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题名DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群
被引量:4
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作者
付小花
李艳丽
乐毅全
王磊
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机构
同济大学污染控制与资源化研究国家重点实验室
同济大学海洋地质国家重点实验室
上海市城市化生态过程与生态恢复重点实验室
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出处
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2012年第9期45-47,50,共4页
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基金
国家自然科学基金资助项目(40571145,40871217)
污染控制与资源化研究国家重点实验室基金资助项目(PCRRY11011)
上海市城市化生态过程与生态恢复重点实验室开放基金资助(2010)
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文摘
精确定量环境样品中特定微生物类群的数量对阐明环境生物治理/修复过程中微生物的功能和效应具有重要意义。该文以土壤样品为例,将PCR-DGGE技术与定量PCR(qPCR)技术联用,定量检测样品中优势微生物类群数量。方法:抽提样品DNA,针对16SrDNA进行PCR-DGGE分析,明确样品中的优势菌群;再根据特定优势菌群的基因序列设计适合的定量引物,通过针对特定优势菌群的定量PCR分析,得到样品中优势菌群的数量信息。该方法灵敏度高、重复性好,并且无需培养,最大限度地保持了样品原始群落信息。
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关键词
优势菌群
定量检测
dgge
定量pcr(qpcr)
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Keywords
dominant bacteriaquantitatively monitoring dgge technology quantitative pcr(qpcr)
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分类号
X172
[环境科学与工程—环境科学]
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