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同义密码子的反常蛋白质二级结构偏好性被引量：3: 1; 作者李晓琴罗辽复刘次全《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期441-444,共4页; 统计分析了 119种人蛋白质和 92种大肠杆菌蛋白质的mRNA序列和蛋白质二级结构的关系 .从二肽频数出发 ,研究了同义密码子使用对蛋白质二级结构的影响 ,证明其影响在 10 %到 2 0 %的量级 .对于人和大肠杆菌 ,在 90 %置信水平上 ,4 0 0对... 展开更多; 关键词同义密码子反常蛋白质二级结构偏好性 mrna序列; 在线阅读下载PDF 职称材料

不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析被引量：1: 2; 作者顾万君周童 +2 位作者马建民孙啸陆祖宏《东南大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第1期72-77,共6页; 在传统的Chou Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息 ,计算了 2 0 0个蛋白 ( 4 9种全α结构蛋白 ,69种全β结构蛋白 ,38种α + β结构蛋白 ,44种α/β结构蛋白 )中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构 (... 展开更多; 关键词同义密码子使用氨基酸二级结构偏向性蛋白质二级结构预测蛋白质折叠类型蛋白设计; 在线阅读下载PDF 职称材料

核酸序列是否包含更多蛋白质结构信息被引量：3: 3; 作者李炜疆宋江宁《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》 CSCD 北大核心 2001年第6期652-655,共4页; 氨基酸序列决定蛋白质高级结构是普遍接受的假设 ,也是蛋白质结构预测的理论基础 .但近来不断有研究表明 ,同义密码子用语和蛋白质二级结构间存在着某些关联 ,这些结果可能对蛋白质折叠理论和基因工程有积极意义 .本文对这一课题研究的... 展开更多; 关键词同义密码子用语氨基酸序列蛋白质二级结构统计关联蛋白质折叠; 在线阅读下载PDF 职称材料

一个蛋白质相似性搜索问题的近似算法: 4; 作者李红武王骁力尚耐丽《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期484-492,共9页; 本文研究了一个蛋白质相似性搜索问题,即在满足mRNA二级结构互补约束且不含终止密码子的条件下,寻找与给定的mRNA和蛋白质有最大相似性的mRNA序列和编码氨基酸序列的问题,简称MRSOS问题.讨论了该问题的复杂性,同时,结合RNA分子二级结构... 展开更多; 关键词蛋白质相似性 mrna二级结构终止密码子近似算法; 在线阅读下载PDF 职称材料

人类p53肿瘤蛋白的偏好性分析及其应用被引量：5: 5; 作者孔娟娟朱平《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2011年第8期2987-2990,共4页; 为了深入研究人类p53肿瘤蛋白,对七条最新的人类p53肿瘤蛋白的mRNA序列的偏好性及其同源性进行了分析。利用MEGA4.0(molecular evolutionary genetics analysis)软件的Distance功能得到七条基因的mR-NA序列及其相应的蛋白质序列的同源性... 展开更多; 关键词 p53肿瘤蛋白 mrna序列偏好性同源性同义密码子同义密码子相对使用度 QRSCU; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名同义密码子的反常蛋白质二级结构偏好性被引量：3: 1; 作者李晓琴罗辽复刘次全; 机构内蒙古大学理工学院中国科学院昆明动物所; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期441-444,共4页; 基金国家自然科学基金重大项目 (No.90 10 3 0 3 0) 昆明动物所细胞与分子进化开放实验室课题基金资助~~; 文摘统计分析了 119种人蛋白质和 92种大肠杆菌蛋白质的mRNA序列和蛋白质二级结构的关系 .从二肽频数出发 ,研究了同义密码子使用对蛋白质二级结构的影响 ,证明其影响在 10 %到 2 0 %的量级 .对于人和大肠杆菌 ,在 90 %置信水平上 ,4 0 0对二肽中分别有 79对和 6 0对 ,在 95 %置信水平上 ,分别有 4 5对和 36对二肽的相应密码子二联体具有不同于氨基酸的反常二级结构偏好性。; 关键词同义密码子反常蛋白质二级结构偏好性 mrna序列; Keywords mrna sequence, protein secondary structures, synonymous codons; 分类号 Q518.1 [生物学—生物化学] Q61 [生物学—生物物理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析被引量：1: 2; 作者顾万君周童马建民孙啸陆祖宏; 机构东南大学吴健雄实验室; 出处《东南大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第1期72-77,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目 ( 60 12 110 1); 文摘在传统的Chou Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息 ,计算了 2 0 0个蛋白 ( 4 9种全α结构蛋白 ,69种全β结构蛋白 ,38种α + β结构蛋白 ,44种α/β结构蛋白 )中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构 (α :螺旋 ,β :折叠 ,C :卷曲 )的偏向性参数 .通过对这些密码子对应氨基酸二级结构偏向性的分析 ,得到了氨基酸二级结构偏向性分析中所忽略的同义密码子的蛋白结构信息 .; 关键词同义密码子使用氨基酸二级结构偏向性蛋白质二级结构预测蛋白质折叠类型蛋白设计; Keywords synonymous codon usage secondary structural propensity of amino acid protein secondary structure prediction protein folding type protein design; 分类号 Q52 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名核酸序列是否包含更多蛋白质结构信息被引量：3: 3; 作者李炜疆宋江宁; 机构江南大学工业生物技术教育部重点实验室; 出处《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》 CSCD 北大核心 2001年第6期652-655,共4页; 基金教育部工业生物技术重点实验室访问学者基金资助课题 .; 文摘氨基酸序列决定蛋白质高级结构是普遍接受的假设 ,也是蛋白质结构预测的理论基础 .但近来不断有研究表明 ,同义密码子用语和蛋白质二级结构间存在着某些关联 ,这些结果可能对蛋白质折叠理论和基因工程有积极意义 .本文对这一课题研究的最新进展情况进行了简要的分析与评述 .; 关键词同义密码子用语氨基酸序列蛋白质二级结构统计关联蛋白质折叠; Keywords synonymous codon usage protein secondary structure statistical correlation protein folding; 分类号 Q52 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一个蛋白质相似性搜索问题的近似算法: 4; 作者李红武王骁力尚耐丽; 机构南阳师范学院数学与统计学院; 出处《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期484-492,共9页; 基金国家自然科学基金(41306207 51349006)~~; 文摘本文研究了一个蛋白质相似性搜索问题,即在满足mRNA二级结构互补约束且不含终止密码子的条件下,寻找与给定的mRNA和蛋白质有最大相似性的mRNA序列和编码氨基酸序列的问题,简称MRSOS问题.讨论了该问题的复杂性,同时,结合RNA分子二级结构的实际特征,考虑了该问题在相应结构图最大度为1的限制情形,简称为MRSOS-D1问题,讨论了此问题的复杂性,并给出了MRSOS-D1问题的7-近似算法.; 关键词蛋白质相似性 mrna二级结构终止密码子近似算法; Keywords protein similarity mrna secondary structure stop codon approximation algorithm; 分类号 TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人类p53肿瘤蛋白的偏好性分析及其应用被引量：5: 5; 作者孔娟娟朱平; 机构江南大学理学院; 出处《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2011年第8期2987-2990,共4页; 基金江南大学创新团队发展计划资助项目(PIRTJiangnan2008CXTD02); 文摘为了深入研究人类p53肿瘤蛋白,对七条最新的人类p53肿瘤蛋白的mRNA序列的偏好性及其同源性进行了分析。利用MEGA4.0(molecular evolutionary genetics analysis)软件的Distance功能得到七条基因的mR-NA序列及其相应的蛋白质序列的同源性,并通过比较它们的RSCU和QRSCU值,对p53基因发生突变时偏好使用同义密码子的情况进行了分析。研究结果表明,基于拟氨基酸编码方法能更明显地展示出它们对同义密码子的一致偏好性,并且p53基因发生突变时偏好使用以c/g结尾的密码子,研究结果对其癌变基因和肿瘤基因的研究有一定的意义。; 关键词 p53肿瘤蛋白 mrna序列偏好性同源性同义密码子同义密码子相对使用度 QRSCU; Keywords p53 tumor protein mrna sequence bias homology synonymous codon RSCU QRSCU; 分类号 O15 [理学—基础数学] TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	同义密码子的反常蛋白质二级结构偏好性	李晓琴罗辽复刘次全	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2003	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析	顾万君周童马建民孙啸陆祖宏	《东南大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心	2004	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	核酸序列是否包含更多蛋白质结构信息	李炜疆宋江宁	《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》 CSCD 北大核心	2001	3	在线阅读下载PDF 职称材料
4	一个蛋白质相似性搜索问题的近似算法	李红武王骁力尚耐丽	《工程数学学报》 CSCD 北大核心	2014	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	人类p53肿瘤蛋白的偏好性分析及其应用	孔娟娟朱平	《计算机应用研究》 CSCD 北大核心	2011	5	在线阅读下载PDF 职称材料