郭妍徐学敏林标扬李伟; 机构上海交通大学系统生物医学研究院浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院; 出处《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期129-134,共6页; 基金上海市科委纳米专项基金资助项目(05dz22321); 文摘从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA,构建小RNA的cDNA文库,然后用illum ina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序。从测序获得的序列数据中去除冗余数据后,与已知人类m iRNA序列数据库进行比对,获得IGROV-1/CP细胞m iRNA表达谱。以所获的序列长度与已知人类m iRNA数据库中序列长度差异不大于2和无碱基错配为限制条件,共找到53种已知m iRNA。按在cDNA文库测序中的出现频率计算,出现频率不大于10的低拷贝m iRNA最多,占检测到所有m iRNA种类的56.6%。说明illum ina通用测序技术能够在检测细胞内的各种小RNA序列的同时反应相对丰度信息,该研究利用上述新技术获得了顺铂耐药性IGROV-1/CP细胞系m iRNA表达种类和相对丰度的实验数据。; 关键词卵巢癌顺铂耐药性 IGROV-1/CP细胞系 mirna illumina测序技术; Keywords ovarian cancer cisplatin-resistance IGROV-1/CP cell line mirna illumina sequencing technology; 分类号 R737.31 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名高通量测序技术在猪miRNA功能研究中的研究进展: 2; 作者许栋何俊贺长青马海明; 机构湖南农业大学动物科学技术学院; 出处《猪业科学》 2017年第3期115-116,共2页; 基金基金项目:宁乡花猪基础研究(5026401-0315069); 文摘 miRNA的研究是近几年生命科学领域的研究热点,该文对miRNA的形成及作用机制进行了论述。当前研究miRNA最主要的手段是高通量测序技术,文章对该技术的起源、发展、原理、分类及近几年在猪miRNA功能研究中的应用进行了综述。高通量测序技术的出现促进了基因组学研究领域的发展,目前已成为猪转录组研究的重要手段,为猪的基因组学研究提供了一个高效的平台,为当前猪品种遗传改良、辅助育种选择工作提供了数据基础。; 关键词猪高通量测序技术 mirna; 分类号 S828 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名新一代测序技术应用于microRNA检测被引量：9: 3; 作者汤海明陈红张静任景怡许宁; 机构北京大学人民医院心内科瑞典卡罗林斯卡医学院医学系; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期784-792,共9页; 基金中华医学会临床医学科研专项基金(编号:09010060161)资助; 文摘 MicroRNAs（miRNAs）是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链RNA（~22nt）,在基因转录后调控中发挥至关重要的作用。越来越多的证据表明,miRNAs参与很多重要的生理和病理过程,例如发育、器官形成、调亡、细胞增殖、肿瘤发生等。近年来飞速发展的新一代测序技术在miRNA检测方面具有重要的应用。文章简要介绍了新一代测序技术3大平台的基本步骤和原理,测序数据的生物信息学分析方法以及新一代测序技术在miRNA方向的主要应用。相比于传统的miRNA检测方法,新一代测序技术具有通量高、对遗传物质检测完全且准确度高,可重复性好等优点,在探索新miRNA、miRNA互补链、miRNA编辑、miRNA异构体检测以及miRNA靶基因检测等方面具有巨大优势。随着新一代测序技术的不断发展,测序成本不断降低,在未来几年,新一代测序技术的使用率或将大大增加。新一代测序技术的不断应用将进一步促进人类对于miRNA在各种生理病理过程中的功能和调控的认识。; 关键词 microRNAs(mirnas)检测新一代测序技术新mirna检测 mirna靶基因检测; Keywords high throughput detection of microRNAs （mirnas） next generation sequencing new mirnas exploration target mRNA detection; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名高通量测序技术在植物MicroRNA研究中的应用被引量：1: 4; 作者康巧林; 机构北京林业大学生物科学与技术学院; 出处《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期114-117,共4页; 文摘 MicroRNA是一类广泛存在于动植物中长约21 nt的非编码小分子RNA,主要通过内切核苷酸或者翻译抑制调节基因转录后表达。植物MicroRNA在植物的生长发育、开花时序、新陈代谢及环境胁迫等方面起重要作用。简述了植物MicroRNA的生物发生、作用机制及调控功能,并在此基础上综述了高通量测序技术在植物MicroRNA研究中的最新应用进展。; 关键词高通量测序技术 solexa 454-FLX 小分子RNA mirna; Keywords High-throughput sequencing solexa 454-FLX small RNA mirna; 分类号 Q789 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名下一代测序技术数据分析进展: 5; 作者朱智东孙明明王海彬郭长全牛申汤溢飞肖华胜; 机构上海伯豪生物技术有限公司上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心; 出处《生物产业技术》 2014年第1期60-66,共7页; 基金上海市科委课题(13DZ2290600) (12DZ942500)资助; 文摘简要综述了序列读取后对基因组的定位和比对后的分析进展，结合RNA测序、miRNA测序、捕获测序探讨了基因组数据分析及其应用。; 关键词测序技术数据分析 mirna 基因组; 分类号 Q811.4 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名果树MicroRNA检测技术研究进展被引量：1: 6; 作者李彦杰杨俊年刘仁华; 机构重庆三峡学院生命科学与工程学院; 出处《中国南方果树》北大核心 2013年第5期47-49,共3页; 基金重庆市科委自然科学基金计划资助项目(cstc2012jjA80009) 重庆三峡学院项目(2008-sxxyqn-31)资助; 文摘微RNA(MicroRNAs,miRNA)是一类广泛存在于真核生物中具有调控功能的内源性非编码RNA分子,miRNA表达谱系的差异与各种各样的生物调节途径有关。对目前果树miRNA研究中常见的检测方法——Northern blotting检测、ISH检测、miRNA芯片检测、测序检测和基于RT-PCR的检测做一简单介绍。; 关键词 mirna 检测技术下一代测序法; 分类号 S66 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于高通量测序研究猪功能microRNA的研究进展被引量：1: 7; 作者张振倪和民郭勇张永红邢凯王楚端; 机构北京农学院动物科学技术学院中国农业大学动物科技学院; 出处《中国畜牧业》 2020年第1期83-86,共4页; 基金国家重点研发计划资助(2018YFD0501000) 现代农业产业技术体系北京市创新团队(BAIC02-2018) +1 种基金北京农学院青年教师科研基金(SXQN201807); 文摘 microRNA(miRNA)是一类由大约22个核苷酸组成的小非编码RNA,广泛的参与了生物的各种生命活动。高通量测序技术为miRNA的发现、挖掘miRNA生物学功能提供了新的技术手段和平台。本文综述了高通量测序技术挖掘猪在脂肪代谢、肌肉发育、繁殖生理、免疫应答等方面功能miRNA的研究进展,旨在为研究miRNA功能和猪品种的遗传改良提供新的理论基础和研究思路。; 关键词繁殖生理高通量测序技术肌肉发育免疫应答核苷酸组成猪品种脂肪代谢 mirna; 分类号 R73 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名细粒棘球绦虫miRNAs的鉴定及分析: 8; 作者郝力力李锐李必富; 机构西南民族大学生命科学与技术学院浙江省农业科学院农产品质量标准研究所; 出处《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期654-657,共4页; 基金西南民族大学中央高校基本科研业务费(11NZYQN06); 文摘细粒棘球绦虫具有复杂的基因调控模式,在中间宿主和终末宿主体内具有截然不同的生物学特性。miRNA是真核生物内存在的非常重要的调控因子,本研究采用Solexa高通量测序技术,对G1株原头蚴mi-croRNAs进行了鉴定和分析,总共发现了108条miRNAs,其中26条属于保守家族,82条是细粒棘球绦虫特有。; 关键词细粒棘球绦虫 mirnaS Solexa高通量测序技术; Keywords Echinococcus granulosus mirnas Solexa high-throughput sequencing technology; 分类号 S852.7 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一种高通量自动化血浆miRNA文库构建方法及其跨批次性能评估被引量：1: 9; 作者么欣彤孙善月刘雅晴石乐明郑媛婷; 机构复旦大学生命科学学院人类遗传学与人类学系; 出处《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期425-434,共10页; 基金上海市科技重大专项(2017SHZDZX01)。; 文摘目的建立一种适用于低起始量血浆样本的高通量(96样本/批次)、自动化miRNA文库构建方法,并系统评估该方法的可靠性与跨批次一致性。方法基于PerkinElmer公司的NEXTFLEX^(■)small RNA-seq试剂盒和Sciclone^(■)NGSx液体工作站,建立自动化miRNA文库构建方法。制备3类血浆参考物质(分别来自健康男性、健康女性和糖尿病患者)模拟临床血浆样本,并使用自动化建库方法进行4个批次文库构建实验。从miRNA检出种类、绝对定量、不同样本间相对定量及差异表达分析等层面评估方法性能及跨批次一致性。结果miRNA检出种类一致性:批次内和批次间并交比(Jaccard index)分别为0.61和0.62;miRNA表达水平绝对定量一致性:批次内和批次间Pearson相关系数平均值均为0.96;两个不同样本间相对定量水平在不同批次间的相关系数平均值为0.74,且超过60%的差异表达miRNA可在多个批次中检出。结论本研究建立了一种高通量自动化血浆miRNA文库构建方法,具有良好的批次内性能和跨批次一致性,可用于大型队列血浆miRNA文库构建实验。; 关键词二代测序 mirna测序技术(mirna-seq) 文库构建性能评估跨批次一致性; Keywords next generation sequencing microRNA sequencing(mirna-seq) library construction performance evaluation cross-batch concordance; 分类号 R-331 [医药卫生]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析	张政希莫凡郭妍徐学敏林标扬李伟	《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心	2009	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	高通量测序技术在猪miRNA功能研究中的研究进展	许栋何俊贺长青马海明	《猪业科学》	2017	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	新一代测序技术应用于microRNA检测	汤海明陈红张静任景怡许宁	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2012	9	在线阅读下载PDF 职称材料
4	高通量测序技术在植物MicroRNA研究中的应用	康巧林	《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心	2012	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	下一代测序技术数据分析进展	朱智东孙明明王海彬郭长全牛申汤溢飞肖华胜	《生物产业技术》	2014	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	果树MicroRNA检测技术研究进展	李彦杰杨俊年刘仁华	《中国南方果树》北大核心	2013	1	在线阅读下载PDF 职称材料
7	基于高通量测序研究猪功能microRNA的研究进展	张振倪和民郭勇张永红邢凯王楚端	《中国畜牧业》	2020	1	在线阅读下载PDF 职称材料
8	细粒棘球绦虫miRNAs的鉴定及分析	郝力力李锐李必富	《浙江农业学报》 CSCD 北大核心	2012	0	在线阅读下载PDF 职称材料
9	一种高通量自动化血浆miRNA文库构建方法及其跨批次性能评估	么欣彤孙善月刘雅晴石乐明郑媛婷	《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2022	1	在线阅读下载PDF 职称材料