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用于多基因表达检测的猕猴桃macroarray阵列
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作者 张波 徐昌杰 陈昆松 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期854-857,共4页
基因阵列是开展高通量功能基因组学研究的有效手段之一。对适用于多年生果树猕猴桃的macroarray阵列进行了探索,构建了含有42个基因的macroarray阵列,与α-32P标记的cDNA探针杂交产生清晰信号,有效分辨了不同基因或基因家族不同成员的... 基因阵列是开展高通量功能基因组学研究的有效手段之一。对适用于多年生果树猕猴桃的macroarray阵列进行了探索,构建了含有42个基因的macroarray阵列,与α-32P标记的cDNA探针杂交产生清晰信号,有效分辨了不同基因或基因家族不同成员的表达差异。DNase处理可去除基因组DNA污染,提高结果准确性。 展开更多
关键词 猕猴桃 macroarray 基因表达 构建
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肺癌细胞株中NVB和Doc药物敏感性关联基因的研究 被引量:6
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作者 蔡莉 隋广杰 王滨 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期523-528,共6页
目的:筛选小细胞肺癌(SCLC)和非小细胞肺癌(NSCLC)细胞株中与诺维苯(NVB)、泰索帝(Doc)药物感受性相关的基因。方法:采用MTT比色分析法测定4株SCLC细胞株和6株NSCLC细胞株对NVB、Doc的药物感受性,同时应用cDNAmacroarray技术检测10株肺... 目的:筛选小细胞肺癌(SCLC)和非小细胞肺癌(NSCLC)细胞株中与诺维苯(NVB)、泰索帝(Doc)药物感受性相关的基因。方法:采用MTT比色分析法测定4株SCLC细胞株和6株NSCLC细胞株对NVB、Doc的药物感受性,同时应用cDNAmacroarray技术检测10株肺癌细胞株中1291个药物感受性关联基因的表达状态,分析二者之间的相关性。结果:与NVB和Doc药物敏感性关联(r≥±0.4)的基因共有56个。1)与NVB药物敏感性相关联的基因有36个,SCLC+NSCLC组与NSCLC组共同表达的基因有20个,其中,SCLC+NSCLC组表达的基因有27个,特异表达的有7个,NSCLC组为29个基因,9个基因特异表达。2)与Doc药物敏感性相关联的基因有50个,其中,SCLC+NSCLC组与NSCLC组共同表达的基因有12个,SCLC+NSCLC组表达的基因有24个,12个基因特异表达,NSCLC组为38个基因,26个基因特异表达。3)肺癌细胞株中与NVB、Doc药物感受性相关联基因的分类主要分布于:信号转导分子﹑代谢酶类及其抑制剂、细胞因子和转录因子等4类。结论:SCLC和NSCLC细胞株中NVB、Doc药物敏感性相关联基因存在明显差异,但分类基本相同。 展开更多
关键词 cDNA macroarray MTT比色分析法 肺癌 细胞株 药物感受性相关联基因 NVB DOC
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肺癌细胞株中GEM和CDDP药物敏感性相关基因的研究 被引量:2
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作者 杨春雨 田振囡 +1 位作者 刘炜 蔡莉 《中国肺癌杂志》 CAS 2009年第10期1061-1068,共8页
背景与目的筛选小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)和非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)细胞株中与健择(gemcitabine hydrochloride,GEM)和顺铂(cisplatin,CDDP)药物敏感性相关的基因,有助于进一步阐明抗癌药物作... 背景与目的筛选小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)和非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)细胞株中与健择(gemcitabine hydrochloride,GEM)和顺铂(cisplatin,CDDP)药物敏感性相关的基因,有助于进一步阐明抗癌药物作用机制,为克服抗癌药物的耐药性、研制开发新的抗癌药物提供新线索,同时也将为临床的个体化治疗提供理论依据。方法采用MTT比色分析法测定4株SCLC细胞株和6株NSCLC细胞株对CDDP和GEM的药物敏感性,同时应用cDNA macroarray技术检测10株肺癌细胞株中1291个药物敏感性相关基因的表达状态,分析二者之间的相关性。结果与GEM药物敏感性呈明显正相关(r≥0.632,P<0.05)的基因有6个;与CDDP药物敏感性关联的基因共有45个;与GEM、CDDP敏感性关联(r≥±0.4)的基因有41个;肺癌细胞系中与GEM和CDDP两类药物敏感性呈明显相关的基因是Metallothinein(信号转导分子)、CathepsinB(组织蛋白酶B)和TIMP1(生长因子);肺癌细胞系中与GEM、CDDP药物敏感性相关联的基因主要分布于Metallothinein、Cathepsin B、生长因子TIMP1等类别。结论SCLC和NSCLC细胞株中GEM、CDDP存在药物敏感性相关基因,其中Metallothinein、Cathepsin B和TIMP1基因与GEM药物敏感性呈正相关,与CDDP药物敏感性呈负相关。 展开更多
关键词 cDNA macroarray MTT比色分析法 肺癌细胞株 药物敏感性 GEM CDDP
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非小细胞肺癌细胞株抗癌药物敏感性相关基因差异表达的初步研究
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作者 蔡莉 王滨 隋广杰 《中国肺癌杂志》 CAS 2005年第3期163-169,共7页
背景与目的为了提高晚期肺癌的化疗效果,实行个体化治疗,筛选和鉴定肺癌细胞抗癌药物敏感性基因具有重要临床意义。本研究比较了非小细胞肺癌(NSCLC)和永生化人支气管上皮细胞(BET2A)细胞株抗癌药物敏感性相关基因的差异表达,以寻找与... 背景与目的为了提高晚期肺癌的化疗效果,实行个体化治疗,筛选和鉴定肺癌细胞抗癌药物敏感性基因具有重要临床意义。本研究比较了非小细胞肺癌(NSCLC)和永生化人支气管上皮细胞(BET2A)细胞株抗癌药物敏感性相关基因的差异表达,以寻找与抗癌药物敏感性相关的基因。方法应用cDNAmacroarray技术,对6株NSCLC和BET2A细胞株的抗癌药物敏感性相关基因进行差异表达分析,RTPCR技术验证滤膜杂交结果。结果在1291个候选基因中筛选出73个差异表达基因,其中45个基因表达上调,28个基因表达下调。RTPCR验证结果与cDNAmacroarray检测结果一致。结论抗癌药物敏感性相关基因的差异表达可能是药物敏感性产生不同的原因之一。本研究结果为逆转肺癌多药耐药性提供了理论基础和新靶点,并为临床新药开发及个体化治疗提供了实验依据。 展开更多
关键词 CDNA macroarray 基因表达 非小细胞肺癌
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