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穿心莲ent-柯巴基焦磷酸合酶基因的克隆与生物信息学分析
被引量：
9
1
作者
姚攀
陈慧芝
+3 位作者
李竹君
何瑞
杨锦芬
徐晖
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期156-162,共7页
旨在克隆穿心莲CPS的编码基因,并进行序列分析。通过RT-PCR和cDNA末端快速扩增的技术从穿心莲叶片中获得目的基因;并利用生物信息学的方法对其编码蛋白进行功能分析。结果显示,获得了全长2 499 bp的cDNA序列,编码一个833 aa的蛋白。序...
旨在克隆穿心莲CPS的编码基因,并进行序列分析。通过RT-PCR和cDNA末端快速扩增的技术从穿心莲叶片中获得目的基因;并利用生物信息学的方法对其编码蛋白进行功能分析。结果显示,获得了全长2 499 bp的cDNA序列,编码一个833 aa的蛋白。序列同源性比较表明,该蛋白与野甘草、咖啡等其他植物来源的CPS具有较高的同源性。保守功能结构域分析显示,该蛋白包含一个富含Asp残基的植物萜类合酶的共有保守功能域"DXDD",归属于萜类生物合成酶I类超级家族和顺式聚异戊二烯焦磷酸合酶超级家族。初步推测克隆得到了穿心莲CPS的编码基因(命名为ApCPS,GenBank登录号为JN216843.1)。
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关键词
穿心莲
穿心莲内
酯
ent-
焦磷酸
古巴
酯
合成酶
(
cps
)
基因克隆
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职称材料
题名
穿心莲ent-柯巴基焦磷酸合酶基因的克隆与生物信息学分析
被引量：
9
1
作者
姚攀
陈慧芝
李竹君
何瑞
杨锦芬
徐晖
机构
广州中医药大学、中药资源科学与工程研究中心
岭南中药资源教育部重点实验室、广州中医药大学
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期156-162,共7页
文摘
旨在克隆穿心莲CPS的编码基因,并进行序列分析。通过RT-PCR和cDNA末端快速扩增的技术从穿心莲叶片中获得目的基因;并利用生物信息学的方法对其编码蛋白进行功能分析。结果显示,获得了全长2 499 bp的cDNA序列,编码一个833 aa的蛋白。序列同源性比较表明,该蛋白与野甘草、咖啡等其他植物来源的CPS具有较高的同源性。保守功能结构域分析显示,该蛋白包含一个富含Asp残基的植物萜类合酶的共有保守功能域"DXDD",归属于萜类生物合成酶I类超级家族和顺式聚异戊二烯焦磷酸合酶超级家族。初步推测克隆得到了穿心莲CPS的编码基因(命名为ApCPS,GenBank登录号为JN216843.1)。
关键词
穿心莲
穿心莲内
酯
ent-
焦磷酸
古巴
酯
合成酶
(
cps
)
基因克隆
Keywords
Andrographis paniculata Andrographolides
ent-
copalyl diphosphate synthase（
cps
） Gene cloning
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
穿心莲ent-柯巴基焦磷酸合酶基因的克隆与生物信息学分析
姚攀
陈慧芝
李竹君
何瑞
杨锦芬
徐晖
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
9
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