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Research Progress in Digging and Validation of miRNA Target Genes Using Experimental Methods 被引量:1
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作者 Luo Xiao Bai Xi +4 位作者 Cai Hua Ji Wei Liu Xin Tang Li-li Zhu Yan-ming 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2012年第2期86-96,共11页
MicroRNAs (miRNAs) are a group of regulatory RNAs that regulate gene expression post-transcriptionally by the degradation or translational inhibition of their target messenger RNAs (mRNAs). Regulation is accomplis... MicroRNAs (miRNAs) are a group of regulatory RNAs that regulate gene expression post-transcriptionally by the degradation or translational inhibition of their target messenger RNAs (mRNAs). Regulation is accomplished when the 22-25 nucleotide miRNAs bind to complementary sequences in the 3'-untranslated regions (UTR). One barrier to miRNA research is to find target genes. Although computational target predictions have shed light on important aspects of microRNA target recognition, questions remain concerning the rates of false positives. In addition, we do not completely understand how microRNAs can recognize and regulate their targets. As such, experimental positive predictions and allow for an unbiased stu ap dy proaches are required, which can reflect in vivo processes, eliminating false of microRNA target recognition. In this review, we summarized experimental approaches that have been described for the identification and validation of mRNA targets associated with specific miRNAs. 展开更多
关键词 mirna target experimental validation
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基于瞬时表达系统的水稻miRNA靶基因快速验证系统的建立 被引量:3
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作者 胡积祥 曹雅倩 +5 位作者 朱秀梅 余超 田芳 杨凤环 陈华民 何晨阳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期57-63,共7页
旨在建立一种准确且快速的基于瞬时表达系统的水稻miRNA靶基因验证系统,为研究水稻miRNAs的生物学功能奠定基础。已有研究证实osa-miR169o剪切靶基因OsNF-YA4(LOC_Os03g48970.1)的mRNA,以此为参照,在烟草和水稻原生质体瞬时表达系统中将... 旨在建立一种准确且快速的基于瞬时表达系统的水稻miRNA靶基因验证系统,为研究水稻miRNAs的生物学功能奠定基础。已有研究证实osa-miR169o剪切靶基因OsNF-YA4(LOC_Os03g48970.1)的mRNA,以此为参照,在烟草和水稻原生质体瞬时表达系统中将miR169o前体基因分别与LUC表达载体、LUC-48970和LUC-48970m3融合表达载体瞬时共表达,通过CCD活体成像和Luminometor分析了共表达后LUC活性的动态变化。利用茎环qRT-PCR对miR169o的表达水平进行分析,获得靶基因验证的适合体系。在水稻原生质体体系中,LUC活性和miR169o表达水平在原生质体转化后逐渐增高;24 h时LUC活性最高,相应miR169o表达水平上升10倍左右。综合分析,在原生质体转化后24 h-36 h为适宜检测时间段。在烟草瞬时表达体系中,农杆菌注射72 h后LUC活性最强,而miR169o的表达在48 h后即可上调20倍。因此,农杆菌注射后48 h-72 h为适宜检测时间段。本系统为水稻miRNA靶基因的验证提供了一种简便、快速,且更接近于体内真实情况的实验方法。 展开更多
关键词 水稻 mirna 荧光素酶 靶基因验证 瞬时表达系统
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microRNA-96-5p靶向调控羊驼黑色素细胞中MITF基因的表达 被引量:6
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作者 张利环 马悦悦 +2 位作者 刘文艳 蓝吴涛 朱芷葳 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1229-1237,共9页
旨在预测并验证调控小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)基因表达的关键miRNA。使用在线软件对与MITF具有靶向关系的miRNAs进行预测。在羊驼黑色素细胞中,利用荧光定量PCR检测过表达和抑制表达m... 旨在预测并验证调控小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)基因表达的关键miRNA。使用在线软件对与MITF具有靶向关系的miRNAs进行预测。在羊驼黑色素细胞中,利用荧光定量PCR检测过表达和抑制表达miR-96-5p后MITF基因的表达量;通过免疫细胞化学技术对过表达和抑制表达miR-96-5p的细胞进行MITF特异抗体的染色。结果表明,miR-96-5p是调控MITF表达的一个关键miRNA,经荧光定量PCR、免疫细胞化学技术检测,当过表达miR-96-5p后,MITF mRNA水平不变,但其下游基因表达量极显著降低(P<0.01),MITF蛋白水平表达量与其下游基因的蛋白水平表达量全部极显著低于空白组(P<0.01),当抑制表达miRNA-96-5p后,MITF mRNA水平不变,但其下游基因表达量显著升高(P<0.01),MITF蛋白水平表达量与其下游基因的蛋白水平表达量全部极显著高于空白组(P<0.01)。miR-96-5p可以靶向结合MITF基因,在MITF转录后水平发挥调控作用,抑制MITF的转录,抑制MITF及其下游基因TYR、TYRP1、TYRP2的表达。 展开更多
关键词 miR-96-5p MITF mirnas预测 靶基因验证
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miR-194-5p靶向调控BCKDHA基因的表达 被引量:3
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作者 张莹姣 乔利英 +5 位作者 景炅婕 潘洋洋 马元 郭云利 魏琼 刘文忠 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1416-1423,共8页
旨在预测并验证调控支链氨基酸分解代谢的限速酶支链α-酮酸脱氢酶复合体(Branched-chainα-ketoacid dehydrogenase complex,BCKDH)中α亚基即BCKDHA基因表达的关键miRNA。本研究利用3个在线软件预测与该基因具有靶标关系的miRNAs。利... 旨在预测并验证调控支链氨基酸分解代谢的限速酶支链α-酮酸脱氢酶复合体(Branched-chainα-ketoacid dehydrogenase complex,BCKDH)中α亚基即BCKDHA基因表达的关键miRNA。本研究利用3个在线软件预测与该基因具有靶标关系的miRNAs。利用荧光定量PCR检测小鼠3T3-L1前脂肪细胞分化过程中和超表达后关键miRNA与BCKDHA的表达量。结果表明,miR-194-5p是调控BCKDHA表达的一个关键miRNA,其种子序列与BCKDHA3′UTR第190~196位碱基完全互补。MiR-194-5p的表达随分化时间呈下降趋势,而BCKDHA mRNA则呈上升趋势。双荧光素酶报告结果也显示二者具有靶标关系,miR-194-5p下调BCKDHA的表达。超表达miR-194-5p后,BCKDHA的表达显著下调(P<0.05)。由此证明,miR-194-5p通过与BCKDHA基因3′UTR结合抑制其表达。 展开更多
关键词 miR-194-5p BCKDHA基因 mirna预测 3T3-L1 靶基因验证
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植物microRNA靶基因的预测与验证技术研究进展 被引量:3
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作者 崔俊霞 魏康宁 +2 位作者 谢伊源 王丽 李用芳 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第7期1-7,共7页
MicroRNA(miRNA)是真核生物中具有重要调控功能的一类小分子RNA。植物miRNA通过碱基互补配对方式引导RNA沉默复合体识别靶基因并介导靶基因mRNA被剪切或蛋白质翻译被抑制,所以对植物miRNA靶基因的分析和验证是研究miRNA功能必不可少的... MicroRNA(miRNA)是真核生物中具有重要调控功能的一类小分子RNA。植物miRNA通过碱基互补配对方式引导RNA沉默复合体识别靶基因并介导靶基因mRNA被剪切或蛋白质翻译被抑制,所以对植物miRNA靶基因的分析和验证是研究miRNA功能必不可少的一部分。植物miRNA靶基因可通过生物信息学方法预测,主要根据miRNA与mRNA的互补程度进行,然而理论上预测的靶基因尚有待于进一步的试验验证。简要介绍了植物miRNA产生过程的最新研究进展以及靶基因的预测方法,重点综述了植物miRNA靶基因的验证方法,包括RLM-5'RACE、降解组测序、瞬时共表达和转基因系统,为更深入地研究植物miRNA介导的调控机制提供参考。 展开更多
关键词 植物mirna 靶基因 剪切 预测 验证
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