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LlDEAD48基因调控对红榄李抗旱能力的影响
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作者 姚俊 王源源 张颖 《东北林业大学学报》 北大核心 2025年第12期17-25,共9页
以红榄李(Lumnitzera littorea)为研究对象,植株的根、茎、叶、花和果实取自海南省三亚铁炉港红树林自然保护区;采集成熟种子,在岭南师范学院红树林研究院实验基地培育萌发,转入冷光源气候培养箱中按照试验设计的培养条件培养,6片真叶... 以红榄李(Lumnitzera littorea)为研究对象,植株的根、茎、叶、花和果实取自海南省三亚铁炉港红树林自然保护区;采集成熟种子,在岭南师范学院红树林研究院实验基地培育萌发,转入冷光源气候培养箱中按照试验设计的培养条件培养,6片真叶时进行干旱胁迫试验(干旱胁迫时间分别为0、12、24、48、96 h,干旱胁迫时培养箱相对湿度设置为0);将野生型和转基因拟南芥种子分别播种于MS固体培养基上,植物光照培养箱培养,种子萌发后移至含甘露醇浓度为0、100、200、300、400 mmol·L^(-1)的MS固体培养基中,培养40 d后整个植株用于RNA提取。采用RACE技术克隆获得LlDEAD48基因全长;构建红榄李基因过表达载体,分析LlDEAD48蛋白亚细胞定位及拟南芥的遗传转化;应用生物信息学,分析LlDEAD48蛋白的保守结构域、理化性质、顺式作用元件、与近缘植物的系统发育树;采集干旱处理的野生型及转基因拟南芥的新鲜叶片,测定生理指标,分析LlDEAD48基因调控对红榄李抗旱能力的影响。结果表明:LlDEAD48基因的cDNA总长度为1849 bp,其开放阅读框(ORF)长1506 bp、5’非翻译区(UTR)为120 bp、3’非翻译区为323 bp,基因编码502个氨基酸,为稳定亲水性蛋白,定位于细胞质内质网区域。顺式作用元件预测,LlDEAD48含有对低温、赤霉素、脱落酸、光和干旱应对元件;LlDEAD48基因在红榄李花组织中高表达。过表达LlDEAD48基因的拟南芥,在干旱胁迫时生长状态明显优于野生型,侧根数量显著增多;过表达LlDEAD48基因能够提高转基因植物中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)的活性,在浓度为400 mmol·L^(-1)的甘露醇诱导时降低叶片中丙二醛(MDA)质量摩尔浓度。这些变化表明,LlDEAD48基因能够增强转基因拟南芥抗旱性,缓解干旱胁迫对植物的氧化损伤。 展开更多
关键词 红榄李 dead-box解旋酶 干旱胁迫 转基因
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甜瓜DEAD-box基因家族鉴定及其在果实发育过程中的表达分析
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作者 高明刚 李金玲 +8 位作者 陈永波 李栋 黄向丽 梁友忠 纪超 王志英 信国滨 李明 梁增文 《蔬菜》 2025年第7期36-45,共10页
DEAD-box基因家族是RNA解旋酶中最大的亚家族,在生物体遗传过程的复制、修复、重组、转录、RNA转运、细胞器基因表达和翻译等各方面都发挥着重要作用。根据甜瓜(Cucumis melo L.)基因组数据,本研究采用生物信息学手段对DEAD-box家族成... DEAD-box基因家族是RNA解旋酶中最大的亚家族,在生物体遗传过程的复制、修复、重组、转录、RNA转运、细胞器基因表达和翻译等各方面都发挥着重要作用。根据甜瓜(Cucumis melo L.)基因组数据,本研究采用生物信息学手段对DEAD-box家族成员进行筛选鉴定,并对其理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、保守基序和在果实发育不同阶段的差异表达进行分析。结果表明:在甜瓜中鉴定到29个CmDEADs基因,分布在12条染色体上;蛋白序列长度在409~1172 aa,等电点(PI)分布范围为5.29~9.95;分子量范围在46430.54~129660.04 Da。系统发育分析将29个CmDEADs分为4个亚群,亚群I~IV分别包含10、8、6、5个基因;物种间共线性分析检测到11个甜瓜CmDEADs与拟南芥的中的16个基因存在共线性关系,24个CmDEADs与26个黄瓜基因存在共线性关系。基因结构分析表明,29个CmDEADs的平均外显子数目为10.38,外显子数目4~15个;保守基序分析表明29个基因均检测到DEAD-box基因家族的9个核心基序。转录组数据分析表明,CmDEAD04、CmDEAD08、CmDEAD12、CmDEAD13、CmDEAD19和CmDEAD25在各发育阶段均维持在高表达水平,其中,CmDEAD04在GSE178084和PRJNA286120两个数据集上均表现为开花后10~20 d的表达量呈上升趋势,开花30 d后表达量开始显著下降,说明CmDEAD04可能在甜瓜果实发育中起了重要作用。本研究能够为甜瓜基因组和DEAD-box家族的遗传研究提供一定的理论参考。 展开更多
关键词 甜瓜 dead-box基因家族 表达分析 鉴定 果实发育 基因组 生物信息学
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Dead Reckoning技术在网络游戏中的应用 被引量:3
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作者 梁白鸥 陈雷霆 蔡洪斌 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2007年第9期231-232,314,共3页
介绍了基于物理运动学算法的预测技术以及基于Cubic Splines算法的平滑处理技术,并给出了Dead Reckoning在网络游戏中应用的具体算法以及该算法的相应实例。
关键词 dead Reckoning 网络延迟 网络游戏 客户端预测 平滑处理
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番茄DEAD-box RNA解旋酶基因SlDEAH1的克隆及表达分析 被引量:3
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作者 张建苓 陈国平 +3 位作者 朱明库 涂昀 胡功铃 胡宗利 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期44-52,共9页
DEAD-box RNA解旋酶是一种特殊的RNA分子伴侣,参与了RNA代谢,包括前体RNA剪接、核糖体合成、RNA降解以及基因表达,并对植物的发育和抗性等也具有重要作用。根据已报道的拟南芥DEAD-box蛋白,通过同源比对,在NCBI据库中筛选得到一个DEAD-b... DEAD-box RNA解旋酶是一种特殊的RNA分子伴侣,参与了RNA代谢,包括前体RNA剪接、核糖体合成、RNA降解以及基因表达,并对植物的发育和抗性等也具有重要作用。根据已报道的拟南芥DEAD-box蛋白,通过同源比对,在NCBI据库中筛选得到一个DEAD-box RNA解旋酶同源蛋白,命名为SlDEAH1,并根据其基因序列设计特异引物,应用RT-PCR方法从野生型番茄(Solanum lycopersicum)AC++中克隆得到了该基因的全长编码区序列。利用生物学网站、软件及实时荧光定量PCR方法,对其进行生物信息学、表达模式、胁迫及激素处理分析。结果表明:SlDEAH1包括2 073 bp的开放阅读框,编码690个氨基酸残基,其编码蛋白有9个保守结构基序,其所涉及到的ATP结合、ATP水解及RNA结合等功能对于解旋酶活性是至关重要的;表达模式分析表明SlDEAH1基因可能在野生型番茄萼片、叶片发育及果实成熟方面起到重要作用;高温、低温、脱水、伤害、盐胁迫不同程度的诱导了SlDEAH1的表达,但在根中该基因的表达受盐胁迫抑制;ABA、ACC、IAA、GA3、MeJA和ZT均不同程度诱导了SlDEAH1的表达,其中ABA诱导效应最为明显。这些结果为进一步研究SlDEAH1在番茄发育和胁迫响应中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 dead-BOX RNA解旋酶 SlDEAH1 胁迫 激素 RT-PCR分析
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DEAD-box基因家族在拟南芥生长发育中的作用 被引量:6
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作者 陈丹 彭雄波 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期941-948,共8页
在RNA代谢过程中,需要许多蛋白和核酸的参与,其中一类蛋白就是RNA解旋酶。RNA解旋酶通过水解ATP获得能量来参与RNA代谢的多个方面,包括核内转录、pre-mRNA的剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解、细胞器内基因的表达。DEAD... 在RNA代谢过程中,需要许多蛋白和核酸的参与,其中一类蛋白就是RNA解旋酶。RNA解旋酶通过水解ATP获得能量来参与RNA代谢的多个方面,包括核内转录、pre-mRNA的剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解、细胞器内基因的表达。DEAD-box蛋白家族是RNA解旋酶中最大的亚家族,它具有9个保守结构域,因motifyⅡ的保守氨基酸序列Asp-Glu-Ala-Asp(DEAD)而命名。该家族在酵母、拟南芥(Arabidopsis thaliana Heynh.)和人类基因组中都有较多的家庭成员。近年来,研究者对拟南芥DEAD-box蛋白家族的结构和功能进行了一些研究,本文着重总结DEAD-box基因家族对拟南芥生长发育的影响。 展开更多
关键词 dead-BOX 拟南芥 生长发育 RNA解旋酶
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甲醛固定对Live/Dead BacLight Bacterial Viability Kit死活细菌染液荧光显微计数海洋细菌的影响 被引量:2
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作者 张瑜斌 崔焱芸 +1 位作者 郑运 孙省利 《生态科学》 CSCD 北大核心 2013年第5期636-641,共6页
利用Live/Dead BacLight Bacterial Viability Kit死活细菌染液对采自湛江东海大堤海水、沉积物细菌和大型海藻拟刚毛藻(Cladophoropsis zollingeri)内生细菌数量进行了甲醛固定处理前后的荧光显微计数对比分析。结果表明,新鲜样品(不... 利用Live/Dead BacLight Bacterial Viability Kit死活细菌染液对采自湛江东海大堤海水、沉积物细菌和大型海藻拟刚毛藻(Cladophoropsis zollingeri)内生细菌数量进行了甲醛固定处理前后的荧光显微计数对比分析。结果表明,新鲜样品(不加甲醛固定)、甲醛刚固定样品、甲醛固定1周样品和甲醛固定2周样品中海洋细菌数量差异不显著(p>0.05)。甲醛固定对Live/Dead BacLight Bacterial Viability Kit死活细菌染液荧光显微计数海洋细菌数量无显著影响,固定后的样品可在2周内完成计数。 展开更多
关键词 甲醛固定 LIVE dead BacLight Bacterial Viability Kit染液 细菌荧光显微计数
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玉米DEAD-box RNA解旋酶基因的克隆及分析 被引量:5
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作者 张珊珊 陶勇生 +1 位作者 郑用琏 张方东 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期640-646,共7页
DEAD-box RNA解旋酶参与RNA转录、前体mRNA剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解等重要的生命活动.根据本室在S-Mo17Rf3Rf3cDNA芯片研究中,检测到花粉发育后期RNA解旋酶上调表达的结果,应用RACE技术从S-Mo17Rf3Rf3花粉中克... DEAD-box RNA解旋酶参与RNA转录、前体mRNA剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解等重要的生命活动.根据本室在S-Mo17Rf3Rf3cDNA芯片研究中,检测到花粉发育后期RNA解旋酶上调表达的结果,应用RACE技术从S-Mo17Rf3Rf3花粉中克隆得到该RNA解旋酶基因全长cDNA,命名为ZmRH2并在GenBank注册登记(DQ327709).序列分析表明该cDNA全长1652bp,从第163bp开始到1386bp含有一个开放阅读框,编码407个氨基酸.其编码的蛋白质具有DEAD-boxRNA解旋酶特有的9个保守模体,与水稻、拟南芥和豌豆中的DEAD-boxRNA解旋酶的氨基酸序列存在着很高的同源性.RT-PCR分析表明,该基因在近等基因系S-Mo17Rf3Rf3和S-Mo17rf3rf3的叶、根、和雌穗中的表达没有差异,但在花丝和花粉中有明显差异. 展开更多
关键词 玉米 dead-BOX RNA解旋酶 保守模体 细胞质雄性不育
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小麦DEAD-box基因家族鉴定及其低温下的表达模式分析 被引量:2
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作者 齐越 于晶 +8 位作者 苍晶 田宇 彭瞰看 王多佳 王政委 任治鹏 梁伊 王晓楠 孟婧 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期127-138,共12页
DEAD-box RNA解旋酶是RNA代谢途後中的关键酶,在RNA代谢过程中调控植株的生长发育和抗逆性。目前,尚未见有人对小麦DEAD-box基因家族进行系统鉴定与分析。为探究小麦DEAD-box基因的功能,本研究以水稻DEAD-box基因家族基因为参照,从小麦... DEAD-box RNA解旋酶是RNA代谢途後中的关键酶,在RNA代谢过程中调控植株的生长发育和抗逆性。目前,尚未见有人对小麦DEAD-box基因家族进行系统鉴定与分析。为探究小麦DEAD-box基因的功能,本研究以水稻DEAD-box基因家族基因为参照,从小麦全基因组数据库中共鉴定到134个小麦DEAD-box家族基因,并利用生物信息学对其家族成员的理化性质、基因结构、进化树和共线性进行分析。结果表明,小麦DEAD-box蛋白多数为弱碱性蛋白,亚细胞定位分布广泛,核分布最多;小麦与水稻DEAD-box家族基因亲缘性较高,小麦DEAD-box蛋白结构域与核心基序排列有序稳定,高度保守;小麦DEAD-box家族基因在进化过程中可能发生了节段性复制事件,水稻与小麦DEAD-box基因无序共线性连线,说明DEAD-box基因在进化过程中可能存在染色体异位突变。进一步以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和东农冬麦2号(Dn2)为材料,对其转录组库中低温差异表达的7个DEAD-box基因进行qRT-PCR分析,结果表明,这7个基因在不同品种和不同组织中表达量均有差异。Dn1中DEAD-box基因的表达量在-10℃达到峰值,而Dn2中DEAD-box基因的表达量在-25℃达到峰值。 展开更多
关键词 小麦 dead-BOX 生物信息学 QRT-PCR 低温胁迫
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DEAD-box家族蛋白在癌症中的研究进展 被引量:8
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作者 文小红 张淑芳 张应爱 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1311-1315,共5页
DEAD-box家族蛋白是一类ATP依赖的RNA解旋酶,在RNA代谢的过程中发挥重要的作用。DEAD-box家族蛋白可通过调节癌基因和抑癌基因的表达及肿瘤相关信号通路等影响细胞的增殖、分化、凋亡,进而发挥促癌或抑癌的作用。
关键词 dead-box家族蛋白 RNA解旋酶 癌症 靶向治疗
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一个水稻DEAD盒RNA解旋酶基因OsBIRH1的克隆鉴定及其蛋白纯化
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作者 宋莉芸 陈洁 +1 位作者 郑重 宋凤鸣 《浙江农业学报》 CSCD 2007年第4期259-263,共5页
克隆鉴定了一个水稻DEAD盒RNA解旋酶基因OsBIRH1。OsBIRH1基因全长cDNA由2167个核苷酸组成,包含1个长1926个核苷酸的开放阅读框,编码1个由641个氨基酸组成的蛋白,预测分子量为70.8kD。OsBIRHI基因位于水稻第3号染色体上,由8个外显... 克隆鉴定了一个水稻DEAD盒RNA解旋酶基因OsBIRH1。OsBIRH1基因全长cDNA由2167个核苷酸组成,包含1个长1926个核苷酸的开放阅读框,编码1个由641个氨基酸组成的蛋白,预测分子量为70.8kD。OsBIRHI基因位于水稻第3号染色体上,由8个外显子和7个内含子组成。预测的OsBIRH1蛋白包含DEAD盒解旋酶所特有的保守DEAD和HELICc结构域以及保守模体结构。系统进化树分析表明,OsBIRH1与拟南芥和人DEAD盒解旋酶有较高的同源性,氨基酸序列同一性为47%~54%。原核表达了OsBIRH1基因,纯化获得重组OsBIRH1融合蛋白,为OsBIRH1生化与生物学功能研究提供科学依据。 展开更多
关键词 水稻 dead盒解旋酶 OsBIRH1
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Recurrent neural network for vehicle dead-reckoning 被引量:2
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作者 Ma Haibo Zhang Liguo Chen Yangzhou 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2008年第2期351-355,共5页
For vehicle integrated navigation systems, real-time estimating states of the dead reckoning (DR) unit is much more difficult than that of the other measuring sensors under indefinite noises and nonlinear characteri... For vehicle integrated navigation systems, real-time estimating states of the dead reckoning (DR) unit is much more difficult than that of the other measuring sensors under indefinite noises and nonlinear characteristics. Compared with the well known, extended Kalman filter (EKF), a recurrent neural network is proposed for the solution, which not only improves the location precision and the adaptive ability of resisting disturbances, but also avoids calculating the analytic derivation and Jacobian matrices of the nonlinear system model. To test the performances of the recurrent neural network, these two methods are used to estimate the state of the vehicle's DR navigation system. Simulation results show that the recurrent neural network is superior to the EKF and is a more ideal filtering method for vehicle DR navigation. 展开更多
关键词 dead reckoning extended Kalman filter recurrent neural network vehicle integrated navigationsystems.
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Design of novel sliding-mode controller for high-velocity AUV with consideration of residual dead load 被引量:3
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作者 JIANG Chun-meng WAN Lei +1 位作者 SUN Yu-shan LI Yue-ming 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第1期121-130,共10页
This work focuses on motion control of high-velocity autonomous underwater vehicle(AUV).Conventional methods are effective solutions to motion control of low-and-medium-velocity AUV.Usually not taken into consideratio... This work focuses on motion control of high-velocity autonomous underwater vehicle(AUV).Conventional methods are effective solutions to motion control of low-and-medium-velocity AUV.Usually not taken into consideration in the control model,the residual dead load and damping force which vary with the AUV’s velocity tend to result in difficulties in motion control or even failure in convergence in the case of high-velocity movement.With full consideration given to the influence of residual dead load and changing damping force upon AUV motion control,a novel sliding-mode controller(SMC)is proposed in this work.The stability analysis of the proposed controller is carried out on the basis of Lyapunov function.The sea trials results proved the superiority of the sliding-mode controller over sigmoid-function-based controller(SFC).The novel controller demonstrated its effectiveness by achieving admirable control results in the case of high-velocity movement. 展开更多
关键词 autonomous underwater vehicle sliding-mode control stability analysis residual dead load sigmoid-function-based control
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Design of dead reckoning system for mobile robot 被引量:3
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作者 于金霞 蔡自兴 +1 位作者 段琢华 邹小兵 《Journal of Central South University of Technology》 EI 2006年第5期542-547,共6页
A dead reckoning system for a wheeled mobile robot was designed, and the method for robot’s pose estimation in the 3D environments was presented on the basis of its rigid-body kinematic equations. After analyzing the... A dead reckoning system for a wheeled mobile robot was designed, and the method for robot’s pose estimation in the 3D environments was presented on the basis of its rigid-body kinematic equations. After analyzing the locomotion architecture of mobile robot and the principle of proprioceptive sensors, the kinematics model of mobile robot was built to realize the relative localization. Considering that the research on dead reckoning of mobile robot was confined to the 2 dimensional planes, the locomotion of mobile robot in the 3 coordinate axis direction was thought over in order to estimate its pose on uneven terrain. Because the computing method in a plane is rather mature, the calculation in height direction is emphatically represented as a key issue. With experimental results obtained by simulation program and robot platform, the position of mobile robot can be reliably estimated and the localization precision can be effectively improved, so the effectiveness of this dead reckoning system is demonstrated. 展开更多
关键词 wheeled mobile robot dead reckoning proprioceptive sensor kinematic equations
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结直肠癌组织和细胞中DEAD盒解旋酶10和Bystin样蛋白的表达及其临床意义
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作者 涂艳娟 郑雪琴 +3 位作者 林欣怡 杨静波 邱燕如 许天文 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1009-1015,共7页
目的:探讨结直肠癌(CRC)组织及结肠癌细胞DLD-1中DEAD盒解旋酶10(DDX10)与Bystin-like(BYSL)的关系及其临床意义。方法:收集2017年3月至2018年3月间福建医科大学附属第二医院手术切除的78例CRC组织和配对癌旁组织,采用免疫组织化学Envis... 目的:探讨结直肠癌(CRC)组织及结肠癌细胞DLD-1中DEAD盒解旋酶10(DDX10)与Bystin-like(BYSL)的关系及其临床意义。方法:收集2017年3月至2018年3月间福建医科大学附属第二医院手术切除的78例CRC组织和配对癌旁组织,采用免疫组织化学Envision法检测癌组织和癌旁组织中DDX10和BYSL的表达水平,采用卡方检验、Pearson相关性分析和Kaplan-Meier法分别分析CRC组织中DDX10、BYSL蛋白表达与其患者的临床病例特征的关系,两者表达的相关性,以及与患者PFS和OS的关系。利用瞬时转染技术在DLD-1细胞中分别转染siDDX10和siNC,用qPCR法检测DLD-1细胞中敲减DDX10的表达对BYSL表达的影响,用CCK-8及Transwell实验验证DDX10及BYSL表达对结肠癌细胞增殖迁移及侵袭的影响。结果:免疫组织化学Envision法检测显示,与癌旁组织相比,DDX10和BYSL在CRC组织中呈高表达(73.08%和74.36%)。CRC组织中DDX10与BY肿瘤分期、是否发生淋巴结转移及复发等临床病例特征均有关联(均P<0.05)。Pearson相关分析结果显示,DDX10与BYSL的表达呈正相关(r=0.636,P<0.001)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,DDX10与BYSL的高表达与患者更差的预后相关。Logistic回归分析发现,DDX10与BYSL均是CRC复发的独立风险因素。CCK-8法及Transwell实验检测结果显示,敲降DDX10的表达可使BYSL表达降低,且可抑制DLD-1细胞的增殖、迁移、侵袭能力(均P<0.05)。结论:DDX10和BYSL在CRC组织中呈高表达,两者表达水平呈正相关,且与患者更差的预后相关,是CRC复发的独立风险因素。可调控结直肠癌DLD-1细胞的增殖、迁移、侵袭能力。 展开更多
关键词 结直肠癌 dead盒解旋酶10 Bystin-like 复发 预后
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低温诱导型凡纳滨对虾DEAD-box RNA解旋酶基因的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 彭金霞 吕丽虹 +2 位作者 韦嫔媛 何苹萍 陈晓汉 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期474-480,共7页
为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子基础,克隆鉴定了凡纳滨对虾DEAD-box RNA解旋酶的同源基因。根据差减文库中筛选到的一个低温上调表达的DEAD-box RNA解旋酶基因片段,通过RACE PCR扩增获得两条高度相似的c DNA全长序列,两条c DNA均为1430... 为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子基础,克隆鉴定了凡纳滨对虾DEAD-box RNA解旋酶的同源基因。根据差减文库中筛选到的一个低温上调表达的DEAD-box RNA解旋酶基因片段,通过RACE PCR扩增获得两条高度相似的c DNA全长序列,两条c DNA均为1430 bp,包含139 bp 5′UTR、79 bp 3′UTR和1212 bp开放阅读框,编码403个氨基酸残基。Blast比对结果显示,两条c DNA与其他物种的DDX5相似性最高,推测为凡纳滨对虾DDX5基因的两个变异体,分别命名为Lv DDX5variant A(Lv DDX5A)和Lv DDX5variant B(Lv DDX5B),在系统进化树中,Lv DDX5A和Lv DDX5B聚为最近的一支,并与虾类DDX5、文昌鱼DDX、贝类的DDX5距离较近。Real-time PCR分析结果显示,Lv DDX5A和Lv DDX5B都呈多组织遍在表达,在精巢、鳃、肠、肌肉和卵巢中,Lv DDX5B表达量高于Lv DDX5A,而在肝胰腺中Lv DDX5A表达量高于Lv DDX5B。在低温胁迫对虾肝胰腺和心中,Lv DDX5A呈上调表达而Lv DDX5B表达量无明显变化。进一步对Lv DDX5A在不同低温条件胁迫对虾的肝胰腺中表达变化进行了分析。结果显示,Lv DDX5A在18℃、15℃、13℃和11℃低温胁迫36h均被诱导表达,并随着15℃和13℃低温胁迫时间的增加呈先上升后下降的表达模式,在48h达到峰值,Lv DDX5A的低温诱导表达模式暗示其可能是在凡纳滨对虾低温适应中发挥作用的剪接体。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 低温诱导 dead-BOX RNA解旋酶 耐寒
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DEAD盒解旋酶10(DDX10)通过增强黑素瘤缺失基因2(AIM2)蛋白稳定性促进AIM2炎性体激活 被引量:1
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作者 赵山美子 林萌 张玉霞 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期289-296,共8页
目的研究DEAD盒解旋酶10(DDX10)对黑素瘤缺失基因2(AIM2)炎性体通路的调控机制。方法通过在HEK293T-caspase-1-ASC-IL-1β(HEK293T-CIA)细胞系中过表达DDX家族成员和AIM2表达质粒,检测上清中的白细胞介素1β(IL-1β)的释放,筛选对AIM2... 目的研究DEAD盒解旋酶10(DDX10)对黑素瘤缺失基因2(AIM2)炎性体通路的调控机制。方法通过在HEK293T-caspase-1-ASC-IL-1β(HEK293T-CIA)细胞系中过表达DDX家族成员和AIM2表达质粒,检测上清中的白细胞介素1β(IL-1β)的释放,筛选对AIM2炎性体通路有调控作用的分子。在DDX10缺失的THP-1细胞系,利用佛波酯(PMA)诱导分化为巨噬细胞,用脂多糖(LPS)预处理,再用poly(dA:dT)刺激巨噬细胞激活AIM2炎性体。采用ELISA检测IL-1β的释放,Western blot法检测胱天蛋白酶1(caspase-1)蛋白的切割和DDX10蛋白水平。采用免疫共沉淀法检测DDX10和AIM2的相互作用,利用免疫荧光细胞化学染色法结合共聚焦显微镜技术确定DDX10和AIM2在HEK293T细胞的共定位情况。结果过表达DDX10显著促进AIM2炎性体通路的激活,缺失DDX10显著降低AIM2炎性体通路的激活,DDX10与AIM2的带有200个氨基酸重复序列的造血性干扰素诱导核蛋白(HIN-200)结构域存在相互作用,并增强AIM2的蛋白稳定性。结论DDX10通过提高AIM2的蛋白稳定性促进AIM2炎性体通路的激活。 展开更多
关键词 dead盒解旋酶10(DDX10) 黑素瘤缺失基因2(AIM2) 炎性体
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低温胁迫下红榄李(Lumnitzera littorea)DEAD-box RNA解旋酶基因的表达分析 被引量:3
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作者 郝露露 柯明思 +3 位作者 朱奕秀 许燕敏 张颖 郑春芳 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期44-55,共12页
转录组分析发现DEAD-box RNA解旋酶家族参与红榄李(Lumnitzera littorea)对低温胁迫的响应。本文对4个低温显著差异表达基因LlDEAD12,LlDEAD32,LlDEAD43和LlDEAD65的生物信息学特性、组织特异性以及在不同温度处理下的红榄李幼苗中的差... 转录组分析发现DEAD-box RNA解旋酶家族参与红榄李(Lumnitzera littorea)对低温胁迫的响应。本文对4个低温显著差异表达基因LlDEAD12,LlDEAD32,LlDEAD43和LlDEAD65的生物信息学特性、组织特异性以及在不同温度处理下的红榄李幼苗中的差异表达进行研究。结果表明,LlDEAD12、LlDEAD32、LlDEAD43和LlDEAD65均属于疏水性蛋白,二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,具有多个糖基化位点和磷酸化位点,且不含有跨膜结构域和信号肽。亚细胞定位分析表明,LlDEAD12和LlDEAD32分别定位于细胞质和细胞核,而LlDEAD43和LlDEAD65则定位于线粒体上。通过蛋白质氨基酸序列的比对分析发现LlDEAD12、LlDEAD32和LlDEAD43分别与马尾松(Pinus massoniana)、巨桉(Eucalyptus grandis)和石榴(Punica granatum)的DEAD-box RNA解旋酶有较近的亲缘关系。荧光定量PCR技术分析发现,LlDEAD12和LlDEAD32在叶中高表达,LlDEAD43和LlDEAD65在茎和花中高表达,但这4个基因在根中都不表达,说明这4个基因对红榄李生长发育的调控主要集中在叶、茎和花等器官。低温胁迫对红榄李幼苗这4个基因的表达均有显著的抑制,说明它们参与了红榄李在低温环境下的分子响应,其中LlDEAD12和LlDEAD32可能参与了叶绿体的发育, LlDEAD43和LlDEAD65可能参与到了维持线粒体功能的稳定。以上结果可为红榄李抗冷性苗木的培育提供科学依据。 展开更多
关键词 红树林 红榄李 dead-box解旋酶 低温胁迫 生物信息学分析
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Adaptive variable structure control for large-scale time-delayed systems with unknown nonlinear dead-zone 被引量:1
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作者 Shen Qikun Zhang Tianping 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2007年第4期865-870,共6页
The problem of adaptive fuzzy control for a class of large-scale, time-delayed systems with unknown nonlinear dead-zone is discussed here. Based on the principle of variable structure control, a design scheme of adapt... The problem of adaptive fuzzy control for a class of large-scale, time-delayed systems with unknown nonlinear dead-zone is discussed here. Based on the principle of variable structure control, a design scheme of adaptive, decentralized, variable structure control is proposed. The approach removes the conditions that the dead-zone slopes and boundaries are equal and symmetric, respectively. In addition, it does not require that the assumptions that all parameters of the nonlinear dead-zone model and the lumped uncertainty are known constants. The adaptive compensation terms of the approximation errors axe adopted to minimize the influence of modeling errors and parameter estimation errors. By theoretical analysis, the closed-loop control system is proved to be semiglobally uniformly ultimately bounded, with tracking errors converging to zero. Simulation results demonstrate the effectiveness of the approach. 展开更多
关键词 nonlinear dead-zone decentralized control adaptive control variable structure control
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DEAD-box解旋酶21对猪传染性胃肠炎病毒复制的调控作用 被引量:1
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作者 谢立兰 尹杰 +1 位作者 黄冬蛾 李么明 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期215-222,共8页
旨在探究DEAD-box解旋酶21(DDX21)对猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)复制的调控作用。首先通过蛋白免疫印迹(Western Blot)分析了TGEV感染对DDX21表达的影响;进一步构建了猪DDX21真核表达质粒以及建立稳定敲低DDX21的PK-15细胞系,运用荧光定量... 旨在探究DEAD-box解旋酶21(DDX21)对猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)复制的调控作用。首先通过蛋白免疫印迹(Western Blot)分析了TGEV感染对DDX21表达的影响;进一步构建了猪DDX21真核表达质粒以及建立稳定敲低DDX21的PK-15细胞系,运用荧光定量PCR(RT-qPCR)、蛋白免疫印迹、间接免疫荧光(IFA)和半数细胞培养物感染量(TCID 50)探究外源过表达DDX21及敲低DDX21对TGEV体外复制的调控作用;构建一系列DDX21截短突变体真核表达质粒,鉴定了DDX21调控TGEV增殖的关键功能域。Western Blot分析显示,在TGEV WH-1株感染早期,PK-15细胞内源性DDX21蛋白的表达水平显著上调;RT-qPCR、Western Blot、IFA和TCID 50试验显示,超表达DDX21可以显著提高TGEV N基因的mRNA水平、N蛋白的表达及病毒滴度,且呈剂量依赖性,其601-784 aa区域是其影响TGEV复制的关键;与阴性对照相比,在相应DDX21敲低细胞系中TGEV的增殖显著被抑制,而回补试验逆转了DDX21敲低细胞系中TGEV的滴度。该研究首次揭示了猪DDX21对TGEV增殖的促进作用并鉴定了其调控TGEV复制的关键结构域,为今后研究DDX21蛋白的功能及TGEV的致病机理提供了理论依据。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 dead-box解旋酶21 宿主蛋白 病毒复制
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Parameter estimation for dual-rate sampled Hammerstein systems with dead-zone nonlinearity 被引量:1
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作者 WANG Hongwei CHEN Yuxiao 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2020年第1期185-193,共9页
The identification of nonlinear systems with multiple sampled rates is a difficult task.The motivation of our paper is to study the parameter estimation problem of Hammerstein systems with dead-zone characteristics by... The identification of nonlinear systems with multiple sampled rates is a difficult task.The motivation of our paper is to study the parameter estimation problem of Hammerstein systems with dead-zone characteristics by using the dual-rate sampled data.Firstly,the auxiliary model identification principle is used to estimate the unmeasurable variables,and the recursive estimation algorithm is proposed to identify the parameters of the static nonlinear model with the dead-zone function and the parameters of the dynamic linear system model.Then,the convergence of the proposed identification algorithm is analyzed by using the martingale convergence theorem.It is proved theoretically that the estimated parameters can converge to the real values under the condition of continuous excitation.Finally,the validity of the proposed algorithm is proved by the identification of the dual-rate sampled nonlinear systems. 展开更多
关键词 dual-rate sampled data dead-zone nonlinearity Hammerstein model system identification convergence analysis
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