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基于高通量测序对塔克拉玛干沙漠南缘2种多年生植物根际细菌及真菌群落结构的研究
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作者 高欢欢 曾凡江 +4 位作者 赵秀芳 朱心宁 郭自春 张波 丁泽华 《现代农业科技》 2019年第8期161-163,168,共4页
本研究利用高通量测序法(Miseq测序平台)对塔克拉玛干沙漠南缘2种多年生植物根际土壤微生物进行初步研究。结果表明,骆驼刺根际土壤中细菌分为16门、33纲、67目、129科、320属,柽柳根际土壤中细菌分为14门、30纲、66目、125科、335属;... 本研究利用高通量测序法(Miseq测序平台)对塔克拉玛干沙漠南缘2种多年生植物根际土壤微生物进行初步研究。结果表明,骆驼刺根际土壤中细菌分为16门、33纲、67目、129科、320属,柽柳根际土壤中细菌分为14门、30纲、66目、125科、335属;骆驼刺根际土壤中真菌分为8门、13纲、36目、58科、104属,柽柳根际土壤中真菌分为8门、13纲、34目、59科、92属。2种植物根际微生物群落结构种间存在差异,真菌差异大于细菌且丰度高。 展开更多
关键词 根际微生物 高通量 多样性Miseq平台 塔克拉玛干沙漠
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高通量测序技术在酿酒微生物多样性研究中的应用 被引量:37
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作者 吴成 王春晓 +3 位作者 王晓丹 周鸿翔 黄永光 邱树毅 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第3期348-355,共8页
高通量测序技术是分析研究酿酒微生物多样性的重要手段,与其他方法相比,具有测序方法简单、通量高、速度快和准确度较高等特点。本文在阐述高通量测序技术特点和测序平台的基础上,着重介绍其在酿酒微生物多样性研究领域中常用的数据分... 高通量测序技术是分析研究酿酒微生物多样性的重要手段,与其他方法相比,具有测序方法简单、通量高、速度快和准确度较高等特点。本文在阐述高通量测序技术特点和测序平台的基础上,着重介绍其在酿酒微生物多样性研究领域中常用的数据分析方法和应用现状,旨在为酿酒微生物多样性研究者提供较为系统、全面的关于高通量测序技术的使用策略。 展开更多
关键词 高通量平台 主成分分析 相对丰度热图 白酒 葡萄酒
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高通量测序技术在细菌耐药中的应用 被引量:6
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作者 陈慧娟 刘琪琦 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期865-874,共10页
细菌耐药已成为威胁全球人类公共健康的重要因素之一,快速、准确明确细菌耐药的特性、机制及传播特征对疾病治疗及控制耐药菌的传播具有重要意义。高通量测序技术可以同时平行检测多个基因序列的状态,已广泛应用于细菌耐药检测。目前高... 细菌耐药已成为威胁全球人类公共健康的重要因素之一,快速、准确明确细菌耐药的特性、机制及传播特征对疾病治疗及控制耐药菌的传播具有重要意义。高通量测序技术可以同时平行检测多个基因序列的状态,已广泛应用于细菌耐药检测。目前高通量测序技术在细菌耐药领域的应用主要有:全基因组测序技术、目标区域测序技术和宏基因组测序技术。所采用的测序平台主要为Illumina、Ion Torrent、BGI等二代测序和Pacific Biosciences、Oxford Nonopore等三代测序平台。通过细菌耐药基因预测细菌耐药表型的准确性在很大程度上依赖于成熟的专业耐药基因数据库,各种通用型、特异型及隐马尔可夫模型耐药基因数据库的建立和完善,为高通量测序技术在细菌耐药领域的应用提供了坚实的基础。本文简要介绍了高通量测序技术、数据分析方法及相应测序平台在细菌耐药领域中的应用进展,并同时介绍了细菌耐药数据库的现状。 展开更多
关键词 高通量技术 平台 细菌耐药 耐药基因 耐药基因数据库
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用于单细胞转录组测序的紫花苜蓿根和叶原生质体提取方法研究
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作者 闫振飞 何勇 +6 位作者 孙娟 苗福泓 马利超 李硕 林琳 王增裕 杨国锋 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期74-81,共8页
以紫花苜蓿种子为材料,研究了不同的酶解液浓度、渗透压、离心力对叶和根原生质体分离的影响,旨在获得高产量、高活性的原生质体悬浮液,以便能够使用10×Genomics平台进行单细胞转录组测序,进而了解植物细胞分化的轨迹。结果表明:... 以紫花苜蓿种子为材料,研究了不同的酶解液浓度、渗透压、离心力对叶和根原生质体分离的影响,旨在获得高产量、高活性的原生质体悬浮液,以便能够使用10×Genomics平台进行单细胞转录组测序,进而了解植物细胞分化的轨迹。结果表明:适用于根的最佳酶解液浓度、甘露醇浓度、离心力分别为2%纤维素酶+1%离析酶、0.5 mol/L、300 g;适用于叶的最佳酶解液浓度、甘露醇浓度和离心力分别为1.25%纤维素酶+0.5%果胶酶+0.5%离析酶、0.4 mol/L、180 g。在此条件下,根原生质体的产量和活性分别达到3.95×10^(6)个/g和81%,叶原生质体的产量和活性分别达到7.09×10^(6)个/g和71%,达到10×Genomics平台的上机标准,为进一步开展紫花苜蓿发育的分子细胞生物学研究奠定基础。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 原生质体分离 单细胞转录组 10×Genomics平台
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新款桌式基因组测序仪Ion Torrent发布
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《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期328-328,共1页
2011年3月17日,Life Technologies公司在北京科技会堂举行2011年生命科学新技术报告会并发布了利用半导体芯片实现高通量测序的Ion Torrent个人化操作基因组测序仪。据介绍,Ion Torrent(PGMtu)作为以半导体芯片进行测序的技术平台... 2011年3月17日,Life Technologies公司在北京科技会堂举行2011年生命科学新技术报告会并发布了利用半导体芯片实现高通量测序的Ion Torrent个人化操作基因组测序仪。据介绍,Ion Torrent(PGMtu)作为以半导体芯片进行测序的技术平台属于基因组测序领域内的革新性产品。通过专有的大规模并行半导体感应器, 展开更多
关键词 基因组 半导体芯片 桌式 生命科学 技术平台 ION 高通量 报告会
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山东省农业科学院测序中心
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《山东农业科学》 2013年第1期F0003-F0003,共1页
山东省农业科学院测序中心成立于2006年,隶属山东省农科院高新技术研究中心,是以“小麦、玉米国家工程实验室”等十余个国家及省部级重点实验审为依托,建立的高通量基因测序技术平台。
关键词 山东省农业科学院 基因 技术研究中心 山东省农科院 技术平台 实验室 高通量 小麦
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