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鲤疱疹病毒2型微滴式数字PCR检测方法的建立及比较分析
被引量:
11
1
作者
赵欣
贾鹏
+8 位作者
刘莹
王津津
史秀杰
潘广
郑晓聪
于力
何俊强
刘荭
吴志新
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2017年第4期126-133,共8页
本研究建立了定量检测鲤疱疹病毒2型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2)的微滴式数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,并与实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法的灵敏性、重复性、特异性和临床样品检测做...
本研究建立了定量检测鲤疱疹病毒2型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2)的微滴式数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,并与实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法的灵敏性、重复性、特异性和临床样品检测做了比较分析。结果表明,与qPCR相比,ddPCR具有相同的特异性,其灵敏性比qPCR低20倍。在定量CyHV-2 DNA时,ddPCR(R^2=0.994)和qPCR(R^2=0.994)均表现出良好的线性关系,且2种检测方法间的定量值呈正相关(R^2=0.989)。在定量检测相同稀释度的CyHV-2 DNA时,qPCR的定量值始终比ddPCR高10倍。ddPCR的组内和组间重复变异系数(CV)分别为0.59%–11.26%和6.55%–23.21%,而qPCR为16.57%–27.56%和22.31%–56.73%,说明ddPCR具有更好的稳定性。在临床样品定量检测时,ddPCR的检出率稍高于qPCR。本研究建立的ddPCR能够准确定量检测CyHV-2,将为CyHV-2相关研究提供有益参考。
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关键词
微滴式数字PCR
鲤疱疹病毒
2
型
实时荧光定量PCR
定量检测
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职称材料
题名
鲤疱疹病毒2型微滴式数字PCR检测方法的建立及比较分析
被引量:
11
1
作者
赵欣
贾鹏
刘莹
王津津
史秀杰
潘广
郑晓聪
于力
何俊强
刘荭
吴志新
机构
华中农业大学水产学院
深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心
深圳市检验检疫科学研究院
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2017年第4期126-133,共8页
基金
国家质量监督检验检疫总局科技项目(2013IK043)
深圳市科技创新委国际合作项目(GJHZ20150316155421411)共同资助~~
文摘
本研究建立了定量检测鲤疱疹病毒2型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2)的微滴式数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,并与实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法的灵敏性、重复性、特异性和临床样品检测做了比较分析。结果表明,与qPCR相比,ddPCR具有相同的特异性,其灵敏性比qPCR低20倍。在定量CyHV-2 DNA时,ddPCR(R^2=0.994)和qPCR(R^2=0.994)均表现出良好的线性关系,且2种检测方法间的定量值呈正相关(R^2=0.989)。在定量检测相同稀释度的CyHV-2 DNA时,qPCR的定量值始终比ddPCR高10倍。ddPCR的组内和组间重复变异系数(CV)分别为0.59%–11.26%和6.55%–23.21%,而qPCR为16.57%–27.56%和22.31%–56.73%,说明ddPCR具有更好的稳定性。在临床样品定量检测时,ddPCR的检出率稍高于qPCR。本研究建立的ddPCR能够准确定量检测CyHV-2,将为CyHV-2相关研究提供有益参考。
关键词
微滴式数字PCR
鲤疱疹病毒
2
型
实时荧光定量PCR
定量检测
Keywords
ddpcr cyhv-2 qpcr quantitative detection
分类号
S945 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
鲤疱疹病毒2型微滴式数字PCR检测方法的建立及比较分析
赵欣
贾鹏
刘莹
王津津
史秀杰
潘广
郑晓聪
于力
何俊强
刘荭
吴志新
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2017
11
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