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m^(6)A去甲基化酶FTO调控BCL2 mRNA稳定性与翻译效率促进血小板前体形成
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作者 夏文军 卢尧 +2 位作者 吴煌 文爱清 陈卫 《陆军军医大学学报》 北大核心 2025年第6期519-530,共12页
目的探究下调m^(6)A去甲基化酶脂肪质量和肥胖相关基因(fat mass and obesityassociated protein,FTO)对MEG-01巨核细胞系血小板前体形成的影响及其机制。方法①分别用1 nmol/L佛波迷酯(phorbol myristate acetate,PMA)组(诱导组)和DMSO... 目的探究下调m^(6)A去甲基化酶脂肪质量和肥胖相关基因(fat mass and obesityassociated protein,FTO)对MEG-01巨核细胞系血小板前体形成的影响及其机制。方法①分别用1 nmol/L佛波迷酯(phorbol myristate acetate,PMA)组(诱导组)和DMSO组(对照组)处理MEG-01细胞72 h,通过Western blot和RT-qPCR检测FTO蛋白和mRNA表达变化情况。②用靶向FTO的病毒液(sh-FTO)和阴性对照病毒液(sh-NC)感染MEG-01细胞,用1 nmol/L PMA诱导sh-NC组和sh-FTO组MEG-01细胞72 h后,Western blot和RT-qPCR检测FTO蛋白和mRNA表达变化情况。碘化丙啶(propidium lodrde,PI)DNA染色检测细胞周期、CCK-8检测细胞活力,Annexin V-FITC/PI双染、TUNEL染色检测细胞凋亡情况,Western blot检测cleaved Caspase-3蛋白表达量,CD41/CD61染色检测巨核细胞成熟情况,明场观察和CD61免疫荧光检测血小板前体形成情况,RT-qPCR检测细胞凋亡相关分子(Caspase-3、BAD、BAK1、BCL2、MCL1)表达量,Western blot检测进一步验证BCL2蛋白变化情况,基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中筛选出数据集;使用加州大学圣克鲁兹分校基因组浏览器(University of California,Santa Cruz genome browser,UCSC)分析比对BCL2 mRNA上的甲基化测序峰;m^(6)A甲基化RNA免疫共沉淀(m^(6)A RNA immunoprecipitation,m^(6)A-RIP)验证MEG-01巨核细胞BCL2 mRNA m^(6)A甲基化富集水平,检测sh-NC组和sh-FTO组BCL2 mRNA m^(6)A甲基化富集水平变化,以mRNA半衰期实验和多聚核糖体分离实验检测BCL2 mRNA翻译效率。结果①与DMSO组相比,PMA组FTO蛋白(P<0.05)和mRNA(P<0.01)表达水平升高;②与sh-NC组相比,sh-FTO组FTO mRNA和蛋白表达水平明显降低(P<0.01),细胞周期发生G1/S期阻滞[(60.80±1.29)%vs(72.13±1.18)%,P<0.01],细胞活力明显降低[(1.17±0.03)%vs(0.69±0.05)%,P<0.05],Annexin V-FITC/PI阳性细胞占比升高[(12.87±0.83)%vs(17.45±1.58)%,P<0.01],TUNEL阳性细胞占比显著升高[(1.03±0.27)%vs(17.49±9.91)%,P<0.01],cleaved Caspase-3蛋白表达水平明显升高(P<0.01),CD41+CD61+阳性率明显降低[(51.63±1.13)%vs(34.08±0.53)%,P<0.01],具有伪足的巨核细胞比率明显降低[(26.49±6.73)%vs(13.31±5.97)%,P<0.01]。③与sh-NC相比,sh-FTO组细胞抗凋亡分子BCL2蛋白和mRNA表达水平显著降低(P<0.01),UCSC GEO测序显示BCL2 mRNA上有m^(6)A甲基化修饰位点,并经m^(6)ARIP实验在MEG-01巨核细胞验证:与GAPDH mRNA相比,BCL2 mRNA有明显的m^(6)A富集信号(P<0.01);与sh-NC相比,BCL2 mRNA上的m^(6)A甲基化修饰明显升高(P<0.01);BCL2 mRNA的稳定性显著降低,翻译效率显著降低(P<0.01)。结论m^(6)A去甲基化酶FTO调控BCL2 mRNA稳定性与翻译效率,促进血小板前体形成。 展开更多
关键词 脂肪质量和肥胖相关基因 血小板前体 m^(6)A甲基修饰 B淋巴细胞瘤-2基因
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高温应激下湖羊卵巢颗粒细胞m^(6)A甲基化修饰差异研究
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作者 李笑微 田微 +1 位作者 刘媛 李惠侠 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第4期1712-1721,共10页
旨在研究高温应激对湖羊卵巢颗粒细胞中m^(6)A甲基化修饰的影响,为揭示高温应激下m^(6)A甲基化修饰对湖羊卵巢颗粒细胞发育和功能的调控机制奠定基础。本研究采集2岁龄左右湖羊母羊新鲜卵巢,收集卵巢表面3~5 mm卵泡中的颗粒细胞,随机分... 旨在研究高温应激对湖羊卵巢颗粒细胞中m^(6)A甲基化修饰的影响,为揭示高温应激下m^(6)A甲基化修饰对湖羊卵巢颗粒细胞发育和功能的调控机制奠定基础。本研究采集2岁龄左右湖羊母羊新鲜卵巢,收集卵巢表面3~5 mm卵泡中的颗粒细胞,随机分为2组,对照组(37℃)和高温应激组(42℃,每天2 h,连续3 d)。通过甲基化RNA免疫共沉淀测序(MeRIP-seq)鉴定m^(6)A峰,获得基因表达数据并进行分析。MeRIP-seq在对照组和高温应激组共有135个具有显著差异的m^(6)A峰,映射到130个差异甲基化基因,主要富集到PI3K-Akt信号通路、谷胱甘肽代谢和Wnt信号通路等。RNA-seq鉴定出359个显著差异表达基因,主要富集在类固醇合成、胆固醇生物合成等信号通路。MeRIP-seq和RNA-seq数据联合分析结果显示,DTX3L、MAGEF1、MAN1C1、CCDC77、RAD51共计5个基因m^(6)A修饰和基因表达水平同时存在显著差异,主要富集在Notch信号通路等。本研究结果表明,高温应激会改变湖羊卵巢颗粒细胞mRNA中m^(6)A修饰水平,最终可能影响细胞增殖、凋亡、雌激素合成等相关通路,为进一步探究m^(6)A修饰在高温应激下的具体作用机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 高温应激 卵巢颗粒细胞 湖羊 m^(6)A甲基修饰 MeRIP-seq
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5-甲基胞嘧啶RNA甲基化在非肿瘤性肾脏疾病中的研究进展
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作者 张晨 赵自霞 +2 位作者 吴私 栾军军 周华 《中国医学科学院学报》 北大核心 2025年第1期86-94,共9页
RNA甲基化修饰是基因表达转录后水平表观遗传学调控的关键过程。5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)是RNA甲基化修饰的一种类型,是真核生物mRNA和其他非编码RNA中常见的转录后修饰,主要调控转运RNA稳定性,核糖体RNA组装和mRNA成熟、稳定性与翻译等生... RNA甲基化修饰是基因表达转录后水平表观遗传学调控的关键过程。5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)是RNA甲基化修饰的一种类型,是真核生物mRNA和其他非编码RNA中常见的转录后修饰,主要调控转运RNA稳定性,核糖体RNA组装和mRNA成熟、稳定性与翻译等生物学过程。m^(5)C RNA甲基化修饰是动态可逆的,受甲基转移酶、去甲基化酶和甲基化识别蛋白的调控。研究证实,m^(5)C RNA甲基化修饰异常与非肿瘤性肾脏疾病的发生相关。本文总结了m^(5)C RNA甲基化相关酶与非肿瘤性急慢性肾脏疾病之间的研究进展,有望为这类疾病的诊断和治疗提供潜在的靶点。 展开更多
关键词 表观遗传学 RNA甲基修饰 RNA 5-甲基胞嘧啶 肾脏疾病
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MeRIP-qPCR技术检测RNA m^(6)A甲基化修饰对t(8;21)AML细胞中KDM4B基因表达的调控作用
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作者 李雨晴 邵杨柳 +2 位作者 李梦月 王莉莉 高晓宁 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期382-388,共7页
目的:通过MeRIP联合逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术,证明WTAP介导的RNA m^(6)A修饰对伴t(8;21)急性髓系白血病(AML)细胞中KDM4B基因的直接调控作用。方法:采用靶向WTAP或KDM4B基因的短发夹RNA(small hairpin RNA,shRNA)慢病毒载体沉默t... 目的:通过MeRIP联合逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术,证明WTAP介导的RNA m^(6)A修饰对伴t(8;21)急性髓系白血病(AML)细胞中KDM4B基因的直接调控作用。方法:采用靶向WTAP或KDM4B基因的短发夹RNA(small hairpin RNA,shRNA)慢病毒载体沉默t(8;21)AML细胞系Kasumi-1和SKNO-1中WTAP或KDM4B基因表达,以转染随机打乱序列(scramble)的shRNA的细胞为对照。用超纯RNA提取试剂盒(DNaseⅠ)提取细胞RNA,Magna MeRIP^(TM)m^(6)A Kit试剂盒富集甲基化修饰片段,并通过RT-qPCR检测m^(6)A甲基化修饰的RNA区域;采用蛋白免疫印迹实验(Western blot)和逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术检测细胞中WTAP、KDM4B蛋白和mRNA的表达水平。采用克隆形成实验检测细胞体外克隆形成能力。结果:沉默Kasumi-1细胞中WTAP的表达后,m^(6)A甲基化修饰在KDM4B mRNA 3’UTR的富集程度显著下降(P<0.01),沉默Kasumi-1和SKNO-1细胞中WTAP的表达可显著抑制KDM4B蛋白(P<0.001)和mRNA表达水平(Kasumi-1:P<0.001;SKNO-1:P<0.01)、细胞体外克隆形成能力下降(Kasumi-1:P<0.001;SKNO-1:P<0.01)。结论:t(8;21)AML细胞系中,WTAP通过调控KDM4B基因mRNA 3’UTR的m^(6)A修饰调控KDM4B的表达,沉默KDM4B表达可以抑制t(8;21)AML细胞增殖。 展开更多
关键词 MeRIP-qPcR 急性髓系白血病 t(8 21)染色体易位 KDM4B RNA m^(6)A甲基修饰
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m^(6)A甲基化在骨骼肌发育中的生物学作用及调控机制研究进展 被引量:1
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作者 何思琦 陈倩 +4 位作者 张贺春 陈红艳 马月辉 周胜花 赵倩君 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第4期1511-1521,共11页
N6-甲基腺苷修饰(N6-methyladenosine, m^(6)A),即RNA腺嘌呤A碱基的第6位氮原子发生甲基化,是真核生物细胞中最普遍和最丰富的RNA修饰。动态可逆的m^(6)A修饰由甲基转移酶样3(METTL3)及其辅助因子组成的甲基转移酶复合物催化,脂肪质量... N6-甲基腺苷修饰(N6-methyladenosine, m^(6)A),即RNA腺嘌呤A碱基的第6位氮原子发生甲基化,是真核生物细胞中最普遍和最丰富的RNA修饰。动态可逆的m^(6)A修饰由甲基转移酶样3(METTL3)及其辅助因子组成的甲基转移酶复合物催化,脂肪质量和肥胖相关基因(FTO)、ALKB同源基因5(ALKBH5)等去甲基化酶消除RNA甲基化修饰信号,并通过m^(6)A结合蛋白识别RNA m^(6)A修饰位点。m^(6)A修饰能够调控RNA的剪接、出核、翻译和稳定性等分子调节作用,已成为表观遗传学领域的研究热点。骨骼肌是动物机体重要的组成部分,其发育涉及成肌细胞增殖、迁移、分化和融合形成肌管细胞,进而形成肌肉纤维等多个过程,受多种转录因子及表观遗传调控。其中,m^(6)A甲基化修饰参与调控肌肉干细胞的维持、成肌细胞增殖及分化。越来越多研究表明,由m^(6)A甲基化修饰介导的转录及转录后调控在骨骼肌生长发育中起着至关重要的调控作用。作者介绍了m^(6)A甲基化修饰酶的种类及作用,重点综述了m^(6)A甲基化修饰在骨骼肌生长发育及相关疾病中的调控机制,为解析肌肉发育表观调控机制及发现潜在的骨骼肌疾病治疗靶点等研究提供新思路。 展开更多
关键词 m^(6)A甲基 m^(6)A甲基修饰 骨骼肌 调控机制
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RNA m^(5)C甲基化修饰在肿瘤中的研究进展 被引量:1
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作者 张安琪 安萌 +3 位作者 姜博 唐文强 潘丽 付波 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2021年第24期1277-1281,共5页
5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,m^(5)C)是RNA中重要的甲基化修饰之一,也是近年来的研究热点。随着甲基化测序技术的发展,在编码RNA及非编码RNA中均证实存在大量的m5C甲基化修饰。RNA m^(5)C甲基化修饰受m^(5)C甲基转移酶、去甲基化酶及... 5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,m^(5)C)是RNA中重要的甲基化修饰之一,也是近年来的研究热点。随着甲基化测序技术的发展,在编码RNA及非编码RNA中均证实存在大量的m5C甲基化修饰。RNA m^(5)C甲基化修饰受m^(5)C甲基转移酶、去甲基化酶及m5C甲基化结合蛋白的调控。m^(5)C甲基化修饰调节RNA的稳定性、转运、翻译和压力应激等,并参与调节肿瘤的发生发展、侵袭转移、肿瘤耐药等进程。本文对RNA m^(5)C甲基化修饰的调控机制、功能以及在肿瘤中的研究进展进行综述,以期为肿瘤诊治研究提供新思路。 展开更多
关键词 m^(5)c甲基修饰 编码RNA 非编码RNA 肿瘤
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RNAm^(5)C甲基化修饰在消化系统癌症中的作用机制 被引量:1
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作者 张心煜 程文栎 张文娟 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS 北大核心 2023年第3期259-266,共8页
RNA的5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)甲基化是一种常见的转录后修饰类型,该RNA甲基化修饰过程受到RNA m^(5)C甲基转移酶及其结合蛋白等调控体系的联合作用。RNA m^(5)C甲基化调控与消化系统癌症密切相关,其水平异常影响癌症的发生发展进程,m^(5)... RNA的5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)甲基化是一种常见的转录后修饰类型,该RNA甲基化修饰过程受到RNA m^(5)C甲基转移酶及其结合蛋白等调控体系的联合作用。RNA m^(5)C甲基化调控与消化系统癌症密切相关,其水平异常影响癌症的发生发展进程,m^(5)C水平升高可促进特定的癌细胞增殖、侵袭和迁移。RNA m^(5)C甲基化及调节体系有望成为消化系统癌症的新型生物标志物,为其预防、干预和治疗提供潜在的作用靶点。 展开更多
关键词 RNA甲基 5-甲基胞嘧啶(m^(5)c) 系统癌症 m^(5)c调节因子
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续苓健骨方调节骨组织m^(6)A甲基化机制研究
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作者 屈丽 谢丽华 +1 位作者 叶云金 葛继荣 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2025年第1期1-7,43,共8页
目的利用表观转录组学微阵列芯片技术检测续苓健骨方对绝经后骨质疏松症模型大鼠中骨组织mRNA的m^(6)A甲基化修饰和基因表达的变化。方法雌性SPF大鼠随机分为模型组、续苓健骨方组,采用去卵巢法构建绝经后骨质疏松症模型。治疗组以续苓... 目的利用表观转录组学微阵列芯片技术检测续苓健骨方对绝经后骨质疏松症模型大鼠中骨组织mRNA的m^(6)A甲基化修饰和基因表达的变化。方法雌性SPF大鼠随机分为模型组、续苓健骨方组,采用去卵巢法构建绝经后骨质疏松症模型。治疗组以续苓健骨方药液进行灌胃给药,模型组给予等量生理盐水,运用MeRIP-qPCR和表观转录组学微阵列芯片技术,检测2组大鼠骨组织中mRNA的m^(6)A甲基化和表达水平变化,并对这些mRNA进行GO和KEGG分析,基于检测结果选取6个差异甲基化基因进行验证。结果与对照组相比,续苓组中差异表达的mRNA共有4479个,其中2298个上调,1497个下调;1215个基因m^(6)A甲基化修饰水平显著变化,其中592个高甲基化,623个低甲基化;联合分析发现,825个基因同时发生mRNA表达和m^(6)A修饰变化,433个m^(6)A高甲基化且mRNA表达上调,392个m^(6)A低甲基化且mRNA表达下调;GO和KEGG分析显示,m^(6)A高甲基化且表达上调的基因参与骨髓细胞分化、线粒体中释放细胞色素C、红细胞分化等过程;m^(6)A低甲基化且表达下调的基因参与甘油三酯分解代谢过程的调节、PPAR、磷脂酰肌醇、甲状腺激素、胆固醇代谢等信号通路;MeRIP-qPCR验证显示续苓组中Ggt1、Hps4、H1fx、Selp、Hras的相对m^(6)A甲基化水平高于对照组。结论续苓健骨方对绝经后骨质疏松模型大鼠骨组织中m^(6)A甲基化修饰影响显著,其中Ggt1、Hps4、H1fx、Selp、Hras等基因的m^(6)A甲基化修饰变化可能是其治疗绝经后骨质疏松症的机制之一。 展开更多
关键词 绝经后骨质疏松症 m^(6)A甲基修饰 续苓健骨方 甲基RNA免疫共沉淀
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RNA m^(6)A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用机制
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作者 叶棣文 张炳杨 +2 位作者 张丹彤 马万山 逯素梅 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期132-140,共9页
目的:探讨RNA m^(6)A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用及机制。方法:收集2型糖尿病患者术中赘余皮下脂肪组织,以非2型糖尿病患者同样组织为对照,检测组间RNA m^(6)A水平。高脂饮食诱导C57BL/6J小鼠构建胰岛素抵抗(in⁃sulin resis... 目的:探讨RNA m^(6)A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用及机制。方法:收集2型糖尿病患者术中赘余皮下脂肪组织,以非2型糖尿病患者同样组织为对照,检测组间RNA m^(6)A水平。高脂饮食诱导C57BL/6J小鼠构建胰岛素抵抗(in⁃sulin resistance,IR)模型(HFD组,n=5,60%高脂饲料喂养16周),对照组10%低脂饲料喂养16周(CD组,n=5)。模型构建成功后,取附睾周围脂肪组织行表观转录组学m^(6)A甲基化修饰芯片检测,并借助MeRIP-qPCR实验、RT-qPCR以及RNA结合蛋白免疫沉淀测定(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RIP)实验验证胰岛素信号转导相关基因变化;进一步观察METTL3小分子抑制剂STM2457对高脂饮食诱导下小鼠胰岛素信号转导基因的影响。结果:2型糖尿病患者和小鼠IR模型脂肪组织中总体m^(6)A修饰水平均升高(患者200 ng RNA t=-8.375,P<0.001;患者100 ng RNA t=-3.722,P=0.006;患者50 ng RNA t=-4.937;P=0.001;小鼠100 ng RNA t=-3.590,P=0.023;小鼠50 ng RNA t=-2.760,P=0.025)。表观转录组学检测证实IR的脂肪组织中1175个基因发生高m^(6)A修饰,55个基因发生低m^(6)A修饰,同时有182个基因呈现高m^(6)A修饰且低表达,包括AKT2、INSR、PIK3R1、ACACA、SREBF1等5个胰岛素信号转导关键基因,其中AKT2、INSR、ACACA、SREBF1等4个基因被确证并证实其与METTL3存在直接结合,其m^(6)A修饰水平受METTL3正向调控。STM2457作用下,胰岛素敏感性提高,且AKT2、INSR、ACACA、SREBF1转录水平上调,提示IR表型改善明显。结论:高脂饮食通过METTL3诱导脂肪细胞胰岛素信号转导基因AKT2、INSR、ACACA、SREBF1发生m^(6)A高甲基化修饰,诱导其低表达,阻滞胰岛素信号转导,进而参与诱发IR。 展开更多
关键词 高脂饮食 胰岛素抵抗 RNA m^(6)A甲基修饰 胰岛素信号转导通路
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RNA m^(5)C甲基化在肿瘤发生发展中的调控作用 被引量:3
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作者 徐英杰 文雪倩 +1 位作者 冯璐瑶 田鑫 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1352-1355,共4页
m^(5)C甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,存在于几乎所有类型的RNA中。RNA m^(5)C修饰在RNA的翻译、稳定性、出核以及DNA损伤修复等生物学过程中发挥了重要作用。近年来越来越多的研究发现,m^(5)C修饰在肿瘤的发生及进展中发挥着重要... m^(5)C甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,存在于几乎所有类型的RNA中。RNA m^(5)C修饰在RNA的翻译、稳定性、出核以及DNA损伤修复等生物学过程中发挥了重要作用。近年来越来越多的研究发现,m^(5)C修饰在肿瘤的发生及进展中发挥着重要的调控作用,且m^(5)C相关修饰酶的表达和预后密切相关。该文主要针对m^(5)C修饰的生物学功能以及在肿瘤发生发展中的作用进行综述。 展开更多
关键词 RNA甲基 5甲基胞嘧啶(m^(5)c) 转录后调控 表观遗传学 肿瘤 靶向治疗
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m^(6)A甲基化在肺癌发生发展中调控机制的研究进展
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作者 郑楷 郭晓阳 +1 位作者 吴旺 李标 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第17期1353-1360,共8页
N6-甲基腺嘌呤修饰(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)是真核细胞中最常见的RNA修饰形式之一,属于表观遗传学修饰的范畴,涉及多种肿瘤的发生和发展。肺癌是全球癌症死亡率最高的恶性肿瘤之一,其发病机制复杂,且早期诊断困难,治疗手段有限。... N6-甲基腺嘌呤修饰(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)是真核细胞中最常见的RNA修饰形式之一,属于表观遗传学修饰的范畴,涉及多种肿瘤的发生和发展。肺癌是全球癌症死亡率最高的恶性肿瘤之一,其发病机制复杂,且早期诊断困难,治疗手段有限。m^(6)A修饰在肺癌中发挥重要作用,相关分子的表达异常导致m^(6)A修饰的失调,从而影响到肺癌的发展。这一现象提示m^(6)A修饰相关分子可能成为肺癌治疗的潜在靶点或诊断标志物。因此,本文综述了m^(6A)修饰在肺癌发生发展过程中的作用,探讨了其与肺癌细胞生物行为及微环境的关系,并讨论了m^(6)A修饰与肺癌相关信号通路之间的相互作用,为深入理解m^(6)A甲基化在肺癌发生和发展中的作用提供了宝贵的参考,对于开发新的诊断和治疗策略具有重要意义。 展开更多
关键词 m^(6)A甲基 肺癌 RNA修饰 信号通路 细胞生物行为
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皮肤疾病中m^(6)A甲基化修饰的作用研究进展 被引量:1
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作者 张喆 李舒丽 李春英 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期381-384,共4页
目前已知mRNA上存在>100种不同形式的表观遗传修饰方式,这些化学修饰能够调控基因产物表达,影响多种生物学过程。其中m^(6)A甲基化修饰是真核生物mRNA上最普遍的转录后修饰方式,广泛调控mRNA的剪切、加工、出核,翻译及降解等过程,近... 目前已知mRNA上存在>100种不同形式的表观遗传修饰方式,这些化学修饰能够调控基因产物表达,影响多种生物学过程。其中m^(6)A甲基化修饰是真核生物mRNA上最普遍的转录后修饰方式,广泛调控mRNA的剪切、加工、出核,翻译及降解等过程,近些年越来越多研究证实异常m^(6)A甲基化与皮肤肿瘤、病毒感染、系统性红斑狼疮、银屑病及皮肤光老化等多种皮肤疾病密切相关。该文主要综述m^(6)A甲基化修饰概念、作用机制以及在相关皮肤疾病中研究进展。 展开更多
关键词 表观遗传修饰 m^(6)A甲基修饰 皮肤肿瘤 皮肤免疫
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基于双向长短时记忆网络和注意力机制的RNA m5C甲基化位点预测 被引量:1
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作者 胡梦 李慧敏 +2 位作者 唐轶 王煜 陈鹏辉 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期303-310,共8页
RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰在许多生物过程中发挥重要的作用,对m5C位点的准确识别有助于更好地理解其生物学功能,所以识别m5C甲基化位点十分必要。尽管已发展了多种识别m5C甲基化位点的机器学习方法,但预测能力仍有待提高。本文基于双... RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰在许多生物过程中发挥重要的作用,对m5C位点的准确识别有助于更好地理解其生物学功能,所以识别m5C甲基化位点十分必要。尽管已发展了多种识别m5C甲基化位点的机器学习方法,但预测能力仍有待提高。本文基于双向长短时记忆网络和注意力机制,提出了一种预测RNA m5C甲基化位点的深度学习算法。用该方法在人、小鼠、酿酒酵母和拟南芥共4种生物的RNA m5C数据集上进行实验,m5C位点预测AUC值分别达到92.5%、99.7%、93.6%和86.5%。与现有预测方法相比,该方法具有较好的预测性能,并且具有更优的泛化能力,为RNA m5C甲基化位点预测提供了一种新方法。 展开更多
关键词 双向长短时记忆网络 注意力机制 m5c甲基位点 深度学习
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玉米赤霉烯酮对湖羊睾丸间质细胞毒性及m^(6)A甲基化修饰相关基因表达的影响 被引量:5
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作者 刘亮 苏晓彤 +4 位作者 李慧贤 胡康瑶 陆宏辉 许新松 万永杰 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期772-779,共8页
[目的]本文旨在探究玉米赤霉烯酮(zearalenone, ZEA)对湖羊睾丸间质细胞(leydig cells, LC)的毒性作用。[方法]用200μmol·L^(-1)ZEA处理湖羊LC 8 h,通过EdU法检测细胞增殖情况,RT-qPCR和Western blot分别检测与细胞增殖和凋亡、... [目的]本文旨在探究玉米赤霉烯酮(zearalenone, ZEA)对湖羊睾丸间质细胞(leydig cells, LC)的毒性作用。[方法]用200μmol·L^(-1)ZEA处理湖羊LC 8 h,通过EdU法检测细胞增殖情况,RT-qPCR和Western blot分别检测与细胞增殖和凋亡、氧化应激、m^(6)A甲基化修饰相关基因和蛋白的表达变化。[结果]与对照组相比,ZEA处理组LC活性和增殖数量极显著下降(P<0.01);细胞增殖相关基因pcna及其蛋白表达水平均极显著下降(P<0.01);促凋亡基因表达水平(bax、caspase3,P<0.01;tp53、caspase9,P<0.05)均显著升高,相对应蛋白表达水平(TP53、CASPASE9,P<0.01)极显著升高;抗凋亡基因bcl-2及蛋白表达水平显著降低(P<0.05);氧化应激相关基因相对表达水平(cat,P<0.05;gsh-px、sod2,P<0.01)显著或极显著上升,其相关蛋白表达水平(SOD2,P<0.01)极显著上升;m^(6)A相关基因alkbh5的相对表达水平显著降低(P<0.05),mettl3和ythdc1水平极显著升高(P<0.01),ythdf3水平显著升高(P<0.05)。[结论]ZEA可抑制湖羊LC增殖,促进湖羊LC凋亡,导致LC发生氧化损伤,产生毒性作用,且其毒性作用可能跟m^(6)A甲基化修饰相关。 展开更多
关键词 玉米赤霉烯酮 湖羊 睾丸间质细胞 增殖 凋亡 应激 m^(6)A甲基修饰
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m^(6)A RNA甲基化修饰在常见心血管疾病和心肌肥大中的研究进展
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作者 杨艺清 王爱 +2 位作者 崔楠 张俊哲 李昭 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期65-68,72,共5页
心血管疾病是影响全球伤残调整生命年和导致死亡的主要原因。最近研究报道,mRNA最普遍的内部修饰N6-腺苷酸甲基化(m^(6)A)在心血管疾病中发挥重要作用。本文概述了m^(6)A RNA甲基化修饰的关键酶及动态调节过程,重点阐述了m^(6)A RNA甲... 心血管疾病是影响全球伤残调整生命年和导致死亡的主要原因。最近研究报道,mRNA最普遍的内部修饰N6-腺苷酸甲基化(m^(6)A)在心血管疾病中发挥重要作用。本文概述了m^(6)A RNA甲基化修饰的关键酶及动态调节过程,重点阐述了m^(6)A RNA甲基化在心肌肥大和心力衰竭、高血压、冠状动脉粥样硬化性心脏病、心律失常等常见心血管疾病中的研究进展,并对m^(6)A RNA甲基化新技术进行了讨论。 展开更多
关键词 RNA修饰 m^(6)A RNA甲基 表观遗传学 心肌肥大 心血管疾病
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Mettl3介导m^(6)A甲基化修饰对过氧化氢诱导的脊髓神经元氧化应激和凋亡的影响
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作者 李宏维 张海鸿 《中国脊柱脊髓杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期834-842,共9页
目的:探讨Mettl3介导m^(6)A甲基化修饰对过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的脊髓神经元氧化应激和调亡的影响。方法:分离新生(24h内)SD大鼠脊髓,经消化、离心后重悬沉淀,差速贴壁30min后收集未贴壁细胞培养于Neurobasal培养基中,经免疫荧光鉴... 目的:探讨Mettl3介导m^(6)A甲基化修饰对过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的脊髓神经元氧化应激和调亡的影响。方法:分离新生(24h内)SD大鼠脊髓,经消化、离心后重悬沉淀,差速贴壁30min后收集未贴壁细胞培养于Neurobasal培养基中,经免疫荧光鉴定呈β3-tubulin阳性,确认为脊髓神经元。将脊髓神经元随机分为6组:空白组,细胞不予任何处理,正常培养;转染对照组,细胞转染阴性对照siRNA(si-NC);转染组,细胞转染Mettl3 siRNA(si-Mettl3);诱导组,细胞采用300μmol/L的H_(2)O_(2)处理;转染对照诱导组,细胞先转染si-NC,然后采用300μmol/LH_(2)O_(2)处理;转染诱导组,细胞先转染si-Mettl3,然后采用300μmol/LH_(2)O_(2)处理。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测各组细胞Mettl3的mRNA表达水平,Westernblot检测Mettl3、Bax、Bcl-2和cleaved Caspase-3的蛋白表达水平,免疫荧光检测Mettl3表达,酶标仪检测各组整体m^(6)A水平,并检测白细胞介素IL-1β、IL-6、肿瘤坏死因子(TNF)-α、超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)和丙二醛(MDA)水平,流式细胞仪检测细胞凋亡。结果:与空白组相比,诱导组的m6A甲基化修饰水平显著提高(P<0.05),Mettl3的mRNA和蛋白表达水平显著性上调(P<0.05),IL-1β(73.39±8.82ng/Lvs125.58±15.31ng/L)、IL-6(63.34±7.12ng/L vs 101.28±12.49ng/L)、TNF-α(103.29±12.19ng/Lvs 204.37±23.65ng/L)和MDA(4.01±0.67pmol/Lvs 9.23±1.05pmol/L)水平显著性升高(P<0.05),SOD(28.37±3.72U/mgvs 17.23±2.05U/mg)和GSHPx(158.19±19.26U/mgvs83.35±9.05U/mg)水平显著性降低(P<0.05),且Bax和cleavedCaspase-3的蛋白表达水平显著性上调(P<0.05),Bcl-2的蛋白表达水平显著性下调(P<0.05),细胞凋亡率显著升高[(8.30±0.68)%vs(34.29±3.16)%,P<0.05];与诱导组相比,转染诱导组的m^(6)A甲基化修饰水平显著性降低(P<0.05),Mettl3的mRNA和蛋白表达水平显著性下调(P<0.05),IL-1β(125.58±15.31ng/L vs 96.28±11.27ng/L)、IL-6(101.28±12.49ng/L vs 84.56±10.24ng/L)、TNF-α(204.37±23.65ng/L vs 147.15±18.46ng/L)和MDA(9.23±1.05pmol/L vs 7.28±0.96pmol/L)水平显著性降低(P<0.05),SOD(17.23±2.05U/mg vs 24.01±2.76U/mg)和GSH-Px(83.35±9.05U/mg vs 121.48±15.47U/mg)水平显著升高(P<0.05),且Bax和cleavedCaspase-3的蛋白表达水平显著性下调(P<0.05),Bcl-2的蛋白表达水平显著性上调(P<0.05),细胞凋亡率显著性降低(34.29±3.16)%vs(23.57±2.01)%,P<0.05)。与空白组相比,转染组的炎性因子、氧化应激和调亡水平均无显著性差异(P>0.05)。结论:H_(2)O_(2)可上调脊髓神经元中m^(6)A甲基化修饰水平,并可诱导氧化应激和细胞凋亡;抑制Mettl3表达能够降低H_(2)O_(2)诱导的脊髓神经元m^(6)A甲基化修饰水平,进而缓解氧化应激和细胞凋亡。 展开更多
关键词 脊髓损伤 m^(6)A甲基修饰 Mettl3 细胞凋亡 应激
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真核生物mRNA的动态m^1A甲基化修饰图谱
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作者 郑青亮 DOMINISSINI D +1 位作者 NACHTERGAELE S MOSHITCH-MOSHKOVITZ S 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期325-325,共1页
高等真核生物的RNA上能发生100多种化学修饰,以前这些修饰在非编码RNA(如tRNA,rRNA)上的功能研究较多,然而绝大部分修饰在mRNA上的修饰图谱以及所发挥的功能作用仍然未知。可逆的m^6A修饰主要发生在mRNA的CDS区,3'-UTR区,特别是终止... 高等真核生物的RNA上能发生100多种化学修饰,以前这些修饰在非编码RNA(如tRNA,rRNA)上的功能研究较多,然而绝大部分修饰在mRNA上的修饰图谱以及所发挥的功能作用仍然未知。可逆的m^6A修饰主要发生在mRNA的CDS区,3'-UTR区,特别是终止密码子附近区域,其广泛参与了RNA代谢的各种生物学过程。据报道m^1A修饰能改变tRNA和rRNA结构从而调控其功能,但该修饰是否存在于mRNA,其在mRNA水平的修饰图谱及其功能仍然不明。 展开更多
关键词 高等真核生物 m^1A 甲基修饰 终止密码子 修饰 基因表达数据库 翻译调控 转录后修饰 特异性识别 质谱分析
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基于METTL3介导的miR-29a-3p的m^(6)A修饰探讨平喘颗粒抑制气道上皮细胞泛凋亡治疗哮喘的机制研究
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作者 毛旭 杨柳欣 +2 位作者 高佳炜 王瑶 袁星星 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第15期1139-1146,共8页
目的:观察平喘颗粒对METTL3介导的气道上皮细胞中miR-29a-3p的m^(6)A修饰的影响,明确其抑制哮喘气道炎症的分子机制。方法:16HBE采用LPS诱导(50 mg/L)构建细胞模型,并给予平喘颗粒含药血清和地塞米松进行干预。分别采用CCK8法检测细胞... 目的:观察平喘颗粒对METTL3介导的气道上皮细胞中miR-29a-3p的m^(6)A修饰的影响,明确其抑制哮喘气道炎症的分子机制。方法:16HBE采用LPS诱导(50 mg/L)构建细胞模型,并给予平喘颗粒含药血清和地塞米松进行干预。分别采用CCK8法检测细胞活性、ELISA法检测炎症因子(TNF-α、IL-6和IL-8)的含量和miR-29a-3p的m^(6)A修饰水平、Western blot检测METTL3与泛凋亡蛋白的表达和qRT-PCR检测METTL3与miR-29a-3p的表达。结果:与模型组相比,平喘颗粒能够显著增加16HBE的活力,抑制炎症因子TNF-α、IL-6和IL-8的含量,下调泛凋亡相关蛋白p-RIPK3、p-MLKL、cleaved Caspase-1、cleaved Caspase-3的表达和GSDMD-NT/FL-GSDMD与GSDME-NT/FL-GSDME的比值,差异均具有统计学意义(P<0.01)。此外,平喘颗粒能够显著上调细胞中miR-29a-3p和METTL3的表达水平,促进miR-29a-3p的m^(6)A修饰水平,与模型组相比差异均具有统计学意义(P<0.01)。结论:平喘颗粒主要通过METTL3增强miR-29a-3p的m^(6)A修饰水平,抑制气道上皮细胞泛凋亡,改善气道炎症。 展开更多
关键词 平喘颗粒 支气管哮喘 泛凋亡 m^(6)A甲基修饰 气道上皮细胞
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m^(6)A修饰对药物代谢酶和药物转运体的调控作用 被引量:5
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作者 赵世宇 刘帅兵 +1 位作者 王月琴 田鑫 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1221-1225,共5页
m^(6)A修饰是RNA甲基化修饰中最丰富的一种修饰,受甲基转移酶和去甲基化酶的动态调控,被m^(6)A识别蛋白识别并结合后可影响mRNA的剪切、稳定性和翻译等生物学过程来调控靶基因的表达。最近的研究发现,m^(6)A修饰可通过多种途径来调控药... m^(6)A修饰是RNA甲基化修饰中最丰富的一种修饰,受甲基转移酶和去甲基化酶的动态调控,被m^(6)A识别蛋白识别并结合后可影响mRNA的剪切、稳定性和翻译等生物学过程来调控靶基因的表达。最近的研究发现,m^(6)A修饰可通过多种途径来调控药物代谢酶和药物转运体表达,进而影响机体对药物的代谢速率或影响细胞中的药物浓度,最终导致药物治疗效果发生变化。该文综述了m^(6)A修饰调控药物代谢酶和药物转运体分子机制的研究进展,以期为临床上的合理用药、个体化用药提供新思路。 展开更多
关键词 RNA甲基 m^(6)A修饰 药物代谢酶 药物转运体 调控机制 研究进展
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1-(5-异喹啉磺酰基)-2-甲基哌嗪(H-7)对肺纤维化大鼠肺单核细胞趋化蛋白-1 mRNA表达的影响
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作者 曾钧 宋烈昌 +2 位作者 金行中 郭丹 林敬明 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期362-365,共4页
研究蛋白激酶C(PKC)抑制剂 1 (5 异喹啉磺酰基 ) 2 甲基哌嗪 (H 7)对肺纤维化大鼠单核细胞趋化蛋白 1(MCP 1)mRNA表达的影响 ,为临床治疗肺纤维化提供理论基础 .博来霉素致大鼠肺纤维化动物模型 ,腹腔注射H 7后 ,定量RT PCR方法检... 研究蛋白激酶C(PKC)抑制剂 1 (5 异喹啉磺酰基 ) 2 甲基哌嗪 (H 7)对肺纤维化大鼠单核细胞趋化蛋白 1(MCP 1)mRNA表达的影响 ,为临床治疗肺纤维化提供理论基础 .博来霉素致大鼠肺纤维化动物模型 ,腹腔注射H 7后 ,定量RT PCR方法检测其对肺组织MCP 1mRNA表达的影响 ;测定实验组和对照组肺组织匀浆内羟脯氨酸的含量 ,观察肺组织病理学变化并计数单核细胞 .结果发现 ,H 7能显著抑制大鼠肺纤维化组织MCP 1mRNA表达和单核细胞的聚集以及羟脯氨酸的含量 .结果表明 ,H 7通过抑制肺组织MCP 1mRNA的表达 ,对博来霉素致肺纤维化有明显的防治作用 . 展开更多
关键词 蛋白激酶c 1-(5-异喹啉磺酰基)-2-甲基哌嗪 基因表达 单核细胞趋蛋白-1 mRNA 肺纤维 博来霉素
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