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题名Gene Ontology在生物数据整合中的应用
被引量：8
- 1
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作者
夏燕
张忠平
曹顺良
朱扬勇
李亦学
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机构
复旦大学计算机与信息技术系
上海生物信息技术研究中心
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出处
《计算机工程》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期57-58,76,共3页
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基金
国家"863"计划基金资助项目(2002AA231011)
上海市重大科技资助项目(02DJ14013)
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文摘
异构数据的高效整合,在生物数据呈爆炸性增长、生物数据库复杂度不断增加的今天,具有重要的理论价值和实际意义。该文基于BioDW——一个整合的生物信息学数据仓库平台,利用统一的GeneOntology语义模型,建立异构数据库之间的语义链接,在概念和联系层次上有效地解决了生物异构数据的整合问题,实现了对生物数据智能化的多重、复合和交叉检索,为生物信息的进一步研究奠定了坚实的基础。
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关键词
生物
整合问题
实际
检索
数据整合
层次
联系
异构数据库
语义模型
数据仓库
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Keywords
ontology
Bio-ontology
gene ontology
Bioinformatics
integration
data warehouse
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分类号
TP311.13
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
G633
[文化科学—教育学]
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题名面向钻井工程的数据仓库解决方案研究
被引量：2
- 2
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作者
景宁
樊洪海
翟应虎
刘德智
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机构
中国石油大学石油工程教育部重点实验室
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出处
《信息网络安全》
2012年第6期93-96,共4页
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基金
国家科技重大专项子课题"钻井工程设计和工艺软件"[2008ZX05021-006]
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文摘
随着钻井工程信息数据的海量增加,各级部门都建立了钻井数据库。由于各个部门和系统在业务与数据关联上缺少总体规划和设计协调,这些数据库从某种程度上形成了一个个的"信息孤岛",所以迫切需要一种集数据集成、管理、分析、辅助决策为一体的数据仓库解决方案,为数据的共享和综合性研究应用提供支持。文章通过对钻井工程数据的分析和信息技术的调研,提出了面向钻井工程的数据仓库解决方案,即一种基于本体论的钻井数据集成方法,在一定程度上解决了钻井数据多源异构的问题。钻井数据仓库的研究和开发,为不同层次和部门的工程管理及技术人员的决策分析提供了强大的数据库支撑,为实现信息化、科学化决策打下了基础。
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关键词
钻井工程
数据仓库
本体论
数据集成
元数据
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Keywords
drilling engineering
data warehouse
ontology
data integration
meta data
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分类号
TP311.13
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名生物语义相似性在数据仓库中的应用与实现
被引量：1
- 3
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作者
夏燕
张忠平
朱扬勇
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机构
复旦大学计算机与信息技术系
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出处
《计算机应用与软件》
CSCD
北大核心
2005年第11期5-7,共3页
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基金
国家‘863’高技术研究发展计划(编号:2002AA231011)
上海市重大科技项目(编号:02DJ14013)的支持
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文摘
通过有效手段从整合的异构生物信息资源中获取高质量的生物数据,能够为生物信息的分析和挖掘提供强有力的支持。本文基于B ioDW———一个整合的生物信息数据仓库系统,以Gene Ontology作为语义模型,应用信息的语义相似度计算方法,获取不同基因产物生物特征的相似度;考虑更多的生物结构信息,使相似性的计算更加符合基因产物自身的生物特征。基于信息的语义相似度计算方法与单纯的相似度计算相比,具有扩展性、准确率高等优点,为生物信息的进一步研究奠定了坚实的基础。
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关键词
生物语义相似性
数据仓库
生物信息资源
数据挖掘
生物特征
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Keywords
Semantic similarity Bioinformation gene ontology data warehouse
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分类号
TP311.13
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名生物数据仓库研究及应用
被引量：9
- 4
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作者
丁建华
彭政
王飞
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机构
复旦大学计算机科学与工程系智能信息处理开放实验室
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2005年第12期192-194,共3页
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基金
国家自然科学基金(编号:60303009
60496325)
北京工业大学开放课题(编号:KP701200372)的资助
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文摘
文章通过分析生物数据源和数据处理的特点,提出了采用综合的集成和管理策略的生物数据仓库框架,并在此基础上实现了一个面向疾病的基因数据仓库平台BioWorld,并且为生物数据挖掘、联机查询、统计分析等提供了统一的接口。
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关键词
数据仓库
数据集成
生物信息学
基因本体
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Keywords
data warehouse,data integration,bioinfomatics,gene ontology
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分类号
TP311.13
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名基于本体的ETL设计研究
被引量：5
- 5
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作者
吴飞
邢桂芬
邢玉萍
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机构
江苏大学计算机科学与通信工程学院
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出处
《计算机工程与设计》
CSCD
北大核心
2007年第7期1517-1519,1571,共4页
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基金
江苏大学基金项目(1283000122)。
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文摘
提出了一种基于本体的ETL设计方法,通过建立各数据源的局部本体和目标数据仓库的全局本体以及本体间的映射,得出以OWL表示的各数据源和目标的映射关系。用本体元数据指导数据抽取、转换和加载过程,解决数据源ETL过程中的语义异构问题,实现了企业数据语义程度的集成。
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关键词
本体
数据抽取
转换与加载
数据集成
数据仓库
元数据
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Keywords
ontology
ETL
data integration
data warehouse
metadata
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分类号
TP311.13
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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