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伪狂犬病病毒广西B、W株gE基因的扩增、克隆及序列分析 被引量：4
1
作者 陆芹章 覃广胜 +1 位作者 黄伟坚 熊艳芸 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1106-1110,共5页
在已鉴定了的伪狂犬病病毒(Pseudorabies Virus,PRV)11种糖蛋白中,gE是其中十分重要的一种非必需糖蛋白,是伪狂犬病病毒重要的毒力基因,它在介导感染细胞的融合,病毒在细胞间的扩散,病毒粒子的释放等方面均起着十分重要的作用[1],尤其... 在已鉴定了的伪狂犬病病毒(Pseudorabies Virus,PRV)11种糖蛋白中,gE是其中十分重要的一种非必需糖蛋白,是伪狂犬病病毒重要的毒力基因,它在介导感染细胞的融合,病毒在细胞间的扩散,病毒粒子的释放等方面均起着十分重要的作用[1],尤其是在影响伪狂犬病病毒神经嗜性和毒力方面的作用.利用PRV gE基因缺失疫苗,结合血清学方法可以区分疫苗接种猪和野毒感染猪[2]. 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 GE基因 扩增 克隆 序列分析 基因缺失疫苗 广西 毒力基因 感染细胞 Virus
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鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因的PCR扩增、克隆及序列分析 被引量：3
2
作者 叶如俊 王红宁 谭炳乾 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期83-88,共6页
研究选择从四川规模化鸡场分离鉴定的5株优势血清型鸡源致病性大肠杆菌代表株(O89,O119,O141,O127)的1型菌毛pilA基因的PCR扩增片段分别定向克隆到pUC18质粒的多克隆位点,并转化到DH5α株大肠杆菌载体菌中,对目的基因的序列测定结果表... 研究选择从四川规模化鸡场分离鉴定的5株优势血清型鸡源致病性大肠杆菌代表株(O89,O119,O141,O127)的1型菌毛pilA基因的PCR扩增片段分别定向克隆到pUC18质粒的多克隆位点,并转化到DH5α株大肠杆菌载体菌中,对目的基因的序列测定结果表明:5个克隆片段均含有1型菌毛pilA基因的全序列,全长459bp,编码信号肽和结构蛋白。用生物软件(DNASTAR)对9株大肠杆菌1型菌毛pilA基因序列、氨基酸序列、菌毛蛋白质二级结构预测及抗原性进行了分析比较,结果显示:鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛间具有同源性,1型菌毛间存在一定的相同抗原位点。 展开更多
关键词 鸡 致病性大肠杆菌 1型菌毛 PILA基因 PCR扩增 克隆 序列分析
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两株A型禽流感病毒NP基因的PCR扩增及序列分析 被引量：2
3
作者 刘泽文 徐涤平 +3 位作者 周平华 段正赢 汪宏才 杨峻 《动物医学进展》 CSCD 2004年第3期96-98,共3页
研究选择 AIV NP基因为目的基因 ,设计了一对特异性引物 ,筛选出最佳的 RT-PCR扩增条件 ,特异性地扩增出了两株 A型禽流感病毒的部分 NP基因片段 ,并对其进行了序列分析 ,结果表明 ,两株来源于不同禽类的 AIV的NP基因同源率高达 92 %。AIV
关键词 A型禽流感病毒 NP基因 PCR扩增 序列分析 禽流感
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猪细小病毒自然弱毒N株结构蛋白VP1基因的扩增及序列分析 被引量：1
4
作者 白安斌 李斌 +8 位作者 梁家幸 梁保忠 姚瑞英 黄安国 杜坚 陈西宁 卢树莲 赵武 蒋玉雯 《广西畜牧兽医》 2008年第4期195-197,共3页
设计两对引物,对广西分离的猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)结构蛋白VP1基因进行分段PCR扩增与测序,并与中国湖北、四川及加拿大、西班牙等地PPV毒株的VP1基因进行对比分析。结果表明这些毒株的VP1基因变异很小,发现存在有6个核苷酸高... 设计两对引物,对广西分离的猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)结构蛋白VP1基因进行分段PCR扩增与测序,并与中国湖北、四川及加拿大、西班牙等地PPV毒株的VP1基因进行对比分析。结果表明这些毒株的VP1基因变异很小,发现存在有6个核苷酸高变位点。PPV-N株与加拿大NADL-2株的VP1基因的同源性最高,它们的核苷酸序列、推导的氨基酸序列的同源性分别为99.9%、99.6%,这为判断PPV-N株和NADL-2株均同属PPV弱毒株提供了分子生物学依据。 展开更多
关键词 PPV-N株 VP1基因 PCR扩增 测序 序列分析
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猪细小病毒自然弱毒N株VP1基因的扩增与序列分析
5
作者 李斌 赵武 +6 位作者 梁家幸 梁保忠 白安斌 姚瑞英 黄安国 何颖 蒋玉雯 《动物医学进展》 CSCD 2008年第10期5-9,共5页
对猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)VP1基因扩增及测序,利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位,以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性。结果表明,PPV-N株VP1基因与弱毒参考毒株NADL-2VP1基因同源性最高,亲缘... 对猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)VP1基因扩增及测序,利用生物信息学技术预测VP1蛋白的二级结构与B细胞抗原表位,以及分析该蛋白的氨基酸差异位点及密码子偏爱性。结果表明,PPV-N株VP1基因与弱毒参考毒株NADL-2VP1基因同源性最高,亲缘关系最近。PPV-N株VP1蛋白的二级结构较为复杂,以β-折叠为主,并有较多的转角和无规则卷曲区域,在序列的20～56、61～80、86～130、136～188区域为B细胞抗原表位的优势区域。PPV强、弱毒株VP1蛋白存在5个氨基酸差异位点(T-365-I,G-528-D,Q-533-H,P-586-S,K-715-R),这些位点处氨基酸残基抗原性与毒力成正相关。PPV-N株VP1蛋白在A、C、E、G、H、I、K、N、Q、R、S、T、V和Y氨基酸于密码子选择上存在一定的偏爱性。 展开更多
关键词 PPV—N株 VP1基因 扩增 生物信息学分析
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粤西地区5种荔枝nrDNA ITS基因扩增及酶切分析研究
6
作者 黎翠萍 陈玉莹 +2 位作者 袁长春 黎海利 刘锴栋 《现代农业科技》 2015年第9期64-67,共4页
对广东省粤西地区的5个荔枝品种进行核糖体DNA（rDNA）内转录间隔区（ITS）的PCR扩增,并用限制酶HhaI、HaeⅢ、EcoRⅠ、HindⅢ、RsaⅠ对扩增产物进行酶切分析。5种荔枝属植物的ITS基因序列长度为600-800bp,PCR产物经过5种酶切后,5种荔... 对广东省粤西地区的5个荔枝品种进行核糖体DNA（rDNA）内转录间隔区（ITS）的PCR扩增,并用限制酶HhaI、HaeⅢ、EcoRⅠ、HindⅢ、RsaⅠ对扩增产物进行酶切分析。5种荔枝属植物的ITS基因序列长度为600-800bp,PCR产物经过5种酶切后,5种荔枝属植物的PCR产物均切出位于600-800bp之间的主带,妃子笑的主带与其余4种差异明显;结果表明,荔枝品种中的白糖罂、新兴、糯米糍、尚书怀4种的亲缘性比较近,妃子笑与这4种的亲缘性较远。 展开更多
关键词 荔枝 ITS基因 酶切分析 基因扩增 粤西地区
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植物乳杆菌HE-1由AI-2/LuxS介导的群体感应与生物膜形成关系的研究 被引量：8
7
作者 张腾 田建军 +2 位作者 李梓媛 贾原博 贺银凤 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期130-132,136,共4页
本研究从AI-2/LuxS群体感应出发,研究植物乳杆菌HE-1的AI-2信号分子生成与生物膜形成的关系,同时对luxS基因进行扩增,从分子生物学角度验证菌株HE-1的AI-2信号分子产生。研究使用生物发光的方法检测植物乳杆菌HE-1不同培养时间AI-2的产... 本研究从AI-2/LuxS群体感应出发,研究植物乳杆菌HE-1的AI-2信号分子生成与生物膜形成的关系,同时对luxS基因进行扩增,从分子生物学角度验证菌株HE-1的AI-2信号分子产生。研究使用生物发光的方法检测植物乳杆菌HE-1不同培养时间AI-2的产生量;使用微孔板法确定不同时间点生物膜的生成量;之后使用PCR的方法扩增其luxS基因片段,对扩增片段进行同源性和系统发育分析。结果显示植物乳杆菌HE-1的生物膜生成时间和生成量与AI-2信号分子的产生时间和产生量非常吻合,luxS基因成功扩增,同源性分析显示植物乳杆菌HE-1与已知植物乳杆菌luxS基因同源性高达99%以上。分析实验结果得出植物乳杆菌HE-1生物膜生成与AI-2/LuxS群体感应系统二者之间有密切的关系,并且luxS基因的扩增成功和同源性分析从分子生物学上验证了植物乳杆菌HE-1具有产生AI-2信号分子的关键基因。 展开更多
关键词 AI-2 luxs群体感应 生物膜形成 luxs基因扩增及同源性分析
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芦花鸡膜联蛋白A2基因PCR扩增
8
作者 孙梦雪 张淑萍 +4 位作者 郭延敏 张世超 王思琪 毛亚娟 姜莉莉 《中国畜禽种业》 2020年第11期170-171,共2页
本研究拟扩增鸡膜联蛋白A2(Annexin A2,ANXA2)基因并对其进行序列分析;根据Genebank数据库中已经发表的鸡ANXA2基因序列(登录号NM_205351.1),设计并合成一对ANXA2基因扩增特异性引物FA/RA。提取鸡肝脏组织RNA并反转录为cDNA,利用RT-PCR... 本研究拟扩增鸡膜联蛋白A2(Annexin A2,ANXA2)基因并对其进行序列分析;根据Genebank数据库中已经发表的鸡ANXA2基因序列(登录号NM_205351.1),设计并合成一对ANXA2基因扩增特异性引物FA/RA。提取鸡肝脏组织RNA并反转录为cDNA,利用RT-PCR方法扩增ANXA2基因。结果表明,该基因CDS区为1020bp,编码339个氨基酸,本试验成功克隆了鸡ANXA2基因并进行序列分析,为深入研究鸡ANXA2基因功能及其在病毒复制过程中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 鸡膜联蛋白A2 基因扩增 序列分析
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猪附红细胞体16S rRNA基因的序列测定和系统进化分析 被引量：23
9
作者 张浩吉 谢明权 +3 位作者 张健騑 覃宗华 顾万军 蔡建平 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期596-601,共6页
从确诊为猪附红细胞体感染的猪场,无菌采集血样,抽提猪附红细胞体基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16S rRNA基因扩增,对扩增产物进行克隆和测序。从3 个地理位置不同的猪场均成功地扩增出长度为1 469 bp的核苷酸序列。系统进化分析表... 从确诊为猪附红细胞体感染的猪场,无菌采集血样,抽提猪附红细胞体基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16S rRNA基因扩增,对扩增产物进行克隆和测序。从3 个地理位置不同的猪场均成功地扩增出长度为1 469 bp的核苷酸序列。系统进化分析表明,3个猪场样品所测序列一致性达99 52%以上,具有相同的基因型,但与国外报道的猪附红细胞体Illinois株同源性为95%,属于同一基因群,但基因型不同;所有种类的附红细胞体和血巴尔通氏体组成同一进化分支,这类血营养菌与支原体科,支原体属的病原最靠近(75%),而与立克次氏体目的病原较远(70%)。上述研究证实,广东所流行的猪附红细胞体是一种新基因型的猪附红细胞体,建议命名为猪附红细胞体广东株型;为反映进化关系,猪附红细胞体和其它血营养菌应划归于支原体科的支原体属。 展开更多
关键词 猪附红细胞体 系统进化分析 rRNA基因 16S 序列测定 附红细胞体感染 基因组DNA 核苷酸序列 立克次氏体 支原体 基因型 通用引物 基因扩增 扩增产物 地理位置 进化关系 猪场 真细菌 分析表 一致性 同源性 基因群 体组成
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转基因食品分析检测技术研究进展 被引量：23
10
作者 王晨光 许文涛 +1 位作者 黄昆仑 罗云波 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第21期297-305,共9页
目前世界各国都以不同方式要求企业对转基因食品进行标识,这就对转基因食品的检测技术提出了更高的要求。本文以转基因食品安全检测控制体系为线索先后介绍了世界各国的转基因标识制度及其必要性和国内外转基因分析检测技术的新进展,其... 目前世界各国都以不同方式要求企业对转基因食品进行标识,这就对转基因食品的检测技术提出了更高的要求。本文以转基因食品安全检测控制体系为线索先后介绍了世界各国的转基因标识制度及其必要性和国内外转基因分析检测技术的新进展,其中包括一些新颖的检测技术,如二代测序技术、等温扩增技术、组学分析技术等,最后预测了这些技术未来的发展前景。 展开更多
关键词 转基因食品 分析检测技术 分子特征 等温扩增
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伪狂犬病病毒Fa株gE基因的克隆与序列的比较分析 被引量：11
11
作者 王勤 郭万柱 +2 位作者 徐志文 汪铭书 王小玉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期389-393,共5页
根据已发表的伪狂犬病病毒(PRV)的基因序列,设计合成一对引物PCL1和PCL2,以PRVFa株的DNA为模板成功地扩增得到预期的长约1 7kb的特异片段,经酶切鉴定,初步确定为gE基因。将扩增产物经KpnⅠ、EcoRⅠ消化形成粘末端克隆到pUC18质粒,得到... 根据已发表的伪狂犬病病毒(PRV)的基因序列,设计合成一对引物PCL1和PCL2,以PRVFa株的DNA为模板成功地扩增得到预期的长约1 7kb的特异片段,经酶切鉴定,初步确定为gE基因。将扩增产物经KpnⅠ、EcoRⅠ消化形成粘末端克隆到pUC18质粒,得到了明显大于载体的重组质粒PpgE。重组质粒PpgE经酶切鉴定为含有PRV的gE基因,测序PpgE得到完整的gE基因片段,并与4株不同来源的毒株进行了比较分析。5毒株的gE同源性比较分析发现毒株间同源性最低也高达97%,这体现了gE基因的保守性。分析还表明Fa与TNL同源。同时99%的高同源性也显示Fa、Ea、SH可能是同一毒株。gE序列在1040-1410碱基的高同源性区域作为PRV的PCR检测或作为核酸探针是非常重要的。 展开更多
关键词 猪 伪狂犬病 病毒 Fa株 GE基因 克隆 序列分析 PCR扩增
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猪ESR基因一个外显子片段的克隆与序列分析 被引量：13
12
作者 徐子清 梅书棋 樊俊华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期101-107,共7页
参考人、鸡、鼠的ESR基因序列 ,设计一对引物 ,采用PCR技术扩增出猪ESR基因一段DNA片段 ,将该片段克隆到pGEM TEasy质粒中 ,重组质粒用PCR扩增和酶切分析进行阳性克隆鉴定 ,然后测定核苷酸序列 ,并推导其氨基酸序列。将测定的猪ESR基因... 参考人、鸡、鼠的ESR基因序列 ,设计一对引物 ,采用PCR技术扩增出猪ESR基因一段DNA片段 ,将该片段克隆到pGEM TEasy质粒中 ,重组质粒用PCR扩增和酶切分析进行阳性克隆鉴定 ,然后测定核苷酸序列 ,并推导其氨基酸序列。将测定的猪ESR基因的部分序列 (332bp)与人、鼠、鸡的序列进行比较 ,结果表明 :猪的核苷酸和氨基酸序列与人、鼠、鸡相比 ,同源性分别为90 0 6 %和 86 36 % ,85 54%和 88 18% ,74 10 %和 71 82 % ,显示了强的保守性 ,猪的核苷酸序列与人、鼠、鸡相比存在着 4处特有变异 ,氨基酸序列aa2 5～ 30存在高变异区。 展开更多
关键词 猪 ESR基因 PCR扩增 序列分析 基因克隆
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大豆NBS类抗病相关基因的克隆与序列分析 被引量：11
13
作者 杨秀红 陈庆山 +1 位作者 杨庆凯 李文滨 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期71-78,共8页
根据拟南芥RPS2基因、烟草N基因和亚麻L6基因的保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR方法从大豆抗疫霉根腐病品种绥农10号的RNA中扩增获得两个通读的大豆NBS类抗病基因同源片段RNEAU-1和RNEAU-2,长度均为513bp,编码171个氨基酸.以RNEAU-1... 根据拟南芥RPS2基因、烟草N基因和亚麻L6基因的保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR方法从大豆抗疫霉根腐病品种绥农10号的RNA中扩增获得两个通读的大豆NBS类抗病基因同源片段RNEAU-1和RNEAU-2,长度均为513bp,编码171个氨基酸.以RNEAU-1为靶序列,采用RACE方法获得了全长3574bp的大豆抗病相关基因SR1,该基因包括3411bp的开放读码框,72bp的5′非翻译区(non-translated region,NTR),68bp的3′非翻译区和20bp的多聚腺苷酸尾.编码1137个通读的蛋白质氨基酸序列,基因编码产物具有TIR、NBS、LRR、HD(conserved domain 1)和conserved domain 2等一系列抗病基因的保守结构域.同源性比较和序列分析显示,该基因为大豆中TIR-NBS-LRR类抗病相关基因.Southern杂交结果表明,SR1基因(或其同源基因)在大豆中具有2～4个拷贝.RT-PCR检测表明,SR1基因在大豆中为低丰度组成型表达,其表达不受病原菌接种和水杨酸的诱导,亦无组织特异性.以绥农10号基因组DNA为模板扩增得到长度为3972bp的SR1基因转录区核苷酸序列,其结构包含5个外显子和4个内含子.SR1基因在GenBank上的登录号为AY193892. 展开更多
关键词 大豆 抗病相关基因 抗病基因 疫霉根腐病 序列分析 N基因 烟草 扩增 NBS 基因编码产物
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羊驼TGF-β1基因的克隆及表达分析 被引量：7
14
作者 贾小云 金雷皓 +3 位作者 丁娜 罗东萍 范瑞文 董常生 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期885-892,共8页
旨在克隆羊驼TGF-β1基因,了解TGF-β1序列特征及其在不同组织中的表达特征,寻找TGF-β1基因的mRNA表达量与毛色之间的相关性,为研究TGF-β1基因的生物学功能提供基础。以羊驼为材料,利用3′和5′RACE技术克隆羊驼TGF-β1基因,利用DNAma... 旨在克隆羊驼TGF-β1基因,了解TGF-β1序列特征及其在不同组织中的表达特征,寻找TGF-β1基因的mRNA表达量与毛色之间的相关性,为研究TGF-β1基因的生物学功能提供基础。以羊驼为材料,利用3′和5′RACE技术克隆羊驼TGF-β1基因,利用DNAman、PROSITE和megAlign软件分别分析序列特征和相似性,应用荧光定量PCR(qRT-PCR)分析TGF-β1基因在不同被毛颜色羊驼皮肤组织中的表达及TGF-β1在山羊不同组织中的表达特异性。结果表明,羊驼TGF-β1cDNA克隆全长为1 364bp(GenBank登录号:KF887499),ORF长1 173bp,编码390个氨基酸。氨基酸序列分析显示,羊驼TGF-β1具有其家族的典型结构特征,与其他哺乳动物相似性很高,与野猪的亲缘关系最近。羊驼TGF-β1基因在棕色羊驼皮肤组织中的表达量是白色羊驼皮肤组织的3.5倍。组织特异性分析表明,TGF-β1在山羊不同组织中均有表达,且在淋巴组织中表达量相对最高。羊驼TGF-β1全长cDNA的克隆和不同组织器官TGF-β1基因表达分析显示,TGF-β1与羊驼毛色形成密切相关。本研究为深入探讨TGF-β1参与动物毛色形成及调控的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 羊驼 TGF-Β1基因 CDNA末端快速扩增 QRT-PCR 表达分析
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沪农灵芝1号全基因组分析和演化比较 被引量：8
15
作者 龚明 鲍大鹏 +1 位作者 唐传红 张劲松 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期1-5,19,共6页
对"沪灵芝"(Ganoderma lucidum SH)等23个真菌物种进行全基因组系统发生分析,进一步选取其中具有代表性的物种进行比较基因组学分析。全基因组系统发生分析和分子钟估计结果显示,沪灵芝分化时间(8.75百万年前)明显晚于灵芝属... 对"沪灵芝"(Ganoderma lucidum SH)等23个真菌物种进行全基因组系统发生分析,进一步选取其中具有代表性的物种进行比较基因组学分析。全基因组系统发生分析和分子钟估计结果显示,沪灵芝分化时间(8.75百万年前)明显晚于灵芝属分化时间(180百万年前);基因家族尺寸和直系同源基因数目分析显示,与另外参试灵芝菌种相比沪灵芝基因家族具有一定的收缩趋势;进一步对基因家族数目进行比较的结果显示,沪灵芝逆转录酶家族发生了显著扩增。GO功能分析提示沪灵芝逆转录酶家族的功能富集主要为核酸结合功能和酶的催化活性。 展开更多
关键词 灵芝 全基因组分析 分子钟 基因扩增 GO功能分析
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捻转血矛线虫(H.contortus)ZJ株H11蛋白基因的克隆及序列分析 被引量：4
16
作者 杜爱芳 李孝军 +1 位作者 侯玉慧 王素华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期387-390,共4页
参照已发表的捻转血矛线虫H11蛋白基因序列设计引物,以H.contortusZJ株的总RNA为模板,进行RT2PCR扩增,成功扩增出H11基因。将PCR产物与pUCm2T载体连接后,转化DH5α感受态细胞,筛选阳性克隆并测序。序列分析表明,其核苷酸序列与国外报道... 参照已发表的捻转血矛线虫H11蛋白基因序列设计引物,以H.contortusZJ株的总RNA为模板,进行RT2PCR扩增,成功扩增出H11基因。将PCR产物与pUCm2T载体连接后,转化DH5α感受态细胞,筛选阳性克隆并测序。序列分析表明,其核苷酸序列与国外报道的H11基因的同源性为99.5%。编码氨基酸序列具有氨基肽酶的保守序列,推测可使虫体不能获得所必需的氨基酸而导致死亡。 展开更多
关键词 捻转血矛线虫 蛋白基因 ZJ株 序列分析 PCR扩增 PCR产物 感受态细胞 核苷酸序列 氨基酸序列 序列设计 总RNA 阳性克隆 保守序列 氨基肽酶 T载体 分析表 同源性 虫体
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西农萨能奶山羊CSN1S2基因多态与产奶量、体尺指标的相关分析 被引量：5
17
作者 蓝贤勇 陈宏 +6 位作者 张润锋 田炎炎 张永德 房兴唐 孙维斌 雷初朝 胡沈荣 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期318-322,共5页
利用PCR2RFLP技术对69只西农萨能奶山羊的CSN1S2基因进行多态性分析。扩增产物为310bp的CSN1S2F基因片段,被Alw26I限制性内切酶消化后表现多态性。F等位基因为310bp,N等位基因为179和131bp,相应地,FF基因型为310bp,NF基因型为310,179和1... 利用PCR2RFLP技术对69只西农萨能奶山羊的CSN1S2基因进行多态性分析。扩增产物为310bp的CSN1S2F基因片段,被Alw26I限制性内切酶消化后表现多态性。F等位基因为310bp,N等位基因为179和131bp,相应地,FF基因型为310bp,NF基因型为310,179和131bp,NN基因型为179和131bp。在该群体中,F等位基因频率为010870,N等位基因频率为019130,处于Hardy2Weinberg平衡状态。将西农萨能奶山羊CSN1S2F基因座不同基因型与平均产奶量进行相关分析,结果表明:CSN1S2的不同基因型对平均产奶量有显著影响,NN基因型个体产奶量最高,FF基因型个体产奶量最低,且FF基因型个体平均产奶量显著低于NN基因型个体(P<0105)。将西农萨能奶山羊CSN1S2F基因座不同基因型与体尺指标进行相关分析,结果表明:在初生重和体高指标上,NF基因型个体显著优于NN基因型个体(P<0105);在体斜长和管围指标上,NF基因型个体略优于NN基因型个体,但差异不显著(P>0105);在成年体重和胸围指标上,不同的基因型个体间无差异。 展开更多
关键词 萨能奶山羊 相关分析 体尺指标 产奶量 基因多态 等位基因频率 RFLP技术 限制性内切酶 基因型 多态性分析 Hardy 基因片段 扩增产物 平衡状态 基因座 个体 PCR FF 平均 初生重 体斜长 消化 体高 胸围 体重
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猪伪狂犬病毒湖北株gE基因的克隆与序列分析 被引量：6
18
作者 郭锐 田永祥 +7 位作者 周丹娜 段正赢 杨克礼 裴小英 王红 廖仁芳 罗咏梅 刘心建 《安徽农业科学》 CAS 2014年第25期8502-8503,8515,共3页
[目的]通过对从湖北省某猪场分离获得的伪狂犬病毒的gE基因克隆和测序，分析其遗传变化规律。[方法]参考GenBank中猪伪狂犬痛病毒（Porcine pseudorabies Virus，PRV）gE基因的序列设计1对引物，对PRV湖北株班基因进行PCR扩增和序列分析... [目的]通过对从湖北省某猪场分离获得的伪狂犬病毒的gE基因克隆和测序，分析其遗传变化规律。[方法]参考GenBank中猪伪狂犬痛病毒（Porcine pseudorabies Virus，PRV）gE基因的序列设计1对引物，对PRV湖北株班基因进行PCR扩增和序列分析，PCR产物克隆到pMD18-T载体。对重组质粒进行限制性内切酶分析和基因测序，与GenBank收录的国内外其他地区的标准参考毒株进行同源性分析和比较。[结果]与标准参考毒株的核苷酸序列同源性为95．0％-98．0％，进化树分析表明，PRVHBXS2014株与河南焦作株EU561349-China同属于一个分支，亲缘关系较近，但存在个别位点的基因突变。[结论]为有效防控该病提供参考。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病毒 GE基因 PCR扩增 克隆 序列分析
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角膜混浊小鼠突变候选基因Map3k1克隆与序列分析 被引量：4
19
作者 吴刘成 刘春 +2 位作者 蒋荧梅 王生存 邵义祥 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第4期1-5,共5页
对具有角膜混浊表型的B6-Co突变系小鼠突变候选基因Map3k1进行克隆及测序分析,寻找该突变系小鼠Map3k1基因的突变位点。以小鼠Map3k1基因的mRNA、全长及上游5 kb序列设计引物,分别以基因组DNA和mRNA为模板,采用PCR和RT-PCR技术分段扩增... 对具有角膜混浊表型的B6-Co突变系小鼠突变候选基因Map3k1进行克隆及测序分析,寻找该突变系小鼠Map3k1基因的突变位点。以小鼠Map3k1基因的mRNA、全长及上游5 kb序列设计引物,分别以基因组DNA和mRNA为模板,采用PCR和RT-PCR技术分段扩增目的基因,将目的片段连接在T载体上,转化至感受态细胞,筛选阳性克隆,质粒DNA分子提取,电泳检测,EcoRⅠ酶切释放目的片段,送上海生工生物工程技术服务有限公司测序。成功扩增出Map3k1基因的20个外显子和上游调控序列,B6-Co小鼠测序结果与基因组数据库序列比对,该基因位于13号染色体第112 559 574的碱基由T突变为A,编码的蛋白质第314氨基酸由亮氨酸变为谷氨酸,但是该基因的表达调控及蛋白质剪切机制仍有待深入研究。 展开更多
关键词 B6-Co突变系小鼠 Map3k1基因 PCR扩增 序列分析
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滚环DNA扩增技术及其应用 被引量：8
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作者 刘青杰 陈德清 《辐射研究与辐射工艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期5-9,共5页
滚环扩增技术是一种等温信号扩增方法,DNA可在很短时间内实现指数扩增,因此,可用于痕量分子的检测。目前,该技术既可以扩增环状DNA、RNA,也可以扩增线性DNA,甚至全基因组DNA。目前,该技术主要用于全基因组扩增、核酸测序、单核苷酸多态... 滚环扩增技术是一种等温信号扩增方法,DNA可在很短时间内实现指数扩增,因此,可用于痕量分子的检测。目前,该技术既可以扩增环状DNA、RNA,也可以扩增线性DNA,甚至全基因组DNA。目前,该技术主要用于全基因组扩增、核酸测序、单核苷酸多态性以及DNA芯片、蛋白质芯片分析等广泛领域。 展开更多
关键词 滚环扩增 全基因组分析 单核苷酸多态性 芯片
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