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基于Agricultural Animal Omics Database(AAOD)数据库挖掘绵羊GDF9基因变异
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作者 潘晔君 刘耿 +2 位作者 潘传英 张清峰 蓝贤勇 《畜牧兽医杂志》 2025年第3期1-9,共9页
目前利用大数据和组学数据库提高绵羊繁殖性能成为解决当前产业发展的关键之一。绵羊生长分化因子9(GDF9)基因对卵泡发育、排卵率及产羔数起着至关重要的作用,也是目前确定的绵羊多胎性状的主效基因之一;虽然其部分重要突变位点与产羔... 目前利用大数据和组学数据库提高绵羊繁殖性能成为解决当前产业发展的关键之一。绵羊生长分化因子9(GDF9)基因对卵泡发育、排卵率及产羔数起着至关重要的作用,也是目前确定的绵羊多胎性状的主效基因之一;虽然其部分重要突变位点与产羔数有关,但绵羊该基因所有可能基因变异如何挖掘仍然是一个尚待解决的问题。近年来,西北农林科技大学动物科技学院姜雨团队开发出Agricultural Animal Omics Database(AAOD)数据库,它整合了全球公共数据及中国本地特色绵羊品种的高深度基因组数据,涵盖50多个品种的遗传变异(SNPs、InDels)、表观标记及表型关联信息,并实现每月动态更新。基于此,本研究旨在利用AAOD数据库挖掘绵羊GDF9基因变异,并期望深入解析GDF9基因的分子结构、表达模式、富集分析、挖掘新的与繁殖力相关的突变位点及其在绵羊繁殖力中的潜在作用。这些结果将为基因编辑技术改良绵羊繁殖力提供新的潜在位点,将为提高绵羊繁殖力提供了遗传改良的理论依据与策略。 展开更多
关键词 绵羊 GDF9基因 Agricultural Animal Omics database(AAOD)数据库 单核苷酸多态性 插入缺失
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采用Geodatabase技术构建流域水文系统地理数据库——以太湖地区西苕溪流域为例 被引量:9
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作者 李恒鹏 刘晓玫 李金莲 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第3期275-281,共7页
如何表达流域复杂的系统结构是实现流域信息与模型集成,构建流域决策支持系统需要研究的首要问题.在分析现有流域数据库存在问题的基础上,以太湖流域西南部的西苕溪流域为研究区,采用面向对象的Geodatabase地理数据技术,通过分析流域系... 如何表达流域复杂的系统结构是实现流域信息与模型集成,构建流域决策支持系统需要研究的首要问题.在分析现有流域数据库存在问题的基础上,以太湖流域西南部的西苕溪流域为研究区,采用面向对象的Geodatabase地理数据技术,通过分析流域系统的组成要素及过程,提出面向流域水文、水质应用需求的数据库信息组织体系;应用Arcgis的Archydro水文分析模块,基于国家基础地理数据库中的数字地形提取流域要素信息,构建了包括河流流线、集水区出水口、监测台站位置、湖库出口等要素的完整水文网络,并分析水文网络要素上下游关系,对流域集水区与河流的水力联系进行表达;通过分析流域监测台站空间信息、监测项目、时间序列的信息特征,设计Geodatabase的表结构和连接类,实现流域空间特征与状态序列的一体化表达,研究可以为流域数据库建设及流域决策支持系统信息平台构建提供一些技术参考. 展开更多
关键词 太湖流域 GEOdatabase 水文系统 数据库 西苕溪 基础地理数据库 流域水文系统 西苕溪流域 数据技术 构建
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基于GeoDatabase的地震构造背景场数据库设计与实现 被引量:4
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作者 刘娜 谢英情 +2 位作者 马颖鹏 李珊 李西 《地震研究》 CSCD 北大核心 2009年第1期94-98,共5页
在介绍GeoDatabase基本结构的基础上,阐述了以个人版GeoDatabase数据模型为基础的云南省地震构造背景场数据库的设计方法实现过程。该数据库建立后能够有效管理多源地震专业数据,可满足地震构造背景数据的一体化管理的需要,并为今后地... 在介绍GeoDatabase基本结构的基础上,阐述了以个人版GeoDatabase数据模型为基础的云南省地震构造背景场数据库的设计方法实现过程。该数据库建立后能够有效管理多源地震专业数据,可满足地震构造背景数据的一体化管理的需要,并为今后地震构造领域的信息化建设提供了一定的科学依据。 展开更多
关键词 地震构造背景数据 GEOdatabase 空间数据库 数据组织
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基于Geo Database的中国岩石圈三维结构数据库设计 被引量:6
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作者 覃如府 许惠平 +1 位作者 欧少佳 叶娜 《地球学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期581-586,共6页
数据对于GIS是非常重要的,但目前在各领域的GIS应用中,普遍对数据的重视程度不够。“中国岩石圈三维结构数据库”是基于GIS(地理信息系统)平台下建立起标准、规范的空间数据库,是整个数据库系统稳定运行的基础。CASE工具是建立复杂地理... 数据对于GIS是非常重要的,但目前在各领域的GIS应用中,普遍对数据的重视程度不够。“中国岩石圈三维结构数据库”是基于GIS(地理信息系统)平台下建立起标准、规范的空间数据库,是整个数据库系统稳定运行的基础。CASE工具是建立复杂地理数据库的最佳方法之一,本文依据面向对象的地理数据模型———GeoDatabase,讨论用CASE工具来建立基于GeoDatabase的中国岩石圈三维结构数据库的具体过程。 展开更多
关键词 中国岩石圈三维结构数据库 GEOdatabase CASE工具 UML
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基于Geodatabase的滑坡灾害空间数据库设计 被引量:8
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作者 朱传华 胡光道 《灾害学》 CSCD 2010年第2期54-57,共4页
整个设计旨在建立滑坡灾害空间数据库,有效管理滑坡灾害数据,为滑坡灾害预测预报服务。基于Geodatabse数据模型,使用CASE工具,在分析滑坡灾害风险评价的数据需求和数据特点的基础上,得出了滑坡灾害空间数据概念模型图,建立了滑坡灾害空... 整个设计旨在建立滑坡灾害空间数据库,有效管理滑坡灾害数据,为滑坡灾害预测预报服务。基于Geodatabse数据模型,使用CASE工具,在分析滑坡灾害风险评价的数据需求和数据特点的基础上,得出了滑坡灾害空间数据概念模型图,建立了滑坡灾害空间数据库。在设计过程中,提出了空间数据和非空间数据的整合方式,以及滑坡监测时间序列数据格式化的示例。 展开更多
关键词 滑坡灾害 GEOdatabase 空间数据库
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基于Geodatabase数据模型和Case工具设计实现配电GIS数据库 被引量:7
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作者 冯晓良 徐学军 +1 位作者 胡森 韩云 《继电器》 CSCD 北大核心 2007年第10期59-63,共5页
传统的地理信息系统数据模型难以表达非结构化数据和GIS中具有复杂结构的数据,也不能表达继承、聚合等在GIS中广泛使用的关系。文章概述了Geodatabase模型的结构和特点,并针对配电网数据结构的特点,在Geodatabase模型的基础上,利用UML... 传统的地理信息系统数据模型难以表达非结构化数据和GIS中具有复杂结构的数据,也不能表达继承、聚合等在GIS中广泛使用的关系。文章概述了Geodatabase模型的结构和特点,并针对配电网数据结构的特点,在Geodatabase模型的基础上,利用UML建模语言和ArcGIS提供的Case工具,设计并实现了配电GIS数据库。这种数据模型和设计方法比传统方法直观、简单且易于修改,对配电网的描述更贴切,利于数据库设计的优化,是设计空间数据库的一种较好的方法。 展开更多
关键词 Geodatabase数据模型 UML CASE工具 配电网数据库
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基于Geodatabase的面向对象时空数据模型 被引量:10
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作者 姜晓轶 周云轩 蒋雪中 《计算机工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第24期27-29,共3页
针对时空数据模型与时态地理信息系统研究中存在的几类问题,提出了一种通用的面向对象时空数据模型GOO-STDM。该模型从时空对象的基本属性和行为出发,运用面向对象方法,将地学对象封装为空间、专题、时间的整体,满足地学对象的what/wher... 针对时空数据模型与时态地理信息系统研究中存在的几类问题,提出了一种通用的面向对象时空数据模型GOO-STDM。该模型从时空对象的基本属性和行为出发,运用面向对象方法,将地学对象封装为空间、专题、时间的整体,满足地学对象的what/where/when语义,具有良好的扩展性。在GOO-STDM基础上,利用Geodatabase模型,采用定制ArcGIS的方法,实现了支持双时态语义的原型TGIS系统,既能满足时空表达的需要,又继承了ArcGIS系统的功能。 展开更多
关键词 时态地理信息系统 时空数据模型 时空数据库 GEOdatabase
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基于Geodatabase的林火扑救空间数据库的设计与实现 被引量:2
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作者 臧淑英 梅晓丹 冯仲科 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第S2期107-110,共4页
随着空间数据量的日益增大及对数据质量要求的日益提高,空间数据库在GIS中的作用越来越重要.该文首先介绍了ArcGIS 9.0中新一代数据模型库Geodatabase的概念、特点和分类,然后对林火扑救的数据源进行了分类,同时着重分析了基于Geodatab... 随着空间数据量的日益增大及对数据质量要求的日益提高,空间数据库在GIS中的作用越来越重要.该文首先介绍了ArcGIS 9.0中新一代数据模型库Geodatabase的概念、特点和分类,然后对林火扑救的数据源进行了分类,同时着重分析了基于Geodatabase的林火扑救空间数据库的结构.最后以庆安县数据为例,设计了庆安县的林火扑救Geodatabase数据库,选用个人Geodatabase来存储,使用ArcGIS9.0的ArcCatalog和ArcMap工具来创建、管理和操作林火扑救空间数据库,以实现属性数据和空间数据无缝集成和一体化存储管理. 展开更多
关键词 GEOdatabase 林火扑救 空间数据库
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基于GeoDatabase的长江流域生态环境信息库模型 被引量:6
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作者 李喆 谭德宝 +2 位作者 程学军 汪朝晖 宋丽 《长江科学院院报》 CSCD 北大核心 2010年第1期4-8,共5页
从空间数据库模型的角度出发,深入分析长江流域生态环境数据的主要种类及其特点,引入GeoDatabase模型的基本概念,尝试使用GeoDatabase模型来组织和管理这些数据,并分别给出长江流域生态环境信息库中特征数据集、栅格数据集和TIN数据集... 从空间数据库模型的角度出发,深入分析长江流域生态环境数据的主要种类及其特点,引入GeoDatabase模型的基本概念,尝试使用GeoDatabase模型来组织和管理这些数据,并分别给出长江流域生态环境信息库中特征数据集、栅格数据集和TIN数据集的组织方式,讨论空间数据与属性数据的连接方法,最后进行了模型评价。 展开更多
关键词 长江流域生态环境信息库 空间数据模型 GEOdatabase模型
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基于Geodatabase的矿区地质灾害数据库的设计 被引量:4
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作者 高佳 《西安科技大学学报》 CAS 2014年第6期748-753,共6页
为了研究和治理矿山开采地区几种常见地质灾害,提高对地质灾害数据的掌握,文中在对矿区地质灾害数据进行收集和整理的基础上,通过对相关技术空间数据引擎、Geodatabase模型进行了简单的介绍,并重点叙述了矿区地质灾害信息管理系统中空... 为了研究和治理矿山开采地区几种常见地质灾害,提高对地质灾害数据的掌握,文中在对矿区地质灾害数据进行收集和整理的基础上,通过对相关技术空间数据引擎、Geodatabase模型进行了简单的介绍,并重点叙述了矿区地质灾害信息管理系统中空间数据库和属性数据库的设计方法及过程,最后从两个数据库的连接等方面,对空间数据和属性数据进行汇总、加工、校验和入库,从而完成了数据库的建立。结果表明:该数据库一旦建立,可满足矿区地质灾害管理一体化的需要,可以为区域地质灾害易发性、危险性区划提供直接的数据支持,为地质灾害信息系统在防灾规划中的应用莫定基础,也为防灾减灾工作提供科学依据。 展开更多
关键词 矿区地质灾害 地理信息管理系统 空间数据库 属性数据库
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基于操作历史图的分布式Key-Value数据库一致性检测算法 被引量:10
11
作者 廖彬 张陶 +3 位作者 李敏 于炯 国冰磊 刘炎 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2019年第12期213-219,共7页
分布式数据库系统的副本机制在提高系统可靠性及性能的同时,导致了多副本数据管理的一致性问题;数据一致性的实现需要一致性协议模型来进行预防,也需要一致性检测算法对非一致数据进行检测。首先,对读写操作记录之间的时序关系、安全一... 分布式数据库系统的副本机制在提高系统可靠性及性能的同时,导致了多副本数据管理的一致性问题;数据一致性的实现需要一致性协议模型来进行预防,也需要一致性检测算法对非一致数据进行检测。首先,对读写操作记录之间的时序关系、安全一致性及并行一致性原则等概念进行定义;其次,根据操作记录集合中读写操作之间的并行与时序关系,提取出操作记录集合向操作记录图转化的规则,并在此基础上设计了操作记录向历史记录图的转化算法;然后,以历史记录图为输入,设计了违反一致性查找算法,查找并返回图中所有违反安全与并行一致性读操作的集合;最后,基于Cassandra进行实验并将读写一致性设置为ONE,通过YCSB产生并行读写压力测试,与同类算法的对比实验验证了所提算法在功能与效率两方面的优越性。 展开更多
关键词 分布式数据库 key-value数据库 一致性原则 一致性检测 DAG图
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一种基于裸闪存的Key-Value数据库优化方法 被引量:7
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作者 秦雄军 张佳程 +1 位作者 陆游游 舒继武 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2017年第6期1326-1336,共11页
近年来,非关系型的key-value数据库得到越来越广泛的应用.然而,目前主流的key-value数据库或者是基于磁盘设计的,或者是传统的基于文件系统和闪存转换层FTL来构建的,难以发挥闪存存储设备的特性,限制了I/O的并发性能,且垃圾回收过程复杂... 近年来,非关系型的key-value数据库得到越来越广泛的应用.然而,目前主流的key-value数据库或者是基于磁盘设计的,或者是传统的基于文件系统和闪存转换层FTL来构建的,难以发挥闪存存储设备的特性,限制了I/O的并发性能,且垃圾回收过程复杂.设计并实现了一种基于裸闪存的keyvalue数据管理架构Flashkv,通过用户态下的管理单元进行空间管理和垃圾回收,充分利用了闪存设备内部的并发特性,并简化了垃圾回收过程,去除了传统文件系统和FTL中的冗余功能,缩短了I/O路径.提出了基于闪存特点的I/O调度技术,优化了闪存的读写延迟,提高了吞吐率;提出了用户态缓存管理技术,降低了数据写入量和频繁系统调用所带来的开销.测试结果表明,Flashkv性能是levelDB的1.9~2.2倍,写入量减少60%~65%. 展开更多
关键词 key-value数据库 闪存 裸设备 数据存储 使用寿命
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多数据库系统集成平台CMDatabase体系结构
13
作者 魏振钢 郭山清 贾忠伟 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2003年第21期112-113,119,共3页
在比较传统的两种实现多数据库系统的体系结构后,针对大规模的数据集成提出 了一种新的体系结构,该体系结构方便了用户的操作,提高了运行效率。
关键词 多数据库系统 异构数据库 体系结构
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一种基于key-value数据库的快速地名地址输入提示方法 被引量:1
14
作者 曹广顺 呙维 +1 位作者 朱欣焰 佘冰 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2017年第11期3334-3338,3344,共6页
现有地址输入提示方法涉及标准地址和POI的研究较少,地址字符串的索引大多采用Trie(字典)树索引,但Trie树建立时内存消耗巨大,在面临海量数据时,问题更加突出。针对以上问题,提出一种基于key-value数据库的快速地名地址输入提示方法。... 现有地址输入提示方法涉及标准地址和POI的研究较少,地址字符串的索引大多采用Trie(字典)树索引,但Trie树建立时内存消耗巨大,在面临海量数据时,问题更加突出。针对以上问题,提出一种基于key-value数据库的快速地名地址输入提示方法。该方法基于Trie树结构进行改进,降低了地址索引的复杂度;基于keyvalue数据库构建Trie树,避免了内存消耗巨大的问题。实验结果表明,基于key-value数据库构建的Trie树索引较基于内存构建的Trie树索引在事务响应性能和内存消耗方面具有明显的优势和效率。 展开更多
关键词 TRIE树 key-value数据库 地名地址 输入提示
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基于SSD的Key-Value系统优化设计与实现 被引量:1
15
作者 刘峪竹 肖侬 +2 位作者 刘芳 陈志广 唐黎哲 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2014年第S1期136-141,共6页
随着互联网技术的迅猛发展,越来越多的非结构化数据涌入到人们的生活中,为这些数据建立高效的索引面临极大的挑战.键值数据库Key-Value以其结构简单和高扩展性而引起人们的广泛关注,已成为海量数据存储系统中的重要组成部分.由于Key-Va... 随着互联网技术的迅猛发展,越来越多的非结构化数据涌入到人们的生活中,为这些数据建立高效的索引面临极大的挑战.键值数据库Key-Value以其结构简单和高扩展性而引起人们的广泛关注,已成为海量数据存储系统中的重要组成部分.由于Key-Value系统对吞吐量要求较高,而基于Flash的固态硬盘(solid state drive,SSD)能够提供很高的随机读性能,在SSD上构建Key-Value系统已成为海量数据存储领域的一大研究热点.鉴于Flash具有非定点更新、寿命有限等特性,基于SSD的KeyValue系统必须针对Flash的特性作专门优化.以一种称为SkimpyStash的基于SSD的Key-Value系统为基础,提出了一种新的Key-Value系统低延迟存储系统(low latency store,LLStore).LLStore使用内存文件映射技术来减少针对SSD的IO请求,除此之外,针对SkimpyStash中低效的压缩策略,提出一种改进方法,可以在少量增加内存开销的情况下极大地减少查询时间.通过与原系统的性能比较实验,LLStore在平均查询时间上可以获得至少12%的加速. 展开更多
关键词 key-value SSD 数据存储 内存文件映射 压缩
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Geodatabase模型的版本控制原理及应用
16
作者 刘恩林 石军南 +1 位作者 罗鹏 雷平 《吉林林业科技》 2007年第2期32-35,共4页
地理空间数据模型设计是地理信息系统数据库建设的核心问题。本文介绍了GIS发展过程中出现的空间数据模型,以及不同空间数据模型的优缺点。并对Geodatabase版本控制原理进行了分析说明,提出了使用版本控制来管理空间数据库的多用户并发... 地理空间数据模型设计是地理信息系统数据库建设的核心问题。本文介绍了GIS发展过程中出现的空间数据模型,以及不同空间数据模型的优缺点。并对Geodatabase版本控制原理进行了分析说明,提出了使用版本控制来管理空间数据库的多用户并发操作、长事务处理,从而保证空间数据库的完整一致性。 展开更多
关键词 地理信息系统 空间数据库 Gcodatabasc 版本控制
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基于Linux内核的Key-Value存储系统——KStore 被引量:1
17
作者 谢沛东 武延军 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2015年第1期99-102,114,共5页
Key-Value存储系统在各种互联网服务中被广泛使用,但现有的Key-Value存储系统通常在用户态空间设计和实现,因为频繁的模式切换和上下文切换,导致访问接口、事务处理效率不高,在高并发、低延迟的数据存储需求中尤为突出。针对该问题,给... Key-Value存储系统在各种互联网服务中被广泛使用,但现有的Key-Value存储系统通常在用户态空间设计和实现,因为频繁的模式切换和上下文切换,导致访问接口、事务处理效率不高,在高并发、低延迟的数据存储需求中尤为突出。针对该问题,给出了一个内核态Key-Value存储系统的实现——KStore:提供内核空间的索引和内存分配机制,并在此基础上,通过基于内核Socket的远程接口以及基于文件系统的本地接口,保证了KStore的低延迟;同时,通过基于内核多线程的并发处理机制,保证了KStore的并发性。实验结果表明,与Memcached相比,KStore在实时性和并发性方面都取得显著优势。 展开更多
关键词 key-value存储系统 LINUX内核 文件系统 内核Socket 内核线程 Slab内存分配
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基于ArcGIS Geodatabase的浙江良渚古城遗址空间数据库的设计与实现 被引量:22
18
作者 金鑫 董少春 +5 位作者 王晓琪 王宁远 陈明辉 姬翔 徐士进 陆婧 《南京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期163-175,共13页
浙江良渚地区的考古研究工作已开展了八十余年,海量考古数据的存储与管理经历了从文件系统向传统关系型数据库再向空间数据库发展的过程.文件系统和传统关系型数据库在存储和管理考古数据上存在着一定的限制,尤其是不能够充分体现考古... 浙江良渚地区的考古研究工作已开展了八十余年,海量考古数据的存储与管理经历了从文件系统向传统关系型数据库再向空间数据库发展的过程.文件系统和传统关系型数据库在存储和管理考古数据上存在着一定的限制,尤其是不能够充分体现考古数据的空间关系,限制了考古空间分析工作的展开.而空间数据库不仅具有普通数据库存储和管理数据的性质,其特性更在于存储空间图形数据、属性数据并建立起二者之间的联系,从而能够将考古发现与其自身地理空间位置、环境紧密结合,为从空间层面进行区域性和综合性的考古分析提供技术支撑,实现向景观考古分析的迈进.基于ArcGIS Geodatabase设计并实现了良渚古城遗址空间数据库,完成了良渚古城数字化地图的矢量化,并综合考古发掘和研究成果,对不同空间实体进行了属性设计,使得各类已发掘的重要遗址、遗迹的空间位置及其文化背景和相互联系能够在地图上直观地表现出来.这一遗址空间数据库不仅实现了空间数据和属性数据的一体化存储、浏览、查询与管理等基础功能,还提供了考古专题地图的动态制作、考古遗址的空间分析等功能,为区域环境考古、景观考古等提供新的研究思路和有力支撑. 展开更多
关键词 ARCGIS GEOdatabase 空间数据库 考古 良渚古城
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Rules-based object-relational databases ontology construction 被引量:6
19
作者 Chen Jia Wu Yue 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2009年第1期211-215,共5页
To solve the problems of shaving and reusing information in the information system, a rules-based ontology constructing approach from object-relational databases is proposed. A 3-tuple ontology constructing model is p... To solve the problems of shaving and reusing information in the information system, a rules-based ontology constructing approach from object-relational databases is proposed. A 3-tuple ontology constructing model is proposed first. Then, four types of ontology constructing rules including class, property, property characteristics, and property restrictions ave formalized according to the model. Experiment results described in Web ontology language prove that our proposed approach is feasible for applying in the semantic objects project of semantic computing laboratory in UC Irvine. Our approach reduces about twenty percent constructing time compared with the ontology construction from relational databases. 展开更多
关键词 ontology constructing semantic objects object-relational databases RULES ONTOLOGY Web ontologylanguage.
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基于Geodatabase的滑坡地质灾害数据库设计 被引量:6
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作者 张立宪 甘淑 +1 位作者 刘永 吕杰 《科学技术与工程》 2010年第34期8503-8507,共5页
滑坡地质灾害数据库建设在减灾工作中占有重要地位。首先对思茅区滑坡地质灾害资料分析和整理,然后从数据库的概念设计、逻辑结构设计和数据库建设方面详细讨论了滑坡地质灾害数据库的设计。在概念设计阶段对滑坡属性表的基本E-R图进行... 滑坡地质灾害数据库建设在减灾工作中占有重要地位。首先对思茅区滑坡地质灾害资料分析和整理,然后从数据库的概念设计、逻辑结构设计和数据库建设方面详细讨论了滑坡地质灾害数据库的设计。在概念设计阶段对滑坡属性表的基本E-R图进行设计;逻辑设计中对滑坡地质灾害信息编码,属性数据库逻辑结构和空间数据库的结构以及数据完整性设计进行详细讨论。论文最后在详细介绍了空间数据库存储方案的基础上讨论了空间数据库和属性数据库的建立方法。 展开更多
关键词 滑坡 地质灾害 数据库设计 GEOdatabase
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