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小麦m^(6)A结合蛋白编码基因TaECT3的克隆与功能分析
1
作者
王嘉宽
石婷瑞
+3 位作者
马宇航
马羽彤
周芮西
李增林
《麦类作物学报》
北大核心
2025年第10期1316-1323,共8页
N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)作为真核生物RNA中最丰富的表观转录修饰类型,通过动态的“写入-擦除-阅读”机制调控植物生长发育及逆境响应。ECT家族蛋白作为m^(6)A阅读结合蛋白,通过识别m^(6)A修饰位点参与RNA代谢调控。为明晰小麦TaECT3作为...
N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)作为真核生物RNA中最丰富的表观转录修饰类型,通过动态的“写入-擦除-阅读”机制调控植物生长发育及逆境响应。ECT家族蛋白作为m^(6)A阅读结合蛋白,通过识别m^(6)A修饰位点参与RNA代谢调控。为明晰小麦TaECT3作为m^(6)A结合蛋白响应逆境胁迫的机理,从小麦材料Fielder中克隆到TaECT3基因CDS全长,对其进行生物信息学分析。结果表明,TaECT3基因的编码区(CDS)长度为1854 bp,编码617个氨基酸,其编码蛋白含有一个ECT家族蛋白典型的YTH保守结构域。TaECT3蛋白分子量为66.93 kDa,等电点为6.48,是亲水性稳定蛋白。其二级结构以无规则卷曲(79.74%)和α-螺旋(13.45%)为主,三级结构模拟显示该蛋白具有m^(6)A结合口袋。经系统进化分析,小麦TaECT3与大麦HvECT3、高粱SbECT3和短柄草BdDF3A之间有较近的亲缘关系,暗示它们之间可能功能保守。EMSA试验显示TaECT3重组蛋白特异性结合m^(6)A修饰RNA;亚细胞定位其可能位于细胞膜;qRT-PCR分析表明,高温(37℃,6 h)和PEG8000模拟干旱(15%,6 h)处理后,小麦Fielder中TaECT3的表达显著上调和下调。以上结果说明小麦TaECT3作为m^(6)A结合蛋白可能参与高温与干旱胁迫响应。
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关键词
小麦
TaECT3
m^(
6
)A结合蛋白
基因克隆
亚细胞定位
EMSA
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职称材料
RNA m^6A甲基化修饰的研究进展
被引量:
5
2
作者
茹文秀
沈雪梅
+1 位作者
张晓燕
陈宏
《中国牛业科学》
2019年第4期44-49,共6页
RNA m^6A甲基化修饰是发生在RNA腺嘌呤(A)第6位N原子上的一种转录后修饰方式。它是由甲基转移酶和去甲基酶以及识别蛋白所催化的一种动态可逆的修饰方式,具有重要的调控功能。本文综述了m^6A甲基化的发现、相关酶的作用以及在生命过程...
RNA m^6A甲基化修饰是发生在RNA腺嘌呤(A)第6位N原子上的一种转录后修饰方式。它是由甲基转移酶和去甲基酶以及识别蛋白所催化的一种动态可逆的修饰方式,具有重要的调控功能。本文综述了m^6A甲基化的发现、相关酶的作用以及在生命过程中的重要功能,以期对未来研究m^6A在牛的遗传育种方面的调控作用提供重要的理论支持。
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关键词
m^
6
A甲基化
甲基转移酶
去甲基酶
识别蛋白
调控功能
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职称材料
题名
小麦m^(6)A结合蛋白编码基因TaECT3的克隆与功能分析
1
作者
王嘉宽
石婷瑞
马宇航
马羽彤
周芮西
李增林
机构
西北农林科技大学生命学院
出处
《麦类作物学报》
北大核心
2025年第10期1316-1323,共8页
基金
西北农林科技大学博士启动经费(2452023033)。
文摘
N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)作为真核生物RNA中最丰富的表观转录修饰类型,通过动态的“写入-擦除-阅读”机制调控植物生长发育及逆境响应。ECT家族蛋白作为m^(6)A阅读结合蛋白,通过识别m^(6)A修饰位点参与RNA代谢调控。为明晰小麦TaECT3作为m^(6)A结合蛋白响应逆境胁迫的机理,从小麦材料Fielder中克隆到TaECT3基因CDS全长,对其进行生物信息学分析。结果表明,TaECT3基因的编码区(CDS)长度为1854 bp,编码617个氨基酸,其编码蛋白含有一个ECT家族蛋白典型的YTH保守结构域。TaECT3蛋白分子量为66.93 kDa,等电点为6.48,是亲水性稳定蛋白。其二级结构以无规则卷曲(79.74%)和α-螺旋(13.45%)为主,三级结构模拟显示该蛋白具有m^(6)A结合口袋。经系统进化分析,小麦TaECT3与大麦HvECT3、高粱SbECT3和短柄草BdDF3A之间有较近的亲缘关系,暗示它们之间可能功能保守。EMSA试验显示TaECT3重组蛋白特异性结合m^(6)A修饰RNA;亚细胞定位其可能位于细胞膜;qRT-PCR分析表明,高温(37℃,6 h)和PEG8000模拟干旱(15%,6 h)处理后,小麦Fielder中TaECT3的表达显著上调和下调。以上结果说明小麦TaECT3作为m^(6)A结合蛋白可能参与高温与干旱胁迫响应。
关键词
小麦
TaECT3
m^(
6
)A结合蛋白
基因克隆
亚细胞定位
EMSA
Keywords
Wheat
TaECT3
m^(
6
)A
reader
protein
Gene cloning
Subcellular localization
EMSA
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
RNA m^6A甲基化修饰的研究进展
被引量:
5
2
作者
茹文秀
沈雪梅
张晓燕
陈宏
机构
西北农林科技大学动物科技学院
出处
《中国牛业科学》
2019年第4期44-49,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31772574)
文摘
RNA m^6A甲基化修饰是发生在RNA腺嘌呤(A)第6位N原子上的一种转录后修饰方式。它是由甲基转移酶和去甲基酶以及识别蛋白所催化的一种动态可逆的修饰方式,具有重要的调控功能。本文综述了m^6A甲基化的发现、相关酶的作用以及在生命过程中的重要功能,以期对未来研究m^6A在牛的遗传育种方面的调控作用提供重要的理论支持。
关键词
m^
6
A甲基化
甲基转移酶
去甲基酶
识别蛋白
调控功能
Keywords
N^
6
-methyladenosine(m^
6
A)
methyltransferase
demethylase
reader
protein
s
regulatory function
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
Q341 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦m^(6)A结合蛋白编码基因TaECT3的克隆与功能分析
王嘉宽
石婷瑞
马宇航
马羽彤
周芮西
李增林
《麦类作物学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
RNA m^6A甲基化修饰的研究进展
茹文秀
沈雪梅
张晓燕
陈宏
《中国牛业科学》
2019
5
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职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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