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乳腺癌中长非编码RNA及LncRNA编码多肽的功能被引量：2: 1; 作者郭艾敏朱爽张军《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期312-321,共10页; 长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的序列长度超过200核苷酸(nucleotide,nt),部分可编码多肽。生物信息分析和多组学技术已被用于在乳腺癌中批量鉴定lncRNA与lncRNA编码肽。本文通过在线软件分析了Spencer数据库中收录的919个lnc... 展开更多; 关键词乳腺癌长非编码rna 长非编码rna编码肽; 在线阅读下载PDF 职称材料

LncRNA编码小肽的功能及研究现状被引量：2: 2; 作者黎秋慧陈瑜丽刘向华《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1577-1583,共7页; 长非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)是一类长度大于200 nt的RNA,在表观遗传的调控中发挥重要作用。由于缺乏编码性开放阅读框(open reading frame,ORF)、序列保守性低及缺乏已知的蛋白质结构域,lncRNA被认为不能编码蛋白质。随... 展开更多; 关键词长非编码rna 短开放阅读框小肽预测与鉴定小肽的功能; 在线阅读下载PDF 职称材料

植物长链非编码RNA研究进展被引量：11: 3; 作者黄小庆李丹丹吴娟《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期344-359,共16页; 长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)长度大于200个核苷酸,大量存在于生物体中并具有多种生物学功能。目前,植物中发现的lncRNA大多由RNA聚合酶Ⅱ转录,并通过目标模仿、转录干扰、组蛋白甲基化和DNA甲基化等多种机制介导基因的表... 展开更多; 关键词数据库基因表达调控生物学功能 long non-coding rnas (lncrnas); 在线阅读下载PDF 职称材料

基于表示学习和深度森林的长链非编码RNA编码短肽预测模型被引量：1: 4; 作者纪腾其孟军 +1 位作者赵思远胡鹤还《计算机应用》 CSCD 北大核心 2021年第12期3614-3619,共6页; 长链非编码RNA(lncRNA)中的小开放阅读框(sORFs)能够编码长度不超过100个氨基酸的短肽。针对短肽预测研究中lncRNA中的sORFs特征不鲜明且高可信度数据尚不充分的问题,提出一种基于表示学习的深度森林(DF)模型。首先,使用常规lncRNA特征... 展开更多; 关键词长链非编码rna 小开放阅读框短肽表示学习深度森林预测; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名乳腺癌中长非编码RNA及LncRNA编码多肽的功能被引量：2: 1; 作者郭艾敏朱爽张军; 机构广东药科大学生命科学与生物制药学院; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期312-321,共10页; 基金国家自然科学基金(No.31570506,31100198,31170480) 校企合作项目(No.43255128,43255094)资助。; 文摘长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的序列长度超过200核苷酸(nucleotide,nt),部分可编码多肽。生物信息分析和多组学技术已被用于在乳腺癌中批量鉴定lncRNA与lncRNA编码肽。本文通过在线软件分析了Spencer数据库中收录的919个lncRNA编码的乳腺癌肿瘤特异性多肽,结果显示,这些多肽涉及抗癌、抗炎和细胞穿透等活性。乳腺癌的发生发展与lncRNAs的异常表达密切相关,lncRNAs通过编码多肽、调控表观遗传、调节免疫等多种途径影响乳腺癌发展。部分lncRNA编码肽独立于lncRNA,通过表观遗传调控、抑制血管生成等途径调控乳腺癌的发展。lncRNA与lncRNA编码肽在乳腺癌的诊断与治疗中也有较大的应用潜力。因此,本文系统综述了lncRNA与lncRNA编码肽在乳腺癌发生发展与诊断治疗中的作用,对该研究领域目前存在的问题和挑战进行了分析。; 关键词乳腺癌长非编码rna 长非编码rna编码肽; Keywords breast cancer long non-coding rnas(lncrna) long non-coding rnas(lncrna)encoded peptide; 分类号 Q74 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名LncRNA编码小肽的功能及研究现状被引量：2: 2; 作者黎秋慧陈瑜丽刘向华; 机构南京医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1577-1583,共7页; 基金国家自然科学基金项目(No.U1704101,31701070,31701508)资助。; 文摘长非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)是一类长度大于200 nt的RNA,在表观遗传的调控中发挥重要作用。由于缺乏编码性开放阅读框(open reading frame,ORF)、序列保守性低及缺乏已知的蛋白质结构域,lncRNA被认为不能编码蛋白质。随着质谱、RNA测序和核糖体分析等先进技术的快速发展和应用,短开放阅读框(short open reading frames,sORFs)被证实具有编码蛋白质的潜力。LncRNA具有sORFs并且能够与核糖体结合。另外,lncRNA类似于mRNA也是由RNA聚合酶II转录而来,因此lncRNA极有可能进行翻译。目前,一些在线工具和实验技术联合运用,成功检测到lncRNA编码的小肽。由于当前实验技术仍存在不足,例如小分子量的肽很难被检测到、小肽的抗体合成困难等,只有较少一部分lncRNA编码小肽被鉴定出来。LncRNA编码的小肽在生物体内发挥重要作用,例如参与胚胎发育、肌细胞发生及肿瘤发生发展等过程。其中,在肿瘤中异常表达的lncRNA编码小肽,有望成为肿瘤治疗的小分子药物、药物靶标和生物标志物,表现出诱人的应用前景。本文对常用的预测和验证lncRNA编码小肽的在线工具和实验技术进行了简单介绍,总结了lncRNA编码小肽的功能并探讨了其在肿瘤中的应用前景,同时也分析了目前研究lncRNA编码小肽所面临的挑战,为更好地理解和研究lncRNA编码小肽提供参考。; 关键词长非编码rna 短开放阅读框小肽预测与鉴定小肽的功能; Keywords long non-coding rna(lncrna) short open reading frames(sORFs) prediction and identification of small peptides function of small peptides; 分类号 Q255 [生物学—细胞生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名植物长链非编码RNA研究进展被引量：11: 3; 作者黄小庆李丹丹吴娟; 机构东北林业大学盐碱地生物资源环境研究中心; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期344-359,共16页; 基金东北林业大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(编号:DL12BA38) 东北林业大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(编号:DL13EA04-02) +1 种基金教育部留学回国人员科研启动基金(第47批)资助; 文摘长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)长度大于200个核苷酸,大量存在于生物体中并具有多种生物学功能。目前,植物中发现的lncRNA大多由RNA聚合酶Ⅱ转录,并通过目标模仿、转录干扰、组蛋白甲基化和DNA甲基化等多种机制介导基因的表达,在植物开花、雄性不育、营养代谢、生物和非生物胁迫等生物过程中起着调节因子的作用。文章综述了近年来发现的植物lnc RNA数据库、预测方法、表达及可能的生物学功能。; 关键词数据库基因表达调控生物学功能 long non-coding rnas (lncrnas); Keywords database gene expression regulation biological function; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于表示学习和深度森林的长链非编码RNA编码短肽预测模型被引量：1: 4; 作者纪腾其孟军赵思远胡鹤还; 机构大连理工大学计算机科学与技术学院; 出处《计算机应用》 CSCD 北大核心 2021年第12期3614-3619,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目(61872055)。; 文摘长链非编码RNA(lncRNA)中的小开放阅读框(sORFs)能够编码长度不超过100个氨基酸的短肽。针对短肽预测研究中lncRNA中的sORFs特征不鲜明且高可信度数据尚不充分的问题,提出一种基于表示学习的深度森林(DF)模型。首先,使用常规lncRNA特征提取方法对sORFs进行编码;其次,通过自编码器(AE)进行表示学习来获得输入数据的高效表示;最后,训练DF模型实现对lncRNA编码短肽的预测。实验结果表明,该模型在拟南芥数据集上能够达到92.08%的准确率,高于传统机器学习模型、深度学习模型以及组合模型,且具有较好的稳定性;此外,在大豆与玉米数据集上进行的模型测试中,该模型的准确率分别能达到78.16%和74.92%,验证了所提模型良好的泛化能力。; 关键词长链非编码rna 小开放阅读框短肽表示学习深度森林预测; Keywords long non-coding rna(lncrna) small Open Reading Frames(sORFs) short peptide representation learning Deep Forest(DF) prediction; 分类号 TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	乳腺癌中长非编码RNA及LncRNA编码多肽的功能	郭艾敏朱爽张军	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2024	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	LncRNA编码小肽的功能及研究现状	黎秋慧陈瑜丽刘向华	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	植物长链非编码RNA研究进展	黄小庆李丹丹吴娟	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2015	11	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于表示学习和深度森林的长链非编码RNA编码短肽预测模型	纪腾其孟军赵思远胡鹤还	《计算机应用》 CSCD 北大核心	2021	1	在线阅读下载PDF 职称材料