目的探讨分化抑制因子1(inhibitor of differentiation factor 1,Id1)对人骨肉瘤细胞MG63恶性逆转向成骨分化的影响。方法用重组腺病毒调控MG63细胞中Id1过表达后,RT-PCR及Western blot检测验证Id1的表达情况,CCK-8检测细胞增殖能力,划...目的探讨分化抑制因子1(inhibitor of differentiation factor 1,Id1)对人骨肉瘤细胞MG63恶性逆转向成骨分化的影响。方法用重组腺病毒调控MG63细胞中Id1过表达后,RT-PCR及Western blot检测验证Id1的表达情况,CCK-8检测细胞增殖能力,划痕实验检测细胞迁移能力,Transwell实验检测细胞侵袭能力,流式细胞术检测细胞周期,ALP读数法检测成骨分化早期指标ALP的活力。结果 Ad Id1重组腺病毒可以使MG63细胞中的Id1表达量增高,Adsi Id1重组腺病毒可以使MG63细胞中的Id1表达量降低(P<0.05);Id1过表达后,MG63细胞的增殖能力、迁移能力、侵袭能力等恶性生物学行为均增强,G1期细胞比例降低,Id1表达量下调后则逆转MG63细胞的恶性生物学行为,G1期细胞比例增高(P<0.05);Id1表达量下调后,正常成骨分化的早期指标碱性磷酸酶(ALP)表达量增高(P<0.05)。结论抑制Id1基因表达可以促使骨肉瘤的恶性生物学行为逆转并诱导骨肉瘤细胞发生成骨分化。展开更多
分化抑制因子-1(Inhibitor of differentiation-1,Id1),属于螺旋-环-螺旋(Helix-loop-helix,HLH)蛋白,最初研究发现在正常细胞发育过程中Id1能抑制细胞的分化,近年来发现Id1还参与到细胞周期的调控过程中,促进细胞增殖。Id1不仅影响正...分化抑制因子-1(Inhibitor of differentiation-1,Id1),属于螺旋-环-螺旋(Helix-loop-helix,HLH)蛋白,最初研究发现在正常细胞发育过程中Id1能抑制细胞的分化,近年来发现Id1还参与到细胞周期的调控过程中,促进细胞增殖。Id1不仅影响正常细胞的发育生长,在许多肿瘤中也出现高表达。Id1能影响细胞外基质的降解及肿瘤血管的生成,与肿瘤的侵袭密切相关。本文主要探讨Id1在肿瘤侵袭中的作用及其可能的分子机制。展开更多
【目的】分析镉胁迫下中辽1号杨的转录水平,筛选差异表达基因,挖掘与镉胁迫相关的功能基因,为深入探索中辽1号杨对镉胁迫响应的分子机制提供理论依据。【方法】以中辽1号杨为试验材料,采用盆栽试验的方法将其扦插于土壤Cd含量为20 mg/kg...【目的】分析镉胁迫下中辽1号杨的转录水平,筛选差异表达基因,挖掘与镉胁迫相关的功能基因,为深入探索中辽1号杨对镉胁迫响应的分子机制提供理论依据。【方法】以中辽1号杨为试验材料,采用盆栽试验的方法将其扦插于土壤Cd含量为20 mg/kg(M20)的花盆中,以不加Cd为对照(CK),80 d后采集不同处理中辽1号杨叶片进行转录组测序,使用DESeq2软件筛选CK与M20处理中辽1号杨的差异表达基因,将得到的差异基因在基因本体数据库(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、蛋白相邻类聚簇数据库(clusters of orthologous groups of proteins,COG)中进行注释,分析差异表达基因在不同数据库中的注释信息。随机挑选6个差异表达基因(超氧化物歧化酶(SOD)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(STK)、脱落酸(ABA)、T复合蛋白1(TCP1)、MYB基因(MYB)、丝裂原活蛋白激酶12(MAPK12)),利用Primer 5软件设计特异性引物进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)试验,检测这6个基因表达水平的变化,验证转录组结果的准确性。【结果】在CK和M20处理的中辽1号杨中,共发现3812个差异表达基因,其中上调表达的有2209个,下调表达的有1603个。GO分析发现,差异表达基因注释到3大类49个功能组中,其中与代谢过程有关基因最多。转录组KEGG代谢通路分析发现,差异表达基因主要在信号转导途径、代谢途径和生物合成途径富集。COG分析发现,1455个差异基因被注释到22种分类中,其中一般功能预测基因注释最多,其次是信号转导机制基因。结合各数据库分析结果发现,Cd胁迫下中辽1号杨转录组的注释结果中代谢过程和信号转导过程相关基因较多。镉胁迫下差异表达基因最多的家族是ABC、MYB、WRKY、bHLH和NAC基因家族,挖掘出与镉胁迫相关基因WRKY家族基因47(WRKY47)、硝酸盐转运蛋白基因(NRT)、ABC家族转运蛋白基因2(ABC2)、苹果酸脱氢酶(MDH)、谷胱甘肽S-转移酶基因(GSTs)、NAC家族基因2(NAC2)的表达量显著上调,MYB家族基因44(MYB44)、重金属相关异戊二烯化植物蛋白基因39(HIPP39)的表达量显著下调。RT-qPCR结果显示,随机挑选6个差异表达基因表达量的变化趋势与转录组测序结果一致。【结论】镉胁迫后中辽1号杨转录组的差异表达基因主要富集在代谢过程和信号转导过程,挖掘出与镉胁迫相关基因,分别是WRKY47、NRT、ABC2、MDH、GSTs、NAC2、MYB44、HIPP39,为深入探索杨树对镉胁迫响应的分子机制提供了理论依据。展开更多
目的:探讨分化抑制因子1基因(inhibitor of differentiation-1, Id1)和Id3是否协同促进结肠癌SW620细胞EMT和细胞的侵袭迁移能力及其可能的机制。方法:利用慢病毒载体构建Idl和Id3单或双基因敲减的结肠癌SW620细胞,实验分为4组:SW620-Sh...目的:探讨分化抑制因子1基因(inhibitor of differentiation-1, Id1)和Id3是否协同促进结肠癌SW620细胞EMT和细胞的侵袭迁移能力及其可能的机制。方法:利用慢病毒载体构建Idl和Id3单或双基因敲减的结肠癌SW620细胞,实验分为4组:SW620-Sh-Id1组(转染shRNA-Id1)、SW620-Sh-Id3组(转染shRNA-Id3)、SW620-Sh-Id1-Id3组(共转染shRNA-Id1和shRNAId3)、SW620-NC组(转染阴性空载慢病毒)。用qPCR法和Western blotting法分别检测敲减效果,显微镜下观察稳定下调Idl和Id3后SW620细胞形态的变化,划痕愈合实验和Transwell小室法检测SW620细胞迁移和侵袭的变化,Western blotting检测EMT标志分子及迁移、侵袭相关蛋白的表达。结果:成功构建了Idl和Id3单基因敲减与双基因敲减的结肠癌SW620细胞株。(1)Idl和Id3的敲除诱导SW620细胞形态由上皮样向间质样转变;(2)与对照组相比,SW620-Sh-Id1组和SW620-Sh-Id3组SW620细胞侵袭和迁移的能力显著下降(均P<0.05);SW620-Sh-Id1-Id3组细胞侵袭和迁移的能力较SW620-Sh-Id1组和SW620-Sh-Id3组也明显下降(均P<0.05);(3)与对照组相比,SW620-Sh-Id1组和SW620-Sh-Id3组β-catenin、snail1及MMP2蛋白表达降低,上皮黏蛋白及TIMP2蛋白表达增高(均P<0.05);SW620-Sh-Id1-Id3组与SW620-Sh-Id1组和SW620-Sh-Id3组相比,β-catenin、snail1及MMP2蛋白表达也下降,同时上皮钙黏蛋白及TIMP2蛋白表达也增高(均P<0.05)。结论:Id1和Id3可能通过诱导EMT协同影响结肠癌SW620细胞侵袭与迁移的能力。展开更多
OBJECTIVE To determine the role of the basic helix-loop-helix(b HLH)transcription factor,differentiated embryonic chondrocyte gene 1(DEC1),in the apoptosis induced by 1-methyl-4-phenylpyridiniumion(MPP+)in SH-SY5Y cel...OBJECTIVE To determine the role of the basic helix-loop-helix(b HLH)transcription factor,differentiated embryonic chondrocyte gene 1(DEC1),in the apoptosis induced by 1-methyl-4-phenylpyridiniumion(MPP+)in SH-SY5Y cells.METHODS SH-SY5Y cells were treated with different concentrations of MPP+for 24or 48 h.The cell inhibition and apoptosis were measured by MTT and DAPI staining.DEC1,the apoptosis-related proteins and PI3K/Akt/GSK3β/β-catenin signaling were determined by Western blotting.The expression of DEC1was regulated by overexpression and sh RNA.RESULTS MPP+induces apoptosis along with decreasing of DEC1expression in SH-SY5Y cells.Overexpression or knockdown of DEC1 can alleviate or enhance the cell inhibition induced by MPP+.And overexpression of DEC1 can alleviate the increased cleaved caspase 3/caspase 3 but not alleviate Bax/Bcl-2 induced by MPP+.Meanwhile,MPP+represses PI3Kp110α,p-Akt/Akt,p-GSK-3β/GSK-3βandβ-catenin expression,which is accompanied by decreasing DEC1 expressions.It is confirmed that the activator or inhibitor of PI3K/Akt/GSK-3βpathway can alleviate or enhance the repression of PI3K/Akt/GSK3β/β-catenin signaling cascade induced by MPP+.Further study,we find that overexpression of DEC1 alone can increase PI3Kp110α,p-Akt/Akt,p-GSK-3β/GSK-3β,andβ-catenin expression.More importantly,overexpression of DEC1 significantly alleviates the decreased levels of PI3Kp110α,p-Akt/Akt,p-GSK-3β/GSK-3β,andβ-catenin induced by MPP+.CONCLUSION DEC1 provides neuroprotection from apoptosis induced by MPP+through PI3K/Akt pathway in SH-SY5Y cells.Promisingly,DEC1 is a candidate gene that may provide a novel therapeutic approach for the treatment of Parkinson disease.展开更多
文摘目的探讨分化抑制因子1(inhibitor of differentiation factor 1,Id1)对人骨肉瘤细胞MG63恶性逆转向成骨分化的影响。方法用重组腺病毒调控MG63细胞中Id1过表达后,RT-PCR及Western blot检测验证Id1的表达情况,CCK-8检测细胞增殖能力,划痕实验检测细胞迁移能力,Transwell实验检测细胞侵袭能力,流式细胞术检测细胞周期,ALP读数法检测成骨分化早期指标ALP的活力。结果 Ad Id1重组腺病毒可以使MG63细胞中的Id1表达量增高,Adsi Id1重组腺病毒可以使MG63细胞中的Id1表达量降低(P<0.05);Id1过表达后,MG63细胞的增殖能力、迁移能力、侵袭能力等恶性生物学行为均增强,G1期细胞比例降低,Id1表达量下调后则逆转MG63细胞的恶性生物学行为,G1期细胞比例增高(P<0.05);Id1表达量下调后,正常成骨分化的早期指标碱性磷酸酶(ALP)表达量增高(P<0.05)。结论抑制Id1基因表达可以促使骨肉瘤的恶性生物学行为逆转并诱导骨肉瘤细胞发生成骨分化。
文摘分化抑制因子-1(Inhibitor of differentiation-1,Id1),属于螺旋-环-螺旋(Helix-loop-helix,HLH)蛋白,最初研究发现在正常细胞发育过程中Id1能抑制细胞的分化,近年来发现Id1还参与到细胞周期的调控过程中,促进细胞增殖。Id1不仅影响正常细胞的发育生长,在许多肿瘤中也出现高表达。Id1能影响细胞外基质的降解及肿瘤血管的生成,与肿瘤的侵袭密切相关。本文主要探讨Id1在肿瘤侵袭中的作用及其可能的分子机制。
文摘【目的】分析镉胁迫下中辽1号杨的转录水平,筛选差异表达基因,挖掘与镉胁迫相关的功能基因,为深入探索中辽1号杨对镉胁迫响应的分子机制提供理论依据。【方法】以中辽1号杨为试验材料,采用盆栽试验的方法将其扦插于土壤Cd含量为20 mg/kg(M20)的花盆中,以不加Cd为对照(CK),80 d后采集不同处理中辽1号杨叶片进行转录组测序,使用DESeq2软件筛选CK与M20处理中辽1号杨的差异表达基因,将得到的差异基因在基因本体数据库(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、蛋白相邻类聚簇数据库(clusters of orthologous groups of proteins,COG)中进行注释,分析差异表达基因在不同数据库中的注释信息。随机挑选6个差异表达基因(超氧化物歧化酶(SOD)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(STK)、脱落酸(ABA)、T复合蛋白1(TCP1)、MYB基因(MYB)、丝裂原活蛋白激酶12(MAPK12)),利用Primer 5软件设计特异性引物进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)试验,检测这6个基因表达水平的变化,验证转录组结果的准确性。【结果】在CK和M20处理的中辽1号杨中,共发现3812个差异表达基因,其中上调表达的有2209个,下调表达的有1603个。GO分析发现,差异表达基因注释到3大类49个功能组中,其中与代谢过程有关基因最多。转录组KEGG代谢通路分析发现,差异表达基因主要在信号转导途径、代谢途径和生物合成途径富集。COG分析发现,1455个差异基因被注释到22种分类中,其中一般功能预测基因注释最多,其次是信号转导机制基因。结合各数据库分析结果发现,Cd胁迫下中辽1号杨转录组的注释结果中代谢过程和信号转导过程相关基因较多。镉胁迫下差异表达基因最多的家族是ABC、MYB、WRKY、bHLH和NAC基因家族,挖掘出与镉胁迫相关基因WRKY家族基因47(WRKY47)、硝酸盐转运蛋白基因(NRT)、ABC家族转运蛋白基因2(ABC2)、苹果酸脱氢酶(MDH)、谷胱甘肽S-转移酶基因(GSTs)、NAC家族基因2(NAC2)的表达量显著上调,MYB家族基因44(MYB44)、重金属相关异戊二烯化植物蛋白基因39(HIPP39)的表达量显著下调。RT-qPCR结果显示,随机挑选6个差异表达基因表达量的变化趋势与转录组测序结果一致。【结论】镉胁迫后中辽1号杨转录组的差异表达基因主要富集在代谢过程和信号转导过程,挖掘出与镉胁迫相关基因,分别是WRKY47、NRT、ABC2、MDH、GSTs、NAC2、MYB44、HIPP39,为深入探索杨树对镉胁迫响应的分子机制提供了理论依据。
基金The project supported by National Natural Science Foundation of China(81573503,81373443)by the Major Project of Jiangsu Provincial Department of Education(13KJA310003)
文摘OBJECTIVE To determine the role of the basic helix-loop-helix(b HLH)transcription factor,differentiated embryonic chondrocyte gene 1(DEC1),in the apoptosis induced by 1-methyl-4-phenylpyridiniumion(MPP+)in SH-SY5Y cells.METHODS SH-SY5Y cells were treated with different concentrations of MPP+for 24or 48 h.The cell inhibition and apoptosis were measured by MTT and DAPI staining.DEC1,the apoptosis-related proteins and PI3K/Akt/GSK3β/β-catenin signaling were determined by Western blotting.The expression of DEC1was regulated by overexpression and sh RNA.RESULTS MPP+induces apoptosis along with decreasing of DEC1expression in SH-SY5Y cells.Overexpression or knockdown of DEC1 can alleviate or enhance the cell inhibition induced by MPP+.And overexpression of DEC1 can alleviate the increased cleaved caspase 3/caspase 3 but not alleviate Bax/Bcl-2 induced by MPP+.Meanwhile,MPP+represses PI3Kp110α,p-Akt/Akt,p-GSK-3β/GSK-3βandβ-catenin expression,which is accompanied by decreasing DEC1 expressions.It is confirmed that the activator or inhibitor of PI3K/Akt/GSK-3βpathway can alleviate or enhance the repression of PI3K/Akt/GSK3β/β-catenin signaling cascade induced by MPP+.Further study,we find that overexpression of DEC1 alone can increase PI3Kp110α,p-Akt/Akt,p-GSK-3β/GSK-3β,andβ-catenin expression.More importantly,overexpression of DEC1 significantly alleviates the decreased levels of PI3Kp110α,p-Akt/Akt,p-GSK-3β/GSK-3β,andβ-catenin induced by MPP+.CONCLUSION DEC1 provides neuroprotection from apoptosis induced by MPP+through PI3K/Akt pathway in SH-SY5Y cells.Promisingly,DEC1 is a candidate gene that may provide a novel therapeutic approach for the treatment of Parkinson disease.
