目的基于气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)代谢组学技术建立4种环境温度下窒息死大鼠早期死亡时间推断的正交偏最小二乘(orthogonal partial least square,OPLS)模型,用于推断不同温度条件下窒息死大鼠的早...目的基于气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)代谢组学技术建立4种环境温度下窒息死大鼠早期死亡时间推断的正交偏最小二乘(orthogonal partial least square,OPLS)模型,用于推断不同温度条件下窒息死大鼠的早期死亡时间。方法将96只大鼠平均分为4个温度组(5℃、15℃、25℃、35℃),每组再分为死后3h、6h、12h、24h,另取6只大鼠作为对照组。4个温度组于设定的时间点、对照组于死后0 h取心血进行GC-MS代谢组学分析。通过OPLS分析,以变量投影重要性(variable importance in projection,VIP)>1及Kruskal-Wallis检验P<0.001筛选出各温度组大鼠心血中与死亡时间相关的差异代谢物,利用差异代谢物分别建立不同温度组的OPLS回归模型,同时设置预测组考察模型的预测能力。结果通过OPLS分析,分别从5℃、15℃、25℃、35℃组大鼠心血中筛选出18、15、24、30种差异代谢物(包括有机酸、氨基酸、糖类、脂质等)。4个温度组模型的预测结果显示,5℃模型相对其他组预测偏差较大,其余各温度组预测结果较为理想。结论不同环境温度下大鼠尸体心血中的代谢物变化有一定差异,利用代谢组学技术推断死亡时间的研究中应当考察环境温度的影响,有望提高死亡时间推断的准确性。展开更多
文摘目的基于气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)代谢组学技术建立4种环境温度下窒息死大鼠早期死亡时间推断的正交偏最小二乘(orthogonal partial least square,OPLS)模型,用于推断不同温度条件下窒息死大鼠的早期死亡时间。方法将96只大鼠平均分为4个温度组(5℃、15℃、25℃、35℃),每组再分为死后3h、6h、12h、24h,另取6只大鼠作为对照组。4个温度组于设定的时间点、对照组于死后0 h取心血进行GC-MS代谢组学分析。通过OPLS分析,以变量投影重要性(variable importance in projection,VIP)>1及Kruskal-Wallis检验P<0.001筛选出各温度组大鼠心血中与死亡时间相关的差异代谢物,利用差异代谢物分别建立不同温度组的OPLS回归模型,同时设置预测组考察模型的预测能力。结果通过OPLS分析,分别从5℃、15℃、25℃、35℃组大鼠心血中筛选出18、15、24、30种差异代谢物(包括有机酸、氨基酸、糖类、脂质等)。4个温度组模型的预测结果显示,5℃模型相对其他组预测偏差较大,其余各温度组预测结果较为理想。结论不同环境温度下大鼠尸体心血中的代谢物变化有一定差异,利用代谢组学技术推断死亡时间的研究中应当考察环境温度的影响,有望提高死亡时间推断的准确性。
