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基于KASP标记的厚皮甜瓜种质资源遗传多样性分析及指纹图谱构建
1
作者
孙国胜
张昌伟
+4 位作者
山溪
许丁帆
戴忠良
张振超
马志虎
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第12期2349-2355,共7页
本研究通过竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记对厚皮甜瓜核心种质资源进行多态性分析,以期筛选厚皮甜瓜种质资源的单核苷酸多态性(SNP)标记,应用于厚皮甜瓜种质资源及品种的纯度鉴定和指纹图谱构建。从公布的297份甜瓜重测序数据中挑...
本研究通过竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记对厚皮甜瓜核心种质资源进行多态性分析,以期筛选厚皮甜瓜种质资源的单核苷酸多态性(SNP)标记,应用于厚皮甜瓜种质资源及品种的纯度鉴定和指纹图谱构建。从公布的297份甜瓜重测序数据中挑选95份厚皮甜瓜重测序数据进行SNP标记开发,对课题组的20份核心厚皮甜瓜种质资源进行多态性分析。结果显示,共计开发50个SNP标记,分布在甜瓜12条染色体中。50个SNP标记中,有23个SNP标记能够将本研究中的19份核心厚皮甜瓜种质资源进行分型,其中Marker33、Marker38、Marker23、Marker36、Marker47、Marker426个标记能够完全区分19份甜瓜种质资源,本研究结果可以为后期厚皮甜瓜种质资源和品种纯度鉴定提供有利的支撑。
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关键词
厚皮甜瓜
单核苷酸多态性
竞争性等位基因特异性
pcr
遗传多样性
指纹图谱
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职称材料
题名
基于KASP标记的厚皮甜瓜种质资源遗传多样性分析及指纹图谱构建
1
作者
孙国胜
张昌伟
山溪
许丁帆
戴忠良
张振超
马志虎
机构
江苏丘陵地区镇江农业科学研究所
南京农业大学
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第12期2349-2355,共7页
基金
江苏省种业振兴揭榜挂帅项目[JBGS(2021)075]
江苏现代农业(西甜瓜)产业技术体系甜瓜育种栽培创新团队项目[JATS(2023)137]。
文摘
本研究通过竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记对厚皮甜瓜核心种质资源进行多态性分析,以期筛选厚皮甜瓜种质资源的单核苷酸多态性(SNP)标记,应用于厚皮甜瓜种质资源及品种的纯度鉴定和指纹图谱构建。从公布的297份甜瓜重测序数据中挑选95份厚皮甜瓜重测序数据进行SNP标记开发,对课题组的20份核心厚皮甜瓜种质资源进行多态性分析。结果显示,共计开发50个SNP标记,分布在甜瓜12条染色体中。50个SNP标记中,有23个SNP标记能够将本研究中的19份核心厚皮甜瓜种质资源进行分型,其中Marker33、Marker38、Marker23、Marker36、Marker47、Marker426个标记能够完全区分19份甜瓜种质资源,本研究结果可以为后期厚皮甜瓜种质资源和品种纯度鉴定提供有利的支撑。
关键词
厚皮甜瓜
单核苷酸多态性
竞争性等位基因特异性
pcr
遗传多样性
指纹图谱
Keywords
muskmelon
single nucleotide polymorphism(SNP)
competitive
allele-specific
pcr
(
kasp
)
genetic diversity
fingerprint
分类号
S652.9 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于KASP标记的厚皮甜瓜种质资源遗传多样性分析及指纹图谱构建
孙国胜
张昌伟
山溪
许丁帆
戴忠良
张振超
马志虎
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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